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      精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)背景下提升醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)臨床適用能力的教學(xué)探索

      2022-03-17 18:53:42熊建軍
      基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教育 2022年9期
      關(guān)鍵詞:遺傳學(xué)測序精準(zhǔn)

      江 和,牛 力,熊建軍

      (九江學(xué)院醫(yī)學(xué)院組織胚胎學(xué)與醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室, 九江 332000; △通訊作者)

      得益于近年來生命科學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,以二代基因測序、人工智能、大數(shù)據(jù)分析為代表的生物學(xué)前沿技術(shù)迅速浸入醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,由此催生不同于傳統(tǒng)診療模式的精準(zhǔn)醫(yī)療模式的出現(xiàn)。其主要特征在于海量的基因測序結(jié)果與患者臨床資料相結(jié)合,在分子水平對患者疾病進行分析,精確尋找發(fā)病原因和治療靶點,從而對不同遺傳背景的患者提出個性化的診斷和治療方案[1]。這一全新的醫(yī)療模式代表著臨床醫(yī)學(xué)的未來發(fā)展趨勢。

      目前,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)正在各級醫(yī)療機構(gòu)“自上而下”地推廣與應(yīng)用,但是臨床醫(yī)生對基因測序技術(shù)、生物信息學(xué)、大數(shù)據(jù)分析等基本技能尚缺乏深入掌握,因而對高校現(xiàn)有的醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)模式提出了新的需求和挑戰(zhàn)[2,3]。醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)主要在DNA水平研究疾病與基因的關(guān)系,既是醫(yī)學(xué)與生物學(xué)的交叉學(xué)科,也是基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床醫(yī)學(xué)相結(jié)合的橋梁學(xué)科,其理論和實踐與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)有著天然的契合度。經(jīng)典的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課堂教學(xué)重點包括單基因病的遺傳及單基因病介紹、染色體畸變及染色體病、群體遺傳學(xué)等,為臨床工作中遺傳病的診斷、治療、預(yù)防和咨詢發(fā)揮重要的作用。但在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)適用范圍不斷擴大的新形勢下,傳統(tǒng)的教學(xué)內(nèi)容與精準(zhǔn)醫(yī)療的培養(yǎng)需求存在脫節(jié),由此造成的弊端可能有:①學(xué)生工作后囿于傳統(tǒng)診療模式,看不懂基因測序結(jié)果或者不能有效甄別基因測序結(jié)果的準(zhǔn)確性;②鈍化了學(xué)生的科學(xué)思維敏感性,工作后可能忽略了對新發(fā)現(xiàn)基因型或表型的首創(chuàng)性研究[4]。

      為此,我們嘗試以醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程為切入點,在臨床醫(yī)學(xué)本科生教學(xué)中逐步引入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的內(nèi)容。目標(biāo)在于通過將部分精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識融入醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程,提高臨床本科生對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識的認(rèn)識、運用和掌握,提升其在臨床工作中對遺傳病的識別、診斷能力,并加強臨床工作中對遺傳病的基礎(chǔ)研究能力。

      1 實施對象

      實施對象為我校2021級五年制臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)部分學(xué)生,在第二學(xué)年第四學(xué)期學(xué)習(xí)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程,已修完人體解剖學(xué)、生理學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)等基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)課程。

      2 教學(xué)改革的內(nèi)容

      2.1 調(diào)整部分課堂教學(xué)內(nèi)容

      目前我校臨床專業(yè)本科生使用的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教材是人民衛(wèi)生出版社第七版。我們將其中的課堂講授內(nèi)容進行小范圍調(diào)整。例如,緒論部分第三節(jié)人類基因組內(nèi)容和第2章基因突變與遺傳多態(tài)性內(nèi)容已在生物化學(xué)與分子生物學(xué)課程中有所介紹,所以改為課前預(yù)習(xí)方式進行自主學(xué)習(xí);第4章單基因病的遺傳內(nèi)容與高中生物學(xué)內(nèi)容存在部分重疊,我們精簡其中的重復(fù)內(nèi)容,將原來4學(xué)時壓縮為2學(xué)時。通過對課堂教學(xué)內(nèi)容的小幅調(diào)整,在不改變總學(xué)時的條件下,既保持了必要的學(xué)習(xí)內(nèi)容和知識點,也空出少量課時用于教學(xué)改革嘗試。

      2.2 增加遺傳數(shù)據(jù)庫查詢實踐

      與第六版教材相比,第七版教材的亮點是增加了“基于疾病的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析”并作為第一章內(nèi)容以凸顯其重要性。臨床醫(yī)師熟知常用遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫的適用范圍,并且熟練掌握操作方法,將有助于遺傳病的精準(zhǔn)診斷、精準(zhǔn)治療和精準(zhǔn)預(yù)防。在教學(xué)改革之前,我們通常以課堂演示的方法介紹常見數(shù)據(jù)庫的使用,但是沒有安排學(xué)生實際動手操作環(huán)節(jié),導(dǎo)致課后印象不深,教學(xué)效果不佳。為強化對遺傳數(shù)據(jù)庫的使用能力,我們在課堂重點介紹OMIM、HGMD、Genecards三個數(shù)據(jù)庫的介紹。其中OMIM的使用,有助于學(xué)生查找某類遺傳病的臨床特征、致病基因、診斷治療、表型-基因型關(guān)系等信息[5];掌握HGMD和Genecards則有助于學(xué)生查找相關(guān)的突變數(shù)據(jù)和基因功能,為科研奠定基礎(chǔ)[6,7]。為此,我們不僅在課堂上介紹以上常用網(wǎng)站,并且增加課后實操練習(xí)內(nèi)容,指定遺傳病和相關(guān)基因讓學(xué)生進入數(shù)據(jù)庫動手查詢,并在下次課堂上公開講解查詢結(jié)果,有效地增強了教學(xué)效果,促進數(shù)據(jù)庫查詢功能的實際掌握。

      2.3 講授基因測序報告解讀方法

      精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)重要的特征之一就是基于基因測序的病因分析,因此需要臨床醫(yī)生(醫(yī)學(xué)生)了解基因測序的基本原理,選擇恰當(dāng)?shù)幕驒z測方法,準(zhǔn)確理解測序分析結(jié)果。全外顯子測序是目前較為成熟和流行的基因測序手段。為了增加醫(yī)學(xué)生的基因測序報告解讀能力,我們收集網(wǎng)絡(luò)上公開的深圳華大基因測序公司、上海天昊醫(yī)學(xué)檢驗實驗室、北京安琪爾基因公司等的基因測序報告進行兩個方面的講解。首先,教師講解來源于不同公司檢測報告的生成流程,包括遺傳數(shù)據(jù)庫的選擇、常用分析軟件的選擇、可疑位點的篩選標(biāo)準(zhǔn)等;其次,對報告內(nèi)容進行解構(gòu)分析,對基因名稱、基因變異類型、基因變異導(dǎo)致氨基酸改變類型、遺傳方式、變異位點致病性的證據(jù)(ACMG)進行解釋,并對結(jié)果進行討論。我們通過以上實例分析讓學(xué)生早期接觸基因測序報告,掌握解讀報告的技巧,增加基因分析的能力,可減少從業(yè)后的知識盲點。

      2.4 努力提高教師教學(xué)能力

      在醫(yī)學(xué)本科教育階段引入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的教學(xué)內(nèi)容,對授課教師的相關(guān)知識儲備和講解能力提出更高的要求。我們未雨綢繆、提前布局,采用請進來、走出去的方式,促進教師的綜合授課能力提升,包括選派優(yōu)秀教師前往美國耶魯大學(xué)遺傳學(xué)系短期進修,參加臨床醫(yī)師臨床遺傳學(xué)基礎(chǔ)知識與遺傳病遺傳咨詢培訓(xùn)班以及全國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)術(shù)年會,邀請校外專家來校進行學(xué)術(shù)講座等,積極向校外優(yōu)秀專家汲取豐富的臨床遺傳學(xué)知識等。通過一系列的進修措施,授課教師的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)理論與實踐能力得到顯著提升,達到課程改革規(guī)定的基本要求。

      2.5 逐步建立與基因測序公司的交流與合作

      基因測序公司的優(yōu)勢在于擁有數(shù)量眾多的測序樣本與強大的數(shù)據(jù)處理能力,但是臨床知識通常較為匱乏,對于復(fù)雜表型的候選基因也可能出現(xiàn)錯誤判斷。醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教師的優(yōu)勢在于扎實的基礎(chǔ)知識與臨床知識,但數(shù)據(jù)處理能力相對較弱。教研室與基因測序公司建立穩(wěn)定的交流與合作關(guān)系可增強理論與實踐的聯(lián)系,提高課堂教學(xué)水平。為此,我們與北京安琪爾基因醫(yī)學(xué)科技有限公司建立了長期合作關(guān)系,及時掌握基因測序技術(shù)的前沿動態(tài),并將相關(guān)知識以講座形式傳遞給學(xué)生,使學(xué)生快速更新精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的知識,促進理論與臨床的緊密聯(lián)合。此外,我們還利用測序公司豐富的報告資源,反復(fù)鍛煉學(xué)生的候選基因分析能力,提高其解決實際案例的水平,學(xué)以致用。

      3 結(jié)果與體會

      3.1 教學(xué)改革促進學(xué)生對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用的提前認(rèn)識

      盡管精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)概念早在2015年就已經(jīng)提出,但是我校臨床專業(yè)醫(yī)學(xué)生對這一概念仍然較為模糊,大部分學(xué)生認(rèn)為新一代基因測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析仍限于科學(xué)研究需要,尚沒有進入臨床的實用。實際上,以全外顯子測序為代表的二代測序已經(jīng)廣泛應(yīng)用于罕見疾病及復(fù)雜疾病的診斷,適用范圍也延伸至地區(qū)級、縣級醫(yī)院[8]。通過此次醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教學(xué)改革,臨床本科生提前接觸和掌握初級的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識,將有助于盡早建立精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)思維,積累遺傳學(xué)疾病知識,為進入臨床工作鋪墊基礎(chǔ)。

      3.2 教學(xué)改革增加學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣

      經(jīng)典的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)授課內(nèi)容較為抽像,部分內(nèi)容在高中生物課程中有過介紹,因此醫(yī)學(xué)生的課堂學(xué)習(xí)積極性不高。通過本次課程內(nèi)容的改革,授課教師反饋學(xué)生對課程學(xué)習(xí)的興趣顯著提升,參與課堂互動積極性增加。其主要原因可能為:基因測序、數(shù)據(jù)分析本身就代表著生命科學(xué)技術(shù)的前沿,是課本以外的全新知識,對學(xué)生有著強烈的吸引力;其次,數(shù)據(jù)庫的使用,增加了學(xué)生動手能力;最后,實例分析法與臨床診療相關(guān)聯(lián),學(xué)生參與其中的分析討論,容易產(chǎn)生成就感。最為明顯的例子是,部分學(xué)生積極主動要求參加課外科研活動,如大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽和“互聯(lián)網(wǎng)+”大賽等。

      3.3 課程評價系統(tǒng)有待優(yōu)化

      目前期末考試試題仍以第七版教材里的內(nèi)容為主要考點,考核形式仍以選擇題、填空題、簡答題和分析題為主。由于數(shù)據(jù)庫檢索和基因篩選的實操性未被列為紙質(zhì)考核內(nèi)容,我們無法以分?jǐn)?shù)準(zhǔn)確評價教學(xué)效果。結(jié)果顯示,期末考試成績在研究班和對照班之間的差異無統(tǒng)計學(xué)意義。這其中原因在于教學(xué)評價系統(tǒng)還不成熟,較難反映學(xué)生對知識系統(tǒng)掌握的程度,需要授課教師設(shè)計出新的符合教學(xué)改革要求的考核體系。

      4 展望

      精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是醫(yī)學(xué)模式最新的發(fā)展方向,為臨床醫(yī)學(xué)本科生培養(yǎng)工作帶來了新的機遇與挑戰(zhàn)。我們嘗試在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程中增加精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)相關(guān)的理論和實踐教學(xué)內(nèi)容,不但提升了學(xué)生對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)內(nèi)容重要性的認(rèn)識、掌握,同時也有助于建立正確的學(xué)習(xí)目標(biāo)和學(xué)習(xí)方法,是對醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程教學(xué)改革的一次有益的嘗試,以期培養(yǎng)出更適應(yīng)于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)要求的新時代醫(yī)學(xué)生。

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