類承鳳,胡 葭,何 峰,沈 蜜,孫修煉,*
(1.中國科學(xué)院武漢病毒研究所,武漢 430071;2.黃岡師范學(xué)院/經(jīng)濟(jì)林木種質(zhì)改良與資源綜合利用湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黃岡 438000)
桿狀病毒是一類專一性寄生昆蟲的病毒,其病毒粒子呈桿狀,具有囊膜結(jié)構(gòu),基因組為閉合環(huán)狀雙鏈DNA,大小為80~180 kb,編碼100~200個(gè)基因,核衣殼直徑約30~60 nm、長度約250~300 nm[1]。桿狀病毒由于對宿主的高度特異性,已經(jīng)被作為高效、安全的生物殺蟲劑廣泛應(yīng)用[2]。桿狀病毒還被開發(fā)成為用于外源基因的高效真核表達(dá)載體以及新型基因治療載體[3]。
在2020年以前,桿狀病毒只分類到科。2020年國際病毒分類委員會(huì)(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)發(fā)布了主要病毒名錄(Master species list)[4]。在這個(gè)名錄中,首次建立了桿狀病毒屬所在的綱和目,進(jìn)一步明確了桿狀病毒的分類地位。筆者在閱讀國內(nèi)文獻(xiàn)和病毒殺蟲劑農(nóng)藥登記相關(guān)文檔時(shí),經(jīng)常發(fā)現(xiàn)桿狀病毒名稱的書寫存在不規(guī)范的情況。例如,沿用 2012年前宿主名稱斜體,病毒特性詞不斜體的書寫方法,如Helicoverpa armigera nucleopolyhedrovirus,或者在不用于系統(tǒng)分類時(shí)將病毒名稱全部斜體。本文的目的主要在于介紹和推廣ICTV本次更新的主要病毒名錄中所提出的桿狀病毒分類地位的改變,以及ICVT推薦的桿狀病毒名稱的書寫和縮寫方法。
表1 ICTV 2020年發(fā)布的桿狀病毒主要種[4]Table 1 ICTV master species list in Baculoviridae,2020 release[4]
線極病毒科目前只有一個(gè)白點(diǎn)病毒屬Whispovirus,該屬也只有一個(gè)種:白斑綜合征病毒(White spot syndrome virus)[4]。
ICTV網(wǎng)站發(fā)布了對如何書寫病毒、種和其他分類單元名稱的建議[12]。根據(jù)這個(gè)文件,桿狀病毒種名由宿主昆蟲的種名和病毒特性詞(如nucleopolyhedrovirus和granulovirus)組成,宿主屬名的首字母大寫,其余字母均小寫。病毒的種名在用于系統(tǒng)分類,即出現(xiàn)在系統(tǒng)分類詞匯“種(species)”后面時(shí),用斜體書寫,但其他情形時(shí)病毒名稱(包括其宿主的屬和種名)全部采用正體書寫,目的是為了保證它們與物種名稱區(qū)分開來。在大多數(shù)文獻(xiàn)中,病毒名稱的使用頻率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于物種名稱。ICTV網(wǎng)站給出的一個(gè)典型的例句是:Infection of larvae of the silkworm,Bombyx mori (family Bombycidae) with the baculovirus Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV) (species Bombyx mori nucleopolyhedrovirus) is often lethal。因此,我們在介紹棉鈴蟲核型多角體病毒懸浮劑時(shí),其英文表達(dá)應(yīng)該是 Helicoverpa armigera nucleopolyhedrovirus(HearNPV) Suspension,而不是Helicoverpa armigera nucleopolyhedrovirus Suspension,因?yàn)檫@個(gè)制劑中的棉鈴蟲核型多角體病毒應(yīng)該是一個(gè)或幾個(gè)HearNPV分離株,而不是Helicoverpa armigera nucleopolyhedrovirus這個(gè)種的所有病毒。
另外,這個(gè)文件還指出,像種名一樣,病毒的更高階分類單元,如綱(class)、目(order)等,名稱的書寫也用斜體[12]。這不同于植物學(xué)和動(dòng)物學(xué)高階分類單元名稱書寫的慣例,植物和動(dòng)物屬以上的分類單元名稱是用正體書寫的。