王 穎,劉曉艷,閔 勇,周榮華,饒 犇
(湖北省生物農(nóng)藥工程研究中心,武漢 430064)
蛋白酶是一類水解蛋白質(zhì)肽鏈的酶,廣泛存在于微生物、動物內(nèi)臟和植物莖葉、果實(shí)中[1]。早在20世紀(jì)初,美國首次將木瓜蛋白酶用于啤酒的澄清處理,而在20世紀(jì)30年代第一次將微生物蛋白酶用于食品行業(yè)[2],隨著科技水平的提高,越來越多的蛋白酶被發(fā)掘出來,并被廣泛應(yīng)用于各行各業(yè),如食品加工、皮革制造、洗滌劑以及分子生物研究等領(lǐng)域[3-5]。
蛋白酶K是蛋白酶的一種,屬于堿性絲氨酸蛋白酶類,來源于林伯氏白色念球菌(Tritirachium al?bumLimber)。首次由Hennrich等于1973年報(bào)道,因其能降解角蛋白,故命名為蛋白酶K;1974年Ebeling等[6]通過凝膠過濾大致確定其分子質(zhì)量為(18 500±500)Da,等電點(diǎn)(pi)為8.9,最適pH在7.5~12.0,是一種堿性蛋白酶。蛋白酶K的蛋白序列由Jany等[7]于1985年報(bào)道,晶體結(jié)構(gòu)由Pahler等于1984年初次報(bào)道,蛋白質(zhì)準(zhǔn)確大小由Gunkel等[8]于1989年報(bào)道,蛋白酶K的基因有2個(gè)外顯子編碼,含有一個(gè)63 bp長的內(nèi)含子;蛋白質(zhì)由15個(gè)氨基酸組成的信號肽、90個(gè)氨基酸組成的前導(dǎo)肽和279個(gè)氨基酸組成的成熟肽組成[7]。蛋白酶K具有2個(gè)Ca2+結(jié)合位點(diǎn),若用乙二胺四乙酸螯合蛋白酶K中的Ca2+,處理3 h其活性降低50%,而加入Ca2+復(fù)性處理,其酶活只有初始酶活的28%;此外,其成熟體還含有典型的絲氨酸蛋白酶類催化三聯(lián)體結(jié)構(gòu)(Asp 39-His 69-Ser 224)和兩對二硫鍵[8]。有研究指出,蛋白酶K對尿素具有較強(qiáng)的耐受性,低濃度十二烷基硫酸鈉(SDS)對其活性影響較低,高濃度影響較大,PMSF對其活性具較強(qiáng)的抑制作用[7,8]。
目前對蛋白酶K的研究主要集中在提高蛋白酶K活性、產(chǎn)量,以及其在各行業(yè)中的應(yīng)用。本研究通過文獻(xiàn)調(diào)研與在線軟件TSpred預(yù)測對蛋白酶K活性具有潛在影響的3個(gè)氨基酸殘基位點(diǎn),對這些位點(diǎn)進(jìn)行定點(diǎn)誘變,并將這些突變基因在畢赤酵母(Pichia pastoris)GS115中進(jìn)行表達(dá),對表達(dá)得到的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,篩選比酶活和熱穩(wěn)定性均得到提高的蛋白酶K突變體。
Escherichia coliTop-10、載 體pPicZαA、酵 母GS115均為Invitrogen公司產(chǎn)品。大腸桿菌(Escherich?ia coli)使用LB培養(yǎng)基培養(yǎng),畢赤酵母使用BMGY、BMMY培養(yǎng)基培養(yǎng),具體配方見Invitrogen手冊。
從NCBI上面查詢到蛋白酶K序列PK(GenBank:P06873.2),在上海生工進(jìn)行了基因合成,利用2個(gè)酶切位點(diǎn)EcoRI和NotI將PK克隆至pPicZαA表達(dá)載體上,得到重組質(zhì)粒pPicZαA-PK。蛋白酶K突變體的構(gòu)建主要是根據(jù)具體的氨基酸突變位點(diǎn),在引物上引入突變堿基,然后利用PCR的方法對基因進(jìn)行點(diǎn)突變,分別得到突變質(zhì)粒pPicZαA-PK108、pPicZαAPK199和pPicZαA-PK238。
在大腸桿菌中構(gòu)建好表達(dá)質(zhì)粒,進(jìn)行酶切和測序鑒定,然后大量提取質(zhì)粒,利用PmeI進(jìn)行線性化,電轉(zhuǎn)化畢赤酵母感受態(tài),然后挑取重組子進(jìn)行搖瓶發(fā)酵,電轉(zhuǎn)換條件和搖瓶誘導(dǎo)條件均根據(jù)Invitrogen手冊實(shí)現(xiàn)。
在一定溫度和pH條件下,在1 min內(nèi)水解酪蛋白產(chǎn)生1μg酪氨酸的酶量為1個(gè)酶活單位,以U表示。蛋白酶K在一定溫度和pH條件下,水解酪蛋白產(chǎn)生含有酚基的酪氨酸,在堿性條件下,可將Folin試劑還原,生成鉬藍(lán)和鎢藍(lán),其顏色的深淺與酪氨酸的含量成正比。通過在680 nm處測定其吸光度,得到酶解產(chǎn)生酪氨酸的量,進(jìn)而計(jì)算蛋白酶K的活力。
以上海生工合成好的蛋白酶K基因?yàn)槟0妫靡颬KF和引物PKR進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得蛋白酶K基因(圖1),然后用限制性內(nèi)切酶EcoRI和NotI分別處理載體pPicZαA和PK片段,連接克隆后得到重組質(zhì)粒,命名為pPicZαA-PK。
圖1 PCR擴(kuò)增蛋白酶K基因
根據(jù)蛋白酶K氨基酸序列,通過網(wǎng)站(http://co?spi.iiserpune.ac.in/TSpred/)對其活性位點(diǎn)進(jìn)行了分析,選取了3個(gè)位點(diǎn)的氨基酸(108I、199L、238M)進(jìn)行飽和突變,其中突變位點(diǎn)氨基酸密碼子根據(jù)畢赤酵母蛋白表達(dá)密碼子偏愛性進(jìn)行了優(yōu)化。例如,將蛋白酶K基因第108位I突變成G,用引物PKF、PK108F、PK108R、PKR(表1)對蛋白酶K基因進(jìn)行搭橋PCR得到目的片段PK108,然后將該片段克隆至pPicZαA載體上,命名為pPicZαA-PK108,根據(jù)該方法,還構(gòu)建了pPicZαA-PK199和pPicZαA-PK238。
表1 用于構(gòu)建野生型及突變體的引物
將蛋白酶K及其突變體質(zhì)粒用SacI線性化,純化后電轉(zhuǎn)化Pichia pastorisGS115感受態(tài)細(xì)胞,涂布MD平板,然后酪素底物平板篩選,如圖2所示,選取水解圈大的菌株進(jìn)行下一步試驗(yàn)。
圖2 酪素平板篩選蛋白酶K重組子
將篩選到的蛋白酶K重組菌株進(jìn)行搖瓶表達(dá),先用200 mL BMGY培養(yǎng)基富集培養(yǎng)至OD600nm為8~12(40~48 h),離心(4 000 r/min,5 min)棄上清液,加入50 mL BMMY培養(yǎng)基重懸,加入1%體積甲醇進(jìn)行誘導(dǎo),誘導(dǎo)72 h,每12 h加1次甲醇。待誘導(dǎo)結(jié)束后,離心(6 000 r/min,5 min)收集培養(yǎng)基上清液,用0.22μm濾膜過濾4℃短期保存,并通過SDS-PAGE檢測蛋白酶K的表達(dá)情況(圖3),之后用BCA試劑盒對發(fā)酵液的蛋白質(zhì)濃度進(jìn)行測定,結(jié)果顯示其濃度為1.5 mg/mL。
圖3 不同誘導(dǎo)時(shí)間蛋白酶K的表達(dá)量(SDS-PAGE檢測)
比較了蛋白酶K野生型菌株和3個(gè)突變菌株在最適條件下(pH 5.0、40℃)的比酶活變化,結(jié)果(表2)表明,第108位氨基酸的突變可以顯著提高蛋白酶K的活性,其他2個(gè)位點(diǎn)的突變則起了負(fù)效應(yīng);除此之外,還比較了幾個(gè)突變子在50℃的熱穩(wěn)定性,突變子pPicZαA-PK108顯示出了更高的熱穩(wěn)定性,該突變子比野生型表現(xiàn)了更好的應(yīng)用前景。
表2 野生型蛋白酶K及其突變體的酶活性比較
林伯氏白色念球菌來源的蛋白酶K(EC3.4.21.64),自1973年首次被發(fā)現(xiàn)以來,有研究者對其結(jié)構(gòu)、性質(zhì)進(jìn)行了研究報(bào)道[5],并實(shí)現(xiàn)了蛋白酶K的異源表達(dá)(主要是大腸桿菌和畢赤酵母)。此外,研究者們還對如何提高蛋白酶K的表達(dá)量、比活性,以及在研究中的最適用量與處理時(shí)間(如在原位雜交中的最適用量與處理時(shí)間)等方面進(jìn)行了研究[6-8],極大程度地促進(jìn)了蛋白酶K在工業(yè)與科研中的應(yīng)用。
本研究首先獲得了野生型的蛋白酶K表達(dá)菌株,然后通過軟件預(yù)測得到了對其熱穩(wěn)定性具有潛在影響的3個(gè)氨基酸殘基位點(diǎn),對它們進(jìn)行了點(diǎn)突變,分別在畢赤酵母GS115中進(jìn)行了分泌表達(dá),通過篩選獲得了一個(gè)熱穩(wěn)定性提高了30%,比活性提高約50%的蛋白酶K突變體pPicZαA-PK108。這對蛋白酶K在工業(yè)上的應(yīng)用起到了一定的促進(jìn)作用,如可以減少蛋白酶K在洗滌劑、食品加工中的用量,降低生產(chǎn)成本;此外,也可提高污水中病毒的滅活效率,減少環(huán)境污染。