胡安妮, 蘇儉生
(上海牙組織修復(fù)與再生工程技術(shù)研究中心,同濟大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院,同濟大學(xué)附屬口腔醫(yī)院口腔修復(fù)科,上海 200072)
牙周炎是牙周支持組織的一種慢性感染性疾病,是成年人牙齒缺失的首要原因。牙周組織的固有免疫系統(tǒng)高度活躍,對維持牙周健康至關(guān)重要[1]。固有免疫是宿主抵御病原刺激的第一道防線,反映了機體的快速抗感染能力,同時也促進了適應(yīng)性免疫的激活。目前已證實,長鏈非編碼RNA(lncRNA)在固有免疫調(diào)控中扮演重要角色[2],包括髓系細胞的分化發(fā)育、炎癥基因的表達和炎癥小體的激活等。據(jù)此,本文將著重探討lncRNA在固有免疫中的作用,并從固有免疫角度,對lncRNA在牙周炎癥反應(yīng)中的研究進展進行綜述。
LncRNA是長度超過200 nt的非編碼RNA,具有m7G帽及PolyA尾。由于缺乏有效的開放閱讀框,lncRNA幾乎無蛋白質(zhì)編碼功能。與mRNA相比,lncRNA長度較短,外顯子少卻更長,表達水平低,進化保守性差。LncRNA主要富集在細胞核,其表達分布對細胞、組織、發(fā)育或疾病狀態(tài)具有特異性,并且高度依賴時間和環(huán)境。 根據(jù)所在基因組中的位置方向,lncRNA主要分為:基因間區(qū)長鏈非編碼 RNA(intergenic lncRNA,lincRNA)、內(nèi)含子長鏈非編碼RNA (intronic lncRNA)、正義長鏈非編碼RNA (sense lncRNA)、反義長鏈非編碼RNA(antisense lncRNA)和雙向長鏈非編碼RNA(bidirectional lncRNA)[3]。 研究表明,lncRNA 可利用 RNA-DNA,RNA-RNA,RNA-蛋白互相作用的方式,從表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄水平和轉(zhuǎn)錄后水平3個層面在諸如X染色體沉默、基因組印記、干細胞多能性、腫瘤生長與轉(zhuǎn)移及免疫應(yīng)答等多種生理、病理過程中起到重要作用[4]。
執(zhí)行固有免疫應(yīng)答的細胞主要有單核/巨噬細胞、樹突狀細胞、中性粒細胞、自然殺傷細胞、固有淋巴細胞(innate lymphoid cells,ILCs)及組織相關(guān)細胞等[5]。LncRNA Lnc-MC被發(fā)現(xiàn)可作為競爭性內(nèi)源RNA結(jié)合miR-199a-5p,從而促進單核細胞向巨噬細胞的分化[6]。LncRNA NTT可結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子C/EBPβ并通過核不均一核糖核蛋白-U(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-U,hnRNP-U) 與鄰近基因PBOV1啟動子相互作用,調(diào)節(jié)單核細胞周期和分化[7]。LncRNA Morrbid可通過調(diào)節(jié)促凋亡分子BCL2L11來調(diào)控嗜酸性粒細胞、中性粒細胞和Ly6c+單核細胞的壽命及穩(wěn)態(tài)[8]。另外,如lncRNA Rroid對維持1型固有淋巴細胞(ILC1)的穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要[9]。
固有免疫應(yīng)答的核心是機體在病原侵襲時能以快速誘導(dǎo)模式識別受體下游炎癥基因的表達。當感染或刺激發(fā)生時,固有免疫細胞的模式識別受體:Toll樣受體 (Toll-like receptors,TLRs)、NOD樣受體(NOD-like receptors,NLRs)、RIG-I樣受體(RIG-I-like receptors,RLRs)、C型凝集素受體和DNA感受器識別病原體相關(guān)分子模式(pathogenassociated molecular patterns,PAMPs)或損傷相關(guān)分子模式(damage-associated molecularpatterns,DAMPs),激活固有免疫信號,引起炎癥細胞因子、轉(zhuǎn)錄因子等效應(yīng)分子表達,啟動炎癥反應(yīng),從而完成病原體的識別和清除。宿主來源的lncRNA在炎癥基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用大致呈現(xiàn)以下3種模式。
2.2.1與RNA結(jié)合蛋白結(jié)合,在基因啟動子區(qū)形成核酸蛋白復(fù)合體,調(diào)控其表達 例如,lincRNACOX2可通過與hnRNP-A2/B1和hnRNP-A/B結(jié)合形成復(fù)合體來抑制多種免疫相關(guān)基因表達,如趨化因子 CCL5(CC chemokine ligand 5)和 CX3CL1[Chemokine (C-X3-Cmotif)ligand 1]等[2]。 LncRNA THRIL則能在與hnRNP-L形成復(fù)合物的同時,定位于腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)啟動子區(qū),作為TNF-α的負反饋調(diào)節(jié)因子控制炎癥過度進展[10]。類似的,lincRNA-EPS也可作為負調(diào)控因子,通過與hnRNP-L相互作用并調(diào)節(jié)其核小體定位來抑制免疫應(yīng)答基因的表達[11]。
2.2.2與轉(zhuǎn)錄或剪接因子結(jié)合,影響其活性 一個經(jīng)典的例子是lncRNA-NEAT1,它可將富脯氨酸/谷氨酰胺剪接因子 (splicing factor proline/glutaminerich,SFPQ)定位到細胞核中形成旁斑,削弱其對白細胞介素-8(interleukin-8,IL-8)啟動子的抑制作用,激活I(lǐng)L-8的轉(zhuǎn)錄[12]。另如,lncRNA PACER能與NF-κB的亞基p50結(jié)合,阻斷其與COX2啟動子作用,激活p300組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (histone acetyltransferase,HAT)的募集從而增加組蛋白乙?;覴NA聚合酶Ⅱ復(fù)合物的組裝,促進炎癥調(diào)節(jié)劑COX2的表達[13]。
2.2.3影響基因表觀遺傳調(diào)控 例如,lincRNACOX2可與染色質(zhì)重塑復(fù)合物SWI/SNF(switching defective/sucrose non-fermenting)形成復(fù)合體,影響SWI/SNF相關(guān)的染色質(zhì)重塑[14]。同樣,lincRNA-COX2與Mi-2/核小體重組和脫乙?;笍?fù)合物Mi2/NuRD(nucleoside remodeling and deacetylase)相互作用,影響IL-12b啟動子區(qū)H3K27乙?;虷3K27二甲基化,起到IL-12b的反向調(diào)控作用[15]。此外,lncRNAIL7R則可以通過調(diào)節(jié)組蛋白3第27位賴氨酸的三甲基化負向調(diào)控炎癥介質(zhì)表達[16]。
炎癥小體是細胞質(zhì)中的一種多蛋白復(fù)合體,由分子感受器、銜接蛋白——凋亡相關(guān)斑點樣蛋白(apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD,ASC)和天冬氨酸特異性半胱氨酸蛋白酶(cysteinyl aspartate-specific proteinase,Caspase)組成,可通過感知PAMPs或DAMPs控制炎癥反應(yīng)。激活后的炎癥小體可組裝活化Caspase-1,介導(dǎo)促炎因子IL-1β和IL-18的成熟分泌,也可以驅(qū)動焦亡執(zhí)行蛋白Gasdermin-D分子切割,引起細胞焦亡[17]。近年來,以NLRP3(NOD-,LRR,and pyrin domain-containing 3)炎癥小體為代表的研究已成為固有免疫領(lǐng)域的熱點,而lncRNA在其中的作用也備受關(guān)注。
研究表明,lincRNA-EPS可抑制炎癥小體中ASC基因的表達,阻遏 IL-1β的產(chǎn)生[11]。 Yi等[18]指出,linRNA-Gm4419可以直接與 NF-κB的 p50亞基結(jié)合,并激活NLRP3炎癥小體從而調(diào)控高糖環(huán)境下腎小球系膜細胞的炎癥進程。此外,lncRNAMALAT1可競爭性地結(jié)合miR-22影響NLRP3的表達,促進高糖誘導(dǎo)的內(nèi)皮細胞焦亡[19]。最新研究顯示,lincRNA-COX2可以通過結(jié)合 NF-κB的 p65亞基并促進其核移位來上調(diào)NLRP3和ASC的表達[20],而 lncRNA-NEAT1 則與 NLRP3、NLRC4 和AIM2炎癥小體的組裝及加工相關(guān)[21]。
牙周炎主要由微生物失調(diào)、宿主免疫及遺傳因素共同促成。當受到牙齦卟啉單胞菌等厭氧菌的侵襲時,牙齦作為抵御外界刺激的第一道屏障,最先通過固有免疫細胞的TLRs(如 TLR2、TLR4)和 NLRs(如NLRP3)識別病原菌及其毒素,觸發(fā)涉及NF-κB途徑的胞內(nèi)信號級聯(lián),分泌IL-6、IL-8、IL-1β及TNF-α等多種效應(yīng)分子,啟動炎癥反應(yīng)和固有免疫應(yīng)答,并在后期激活適應(yīng)性免疫。在未受到有效控制的情況下,持續(xù)且廣泛的炎癥反應(yīng)和過剩的炎癥因子將進一步蔓延至深部,導(dǎo)致宿主促炎-抗炎免疫失衡,進而造成牙周膜膠原纖維溶解和牙槽骨吸收[1]。
文獻表明,lncRNA與牙周炎病程密切相關(guān),芯片研究發(fā)現(xiàn),與正常牙周組織相比,牙周炎癥組織中共有8 925種lncRNA的差異表達,說明lncRNA可能在牙周炎進程中發(fā)揮部分或關(guān)鍵作用[22]。已有研究證明,lncRNA參與的固有免疫主要以lncRNA/miRNA/效應(yīng)分子或信號通路的模式影響牙周炎癥反應(yīng)。例如,lnRNA-MALAT1在慢性牙周炎患者的牙齦組織中高表達,并可作為分子海綿競爭性結(jié)合miR-20a,上調(diào)TLR4并促進IL-6、IL-8等炎癥因子的產(chǎn)生,提示MALAT1/miR-20a/TLR4途徑有望成為牙周炎治療的新靶點[23]。又如,lncRNA FGD5-AS1在牙周炎牙齦組織和人牙周膜細胞炎癥模型中均呈現(xiàn)低表達,它可以通過miR-142-3P/SOCS6/NF-κB信號負向調(diào)控TNF-α、IL-1β等炎癥因子表達[24]。類似的,在炎癥來源的牙周膜干細胞中,lncRNA MAFG-AS1在限制細胞增殖的同時也能結(jié)合miR-146a,削弱miR-146a對TLR4的靶向抑制作用[25]。此外,還有一些lncRNA可能通過固有免疫與牙周炎存在關(guān)聯(lián),但潛在機制尚待考證。例如,lncRNA ANIRL在感染的牙齦上皮和成纖維細胞中均呈高表達[26],而其又受NF-κB信號調(diào)節(jié),介導(dǎo)IL-6等促炎因子產(chǎn)生[27]。LncRNA OIP5-AS1在炎性牙周組織中顯著低表達[28],而其又能夠結(jié)合并限制HuR蛋白靶向TNF、TLR4 mRNA 等功能的發(fā)揮[29]。
固有免疫既是機體抗感染的首要防線,又是適應(yīng)性免疫的前哨,貫穿了牙周炎病理發(fā)展的始終。鑒于lncRNA與固有免疫的密切聯(lián)系和固有免疫在牙周炎中的關(guān)鍵地位,lncRNA參與的固有免疫與牙周炎的關(guān)系及其效應(yīng)機制亟待深入挖掘。
綜上所述,目前l(fā)ncRNA已在腫瘤、遺傳等領(lǐng)域獲得豐厚的進展,而其在固有免疫方面的研究仍處于起步階段。固有免疫作為宿主抵御病原侵襲的先鋒和承接適應(yīng)性免疫的橋梁,在機體健康和穩(wěn)態(tài)維持中的有效調(diào)節(jié)顯得尤為重要。LncRNA介導(dǎo)固有免疫調(diào)控的一大優(yōu)點是可以通過現(xiàn)有的蛋白因子庫調(diào)節(jié)靶基因的表達,從而在短時間內(nèi)對外界刺激做出響應(yīng)。然而,現(xiàn)階段該領(lǐng)域研究也面臨著一些挑戰(zhàn),如lncRNA在固有免疫細胞的其他功能(如細胞黏附、趨化性、吞噬、抗原呈遞等)中的作用尚待挖掘,并且由于lncRNA的種類間同源性較差,導(dǎo)致實驗結(jié)果的臨床轉(zhuǎn)化存在困難??梢悦鞔_的是,lncRNA與疾病發(fā)生、發(fā)展緊密相關(guān),這就使得lncRNA作為新的藥物靶點用于感染和急、慢性炎癥等疾病的治療成為可能,而牙周炎便是其中之一。希望隨著研究的不斷深入,lncRNA在固有免疫和牙周炎中的更多發(fā)現(xiàn)將逐步被挖掘,從而為牙周炎和其他固有免疫相關(guān)疾病的預(yù)防及治療提供新的思路和應(yīng)對策略。