余行,何奕松,傅玉川
四川大學(xué)華西醫(yī)院 放療科,四川 成都 610041
醫(yī)學(xué)影像是實(shí)現(xiàn)現(xiàn)代精確放療的基礎(chǔ)條件之一。為了得到可接受的劑量分布,放療醫(yī)生通常在CT圖像上直接或匹配MRI、PET-CT等影像聯(lián)合勾畫靶區(qū)及危及器官[1-2],然后由物理師或劑量師基于CT圖像設(shè)計(jì)治療計(jì)劃,其中的劑量計(jì)算基礎(chǔ)是電子密度與CT值的轉(zhuǎn)換關(guān)系[3-4]。CT值是與物質(zhì)吸收系數(shù)相關(guān)的相對(duì)值,其HU數(shù)值通常為-1000~3000。若將空氣的CT值設(shè)為-1000 HU,對(duì)于骨或者密度高于骨的組織或物體而言,其CT值可超過1000 HU。
常見的CT影像位深為12或16,對(duì)應(yīng)的灰階數(shù)可達(dá)4096或65536,而人眼可識(shí)別的灰階數(shù)不超過900[5]。因此當(dāng)使用CT影像進(jìn)行臨床診斷時(shí),需要調(diào)整其顯示模式,其中窗寬(Window Width,WW)/窗位(Window Level,WL)是CT圖像顯示的可調(diào)節(jié)屬性之一,優(yōu)化最佳WW/WL有助于疾病的診斷[6]。在勾畫放療相關(guān)的危及器官時(shí),對(duì)應(yīng)不同的身體部位或器官也有推薦的WW/WL,例如對(duì)肺進(jìn)行勾畫時(shí)使用肺窗(-1150~350 HU),對(duì)心臟進(jìn)行勾畫時(shí)使用縱隔窗(-160~240 HU)[7-8]。WW/WL的調(diào)節(jié)不僅提高了對(duì)比度,同時(shí)也可以排除無關(guān)組織及器官的影響。
由于CT圖像的成像受多種因素如CT裝置、管電壓、對(duì)比劑或重建等因素的影響,無論是傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)圖像處理算法,還是近年來興起的基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像處理方法[9],都需要將WW/WL調(diào)節(jié)作為重要的預(yù)處理步驟。WW/WL調(diào)節(jié)可分為固定WW/WL調(diào)節(jié)與非固定WW/WL調(diào)節(jié)。Huo等[10]研究表明使用固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)腹部CT圖像給予軟組織窗(160~240 HU)的轉(zhuǎn)換后能改善右腎及胃的分割結(jié)果。Lee等[11]研究表明通過自適應(yīng)WW/WL轉(zhuǎn)換能夠提高顱內(nèi)出血及結(jié)石的檢出率。通常而言,對(duì)于來自相同CT設(shè)備、具有相同重建核數(shù)及掃描參數(shù)的數(shù)據(jù)集,固定WW/WL轉(zhuǎn)換往往有較好且較穩(wěn)定的分割結(jié)果;而非固定WW/WL轉(zhuǎn)換常用于數(shù)據(jù)集來源不同或掃描條件不同等條件下的醫(yī)學(xué)圖像分割或醫(yī)學(xué)目標(biāo)檢測(cè),且可影響基于深度學(xué)習(xí)的圖像自動(dòng)分割結(jié)果或目標(biāo)檢測(cè)結(jié)果[10-12]。不同的非固定WW/WL轉(zhuǎn)換在特定情況下能夠改善圖像分割的結(jié)果,但尚未有研究探討常見的固定WW/WL對(duì)于自動(dòng)分割結(jié)果的影響。
本文以肺癌放療涉及的危及器官為例,利用公開數(shù)據(jù)集,通過對(duì)胸部影像CT進(jìn)行固定WW/WL的調(diào)節(jié)處理,探究臨床上常見的不同固定WW/WL對(duì)于肺癌放療中基于深度學(xué)習(xí)的危及器官自動(dòng)勾畫結(jié)果的影響,同時(shí)驗(yàn)證圖像預(yù)處理對(duì)于影像自動(dòng)分割的作用。
該研究中使用的數(shù)據(jù)集來源于2017年肺癌分割比賽的公開數(shù)據(jù)集[13],危及器官包括心臟、食管、脊髓、左肺和右肺。公開數(shù)據(jù)集中共60例CT數(shù)據(jù),分別來自3個(gè)不同的癌癥中心,每個(gè)中心20例。所有的CT掃描均包括整個(gè)胸部,層數(shù)為103~279,CT重建矩陣為512×512,層厚為1.25~3.0 mm,像素大小為0.98~1.37 mm。
WW/WL作為CT影像顯示的可調(diào)節(jié)屬性,能夠幫助醫(yī)生獲得更為清晰的CT影像。根據(jù)不同的WW/WL值,CT影像被相應(yīng)地轉(zhuǎn)為灰度圖像,灰度值為0~255,0為黑色,255為白色。本研究中,CT圖像與灰度圖像的轉(zhuǎn)換方法如式(1)所示。
假設(shè)CT圖像中一個(gè)像素的CT值為f(i),g(i)為經(jīng)過WW/WL調(diào)節(jié)后的像素值,其中m=WL-0.5WW,n=WL+0.5WW。WW/WL的調(diào)節(jié)方法如圖1所示。
圖1 WW/WL調(diào)節(jié)的示意圖
為了評(píng)估不同固定WW/WL對(duì)于圖像自動(dòng)分割效果的影響,在訓(xùn)練前首先對(duì)圖像進(jìn)行WW/WL調(diào)節(jié),選取了5種不同的WW/WL,其中4種為臨床上常見的預(yù)設(shè)WW/WL[14],包括軟組織窗(-140~260 HU)、縱隔窗(-160~240 HU)、骨窗(-450~1050 HU)、肺窗(-1150~250 HU),另外一種為全WW/WL(Whole Intensity Range,WIR),其轉(zhuǎn)換示意圖如圖2所示。本研究選取2D-Unet[15]作為深度學(xué)習(xí)的網(wǎng)絡(luò)框架,同時(shí)隨機(jī)選取數(shù)據(jù)集中的48例作為訓(xùn)練和驗(yàn)證集,余下12例作為測(cè)試集。在訓(xùn)練與測(cè)試時(shí)均對(duì)數(shù)據(jù)集進(jìn)行相同的WW/WL調(diào)節(jié)處理。除了WW/WL調(diào)節(jié)外,其他處理操作都相同。同時(shí),為了排除其他誤差,本研究未使用數(shù)據(jù)擴(kuò)增、遷移學(xué)習(xí)等其他提高分割效果的措施。該網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練在GeForce RTX 3090上進(jìn)行,使用Pytorch 1.8.1和Python 3.8進(jìn)行訓(xùn)練,訓(xùn)練損失函數(shù)為Dice損失函數(shù),圖像大小為512×512,epochs為60,batch size為8,學(xué)習(xí)率為0.0001。實(shí)驗(yàn)的總體方法如圖3所示。
圖2 同一層面不同的WW/WL調(diào)節(jié)示意圖
圖3 實(shí)驗(yàn)流程圖
1.4.1 Dice相似性系數(shù)
Dice相似性系數(shù)(Dice Similarity Coefficient,DSC)是醫(yī)學(xué)圖像分割中常用的指標(biāo),其計(jì)算公式如式(2)所示。
其中|A|代表醫(yī)生勾畫的分割區(qū)域,|B|代表自動(dòng)分割區(qū)域,|A∩B|代表A和B的交集。DSC的數(shù)值介于0~1之間,其中1表示圖像之間完全重疊,0表示完全沒有重疊,數(shù)值越高代表分割效果越好。
1.4.2 Hausdorff距離
對(duì)于兩個(gè)給定的集合A和B,最大Hausdorff距離(Hausdorff Distance,HD)定義如式(3)~(4)所示。
其中||a-b||是歐幾里得距離,a和b分別是A和B邊緣上的點(diǎn),同時(shí)h(A,B)通常被稱為直接HD。
95% HD與最大HD相似,但95%HD基于A和B中邊界點(diǎn)之間距離的第95個(gè)百分位的計(jì)算,其目的在于消除極端點(diǎn)對(duì)于分割結(jié)果的影響。
利用不同固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)肺癌危及器官進(jìn)行自動(dòng)分割的結(jié)果如表1和圖4~5所示。就心臟而言,其最佳分割DSC值為軟組織窗(0.895±0.055),食管的分割DSC在縱隔窗表現(xiàn)最好(0.802±0.044);左肺在肺窗DSC值(0.941±0.024)表現(xiàn)最好,右肺在骨窗DSC值(0.956±0.019)表現(xiàn)最好,脊髓在WIR下分割DSC值結(jié)果(0.908±0.025)最好。
表1 不同WW/WL調(diào)節(jié)下危及器官的分割結(jié)果
圖4 不同WW/WL調(diào)節(jié)下的分割結(jié)果對(duì)比
圖5 不同危及器官在不同WW/WL下的DSC值分割對(duì)比
就左、右肺及脊髓在不同WW/WL下的DSC分割結(jié)果而言,不同WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)于其分割結(jié)果無顯著影響(P=0.057、0.090、0.894),如表2~3所示。對(duì)于食管和心臟而言,不同WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)于其分割結(jié)果有顯著影響(P<0.001)。
脊髓在不同WW/WL調(diào)節(jié)下的分割結(jié)果無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.116);左肺、右肺、食管及心臟在不同WW/WL下的分割結(jié)果均有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.005、0.001、<0.001、0.007),結(jié)果如表2、表4所示。
表2 不同WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)危及器官勾畫影響的P值
表3 不同WW/WL對(duì)食管和心臟勾畫結(jié)果DSC的影響
表4 不同WW/WL對(duì)左右肺、食管和心臟勾畫結(jié)果95%HD的影響
本研究首次利用了五種常見的固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)肺癌的危及器官進(jìn)行了自動(dòng)勾畫并就不同的固定WW/WL轉(zhuǎn)換后的分割結(jié)果進(jìn)行了對(duì)比,發(fā)現(xiàn)心臟的最佳分割DSC值出現(xiàn)在軟組織窗,食管的最佳DSC值出現(xiàn)在縱隔窗,左肺最佳分割DSC值出現(xiàn)在肺窗,右肺最佳DSC值出現(xiàn)在骨窗,脊髓的最佳分割DSC值出現(xiàn)在WIR。
CT影像的WW/WL調(diào)節(jié)不僅常應(yīng)用于臨床診斷,也應(yīng)用于放療的靶區(qū)及危及器官勾畫。在RTOG-116號(hào)報(bào)告中,推薦在肺窗條件下勾畫危及器官肺,在縱隔窗條件下勾畫心臟。近年來,深度學(xué)習(xí)被廣泛應(yīng)用于放療靶區(qū)及危及器官的自動(dòng)勾畫,而固定WW/WL調(diào)節(jié)也成為網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練前對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理的重要步驟,因此,有必要探討臨床上常見的固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)放療危及器官自動(dòng)勾畫的影響。本研究表明,對(duì)于脊髓而言,不同的WW/WL調(diào)節(jié)無論對(duì)DSC還是95%HD,均無明顯影響。但對(duì)肺而言,WW/WL的調(diào)整有利于降低勾畫偏離較大的現(xiàn)象。對(duì)于食管和心臟而言,不同的WW/WL對(duì)其勾畫結(jié)果影響較大,但其最佳WW/WL調(diào)節(jié)與臨床上推薦使用的WW/WL調(diào)節(jié)基本一致。
對(duì)于肺癌危及器官中的大部分器官如左右肺、食管及心臟而言,利用WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理大多能得到優(yōu)于不進(jìn)行預(yù)處理的結(jié)果。而作為醫(yī)學(xué)圖像處理任務(wù)中預(yù)處理的重要步驟或影像診斷中的重要步驟,除了常規(guī)對(duì)WW/WL進(jìn)行固定調(diào)節(jié)外,有不少的研究也就非固定WW/WL進(jìn)行了研究。Sundaran等[16]利用深度學(xué)習(xí)的方法消除MRI背景中的無關(guān)像素從而尋找一個(gè)最佳的WW/WL。Hoogi等[12]利用自適應(yīng)局部窗口對(duì)CT和MRI上的肝臟病變進(jìn)行了分割并取得了較好的分割結(jié)果。由于不同掃描機(jī)器、不同醫(yī)療機(jī)構(gòu)掃描程序、不同個(gè)體之間的差異,最佳WW/WL并不固定,因此非固定WW/WL調(diào)節(jié)的應(yīng)用能夠提高分割結(jié)果的泛化性。但是這并不意味著非固定WW/WL調(diào)節(jié)是優(yōu)于固定WW/WL調(diào)節(jié)的,Huo等的研究結(jié)果表明對(duì)于來自相同CT設(shè)備、具有相同重建核數(shù)及掃描參數(shù)的數(shù)據(jù)集而言,固定WW/WL調(diào)節(jié)反而具有較好的分割結(jié)果[10]。如何將固定WW/WL調(diào)節(jié)和適應(yīng)性調(diào)節(jié)結(jié)合起來得到最優(yōu)化的圖像處理結(jié)果,仍是今后需要進(jìn)一步探討的課題。
由于本研究的目的是探究不同固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)于危及器官自動(dòng)分割結(jié)果的影響,而不是追求最佳分割結(jié)果,因此只選擇了最簡單的2D-Unet網(wǎng)絡(luò)作為自動(dòng)分割工具。另外,本文只就肺癌的危及器官分割進(jìn)行了研究,并未涉及頭頸、腹部及盆腔的危及器官,未來還需要就其他部位的危及器官進(jìn)行深入研究。
不同固定WW/WL調(diào)節(jié)對(duì)不同危及器官的影響不同,在進(jìn)行自動(dòng)分割時(shí)應(yīng)選取合適的WW/WL值,可大致參考臨床推薦WW/WL值。