郭經(jīng)奇,李 瑩,范吉林,任雯慶,薛振宇,張世亮
(1.山東中醫(yī)藥大學,2.山東中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院,山東 濟南 250014)
陣發(fā)性房顫(PAF)是我國常見心律失常的一種,發(fā)病時心房顫動,心室出現(xiàn)不規(guī)則快速的收縮,有時伴有胸悶、憋氣、心慌等癥狀,嚴重者可出現(xiàn)休克導致死亡,必須給予有效的治療和預防[1,2]。目前臨床上該病治療以西藥為主,雖然西藥取得了一定的療效,但仍會導致其他心律失常,副作用明顯。大量臨床實驗和經(jīng)驗證明,中醫(yī)中藥不僅治療PAF效果較好,還能改善西藥帶來的不良反應。再者,隨著大眾對中醫(yī)中藥認知度、認可度的增高,中醫(yī)藥的應用顯得尤為重要。
人參、甘松是張世亮教授臨床上治療陣發(fā)性房顫的常用藥對,長期的臨床觀察發(fā)現(xiàn)該藥對的應用不但能明顯降低房顫發(fā)作次數(shù)和每次發(fā)作的時間,而且對心、腦、腎等器官的保護也有效果。人參藥用部位是根與根莖,中醫(yī)認為其能補五臟,安魂魄,貴為藥中之上品,大補元氣,氣足則血充,氣血充足則脈搏調和,甘松藥用部位也是干燥根與根莖,辛香行散,入肝脾心經(jīng),能理氣止痛,醒脾健胃,止驚悸安神[3],人參、甘松合用既能補氣行氣,又能安神止驚。現(xiàn)代藥理研究發(fā)現(xiàn),人參中有40 多種皂苷,在神經(jīng)、心血管、內分泌疾病中具有積極作用,人參皂苷Rg1 具有抗炎抗氧化作用,而且能減輕大鼠心肌損傷后心律失常的發(fā)生率[4,5],甘松具有抗心律失常、抗抑郁、提高心肌耐受缺氧能力等作用[6]?,F(xiàn)中醫(yī)學者多把甘松作為君藥或臣藥來治療PAF。其中參松養(yǎng)心膠囊就配伍人參甘松來治療心律失常。目前研究更多的是關注單個藥物和單種成分的作用,而臨床證明中藥復方在緩解PAF 癥狀,調節(jié)心律,提高生活質量上取得很好療效[7]。而人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫的作用機制尚不明確,其系統(tǒng)性研究少有報道,本研究基于網(wǎng)絡藥理學,系統(tǒng)分析該藥對的有效活性成分和作用靶點,利用數(shù)據(jù)庫分析核心蛋白并通過GO 和KEGG 分析主要功能和主要途徑,為指導臨床和今后的深入研究提供依據(jù)。
登錄中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫(TCMSP http://lsp.nwu.edu.cn/),分別以人參和甘松為關鍵詞進行檢索,獲得人參和甘松所有的化學成分,包括化學成分的名字(moleclue name)、生物利用度(OB)、類藥性(DL)等。眾所周知,藥物不是所有的化學成分都能發(fā)揮治療作用,OB 包括生物利用程度和生物利用速度,程度是指中藥經(jīng)口服進入機體吸收入血后,經(jīng)過肝臟首過效應進入血液循環(huán)的藥量百分比,速度則指藥物進入血液循環(huán)達到有效劑量的時間。OB 是決定藥物的化學成分是否具備有效活性的關鍵指標。DL 是指化學成分與已知藥物的相似度,可體現(xiàn)此化學成分成為藥物的可能性。結合文獻研究,將OB≥30%,DL≥0.18 為條件,篩選出人參和甘松的潛在有效成分。
繼續(xù)通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫檢索人參和甘松的所有成分的靶點,并與已得到的潛在成分相映射,獲得潛在靶點,利用Uniprot 數(shù)據(jù)庫(http://www.uniprot.org/)將人參和甘松有效靶點與人類相關基因相對應,獲得藥物的潛在靶點。
登 錄GeneCards 數(shù) 據(jù) 庫(https://www.genecards.org/),以paroxysmal atrial fibrillation 為關鍵詞進行檢索,獲得陣發(fā)性房顫的所有相關靶基因,并導出到Excel,為后續(xù)處理做準備。
為了觀察人參-甘松藥對與陣發(fā)性房顫的關聯(lián),利用繪圖網(wǎng)址(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/),將已獲得的藥物潛在靶點和疾病靶點導入,從而獲得韋恩圖。通過韋恩圖可以更加直觀的看出,人參-甘松藥對是通過多基因、多靶點來治療陣發(fā)性房顫。
將藥物疾病映射的共同靶點與藥物的有效活性成分導入Cytoscape3.7.2 軟件,構建藥物-疾病-活性成分-靶點網(wǎng)絡圖。
為了進一步獲取關鍵靶點,利用STRING 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/),將藥對和疾病的共同靶點導入該數(shù)據(jù)庫,并限定物種為人類物種(Homo sapiens),獲得蛋白互作網(wǎng)絡圖(PPI),檢索研究相關文獻,為確保可信度,將交互分數(shù)限定為>0.4,去除無相互作用的單一蛋白,獲得最終的PPI 網(wǎng)絡圖,導出圖片并以TSV 格式保存結果,利用R x64 3.6.2軟件,將結果挑選出前30 名核心靶標,并繪制柱狀圖。
為了分析人參-甘松藥對作用于陣發(fā)性房顫的生物功能過程和通路傳導過程,從而更清晰的闡述作用機制,利用DAVID 數(shù)據(jù)庫(http://david.ncifcrf.gov/)對篩選出的藥物和疾病的共同靶點基因進行GO 分析和KEGG 分析。
通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫收集到,人參190 個化學成分,甘松57 個化學成分,共247 個化學成分。以OB≥30%,DL≥0.18 作為條件,篩選得到潛在的有效成分,人參22 個潛在成分,甘松6 個潛在成分,共獲得28 個潛在有效成分,如豆甾醇、β-谷甾醇、人參皂苷Rh2、金合歡素、隱丹參酮、刺槐堿等,見表1。
表1 人參-甘松藥對潛在有效成分Tab 1 Potentially active components of Renshen-Gansong drug pairs
在獲得的人參甘松28 個潛在有效成分中,通過Uniprot 數(shù)據(jù)庫共找到人類相關靶點97 個,通過GeneCards 數(shù)據(jù)庫共找到陣發(fā)性房顫靶點750 個,利用繪圖網(wǎng)址,得到藥物與疾病的共同靶點45 個,并繪制出韋恩圖,見圖1。
圖1 藥物疾病靶點韋恩圖Fig 1 Venn diagram of drug disease target
將有效成分與共同靶點導入Cytoscape3.7.2 軟件獲得可視化的調控網(wǎng)絡圖,見圖2。圖中節(jié)點包括藥物、疾病、活性成分、靶點,而邊則表示他們之間存在相互關系,紅色菱形代表疾病和藥物,綠色圓形代表人參活性成分,藍色圓形代表甘松活性成分,黃色三角形代表靶點基因,通過此網(wǎng)絡直觀的看出人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫是通過多種成分、多種靶點來發(fā)揮作用。
圖2 藥物-疾病-活性成分-靶點網(wǎng)絡圖Fig 2 Drug-disease-active components-target network diagram
利用STRING 數(shù)據(jù)庫獲得蛋白互作網(wǎng)絡圖,見圖3,圖中共有50 個節(jié)點,310 條邊,節(jié)點代表蛋白,淺藍色邊代表來自管理的數(shù)據(jù)庫(from curated databases),紫色邊代表實驗測定(experimentally determined),綠色邊代表基因相鄰(gene neighborhood),紅色邊代表基因融合(gene fusions),深藍色邊代表基因共現(xiàn)(gene co-occurrence),黃色邊代表文本挖掘(textmining),黑色邊代表共表達(co-expression),淡藍色邊代表蛋白質同源性(protein homology)。利用R 軟件挑選出前30 位核心靶標并繪制柱狀圖,見圖4,如P53 蛋白、前列腺素內過氧化物合酶2、腫瘤壞死因子、白細胞介素-1β、JUN 蛋白、絲裂原激活蛋白激酶14、內皮一氧化氮合成酶、雌激素受體1、血紅素加氧酶1 等,提示這些靶標可能為人參甘松治療陣發(fā)性房顫的關鍵核心成分。
圖3 蛋白互作網(wǎng)絡圖Fig 3 Protein interaction network diagram
圖4 核心靶標柱狀圖Fig 4 Histogram of core targets
利用DAVID 數(shù)據(jù)庫將篩選出的疾病和藥物共同靶點進行GO 分析,為了數(shù)據(jù)更準確,設置pvalueCutoff 為0.05,共得到了80 條GO 生物功能,選取前20 的主要功能繪制氣泡圖,見圖5。參與的功能主要有神經(jīng)遞質受體活性(Neurotransmitter receptor activity)、核受體活性(nuclear receptor activity)、被動跨膜轉運蛋白活性(passive transmembrane transporter activity)門控通道活動(gated channel activity)、離子通道活性(ion channel activity)的調節(jié),血紅素結合(heme binding)、四吡咯結合(tetrapyrrole binding)、泛素蛋白連接酶結合(ubiquitin protein ligase binding)等。繼續(xù)進行KEGG 通路富集分析,共獲得114 條通路,選取前20 條繪制柱狀圖,見圖6,參與的通路包括信號通路,如IL-17 信號通路(IL-17 signaling pathway)、糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE 信號通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、鈣信號通路(Calcium signaling pathway)、TNF 信號通路(TNF signaling pathway)、VEGF 信 號 通 路(VEGF signaling pathway)等,其他通路如流體剪應力與動脈粥樣硬化通路(Fluid shear stress and atherosclerosis)、5-羥色胺能突觸通路(Serotonergic synapse)、心肌細胞中的腎上腺素能信號轉導通路(Adrenergic signaling in cardiomyocytes)等,結果顯示人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫與多種生物功能、多種通路密切相關。
圖5 前20 生物功能氣泡圖Fig 5 Top 20 biological function bubble chart
圖6 前20 通路柱狀圖Fig 6 Histogram of the top 20 channels
陣發(fā)性房顫目前是我國常見心律失常之一,人口老齡化的加重,導致其患病率增加。小于60 歲人群患病率約1%,75~84 歲患病率約12%,大于80歲患病率超過1/3[8]。如此高的患病率,不僅給家庭帶來較大的生活壓力,也給社會帶來經(jīng)濟負擔[9]。陣發(fā)性房顫在祖國醫(yī)學中稱為“心悸”、“怔忡”,其基本病機主要是臟腑氣血虛衰失調,人參補氣之力甚佳,氣充則血充,又能安五臟,恰中病機。甘松能行氣解郁開竅,入心經(jīng),能安心神、定心悸、養(yǎng)心血,入脾經(jīng),能理氣,調節(jié)氣機升降,使補而不滯。人參、甘松合用,具有補心止悸之效。
本研究基于現(xiàn)代藥理研究與網(wǎng)絡藥理學平臺探討人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫的作用機制,共收集到28 種有效成分。如豆甾醇(Stigmasterol)屬于植物甾醇,具有抗氧化、抗炎、降低膽固醇、抗糖尿 病 的 作 用[10]。張 浩 楠 等[11]通 過 豚 鼠 實 驗 證 明,β-谷甾醇(beta-sitosterol)和山奈酚(kaempferol)具有抗心律失常的作用。山奈酚具有抗炎,抗氧化,調節(jié)免疫,保護心肌等作用[12]。甘春麗等[13]研究發(fā)現(xiàn),山奈酚黃酮醇類化合物能選擇性阻斷L 型鈣通道,拮抗鈣超載,保護心肌細胞。研究表明金合歡素(acaciin)能抗炎抗氧化,抗癌,調節(jié)免疫,保護心臟 等 作 用[14]。Wu 等[15]通 過 研 究HEK293 細 胞 發(fā)現(xiàn),金合歡素能抑制hKv4.3 電流并降低失活后的恢復,通過對hKv4.3 的使用和阻斷可能對房顫的治療有作用。隱丹參酮(cryptotanshinone)能抗心血管疾病,改善微循環(huán),改善心肌供血,抗炎抗氧化[16]。綜合看來,人參-甘松可能通過抗炎抗氧化,調節(jié)hKv4.3 等過程治療陣發(fā)性房顫。
藥物-疾病-活性成分-靶點網(wǎng)絡圖的構建,可直觀感受到人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫是通過多成分,多靶點發(fā)揮作用。PPI 網(wǎng)絡圖顯示各蛋白靶點之間關系密切,相互作用最多的前4 位蛋白靶點為P53 蛋白(TP53)、前列腺素內過氧化物合酶2(PTGS2)、腫瘤壞死因子(TNF)、白細胞介素-1β(IL1B)。研究表明,P53 基因雖是重要的抑癌基因,但其在各種細胞中廣泛存在,并與心血管疾病密切相關,能抑制細胞凋亡,抗動脈粥樣硬化,改善心肌缺血,相信隨著對P53 基因研究的不斷深入,能發(fā)現(xiàn)在心血管其他疾病中的重要作用[17]。郭麗娜等[18]通過研究發(fā)現(xiàn),葛根通過多靶點多途徑治療心血管疾病,預測到可能與PTGS2 基因的表達有關,PTGS2 基因參與腫瘤、炎癥反應等多種病理生理過程。相關臨床研究顯示,炎癥在房顫的觸發(fā)和維持中發(fā)揮重要作用,TNF-α 作為炎癥因子通過改變離子通道,導致心房重構,增加房顫的發(fā)病率,且在房顫患者中,TNF-α 水平明顯增高[19-21]。Wang 等[22]通過對犬的實驗發(fā)現(xiàn),IL-1β 能顯著激活心臟左側星狀神經(jīng)節(jié)這一重要交感神經(jīng)成分,從而發(fā)生室性心律失常。張倩倩等[23]也通過犬實驗發(fā)現(xiàn),IL-1β 能顯著激活心房神經(jīng)節(jié)叢,誘導房顫的發(fā)生,并促進房顫患者心房纖維化。因此蛋白互作網(wǎng)絡也體現(xiàn)出作用機制是復雜多樣的。
GO 分析和KEGG 分析結果顯示,人參甘松治療陣發(fā)性房顫主要涉及炎癥因子信號通路,包含IL-17 信號通路、TNF 信號通路;信號傳導通路,包含糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE 信號通路、VEGF 信號通路、心肌細胞中的腎上腺素能信號轉導通路;離子轉運相關通路,包含鈣信號通路等;疾病信號通路,包含利什曼病通路、非洲錐蟲病等。因此推斷,人參、甘松藥對治療陣發(fā)性房顫可能與這些信號通路密切相關。近研究顯示炎癥與炎癥因子與AF 的發(fā)生、維持關系緊密,桑翠[24]通過臨床研究發(fā)現(xiàn),Th17 細胞響應IL-23 刺激產(chǎn)生的IL-17能誘導和介導炎癥的發(fā)生,參與了永久性房顫的病理過程。成晨等[25]從選取的384 名孤立性房顫患者中發(fā)現(xiàn)了NPPA 突變基因p.Ile138Thr,為確定該突變基因能誘導房顫,進行了大鼠實驗,發(fā)現(xiàn)突變基因通過激活多個途徑,包括TNF 信號通路、NF-κB通路和nod 樣通路,TNF 通路和NF-κB 通路能激活IL-1β 基因,導致免疫反應和炎癥,最終導致房顫。鈣信號通路[26]能調控許多細胞的功能,張菀桐等[27]通過大鼠實驗,發(fā)現(xiàn)穩(wěn)心顆粒能調控Cav1.2-CaM-CaMKⅡ信號通路,減輕房顫大鼠心肌細胞鈣超載,恢復鈣穩(wěn)態(tài),從而治療房顫。
綜上,本研究初步揭示了人參-甘松藥對通過多種靶點、多種成分、多種功能與信號通路協(xié)同發(fā)揮治療陣發(fā)性房顫的作用,除已報道的文獻,仍有部分研究結果需要進一步實驗證實,共同探討藥物的作用機制,為臨床提供理論依據(jù)。