吳昭慶,胡萍*,程華,楊欣
(1.貴州大學(xué) 釀酒與食品工程學(xué)院,貴陽(yáng) 550025;2.貴州省長(zhǎng)順黔南山綠色食品有限公司,貴州 黔南布依族苗族自治州 550700;3.貴州省安順職業(yè)技術(shù)學(xué)院,貴州 安順 561000)
貴州辣椒資源豐富,營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高,是一種重要的藥食同源蔬菜[1-2]。糍粑辣椒作為貴州獨(dú)具一格的地方特色辣椒制品,選用干紅辣椒、姜、蒜等為原料,經(jīng)高溫煮制、鐳砵搗碎而得,是貴州特色辣子雞和油辣椒等家常菜肴的特色佐料,具有色澤鮮艷、味道鮮美、風(fēng)味獨(dú)特等特點(diǎn)[3]。
糍粑辣椒水分含量較高,即使在冰箱中冷藏保鮮,其保質(zhì)期也不超過(guò)1周,所以出現(xiàn)了產(chǎn)品難以保存、不易貯藏、保質(zhì)期短的技術(shù)難題。目前對(duì)糍粑辣椒的研究鮮有報(bào)道[4-5],對(duì)糍粑辣椒中腐敗微生物及致腐機(jī)理更是不清楚,為了采取有針對(duì)性的措施延長(zhǎng)產(chǎn)品的保質(zhì)期,必須掌握糍粑辣椒的優(yōu)勢(shì)腐敗菌及其生長(zhǎng)影響因素。
PCR-DGGE技術(shù)可較為全面地體現(xiàn)樣品微生物的多樣性及細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)變化,該技術(shù)也被廣泛應(yīng)用于食品中微生物菌相的變化分析[6-11],在由微生物所引起的食品腐敗變質(zhì)方面提供了較大的技術(shù)支撐[12-14]。丁文等[15]采用傳統(tǒng)培養(yǎng)和非培養(yǎng)(PCR-DGGE)比較的方法對(duì)熱處理辣椒醬中的殘留微生物情況進(jìn)行了研究,得出采用傳統(tǒng)培養(yǎng)法不易對(duì)某些相對(duì)豐度較低的微生物菌株進(jìn)行分離,采用PCR-DGGE 技術(shù)則可更全面準(zhǔn)確地反映辣椒醬中微生物種類(lèi)的多樣性。因此,本研究基于PCR-DGGE技術(shù)對(duì)糍粑辣椒腐敗過(guò)程中細(xì)菌群落微生物進(jìn)行動(dòng)態(tài)變化監(jiān)控分析,明確其中的優(yōu)勢(shì)腐敗菌群及腐敗特點(diǎn),為后續(xù)如何利用適當(dāng)?shù)谋ur技術(shù)、有效的殺菌方式,有針對(duì)性地抑制糍粑辣椒腐敗微生物的生長(zhǎng),為提高貴州糍粑辣椒制品的質(zhì)量穩(wěn)定安全性和延長(zhǎng)貨架期提供一定的科學(xué)理論依據(jù)和指導(dǎo)。
樣品:取自貴州省黔南山綠色食品有限公司,新鮮生產(chǎn)未作任何處理的糍粑辣椒樣品(約500 g),樣品采集完成后,立即送到實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行0~7 d的DNA提取及相關(guān)理化指標(biāo)的測(cè)定。
溶菌酶、去離子甲酰胺、TE緩沖液(8.0)、Tris-平衡酚:北京索萊寶科技有限公司;溴化乙錠(ethidium bromide, EB):美國(guó)Sigma公司;PCR引物:上海捷瑞生物技術(shù)有限公司;GoTaq?Green Master Mix:美國(guó)Promega公司;無(wú)水乙醇:重慶川東化工有限公司;實(shí)驗(yàn)所用其他有機(jī)、無(wú)機(jī)試劑:均為分析純,市售。
Micro 17R微量高速冷凍離心機(jī) 美國(guó) Thermo Electron公司;DK-98-Ⅱ電熱恒溫水浴鍋 天津市泰斯特儀器有限公司;渦旋振蕩器、混合機(jī) 江蘇省海門(mén)市麒麟醫(yī)用儀器廠;立式壓力蒸汽滅菌器 江陰濱江醫(yī)療設(shè)備有限公司;Gel Doc XR凝膠成像系統(tǒng)、PCR儀 美國(guó)BIO-RAD公司;超純水儀 上海市和泰儀器有限公司;電子天平 上海浦春計(jì)量?jī)x器有限公司;快速水分測(cè)定儀 深圳冠亞水分儀科技有限公司;便攜式pH計(jì) 深圳德圖儀表有限公司。
1.4.1 細(xì)菌總DNA的提取
參照臧凱麗等、樊敏等[16-17]的方法,準(zhǔn)確稱取10 g糍粑辣椒樣品放入250 mL三角瓶中,加入磷酸鹽緩沖液(137 mmol/L NaCl, 4.3 mmol/L NaH2PO4·7H2O, 1.4 mmol/L KH2PO4, 2.7 mmol/L KCl) ,用4層無(wú)菌紗布過(guò)濾粗渣,收集無(wú)渣濾液,用移液槍吸取至2 mL離心管中,10000×g離心6 min,倒掉清液,富集沉淀,若沉淀量少,可重復(fù)2~3次,然后加400 μL溶菌酶 (質(zhì)量濃度50 mg/mL),在37 ℃條件下進(jìn)行1 h的水浴(每隔20 min搖勻一次);水浴后加入200 μL的十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)(10%),在60 ℃條件下進(jìn)行20 min的水浴;水浴后先加入100 μL 5 mol/L NaCl,再加入600 μL十六烷基三甲基溴化銨 (hexadecyl trimethyl ammonium bromide, CTAB),在65 ℃條件下進(jìn)行15 min的水浴,然后將水浴后的混合溶液12000×g離心6 min,用移液槍吸取上清液與等體積的Tris-飽和酚∶氯仿∶異戊醇為25∶24∶1溶液混勻,12000×g離心5 min;吸取上清液至新的離心管,與等體積的氯仿∶異戊醇為24∶1溶液混勻,12000×g離心5 min;吸取上清液至新的離心管,加入2倍體積分?jǐn)?shù)為30%聚乙二醇和3 mol/L 1/8體積NaCl,于4 ℃條件下放置3 h后取出于12000×g離心10 min,倒掉上清液,吸取200 μL冰乙醇洗滌,加60 μL TE緩沖液置于-20 ℃條件下保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.2 感官評(píng)定標(biāo)準(zhǔn)
參照《貴州糍粑辣椒制作工藝》稍作修改。
1.4.3 菌落總數(shù)的測(cè)定
參照《微生物學(xué)試驗(yàn)教程》[18]。
1.4.4 Aw值的測(cè)定
參照GB 5009.3-2010《食品中水分的測(cè)定》。
1.4.5 pH值的測(cè)定
參照GB/T 10468-1989《水果和蔬菜產(chǎn)品pH值的測(cè)定方法》[19]。
1.4.6 總酸含量的測(cè)定
參照GB/T 12456-2008《食品中總酸的測(cè)定》[20]。
1.4.7 PCR擴(kuò)增
1.4.7.1 第1輪PCR擴(kuò)增(巢式PCR)
采用27F[21](AGA GTT TGA TCC CTC AG)和1492R(GGT TAC CTT GTT ACG ACT T)通用引物對(duì)細(xì)菌進(jìn)行16S rDNA全長(zhǎng)擴(kuò)增。反應(yīng)總體系(25 μL):DNA模板2 μL,引物(1 μmol/L)各2 μL,Go Taq?Green Master Mix(2X)12 μL,滅菌dd H2O 6 μL。PCR擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性1 min,58.5 ℃退火1 min;72 ℃延伸2 min,共25個(gè)循環(huán);最終72 ℃延伸2 min。
1.4.7.2 第2 輪PCR擴(kuò)增(降式PCR)
以2 μL第1輪PCR產(chǎn)物為模板DNA,采用引物GC-338F(GC-ACT CCT ACG GGA GGC AGC AG)和518R(ATT ACC GCG GCT GCT GG)擴(kuò)增,反應(yīng)總體系25 μL(同上)。PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性1 min,退火溫度從67.5 ℃降至57.5 ℃,每個(gè)循環(huán)降低0.5 ℃,退火時(shí)間是3 s,72 ℃延伸1 min,20個(gè)循環(huán);恒定退火溫度下進(jìn)行94 ℃變性1 min, 57.5 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共10個(gè)循環(huán)。
1.4.7.3 第3輪PCR 擴(kuò)增(Reconditioning PCR)
以2 μL第2輪PCR產(chǎn)物為模板DNA,采用引物338F(ACT CCT ACG GGA GGC AGC AG)和518R(ATT ACC GCG GCT GCT GG)進(jìn)行Reconditioning PCR擴(kuò)增。反應(yīng)總體系25 μL(同上),PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,57 ℃退火35 s,72 ℃延伸1 min,為5個(gè)循環(huán);最終72 ℃延伸5 min。
PCR產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。
1.4.8 變性梯度凝膠電泳(DGGE)
對(duì)樣品細(xì)菌16S rDNA V3區(qū)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行DGGE電泳。參照胡萍[22]的條件稍作改動(dòng):8%聚丙烯酰胺凝膠,變性梯度范圍35%~65%(其中100%變性劑含有7 mol/L尿素和40%甲酰胺);上樣后在0.5×TAE緩沖液(TAE緩沖液是由三羥甲基氨基甲烷、乙酸和乙二胺四乙酸組成)中200 V預(yù)電泳10 min,然后85 V電泳16 h,EB染色后置于凝膠成像儀,在系統(tǒng)內(nèi)拍照,采用Quantity One (Bio-Rad)分析軟件進(jìn)行圖像分析。
1.4.9 條帶回收及測(cè)序
在無(wú)菌操作下,用無(wú)菌刀片將DGGE膠上不同位置的條帶切下,放入2 mL離心管中,搗碎后加入20 μL ddH2O,于4 ℃過(guò)夜。吸取2 μL為模板DNA對(duì)16S rDNA V3可變區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增(條件同1.4.7.2)。將PCR產(chǎn)物經(jīng)過(guò)DGGE證明和所割條帶在相同遷移位置后再割膠回收,使用引物(不含GC夾子)對(duì)16S rDNA V3的可變區(qū)再次進(jìn)行擴(kuò)增,將純化后的PCR產(chǎn)物送到上海紅生物工程技術(shù)公司進(jìn)行測(cè)序。登錄NCBI(nationalc enter of biotechnology information)中的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行序列相似性比對(duì)。
1.4.10 數(shù)據(jù)處理
采用 Excel 2017對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算,Mega 7.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),所有數(shù)據(jù)測(cè)定均重復(fù)3次,結(jié)果采用平均值±標(biāo)準(zhǔn)差來(lái)表示。
對(duì)0~7 d糍粑辣椒每隔24 h記錄其感官品質(zhì),結(jié)果見(jiàn)表1。
表1 糍粑辣椒貯藏過(guò)程中的感官品質(zhì)Table 1 The sensory quality of Ciba pepper during storage
由表1和表2可知,糍粑辣椒貯藏0~7 d過(guò)程中,感官品質(zhì)隨著貯藏時(shí)間的延長(zhǎng)而逐漸下降,從第0天的色澤鮮艷呈亮棕紅色,組織狀態(tài)粘稠度好,呈泥狀,氣味濃郁,香味突出,愉悅有食欲,到第6天的色澤呈暗紅色,組織狀態(tài)粘稠度很差,質(zhì)地稀薄,有略微酸腐異味這些腐敗特征;水分活度值是決定食品腐敗變質(zhì)和保質(zhì)期的重要參數(shù),水分活度越小的食物越穩(wěn)定,較少出現(xiàn)腐敗變質(zhì)現(xiàn)象,糍粑辣椒Aw值從第0天的(61.75±0.15)%到第6天的(59.61±0.12)%,呈下降趨勢(shì),但是糍粑辣椒總體Aw還是過(guò)高,說(shuō)明Aw值給微生物提供了一個(gè)良好的生長(zhǎng)環(huán)境,是導(dǎo)致糍粑辣椒腐敗變質(zhì)的一個(gè)重要因素;pH和菌落總數(shù)值是反映食品品質(zhì)的重要指標(biāo),能夠反映食品在貯藏過(guò)程中的微生物代謝和生長(zhǎng)繁殖情況,總酸含量可以反映糍粑辣椒中酸味物質(zhì)含量變化,會(huì)使糍粑辣椒產(chǎn)生酸腐味,從而可判定為已腐敗變質(zhì),糍粑辣椒pH值從第0天的5.21±0.02降到第6天的4.67±0.04,總酸值也從第0天的(4.17±0.05) g/kg升高至第6天的(6.29±0.07) g/kg;菌落總數(shù)值從第0天的(3.25±0.05) lg CFU/g增加到第6天的(7.12±0.03) lg CFU/g,說(shuō)明隨著貯藏天數(shù)的增加,微生物大量生長(zhǎng)繁殖,在酶和產(chǎn)酸菌的共同作用下產(chǎn)酸,從而導(dǎo)致pH值逐漸降低,總酸含量逐漸升高,產(chǎn)品品質(zhì)急速下降,最終導(dǎo)致產(chǎn)品發(fā)生腐敗變質(zhì)。綜上所述,通過(guò)對(duì)感官的評(píng)定和理化指標(biāo)的測(cè)定得出本研究糍粑辣椒在第6天已達(dá)到肉眼可見(jiàn)的顯著腐敗。
表2 糍粑辣椒理化指標(biāo)的測(cè)定Table 2 The detection of physical and chemical indexes of Ciba pepper
圖1 PCR電泳結(jié)果
糍粑辣椒樣品0~7 d細(xì)菌總DNA的DGGE圖譜見(jiàn)圖2。
圖2 樣品貯藏過(guò)程細(xì)菌總DNA的DGGE圖譜
采用2次重復(fù)檢測(cè)驗(yàn)證每個(gè)取樣點(diǎn)條帶的方式,結(jié)果顯示DGGE圖譜皆無(wú)明顯差異。DGGE圖譜上條帶的多少和亮度分別代表微生物種類(lèi)的多少和數(shù)量的多少[23],條帶越多說(shuō)明樣品的菌種種類(lèi)越豐富,條帶越粗亮說(shuō)明該種微生物數(shù)量多,占優(yōu)勢(shì)。圖譜上不同遷移位置條帶代表著不同種類(lèi)的微生物,相同的遷移位置代表著相同的條帶,同種微生物遷移位置相同,即為相同條帶,反之,則稱為差異性條帶[24]。由DGGE圖可以看出,在0~7 d糍粑辣椒貯藏動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)過(guò)程中,檢測(cè)出較多條帶,也都比較亮,表明糍粑辣椒中微生物多樣性較高,優(yōu)勢(shì)菌較突出。將DGGE圖譜上不同的條帶進(jìn)行割膠、DNA回收、測(cè)序,登錄NCBI網(wǎng)站在Blast軟件中的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)里進(jìn)行序列比對(duì),其分析結(jié)果見(jiàn)表3,條帶8,12分別為潘氏泛酸菌株(Pantoeacypripedii)、非培養(yǎng)的羅思河小桿菌屬(UnculturedRhodanobactersp.),相似性為93%、92%,其余條帶檢測(cè)出的細(xì)菌相似性則均達(dá)95%以上,其中,條帶10,14分別為蔥屬洋蔥菌(Alliumcepa)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacterarilaitensis),其相似性高達(dá)100%。
表3 DGGE條帶細(xì)菌16S rDNA部分基因序列比對(duì)分析Table 3 The sequence analysis of bacterial 16S rDNA partial genes of DGGE bands
由圖2和表3可知,糍粑辣椒在0~7 d的貯藏過(guò)程中,微生物多樣性較高,有明顯的差異動(dòng)態(tài)演替性。共檢測(cè)出14種不同種屬的細(xì)菌:Leuconostoclactis,Klebsiellaoxytoca,Weissellasp.,Serratiasp.,Leclerciaadecarboxylata, UnculturedChroococcidiopsissp.,Pantoeacypripedii,Alliummonanthum,Arthrobactersp.,Paenarthrobacternitroguajacolicus,Glutamicibacterarilaitensis, UnculturedRhodanobactersp.,Alliumcepa和Alliumxichuanense。貯藏1 d時(shí),糍粑辣椒微生物菌相較0 d時(shí)發(fā)生了明顯的變化,條帶顯著增多,變亮,條帶4,5,9,11,12顯現(xiàn)且較亮,分別屬于沙雷氏菌(Serratiasp.)、阿德萊斯特菌(Leclerciaadecarboxylata)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacternitroguajacolicus)、西川蔥屬(Alliumxichuanense)、非培養(yǎng)的羅思河小桿菌(UnculturedRhodanobactersp.)。貯藏2 d時(shí),菌相又有不同變化,條帶4,5,11,12消失,條帶2,6,8,9明顯變亮,分別屬于產(chǎn)酸克雷伯氏菌(Klebsiellaoxytocastrain)、蔥屬菌(Alliummonanthum)、潘氏泛酸菌株(Pantoeacypripedii)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacternitroguajacolicus),直到貯藏第6天時(shí),條帶8,9完全消失,原因可能是樣品貯藏時(shí)間過(guò)長(zhǎng),所在環(huán)境的不利影響和樣品本身水分含量高,pH偏低,總酸升高,細(xì)菌大量增長(zhǎng)繁殖,產(chǎn)生一系列的代謝產(chǎn)物,從而抑制了條帶8,9的生長(zhǎng)[25]。樣品的貯藏過(guò)程就是樣品的腐敗過(guò)程,條帶8,9是在樣品貯藏過(guò)程中逐步出現(xiàn)最后在腐敗終點(diǎn)時(shí)才消失的,這與Gram等[26]關(guān)于特定腐敗菌(SSO)的理論相符:特定腐敗菌在產(chǎn)品貯藏初期數(shù)量很少,僅占微生物群落的很少部分,但在產(chǎn)品腐敗過(guò)程中逐漸占據(jù)主導(dǎo)地位。從DGGE圖中可以看出,隨著貯藏時(shí)間的延長(zhǎng),主要優(yōu)勢(shì)條帶 6,7,10,13,14從樣品初期0 d到整個(gè)腐敗后期都一直存在,并且一直處于高濃度亮度,分別屬于蔥屬菌(Alliummonanthum)、未培養(yǎng)的球菌(UnculturedChroococcidiopsissp.)、蔥屬洋蔥菌(Alliumcepa)、關(guān)節(jié)桿菌(Arthrobactersp.)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacterarilaitensis),不僅粗而且亮,在腐敗過(guò)程中占據(jù)著絕對(duì)的優(yōu)勢(shì)主導(dǎo)地位,說(shuō)明它也是糍粑辣椒的主要腐敗菌,且還是糍粑辣椒貯藏過(guò)程中的優(yōu)勢(shì)腐敗菌。因此,綜上分析,可以確定糍粑辣椒的主要腐敗菌群為蔥屬菌(Alliummonanthum)、未培養(yǎng)的球菌(UnculturedChroococcidiopsissp.)、蔥屬洋蔥菌(Alliumcepa)、關(guān)節(jié)桿菌(Arthrobactersp.)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacterarilaitensis),而潘氏泛酸菌株(Pantoeacypripedii)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacternitroguajacolicus)為糍粑辣椒貯藏過(guò)程中的優(yōu)勢(shì)腐敗菌。
將細(xì)菌DGGE圖譜上切割條帶測(cè)序結(jié)果進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建,結(jié)果見(jiàn)圖3。
圖3 菌株系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
所得測(cè)序結(jié)果可以分為3個(gè)類(lèi)別:類(lèi)別Ⅰ為未培養(yǎng)的球菌(UnculturedChroococcidiopsissp.)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacternitroguajacolicus)、蔥屬洋蔥菌(Alliumcepa)、非培養(yǎng)的羅思河小桿菌(UnculturedRhodanobactersp.)、阿德萊斯特菌(Leclerciaadecarboxylata)、西川蔥屬(Alliumxichuanense)、蔥屬菌(Alliummonanthum)、潘氏泛酸菌株(Pantoeacypripedii)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacterarilaitensis),包含條帶為7,9,10,12,5,11,6,8,14,類(lèi)別Ⅱ?yàn)殛P(guān)節(jié)桿菌(Arthrobactersp.),包含條帶是13,類(lèi)別Ⅲ是乳明串珠菌(Leuconostoclactis)、產(chǎn)酸克雷伯氏菌(Klebsiellaoxytocastrain)、魏斯氏菌(Weissellasp.)、沙雷氏菌(Serratiasp.),包含條帶為1,3,2,4。
本研究基于PCR-DGGE技術(shù)對(duì)糍粑辣椒腐敗過(guò)程中的細(xì)菌多樣性進(jìn)行動(dòng)態(tài)分析,研究結(jié)果表明:樣品貯藏0~7 d過(guò)程中,隨著貯藏時(shí)間的延長(zhǎng),pH和Aw值呈下降趨勢(shì),菌落總數(shù)和總酸值則顯著升高,感官評(píng)定呈逐漸降低趨勢(shì),綜合分析得出在第6天達(dá)到肉眼可見(jiàn)的腐敗終點(diǎn)。通過(guò)DGGE共檢測(cè)出14種不同種屬的細(xì)菌,從而確定糍粑辣椒腐敗過(guò)程中的主要腐敗菌群是蔥屬菌(Alliummonanthum)、未培養(yǎng)的球菌(UnculturedChroococcidiopsissp.)、蔥屬洋蔥菌(Alliumcepa)、關(guān)節(jié)桿菌(Arthrobactersp.)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacterarilaitensis),其中,優(yōu)勢(shì)腐敗菌則是潘氏泛酸菌株(Pantoeacypripedii)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacternitroguajacolicus)。本研究結(jié)果將為糍粑辣椒貯藏過(guò)程中微生物的腐敗研究提供非常重要的生物學(xué)數(shù)據(jù)支撐,同時(shí)也為如何延長(zhǎng)糍粑辣椒保質(zhì)期技術(shù)的研究及采用針對(duì)性的抑制手段提供了強(qiáng)大的理論支撐。