陳向東 王宗繼 徐麗 杜廣青 胡靖敏 王永紅
1.目的
蛋白質(zhì)是代謝反應中的功能執(zhí)行者,直接催化反應的發(fā)生,而不同代謝狀態(tài)下蛋白的表達及活性都有不同程度的差異,通過不同狀態(tài)下蛋白表達的差異來反映代謝途徑的改變。細胞破碎和蛋白質(zhì)提取是獲得蛋白質(zhì)提取量的關鍵,目前凝結(jié)芽孢桿菌細胞破碎和蛋白提取的研究比較少,因此將建立凝結(jié)芽孢桿菌細胞破碎和蛋白質(zhì)提取的方法。
2.材料與方法
2.1實驗材料
2.1.1實驗試劑
蛋白提取緩沖液見表2.1,SDS-PAGE 分離膠和濃縮膠配方見表2.2和表2.3,脫色液見表2.4,SDS上樣緩沖液見表2.5,考馬斯亮藍染色液見表2.6。蛋白定量采用BCA法蛋白質(zhì)濃度測定試劑盒,生工生物工程(上海)股份有限公司。
2.1.2實驗儀器與設備
2.2實驗方法
2.2.1細胞破碎方法
凍干后液氮研磨:保存于-80 ℃冰箱中的菌體樣品先于凍干機中凍干至少24 h,之后,將凍干后的菌體置于預冷過的研缽中同時加入液氮一起研磨,液氮研磨時間為10 min,研磨成粉末狀之后加入到裂解液中,6000 rpm 離心30 min 后取上清。
凍融法:保存于-80 ℃冰箱中的樣品重懸于裂解液中,將樣品于-80 ℃冰箱冷凍10min 中,之后于95 ℃煮10 min,重復以上步驟3-5 次,6000 rpm 離心30 min 后取上清。
超聲裂解法:保存于-80 ℃冰箱中的菌體樣品重懸于裂解液中,超聲破碎儀使用3 mm微探頭,功率設置為650 W×55%,超聲5 秒,停5 秒,如此反復多次,整個過程要確保在冰上進行且持續(xù)20 min 左右,6000 rpm,30 min 后保留上清。
冷凍破碎法:保存于-80 ℃冰箱中的菌體樣品重懸于裂解液中,加入0.5g磁力玻璃珠,于全自動樣品冷凍研磨儀,65Hz,10min。將破碎完的菌體離心,6000 rpm 離心30min 后取上清。
2.2.2蛋白濃度測定
計算BCA工作液總體積:BCA工作液總體積=(標準曲線測定點數(shù)+樣品數(shù))×重復次數(shù)×每個樣品所需的BCA工作也體積;根據(jù)所需BCA工作液總體積,定量取溶液A:溶液B=50:1,混勻制成BCA工作液;按照表2.8制備BCA標準曲線。
采用酶標板法,向酶標孔中分別加入5μL不同濃度的標準蛋白溶液;每個標準品設置2個重復,各孔分別加入5μL溶液F,37℃水浴中保溫30min,隨后個加入200μL BCA工作液,迅速混勻,在37℃水浴中保溫30min.冷卻至室溫后,在酶標儀上測各孔的A562值。以各孔A562平均值為縱坐標,對應的蛋白質(zhì)濃度為橫坐標,繪制標準曲線。
3.結(jié)果
3.1蛋白濃度標準曲線
以BSA(牛血清蛋白)濃度為橫坐標,吸光值為縱坐標,繪制BCA標準曲線見圖3.1,相關系數(shù)R2為0.9941。
3.2蛋白提取方法篩選
3.2.1細胞破碎方法篩選
細胞破碎方法分別選用了凍融法、冷凍破碎法、超聲破碎法和凍干后液氮研磨法。根據(jù)圖3.2,鏡檢結(jié)果顯示經(jīng)過凍融法破碎后凝結(jié)芽孢桿菌形態(tài)變化不大;使用玻璃珠冷凍破碎和凍干后液氮研磨可打碎部分桿菌,桿菌形態(tài)長短不一,破碎不均勻;使用3 mm微探頭,功率650 W×55%,超聲20min后菌體形態(tài)呈現(xiàn)均勻的短桿狀。
為了進一步探究細胞破碎的效果,比較了四種破碎方法提取的蛋白濃度差異并結(jié)合SDS-PAGE結(jié)果進行分析。從提取的蛋白濃度來看,凍干后液氮研磨>冷凍破碎>超聲破碎>凍融法(表3.1),結(jié)合相應的電泳圖(圖3.3),凍干后液氮研磨提取的蛋白種類最多。盡管,超聲破碎后得到均勻的短桿狀,由于超聲過程中不可避免有產(chǎn)熱以及大量泡沫,最終都會影響蛋白提取效果。綜上所述,最終選擇凍干后液氮研磨法進行細胞破碎進行后續(xù)實驗。
3.2.2蛋白提取緩沖液成分及用量優(yōu)化
3.2.1.1不同蛋白提取緩沖液篩選
在細胞破碎方法為凍干后液氮研磨的條件下,比較了不同緩沖液的提取效果,采用Tris-HCl pH6.7,2%SDS,蛋白裂解液(0.1M Tris-HCl pH 7.6、2%SDS、0.1M DTT、1mM PMSF)進行蛋白提取。結(jié)果表明,蛋白裂解液提取的蛋白量大(表3.2),SDS-PAGE電泳圖的條帶數(shù)也比另外兩種緩沖液多(圖3.4)。
3.2.1.2蛋白裂解液用量篩選
蛋白裂解液分別調(diào)整SDS為2%、4%,DTT為0.1M、0.2M,20mg(菌粉)分別加入裂解液用量1mL、2mL、4mL進行對比(表3.3)。根據(jù)蛋白濃度測定結(jié)果,比較裂解液1和3,2和4發(fā)現(xiàn),SDS調(diào)整為2%時,蛋白提取濃度以及種類更多;而DTT用量的改變并沒有影響蛋白提取的效果;裂解液的用量增加到2mL時,蛋白提取效果更好,進一步將裂解液用量增加至4mL后,蛋白的提取效果沒有進一步提高(表3.4、圖3.5)。最終確定蛋白裂解液的配方為0.1M Tris-HCl pH 7.6、2%SDS、0.1M DTT、1mM PMSF,用量為2mL。
作者簡介:陳向東(一作),漢族,男,山東省臨沂市,1980.06.05,本科,工程師,山東衛(wèi)康生物醫(yī)藥科技有限公司,食品工程。