榮 娜,簡思杰,孫 薇,康 超,陳 琛,劉 祥
(陜西理工大學 生物科學與工程學院 中德天然產(chǎn)物研究所,陜西 漢中 723001)
嗜水氣單胞菌(Aeromonashydrophila,A.hydrophila)屬于弧菌科氣單胞菌屬,是導致水生動物感染細菌性疾病的主要病原菌,主要可誘發(fā)魚類感染敗血癥,死亡率高[1-3],嚴重影響了水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的經(jīng)濟發(fā)展。傳統(tǒng)上的抗生素防治見效快,但存在抗生素殘留及菌株耐藥性等副作用[4]。疫苗免疫因其無毒害、安全性高而備受關(guān)注,但目前應(yīng)用于商業(yè)養(yǎng)殖的滅活疫苗免疫效果不穩(wěn)定,且存在二次感染風險[5-6]。因此,有必要研制有效防治嗜水氣單胞菌的新型疫苗。而亞單位疫苗以純化的蛋白質(zhì)、多糖或核酸等免疫活性片段作為組分,安全穩(wěn)定且免疫持久[7],成為當今的研究熱點。
外膜蛋白(Outer membrane protein,OMP)是嗜水氣單胞菌的毒力因子之一[8],作為細菌免疫原具有安全性高、免疫原性強等優(yōu)點[9]。研究發(fā)現(xiàn),嗜水氣單胞菌外膜蛋白OprM、OmpC、OmpF均具有良好的免疫原性,可有效抵抗嗜水氣單胞菌感染[10-12],有望作為亞單位疫苗的候選成分。TolC蛋白是革蘭氏陰性菌細胞外膜上的通道蛋白,對該蛋白質(zhì)的研究大多聚焦于其在細菌體內(nèi)形成的ArcAB-TolC多藥外排系統(tǒng)[13-14]。然而,YANG等[15]發(fā)現(xiàn),沙門氏菌的TolC蛋白具有較強的抗原性和免疫原性,可有效抵抗沙門氏菌的感染,張志強等[16]將遲緩愛德華菌外膜蛋白TolC免疫小鼠,發(fā)現(xiàn)小鼠對遲緩愛德華菌具有較強的抵抗力,表明TolC是制備疫苗的潛在良好抗原。目前,有關(guān)嗜水氣單胞菌TolC蛋白免疫學功能研究尚未見報道。為此,選取嗜水氣單胞菌外膜蛋白TolC為研究對象,在線預測其理化性質(zhì),分析其菌屬間同源性與進化關(guān)系,原核表達純化TolC蛋白并探討其最佳誘導表達條件,將純化的TolC蛋白免疫小鼠制備抗血清,體外模擬TolC蛋白抗血清與不同魚類致病菌的識別作用,進一步探究其抗原性,旨在為研制嗜水氣單胞菌亞單位疫苗提供理論參考。
嗜水氣單胞菌ATCC 7966,Escherichiacoli(E.coli) DH5α、BL21菌株及pET-32a質(zhì)粒由陜西理工大學中德天然產(chǎn)物研究所保存;DNA聚合酶、T4 DNA連接酶、內(nèi)切酶BamHⅠ和XhoⅠ購自TaKaRa公司;質(zhì)粒提取、膠回收試劑盒購自上海生物工程公司;IPTG、TMB顯色液購自西安赫特生物科技有限公司;HRP標記山羊抗小鼠IgG購自Sigma公司;引物合成、基因測序由楊凌天潤奧科生物公司完成;4~5周齡昆明鼠購自西安交通大學實驗動物中心,試驗前飼養(yǎng)3 d,每日定量喂食供水。
1.2.1 生物信息學分析 從NCBI數(shù)據(jù)庫查找獲取嗜水氣單胞菌以及不同菌株來源的TolC蛋白序列,利用GeneDoc軟件進行同源性比對,通過MEGA軟件構(gòu)建TolC蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹;采用ProParam數(shù)據(jù)庫預測TolC蛋白的親水性、等電點、穩(wěn)定指數(shù)等理化指標,從ProScale Analysis數(shù)據(jù)庫中獲取親水性圖譜;采用TMHMM 2.0和SignalP 3.0軟件預測TolC蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽位置,利用SOPMA和SWISS-MODEL軟件分別進行二級結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)預測,通過STRING軟件在線獲取TolC蛋白與其他蛋白質(zhì)的相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
1.2.2 重組菌株的構(gòu)建 從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取嗜水氣單胞菌ATCC 7966菌株的全基因組序列,采用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計引物擴增TolC基因。Primer-F:ATAGGATCCGTGCTGGGCTCGGCCCAG;Primer-R:GTTCTCGAGTCATGAATTCACCTCGAT(劃線位置為BamHⅠ和XohⅠ的酶切位點)。以提取的嗜水氣單胞菌全基因組為模板,利用rTaq聚合酶實現(xiàn)TolC擴增,PCR體系為50 μL,退火溫度設(shè)為55 ℃。PCR產(chǎn)物經(jīng)核酸電泳檢測并回收,BamH Ⅰ 和XohⅠ 雙酶切PCR產(chǎn)物與載體pET-32a,通過T4 DNA連接酶將TolC片段連接至質(zhì)粒pET-32a中,轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,獲得重組質(zhì)粒。通過雙酶切和基因測序進一步鑒定重組質(zhì)粒,將鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coliBL21中,構(gòu)建TolC蛋白原核表達菌株。
1.2.3 重組蛋白的表達及純化 挑取表達菌單菌落過夜培養(yǎng),以1∶100轉(zhuǎn)接新鮮培養(yǎng)基培養(yǎng)至OD600為0.6,加入0.1 mmol/L的IPTG,低溫誘導過夜,取1 mL菌液收集菌體,加入300 μL 2×SDS Loading Buffer,沸水浴變性5 min,離心取上清10 μL進行SDS-PAGE電泳,檢測TolC表達情況,再通過包涵體洗滌和SDS-PAGE電泳切膠法純化TolC蛋白[9]。
1.2.4 重組蛋白表達條件的優(yōu)化 采用L9(34)試驗(表1)進行TolC蛋白最佳表達條件研究。簡要過程:過夜培養(yǎng)TolC表達菌至飽和,以1∶100轉(zhuǎn)接至600 mL培養(yǎng)液中,37 ℃條件下200 r/min培養(yǎng)至表中不同OD600值,按照組合要求加入不同濃度的IPTG并在設(shè)定條件下誘導,每組合進行3組重復。收取1 mL誘導菌液,沉淀加入300 μL 2×SDS Loading Buffer,沸水浴變性TolC蛋白5 min,通過SDS-PAGE電泳獲得不同誘導條件下TolC蛋白的表達圖譜。使用軟件Phoretix 1D和SPSS 13.0分別進行表達圖譜光密度和不同因子顯著性分析。
表1 TolC表達條件優(yōu)化試驗的因子與水平
1.2.5 TolC蛋白抗血清的制備及特異性與效價檢測 昆明鼠試驗組和對照組各10只。取純化的TolC蛋白100 μg混合100 μL弗氏完全佐劑,腹腔注射免疫小鼠。14 d后,等量蛋白混合100 μL弗氏不完全佐劑,再次免疫小鼠。21 d后,進行第3次免疫,對照組免疫PBS。7 d后小鼠經(jīng)眼球取血,4 ℃靜置待血清析出,3 000 r/min離心10 min,獲取抗血清于-80 ℃保存。采用Western blot檢測TolC蛋白抗血清特異性與效價,方法如下:SDS-PAGE電泳嗜水氣單胞菌全蛋白,200 mA轉(zhuǎn)PVDF膜40 min,PVDF膜充分封閉2 h后與不同稀釋倍數(shù)(1∶200、1∶400、1∶800、1∶1 600、1∶3 200)的小鼠抗血清于37 ℃輕搖孵育40 min(對照為陰性抗血清),再與1∶3 000倍稀釋的二抗于37 ℃輕搖孵育1 h,洗滌后通過DAB顯色法確定TolC蛋白抗血清的特異性。
1.2.6 體外模擬TolC蛋白抗血清與細菌的相互作用 采用ELISA[17]檢測TolC蛋白抗血清與3種魚類致病菌的相互作用:分別培養(yǎng)嗜水氣單胞菌、熒光假單胞菌和溶藻弧菌至OD600約1.0,菌體用1 %的甲醛生理鹽水80 ℃滅活,生理鹽水調(diào)整菌液OD600=0.2,分裝為1 mL/管(菌量108cfu),小管菌分別與100 μL不同稀釋倍數(shù)的TolC蛋白抗血清(1∶400、1∶800、1∶1 600、1∶3 200、1∶6 400)孵育90 min,對照為陰性血清。菌體洗滌后與200 μL 1∶3 000倍稀釋的二抗孵育1 h,洗滌菌體并混合20 μL PBS至酶標板中,加入200 μL TMB顯色液,室溫避光顯色10 min,加入50 μL 2 mol/L H2SO4終止反應(yīng),450 nm處讀數(shù)。
2.1.1 同源性與系統(tǒng)發(fā)育分析 通過GeneDoc軟件獲取不同菌株TolC氨基酸序列多重比對結(jié)果(圖1),不同菌屬間TolC蛋白同源性較差。利用MEGA軟件構(gòu)建TolC系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2),發(fā)現(xiàn)不同種類氣單胞菌間親緣關(guān)系相對于其他菌株更近,推測TolC蛋白可能為不同種類氣單胞菌提供交叉免疫保護作用。
2.1.2 理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)與功能預測 ProtParam數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,TolC蛋白含有452個氨基酸,等電點為5.85,半衰期大于10 h,不穩(wěn)定指數(shù)為34.43,屬于穩(wěn)定蛋白;親水性圖譜顯示,氨基酸最大分值為2.256,最小為-2.089,親水性平均值為-0.268,為親水性蛋白(圖3A);跨膜結(jié)構(gòu)預測圖譜(圖3B)顯示,TolC蛋白具有跨膜結(jié)構(gòu),但可信度較低;信號肽預測結(jié)果(圖3C)顯示,TolC蛋白無信號肽序列;SOPMA軟件二級結(jié)構(gòu)預測顯示,α-螺旋占全序列61.1%,無規(guī)則卷曲占27.4%,延伸鏈占11.5%(圖3D)。SWISS-MODEL軟件三級結(jié)構(gòu)預測結(jié)果顯示,TolC蛋白的三維結(jié)構(gòu)呈孔狀(圖3E);通過STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)有10種蛋白質(zhì)可與TolC蛋白相互作用,其中來源于嗜水氣單胞菌的蛋白AHA_3508、3507、3506與TolC蛋白作用關(guān)系最為緊密(圖3F)。
利用引物Primer-F、Primer-R擴增TolC基因,電泳檢測顯示在約1 300 bp處存在單一條帶(圖4A),大小與NCBI數(shù)據(jù)庫公布的TolC大小為1 359 bp一致。重組質(zhì)粒pET-32a-TolC經(jīng)BamHⅠ和XohⅠ 雙酶切,獲得約1 300 bp的目標條帶,大小符合理論值(圖4B)。目的基因測序鑒定結(jié)果顯示與 NCBI 數(shù)據(jù)庫所公布序列一致,證實成功構(gòu)建重組質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coliBL21獲得TolC蛋白表達菌株,經(jīng)IPTG誘導后,電泳結(jié)果顯示,在約70 ku處目標蛋白成功表達;采用包涵體洗滌和SDS-PAGE電泳切膠法獲得了較高純度的TolC蛋白(圖4C)。
收取不同組合條件下的誘導菌體,經(jīng)SDS-PAGE電泳獲得不同誘導條件下TolC蛋白的表達圖譜(圖5),圖譜光密度值分析結(jié)果見表2,所得數(shù)據(jù)極差和方差分析如表3和表4所示。由表3可看出,在誘導TolC蛋白表達時,最佳條件組合為A3B1C2D3,即在菌液OD600為1.0時如入終濃度為0.1 mmol/L的IPTG,37 ℃誘導8 h。表4結(jié)果顯示,誘導劑IPTG濃度達到顯著性,由此可知,誘導劑IPTG濃度對于TolC蛋白的高效表達影響較大。
Western blot結(jié)果顯示,TolC蛋白抗血清與TolC特異性結(jié)合,呈現(xiàn)出明顯的單一條帶,陰性對照無條帶。表明TolC蛋白具有良好的免疫原性,制備獲得特異性較好的TolC蛋白抗血清,抗血清效價達到1∶3 200(圖6)。
表2 TolC表達圖譜光密度分析Tab.2 Optical density analysis of TolC expression map
表3 TolC表達圖譜光密度數(shù)值的極差分析Tab.3 Range analysis of optical density of TolC expression map
表4 TolC表達圖譜光密度數(shù)值的方差分析Tab.4 Variance analysis of optical density of TolC expression map
采用ELISA檢測TolC蛋白抗血清與3種魚類致病菌的體外相互作用,結(jié)果顯示,TolC蛋白抗血清與嗜水氣單胞菌、熒光假單胞菌以及溶藻弧菌在體外均存在相互作用,且隨著抗血清稀釋倍數(shù)的增大,兩者結(jié)合能力逐漸減弱(圖7)。其中TolC蛋白抗血清與嗜水氣單胞菌的相互識別最為緊密,當抗體滴度達到1∶6 400時,仍可檢測到兩者的相互作用。由此可見,TolC蛋白具有良好的抗原性,TolC蛋白抗血清可通過形成抗原(病原菌)-抗體復合物,再結(jié)合抗原呈遞作用,實現(xiàn)動物體內(nèi)病原菌的清除。
生物信息學可準確預測蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)與抗原表位,為蛋白質(zhì)功能研究提供參考價值[18]。本研究中,同源性和進化關(guān)系分析結(jié)果顯示,不同菌屬細菌間TolC蛋白同源性較差,說明不同細菌間TolC蛋白差異較大,而不同種類的氣單胞菌間親緣關(guān)系較近。據(jù)此推測,TolC蛋白作為免疫原產(chǎn)生的抗體可能在不同種類的氣單胞菌間存在交叉免疫保護作用。此外,TolC蛋白二級結(jié)構(gòu)預測發(fā)現(xiàn),無規(guī)則卷曲占比達27.4%,該結(jié)構(gòu)易扭曲盤旋,暴露在TolC蛋白外層,成為優(yōu)勢細胞抗原表位的可能性較大,這為抗原表位的預測提供了依據(jù)[18]。
多克隆抗體制備簡單、可結(jié)合靶蛋白的多個抗原表位,而外膜蛋白作為嗜水氣單胞菌的主要毒力因子之一,能夠激發(fā)機體產(chǎn)生高水平保護性抗體[9,19]。因此,利用原核表達純化的蛋白質(zhì)免疫動物是制備多克隆抗體的常見方法。李海賓等[20]利用鼠傷寒沙門菌SseB和SseL蛋白免疫小鼠制備了特異性多抗,呂莫然等[21]將純化的豬細小病毒7型cap蛋白免疫小鼠,制備了高效價的鼠源多克隆抗體。本研究將純化的嗜水氣單胞菌TolC蛋白免疫小鼠,獲得了特異性較好的TolC蛋白抗血清,效價達到1∶3 200。體外模擬試驗結(jié)果顯示,TolC抗血清與嗜水氣單胞菌、熒光假單胞菌、溶藻弧菌存在相互作用,進一步驗證了TolC蛋白具有良好的抗原性,這與YANG等[15]、張志強等[16]關(guān)于沙門氏菌和遲緩愛德華氏菌TolC蛋白的研究結(jié)果相似,均證實了TolC蛋白具有良好的免疫原性和抗原性。由此推測,嗜水氣單胞菌TolC蛋白也可能對一些其他的魚類致病菌具有良好的免疫原性,發(fā)揮交叉免疫保護功能。
蛋白質(zhì)表達由于受到表達宿主的影響,其往往具有最佳表達條件。本研究中,菌液OD600為1.0、IPTG終濃度為0.1 mmol/L、37 ℃誘導8 h時,TolC蛋白獲得最大表達量。ZHAO等[22]研究發(fā)現(xiàn),誘導劑TPTG具有一定毒性,且高濃度的 IPTG會導致大量包涵體產(chǎn)生,降低了可溶性蛋白的表達。伍娜娜等[23]研究發(fā)現(xiàn),長時間誘導會導致蛋白質(zhì)被細菌蛋白酶降解,不利于蛋白質(zhì)的高效表達。本研究也發(fā)現(xiàn),低濃度的IPTG、適度的誘導時間更利于TolC蛋白的高效表達,該結(jié)果為工業(yè)生產(chǎn)上大量制備TolC蛋白提供了理論依據(jù)。
綜上所述,嗜水氣單胞菌外膜蛋白TolC為孔狀蛋白,在氣單胞菌屬間進化保守,具有較強的免疫原性和抗原性,并可能對不同魚類致病菌存在交叉免疫保護作用,可成為防治嗜水氣單胞菌感染的疫苗候選抗原。