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      瘤背石磺體腔細(xì)胞分類、免疫相關(guān)酶特性及初步轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

      2022-02-18 12:58:08呂庭莉杲紹強(qiáng)張虎張易嬋陳鵬王嘉偉喬幗楊伯平張明明
      海洋學(xué)報(bào) 2022年2期
      關(guān)鍵詞:體腔色素測(cè)序

      呂庭莉 ,杲紹強(qiáng),張虎,張易嬋,陳鵬 ,王嘉偉,喬幗,楊伯平,張明明*

      (1.大連海洋大學(xué) 水產(chǎn)與生命學(xué)院,遼寧 大連 116023;2.鹽城工學(xué)院 海洋與生物工程學(xué)院,江蘇 鹽城 224051;3.邳州市新河鎮(zhèn)農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣服務(wù)中心,江蘇 徐州 221313;4.江蘇省海洋水產(chǎn)研究所,江蘇 南通 226007;5.鹽城工學(xué)院 電氣工程學(xué)院,江蘇 鹽城 224051)

      1 引言

      瘤背石磺(Onchidium struma)隸屬軟體動(dòng)物門(mén)(Mollusca)、腹足綱(Gastropoda)、石磺科(Onchidiidae),俗稱土海參,又名海賴子,具有豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值[1]。主要生長(zhǎng)在潮間帶灘涂中,其背部表皮角質(zhì)層厚,溫度適應(yīng)性強(qiáng),適應(yīng)陸棲生活[2],因有自由生活幼蟲(chóng)期而被認(rèn)為是海洋生物向陸地生物輻射進(jìn)化的重要代表物種[3]。此外,瘤背石磺屬于海洋灘涂底棲動(dòng)物,其早期發(fā)育對(duì)各種環(huán)境因子的變化尤為敏感,且因其幼蟲(chóng)易于采集和培育,常被用于評(píng)價(jià)海洋污染物的毒性,也可被作為海洋生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)的指示生物[4]。

      近年來(lái),瘤背石磺作為一種具有較高經(jīng)濟(jì)和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值的海產(chǎn)珍品,日益受到人們的青睞,但由于環(huán)境污染、濫采濫捕或過(guò)度采捕等因素,其自然資源量已急劇減少。人們已經(jīng)對(duì)瘤背石磺的人工養(yǎng)殖進(jìn)行了研究[5],但是尚未突破其規(guī)模化養(yǎng)殖技術(shù)。因此,研究瘤背石磺基礎(chǔ)免疫學(xué)將對(duì)其生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖和物種保護(hù)具有重要意義。

      目前人們普遍認(rèn)為,包括軟體動(dòng)物在內(nèi)的無(wú)脊椎動(dòng)物缺乏適應(yīng)性免疫,完全依賴于先天性免疫應(yīng)答[6]。牡蠣和貽貝等雙殼類通過(guò)血細(xì)胞吞噬侵入的微生物、促進(jìn)傷口愈合、消化食物和運(yùn)輸營(yíng)養(yǎng)[7-8];體腔液及其體腔細(xì)胞是海參先天性免疫防御的重要組成部分,發(fā)揮著重要的免疫防御作用,具有氧化殺滅、吞噬清除、凝集和創(chuàng)傷修復(fù)等多種防御功能[9-10]。近年來(lái),隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,國(guó)內(nèi)外學(xué)者相繼利用單克隆抗體、熒光標(biāo)記及分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)海參(Holothurioidea)、海膽(Echinoidea)和海星(Asteroidea)等棘皮動(dòng)物體腔細(xì)胞的形態(tài)、功能和發(fā)生進(jìn)行了深入研究,進(jìn)一步揭示了棘皮動(dòng)物體腔細(xì)胞在免疫系統(tǒng)中的重要作用[11-13]。但人們對(duì)瘤背石磺體腔細(xì)胞的特點(diǎn)及其在免疫防御中的作用知之甚少。

      轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門(mén)基于整體轉(zhuǎn)錄水平來(lái)研究基因轉(zhuǎn)錄圖譜并揭示生物學(xué)通路和性狀調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分子機(jī)制的學(xué)科,近年來(lái)被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究中[14-15]。高通量RNA-Seq 測(cè)序技術(shù)是目前廣泛應(yīng)用的第二代檢測(cè)技術(shù),具有高通量、高準(zhǔn)確性、成本低等優(yōu)點(diǎn)[16],基于此技術(shù),不僅轉(zhuǎn)錄組本身及其調(diào)控復(fù)雜性的認(rèn)知被大大拓展,有關(guān)生物體的功能基因組學(xué)研究也被深入推進(jìn)[17],如刺參(Apostichopus japonicus)[18]和太平洋牡蠣(Crassostrea gigas)等[19]。藉此,本研究利用RNA-Seq 測(cè)序技術(shù)對(duì)來(lái)自健康瘤背石磺的體腔細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,豐富其遺傳信息;此外,本文研究了瘤背石磺體腔細(xì)胞的免疫相關(guān)酶和抗氧化酶活性,統(tǒng)計(jì)了體腔細(xì)胞中各主要類型體腔細(xì)胞的密度,研究結(jié)果將為今后進(jìn)一步研究瘤背石磺的基礎(chǔ)免疫學(xué)提供寶貴的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),對(duì)于提高人工繁育的效率和質(zhì)量、遺傳圖譜的建立和物種保護(hù)提供有價(jià)值的參考。

      2 實(shí)驗(yàn)材料與方法

      2.1 材料

      健康瘤背石磺(平均體質(zhì)量:(8.3±0.5)g)采自江蘇省射陽(yáng)縣新洋港潮間帶,帶泥運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室后,在塑料飼養(yǎng)箱內(nèi)(70 cm × 50 cm × 40 cm,90 頭/箱)暫養(yǎng)3 d。塑料桶內(nèi)鋪上8~12 cm 厚的海泥,再鋪上半圓形瓦片供瘤背石磺隱藏和附著。每個(gè)飼養(yǎng)箱用網(wǎng)紗覆蓋,用于通風(fēng)、觀察和防止瘤背石磺逃生。飼養(yǎng)箱內(nèi)的相對(duì)濕度通過(guò)噴灑人工海水保持在80%左右,與自然生活潮間帶濕度相近[20],室溫保持在(26±1)℃。暫養(yǎng)期間,投喂螺旋藻(粗蛋白57.64%、粗脂肪2.73%、灰分7.53%、鈣0.2%、磷0.79%和水分8.28%),日投喂量為體質(zhì)量的2%,將螺旋藻涂抹于無(wú)菌玻璃上,并在飼喂2 h 后清理干凈,防止藻類腐敗發(fā)臭以保持良好的養(yǎng)殖環(huán)境。

      2.2 實(shí)驗(yàn)方法

      2.2.1 瘤背石磺體腔液的采集

      暫養(yǎng)3 d 后,將瘤背石磺隨機(jī)分到3 個(gè)飼養(yǎng)箱中,每箱放置15 頭。從每箱中隨機(jī)選取3 頭瘤背石磺,用無(wú)菌海水沖洗體表海泥后,解剖紙吸干水分,用無(wú)菌手術(shù)剪沿瘤背石磺腹部縱向解剖,并用50 mL 離心管收集體腔液。記錄體腔液體積后,取100 μL 體腔液與等體積的抗凝劑(葡萄糖:20.8 g/L、檸檬酸鈉:8 g/L、EDTA :3.36 g/L、氯化鈉:22.5 g/L,pH:7.5)混勻,進(jìn)行體腔細(xì)胞計(jì)數(shù)。剩余體腔液于4℃、3 000 r/min離心30 min,分別收集上清液和底層細(xì)胞沉淀,每3 頭瘤背石磺的上清液混合作為一個(gè)平行樣本,-80℃保存,用于免疫相關(guān)酶和抗氧化酶活性測(cè)定;底層細(xì)胞加入RNA 保護(hù)劑以防止RNA 降解,立即放于液氮中速凍,然后轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱保存?zhèn)溆?,用于轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。

      2.2.2 瘤背石磺體腔細(xì)胞的分類和數(shù)量分析

      將處理獲得的體腔液制作細(xì)胞涂片,在40 倍光學(xué)顯微鏡(Olympus,PH100-3B41L-IPL)下觀察體腔細(xì)胞并依據(jù)形態(tài)、大小和核質(zhì)比進(jìn)行細(xì)胞分類。

      將體腔液滴于血球計(jì)數(shù)板(25×16)上,并在光學(xué)顯微鏡下測(cè)定總體腔細(xì)胞密度(Total Coelomocytes Density,TCD)和不同類型體腔細(xì)胞密度(Different Coelomocytes Density,DCD)。計(jì)算公式為

      式中,A為25 中方格內(nèi)總體腔細(xì)胞數(shù)之和(單位:cells/mL);B為稀釋倍數(shù);C為25 中方格中某類型體腔細(xì)胞數(shù)之和(單位:cells/mL)。細(xì)胞計(jì)數(shù)重復(fù)3 次。

      2.2.3 瘤背石磺體腔液中免疫相關(guān)指標(biāo)活性測(cè)定

      通過(guò)試劑盒測(cè)定體腔液中酸性磷酸酶(Acid Phosphatase,ACP)、堿性磷酸酶(Alkaline Phosphatase,AKP)、超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)和酚氧化酶(Phenoloxidase,PO)活力及總抗氧化能力(Total Antioxidant Capacity,T-AOC),試劑盒均購(gòu)自南京建成生物工程研究所,根據(jù)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作和活力計(jì)算。

      2.2.4 瘤背石磺體腔細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

      2.2.4.1 總RNA 提取和cDNA 文庫(kù)的構(gòu)建

      cDNA 文庫(kù)的構(gòu)建及測(cè)序在北京諾禾致源生物信息科技有限公司進(jìn)行。根據(jù)使用說(shuō)明書(shū)從體腔細(xì)胞中提取總RNA,RNA 的質(zhì)量經(jīng)Agilent 2100 生物分析儀檢測(cè)合格后用于cDNA 文庫(kù)構(gòu)建。根據(jù)RNA 質(zhì)量篩選獲得6 個(gè)樣品的RNA,純化后,使用fragment buffer 將包含Poly(A)的mRNA 片段分成200~250 bp 的短片段。使用N6 引物將片段化的RNA 轉(zhuǎn)錄入第一鏈cDNA,隨后合成第二鏈cDNA。用QIA quick PCR 試劑盒純化雙鏈cDNA,之后通過(guò)2%瓊脂糖凝膠電泳回收目的大小片段。使用PCR primer cocktail 和PCR master mix 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增來(lái)富集合適的銜接子連接的片段。PCR 產(chǎn)物經(jīng)ampureXP 珠純化后使用Illumina HiSeq? 3000 平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。

      2.2.4.2 Unigenes 功能注釋與分類

      獲得原始片段后,使用FastQC(http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk//projects/fastqc/)軟件進(jìn)行質(zhì)量分析,去除帶有接頭、低質(zhì)量和N(表示無(wú)法確定堿基信息)比例大于10%的序列,獲得過(guò)濾后數(shù)據(jù)。將過(guò)濾后的數(shù)據(jù)用Trinity(http://trinityrnaseq.sourceforge.net/)組裝出全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本序列。在已知的核苷酸和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中,將所有組裝的Unigenes 通過(guò)BLASTX進(jìn)行比對(duì),去掉E-value 值大于10-5的比對(duì)序列。數(shù)據(jù)庫(kù)包括:NCBI 核酸數(shù)據(jù)庫(kù)(Nt:https://www.ncbi.nlm.nih.gov)、NCBI 冗余蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(Nr:http://www.ncbi.nlm.nih.gov)、PFAM(HMMER3.0package)、Swiss-Prot 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.uniprot.org)、COG 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/)和KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.genome.jp/kegg)。

      2.3 數(shù)據(jù)處理

      3 結(jié)果

      3.1 瘤背石磺體腔細(xì)胞的分類和數(shù)量

      根據(jù)細(xì)胞形態(tài)、大小、核質(zhì)比、顏色和相關(guān)研究報(bào)道[21],將瘤背石磺的體腔細(xì)胞分為變形細(xì)胞(圖1a)、球形細(xì)胞(圖1b)和色素細(xì)胞(圖1c)。變形細(xì)胞類似海參中的變形細(xì)胞,細(xì)胞形狀各異,大小不一,細(xì)胞核呈圓形,胞質(zhì)中含有大量的絲狀偽足,呈花瓣?duì)頪22];球形細(xì)胞靜止時(shí)呈球形,內(nèi)部均勻充滿了小球狀顆粒,大小不一;色素細(xì)胞的形狀各異,大小不一,呈黃色或棕色。在瘤背石磺體腔液中,3 類細(xì)胞的密度由多到少依次為球形細(xì)胞((6.17±0.14)×106cells/mL)、變形細(xì)胞((1.40±0.30)×105cells/mL)、色素細(xì)胞((7.00±0.40)×104cells/mL)(圖2)。

      圖1 瘤背石磺體腔液中不同類型體腔細(xì)胞的顯微形態(tài)(×40)Fig.1 The micro-morphology of different coelomocytes in coelomic fluid of Onchidium struma (×40)

      圖2 瘤背石磺體腔液中不同類型體腔細(xì)胞的密度Fig.2 Density of different coelomocytes in coelomic fluid of Onchidium struma

      3.2 瘤背石磺體腔液免疫相關(guān)酶活性分析

      無(wú)外源刺激下瘤背石磺體腔液中ACP、AKP、TAOC、SOD 和PO 均有活力,ACP、AKP、T-AOC、SOD 和PO 活性分別為(0.98±0.60)U/mL、(4.68±0.98)U/mL、(0.01±0)U/mL、(21.59±1.33)U/mL 和(180.34±2.85)U/mL,其中,PO 活性最高。

      3.3 瘤背石磺體腔細(xì)胞高通量測(cè)序與序列拼接

      瘤背石磺體腔細(xì)胞6 個(gè)文庫(kù)的序列統(tǒng)計(jì)見(jiàn)表1。原始序列過(guò)濾后,共獲得328 759 318 條原始測(cè)序數(shù)據(jù)和318 727 812 條過(guò)濾后數(shù)據(jù),過(guò)濾后數(shù)據(jù)比例為96%。在這些過(guò)濾后數(shù)據(jù)中,Q20 值為97.51%,Q30 值為92.91%,GC 含量為40.66%,這表明測(cè)序質(zhì)量較好,可用于后續(xù)分析。

      表1 瘤背石磺體腔細(xì)胞6 個(gè)文庫(kù)的序列統(tǒng)計(jì)Table 1 Statistics of transcriptomic sequences from six libraries formed from coelomocytes of Onchidium struma

      將來(lái)自6 個(gè)文庫(kù)的過(guò)濾后數(shù)據(jù)使用Trinity 軟件進(jìn)一步組裝得到63 097 個(gè)Unigenes,其平均長(zhǎng)度、最長(zhǎng)長(zhǎng)度和最短長(zhǎng)度分別為1 520 bp、29 277 bp 和301 bp。此外,過(guò)濾后數(shù)據(jù)被組裝成124 853 個(gè)轉(zhuǎn)錄本,它們的平均長(zhǎng)度、最長(zhǎng)長(zhǎng)度和最短長(zhǎng)度分別為1 974 bp、29 277 bp和301 bp(圖3)。瘤背石磺體腔細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本測(cè)序原始數(shù)據(jù)在NCBI 中的登錄號(hào)分別為:SRR6118632、SRR6118633、SRR6118634、SRR6118635、SRR6118636和SRR6118637。

      圖3 瘤背石磺體腔細(xì)胞Unigenes 和Transcript 長(zhǎng)度分布Fig.3 Length distribution of all Unigenes and Transcript from coelomocytes in Onchidium struma

      3.4 Unigenes 功能注釋與分類

      63 097 個(gè)Unigenes 在GO、KO、KOG、NR、NT、PFAM 和SwissProt 數(shù)據(jù)庫(kù)中成功注釋的比例分別為33.33%、11.5%、11.55%、30.64%、9.45%、33.33%和20.85%。

      在這些Unigenes 中,99%以上的Unigenes 與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中的注釋序列的相似性大于40%(圖4a),18.4%的Unigenes 的E值大于10-15(圖4b)。這些非重復(fù)序列基因比對(duì)分析表明,與瘤背石磺轉(zhuǎn)錄本具有最高相似度的是海蝸牛(Aplysia californica)(47.1%),其次是光滑雙臍螺(Biomphalaria glabrata)(27.8%)、棒絡(luò)新婦蜘蛛(Nephila clavipes)(3.1%)、仿刺參(1.7%)和青螺(Lottia gigantea)(1.4%)(圖4c)。

      圖4 瘤背石磺體腔細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中已知序列比對(duì)結(jié)果Fig.4 Comparison of transcriptomic sequences from coelomocytes in Onchidium struma with the known sequences from different species in database

      在GO 功能注釋中,21 036 個(gè)Unigenes 被注釋到3 個(gè)功能類別,分別為:分子功能、生物過(guò)程和細(xì)胞組成,并被進(jìn)一步注釋為55 個(gè)子類。在這3 大功能類別中,得到注釋最多的子類是細(xì)胞過(guò)程、結(jié)合、單生物過(guò)程、代謝過(guò)程、催化活性、細(xì)胞、細(xì)胞組分和膜(圖5)。

      圖5 瘤背石磺體腔細(xì)Unigenes 的GO 功能注釋Fig.5 Gene ontology (GO) functional annotation of Unigenes from coelomocytes in Onchidium struma

      COG 數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果顯示,共有7 294 個(gè)Unigenes 被注釋到26 個(gè)功能類別中(圖6)。其中,優(yōu)勢(shì)類群為:“一般功能預(yù)測(cè)” “信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制” “翻譯后修飾、蛋白質(zhì)折疊、分子伴侶” “未知功能” “轉(zhuǎn)錄、核糖體結(jié)構(gòu)和發(fā)生” “胞內(nèi)運(yùn)輸分泌和囊泡轉(zhuǎn)運(yùn)”和“轉(zhuǎn)錄”。在這些Unigenes 中,有302 個(gè)Unigenes 與“復(fù)制、復(fù)合、修復(fù)”和“防御機(jī)制”有關(guān)。

      圖6 瘤背石磺體腔細(xì)胞Unigenes 的COG 統(tǒng)計(jì)圖Fig.6 Cluster of orthologous group (COG) functional annotation of Unigenes from coelomocytes in Onchidium struma

      基于KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù),共有7 258 個(gè)Unigenes 被劃分為5 個(gè)類別:細(xì)胞過(guò)程、遺傳信息處理、環(huán)境信息處理、代謝和生物系統(tǒng),共涉及32 個(gè)KEGG 注釋分類,得到最多注釋的為“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)” “運(yùn)輸和分解代謝”“內(nèi)分泌系統(tǒng)” “翻譯” “折疊、分選和降解” “碳水化合物代謝” “消化系統(tǒng)” “細(xì)胞交流” “脂類代謝”和“免疫系統(tǒng)”,參與免疫系統(tǒng)的Unigenes 共有309 個(gè)(圖7)。

      圖7 瘤背石磺體腔細(xì)胞Unigenes 的KEGG 注釋分類Fig.7 KEGG annotation of the assembled Unigenes from coelomocytes in Onchidium struma

      4 討論

      國(guó)內(nèi)外對(duì)石磺科的研究起步較晚,目前的研究主要集中在繁殖生物學(xué)和生態(tài)學(xué)這兩個(gè)方面,而關(guān)于免疫學(xué)方面的研究甚少[23-24]。與其他海洋無(wú)脊椎動(dòng)物一樣,體腔液是瘤背石磺進(jìn)行病原防御的重要體液,其經(jīng)離心后大致可分為由各類體腔細(xì)胞組成的底部沉淀和由多種免疫相關(guān)酶、補(bǔ)體因子和凝集素等體液免疫因子組成的體腔上清液兩部分[25]。本研究中,我們觀察到了3 種不同類型的體腔細(xì)胞,分別是變形細(xì)胞、球形細(xì)胞和色素細(xì)胞,這與海參體腔液中體腔細(xì)胞組成相類似[21]。在十足目甲殼動(dòng)物和雙殼類軟體動(dòng)物中,已鑒定出3 種主要的血細(xì)胞類型,即透明細(xì)胞、半顆粒細(xì)胞和顆粒細(xì)胞[26-27]。其中,透明細(xì)胞多呈規(guī)則圓形,且胞內(nèi)不含顆粒,在海洋無(wú)脊椎動(dòng)物的大部分種類中均有發(fā)現(xiàn),包括香港牡蠣(Crassostrea hongkongensis)[28]、三角帆蚌(Hyriopsis cumingii Lea)[29]、西施舌(Coelomactra antiquata)、波紋巴非蛤(Paphia undulata)、雙線紫蛤(Sanguinolaria diphos)[30]和橄欖蟶蚌(Solenaia oleivora)[31]等,除此之外,有人在蝦夷馬糞海膽(Strongylocrntrotus intermedius)[32]和紫海膽(Anthocidaris crassispina)[33]中發(fā)現(xiàn)了一類無(wú)色球形細(xì)胞,其細(xì)胞特征與透明細(xì)胞基本類似,因此也可歸為一類細(xì)胞進(jìn)行命名劃分。San Miguel-Ruiz 和García-Arrarás[34]在褐石海參(Holothuria glaberrima)體壁上人工創(chuàng)傷進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)體壁創(chuàng)傷后,球形細(xì)胞和桑椹細(xì)胞的數(shù)量會(huì)逐漸增加,并且不斷遷移至傷口附近,重構(gòu)細(xì)胞基質(zhì),進(jìn)而促進(jìn)傷口愈合。色素細(xì)胞來(lái)源于外胚層中被稱為神經(jīng)嵴細(xì)胞的特化細(xì)胞,是兩棲動(dòng)物、魚(yú)類、爬行動(dòng)物、甲殼動(dòng)物和頭足綱動(dòng)物中含有生物色素的一類細(xì)胞[35]。色素細(xì)胞是調(diào)控動(dòng)物體色的關(guān)鍵,與生物生存和繁殖活動(dòng)密切相關(guān)[36]。在魚(yú)類中共報(bào)道6 種色素細(xì)胞,包括虹彩色素細(xì)胞、黃色素細(xì)胞、黑色素細(xì)胞、白色素細(xì)胞、紅色素細(xì)胞和藍(lán)色素細(xì)胞,但是色素細(xì)胞的組成因物種而異[37]。徐偉等[38]研究了幾種不同鯉鯽的鱗片色素細(xì)胞發(fā)現(xiàn),組成鱗片的色素細(xì)胞有4 種:紅色素細(xì)胞、黃色素細(xì)胞、黑色素細(xì)胞和鳥(niǎo)糞素細(xì)胞,鳥(niǎo)糞素細(xì)胞又可被分為虹彩色素細(xì)胞和白色素細(xì)胞。在瘤背石磺體內(nèi),我們觀察到了黃棕色的色素細(xì)胞,推測(cè)其可能類似于魚(yú)類中的黃色素細(xì)胞,使瘤背石磺外觀呈土黃色,便于其藏匿于灘涂中,具有一定的保護(hù)作用。目前,不同類型的體腔細(xì)胞在瘤背石磺免疫系統(tǒng)中的具體作用尚不清楚,有待深入研究。

      體腔液是低等水生動(dòng)物的重要體液之一,含有凝集素、溶血素、酶、類補(bǔ)體物質(zhì)等大量免疫因子[39]。酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的,對(duì)其底物具有高度特異性和高度催化效能的蛋白質(zhì)或RNA,是機(jī)體非特異性免疫的重要組成部分,動(dòng)物體內(nèi)酶水平可間接反應(yīng)機(jī)體免疫能力[40]。在健康瘤背石磺體腔液內(nèi),各種酶均保持活性,并發(fā)揮各自的作用來(lái)維持機(jī)體的穩(wěn)態(tài)。超氧陰離子()是好氧生物機(jī)體代謝過(guò)程中必不可少的物質(zhì),在正常狀態(tài)下,自由基的產(chǎn)生和消除維持著動(dòng)態(tài)平衡。當(dāng)機(jī)體受到外來(lái)病原如細(xì)菌、病毒侵害時(shí),機(jī)體會(huì)產(chǎn)生應(yīng)激反應(yīng)從而釋放大量活性氧,最終使機(jī)體發(fā)生細(xì)胞凋亡或壞死等損傷[41]。T-AOC、SOD 是機(jī)體重要的抗氧化酶,T-AOC 反映機(jī)體的總抗氧化能力;SOD 可以和過(guò)氧化氫酶(Catalase,CAT)協(xié)同作用,減少機(jī)體的氧化損傷[42]。PO 是一種重要的免疫相關(guān)酶,參與無(wú)脊椎動(dòng)物的體液免疫防御過(guò)程,與黑色素產(chǎn)生、細(xì)胞黏附、包裹和吞噬有關(guān)[43]。磷酸酶根據(jù)最適pH 的不同,分為堿性磷酸酶AKP 和酸性磷酸酶ACP,它們是溶酶體酶的重要組成部分,具有水解、清除、消化異物的作用,從而達(dá)到免疫防御;并與生物的DNA、RNA、脂質(zhì)和蛋白質(zhì)的代謝有關(guān),可以促進(jìn)機(jī)體生長(zhǎng)和提高免疫力[44-45]。在健康瘤背石磺體內(nèi),ACP 和AKP 以酶原的形式存在于體腔液中,ACP 的活性可以代表體腔液清除異物的能力[45]。本實(shí)驗(yàn)揭示,自然狀態(tài)下瘤背石磺體腔液中存在的多種抗氧化及免疫相關(guān)酶的活性,這不僅為進(jìn)一步檢測(cè)瘤背石磺在應(yīng)激狀態(tài)下的免疫應(yīng)答能力提供了對(duì)比,也為瘤背石磺抗氧化系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)的研究提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

      楊鐵柱[46]在2020 年利用RNA-Seq 技術(shù)篩選出與瘤背石磺歸巢行為相關(guān)聯(lián)的生物節(jié)律性和環(huán)境感知性基因,為探討瘤背石磺在潮間帶灘涂區(qū)域適應(yīng)性進(jìn)化提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。對(duì)于瘤背石磺而言,體腔細(xì)胞是其發(fā)揮非特異性免疫的重要載體,為了進(jìn)一步剖析瘤背石磺體腔細(xì)胞的免疫防御分子機(jī)制,本實(shí)驗(yàn)通過(guò)Illumina 平臺(tái)對(duì)瘤背石磺的體腔細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序與功能注釋,共獲得63 097 個(gè)Unigenes,數(shù)據(jù)含量大,基因信息豐富,可為未來(lái)瘤背石磺的研究奠定基礎(chǔ)。通過(guò)GO 功能注釋,有21 036 個(gè)Unigenes 被注釋到分子功能、生物過(guò)程和細(xì)胞組成3 個(gè)功能類別中,這與刺參體腔細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)高度相似[47]?;贜r 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比,海蝸牛與瘤背石磺序列同源性最高,與Oskars等[48]的報(bào)道相似,其次是光滑雙臍螺、棒絡(luò)新婦蜘蛛、刺參和青螺,分別屬于軟體動(dòng)物門(mén)、節(jié)肢動(dòng)物門(mén)和棘皮動(dòng)物門(mén),瘤背石磺與不同物種間的同源性也證明了其獨(dú)特的進(jìn)化地位。基于通路的分析有助于進(jìn)一步闡明基因的生物學(xué)功能和相互作用機(jī)制,KEGG注釋表明,這些Unigenes 參與了機(jī)體的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)翻譯、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換、免疫防御等各個(gè)過(guò)程,這將為進(jìn)一步篩選免疫相關(guān)基因和信號(hào)通路提供指引。

      5 結(jié)論

      瘤背石磺體腔液內(nèi)主要含有變形細(xì)胞、球形細(xì)胞和色素細(xì)胞3 種不同類型的體腔細(xì)胞,其中,球形細(xì)胞最多。此外,瘤背石磺的體腔液內(nèi)含有多種抗氧化酶和免疫相關(guān)酶,它們發(fā)揮著各自的作用,共同維護(hù)機(jī)體健康。RNA-Seq 測(cè)序表明,從瘤背石磺體腔細(xì)胞中共組裝出63 097 個(gè)Unigenes,這些Unigenes 被成功注釋到GO、COG 和KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù)中。如上結(jié)果為深入了解瘤背石磺進(jìn)化地位及其免疫系統(tǒng)奠定理論基礎(chǔ),為發(fā)展瘤背石磺人工養(yǎng)殖提供理論指導(dǎo)。

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