曹 丹,呂京澴,陳汝蕾
(南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院,蘇州市立醫(yī)院病理科,江蘇 蘇州 215002)
隨著甲狀腺結(jié)節(jié)發(fā)病率的提高,除了超聲檢查外,多項研究表明,細(xì)針穿刺細(xì)胞學(xué)(fineneedle aspiration cytology, FNAC)聯(lián)合BRAFV600E檢測可以提高術(shù)前甲狀腺良惡性結(jié)節(jié)的診斷率[1-2],并且BRAFV600E突變狀態(tài)對甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)的治療及預(yù)后的評估具有重要的指導(dǎo)意義[3],它的特異性高達(dá)95.5%~100.0%[4-5],但是敏感性較低,僅有40%~56%[6-7],且存在一定比例的假陰性率,主要是由于細(xì)針穿刺的局限性,用于檢測的腫瘤細(xì)胞含量不足引起。根據(jù)FNA指南,由于不同的檢查需要,通常每個結(jié)節(jié)會穿刺2~3 次,細(xì)胞學(xué)樣本置于細(xì)胞保存液中,基因檢測樣本保存于細(xì)胞裂解液中。而實際操作中,每一次穿刺得到的細(xì)胞量并不是平均的,分別用于細(xì)胞學(xué)和基因檢測的樣本量也會不同,有時會出現(xiàn)液基涂片腫瘤細(xì)胞豐富,但用于基因檢測的細(xì)胞量不足,或者細(xì)胞總量雖然夠,但腫瘤細(xì)胞比例少,含大量的非腫瘤細(xì)胞,如正常濾泡上皮細(xì)胞和淋巴細(xì)胞等,因此出現(xiàn)細(xì)胞學(xué)診斷明確為PTC,而BRAFV600E結(jié)果模棱兩可的現(xiàn)象。本文對工作中遇到的這類液基涂片細(xì)胞進(jìn)行回收,再次擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)PCR(amplification refractory mutation system PCR, ARMS-PCR),分析BRAFV600E突變情況,并將術(shù)后病例的組織學(xué)類型歸納總結(jié)。
1.1 標(biāo)本來源 收集我科2021年1月—8月的樣本庫中經(jīng)兩名醫(yī)生按照甲狀腺Bethesda標(biāo)準(zhǔn)診斷為PTC的液基涂片18 例,每張片子上至少有6簇及以上的細(xì)胞團(tuán),同時18 例標(biāo)本的BRAFV600E的擴(kuò)增曲線高于基線,但沒有呈完整的S型,按照診斷標(biāo)準(zhǔn)陽性診斷依據(jù)不足。
1.2 主要試劑儀器 二甲苯、無水乙醇購于國藥集團(tuán), DNA提取試劑盒、人類BRAFV600E突變檢測試劑盒購于廈門艾德醫(yī)藥科技有限公司,水浴鍋購于上海精宏實驗設(shè)備有限公司,離心機(jī)和紫外分光光度計購于賽默飛世爾科技有限公司,PCR儀購自羅氏公司。
1.3 液基涂片細(xì)胞再回收 將所選液基片子通過數(shù)字掃描技術(shù)形成數(shù)字切片并儲存,把其置于烤片機(jī)上5 min,直至樹膠變軟融化,揭掉蓋玻片迅速置于二甲苯中10 min,再將其轉(zhuǎn)移至無水乙醇中10 min后取出,將組織吹干,在1.5 mL離心管中加入180 μL細(xì)胞裂解液,用移液器吸取30 μL滴加到涂片的細(xì)胞區(qū)域,在濕潤狀態(tài)下用一次性手術(shù)刀片將組織刮下,并用少量裂解液將剩下的細(xì)胞沖洗于離心管中,隨后按照核酸提取試劑說明書進(jìn)行DNA提取。
1.4 檢測DNA的濃度與純度 紫外分光光度計測量260 nm(A260)和280 nm(A280)的吸光度值,得到DNA濃度和純度,當(dāng)A260/A280為(1.8±0.1)時,說明提取的總DNA純度合格,隨后對樣本進(jìn)行定量,濃度大于5 ng/μL者,稀釋至1 ng/μL,濃度低于5 ng/μL者,原液上機(jī)。
1.5 ARMS法檢測BRAFV600E的突變情況 按照說明書配制反應(yīng)混合液,設(shè)立陰性對照(negative control,NC)和陽性對照(positive control, PC),使用ARMS法對所提取DNA的BRAFV600E突變狀態(tài)進(jìn)行檢測,反應(yīng)結(jié)束后將閾值線調(diào)節(jié)至擴(kuò)增曲線升起的拐點處,得到突變FAM信號和內(nèi)控VIC信號的循環(huán)閾值(cycle threshold, Ct)。首先分析NC和PC結(jié)果是否符合實驗要求,再對待測樣品內(nèi)控進(jìn)行評估,確定實驗結(jié)果成功可信,最后研究樣本的FAM信號,若突變檢測管的擴(kuò)增曲線呈S型且Ct值<30,則為突變陽性,BRAFV600E為突變型。若樣品的FAM曲線不呈S型或Ct值≥30,則為陰性,稱為BRAFV600E野生型。
1.6 HE染色 對術(shù)后標(biāo)本進(jìn)行常規(guī)HE染色,顯微鏡下觀察組織學(xué)類型。
1.7 統(tǒng)計學(xué)分析 應(yīng)用SPSS 22.0統(tǒng)計軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,兩組比較采用t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 D N A的濃度和純度 對照組的濃度為(10.737±8.158)ng/μL,實驗組的DNA濃度為(7.471±4.058)ng/μL,兩者差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。此外,兩者純度分別為(1.815±0.076)和(1.848±0.064),均為合格,差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
2.2 BRAFV600E突變狀態(tài) 圖1為對照組,選取了1 例典型樣本的擴(kuò)增曲線圖,圖2為實驗組,包含全部18 例樣本的擴(kuò)增曲線。兩組NC均為陰性曲線,說明實驗過程沒有受到污染,PC的曲線正常升起,表明試劑有效。再對兩組的待測樣本的內(nèi)控信號(VIC信號)進(jìn)行分析,結(jié)果見表1,對照組Ct值為(14.267±1.040),實驗組Ct值為(13.807±0.819),兩者差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),均在實驗要求的13~21之間,說明兩組加入的總DNA量符合實驗要求,實驗成功。最后對兩組的突變反應(yīng)管進(jìn)行分析,對照組樣本擴(kuò)增曲線高于基線,但升起時間較晚,不呈完整的S型,不符合陽性診斷標(biāo)準(zhǔn),但也不能輕易判讀為陰性。實驗組結(jié)果顯示:18 例樣本均有平滑的上升S型曲線,與基線的交叉點在30 個循環(huán)以下,Ct值為(18.194±1.980),具體見表1(FAM信號),我們將其判讀為陽性,即為BRAFV600E突變型。
表1 各組反應(yīng)管在FAM和VIC信號下的Ct值
圖1 對照組FAM信號下的BRAFV600E擴(kuò)增曲線
圖2 實驗組FAM信號下的BRAFV600E擴(kuò)增曲線
2.3 組織學(xué)結(jié)果 以術(shù)后組織病理診斷結(jié)果作為金標(biāo)準(zhǔn),18 例均確診為PTC,見圖3、圖4。
圖3 腫瘤呈乳頭狀結(jié)構(gòu),可見纖維血管軸心及砂粒體(HE×100)
圖4 細(xì)胞核呈毛玻璃樣,部分細(xì)胞可見核溝(HE×100)
甲狀腺腫瘤近年來的發(fā)病率顯著提高,其中PTC是甲狀腺癌最常見的病理類型,占85%~95%[8],但其預(yù)后較好,所以早診斷早治療也顯得尤為重要。FNAC是術(shù)前鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的重要方法,具有創(chuàng)傷小、準(zhǔn)確性高等優(yōu)點,但其中仍有10%~40%的結(jié)節(jié)無法明確性質(zhì)[9],2015年美國甲狀腺協(xié)會(ATA)指南推薦使用分子標(biāo)志物來進(jìn)一步診斷[10],其中BRAFV600E是PTC的特異性分子標(biāo)記物。BRAFV600E突變激活RAS-RAF-MEKERK信號通路引起細(xì)胞的惡性增殖,最終導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生[11]。已有多項研究[12-13]表明BRAFV600E基因突變與腫瘤大小、被膜外侵犯及頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),提示其突變是PTC復(fù)發(fā)的獨(dú)立危險因素。本文用ARMS法檢測BRAFV600E的突變狀態(tài),DNA分別提取自細(xì)胞裂解液(對照組)和已經(jīng)制片的液基涂片(實驗組),結(jié)果顯示實驗組濃度低于對照組,可能由于實驗組的細(xì)胞來自于再提取,從液基細(xì)胞制片過程到再提取操作,都會損失部分細(xì)胞,而對照組是直接從細(xì)胞裂解液中提取,幾乎沒有損失,但兩組差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),并且兩組內(nèi)控均合格,說明實驗組雖然濃度低,但加入PCR反應(yīng)體系的DNA總量是夠的。PCR結(jié)果顯示實驗組中18 例均為BRAFV600E陽性,我們認(rèn)為與對照組相比,實驗組的陽性率顯著提高的原因是由于提取的是總DNA,雖然對照組濃度更高,但可能其中正常細(xì)胞較多,腫瘤細(xì)胞比例少,低于ARMS法能檢測出的最低1%突變的標(biāo)準(zhǔn),造成BRAFV600E結(jié)果的不明確,而實驗組再提取直觀地選取了有豐富腫瘤細(xì)胞數(shù)量的標(biāo)本,相當(dāng)于事先對腫瘤細(xì)胞量進(jìn)行了評估,所以陽性率大大提高,最后組織學(xué)結(jié)果也證實了我們的術(shù)前診斷。
雖然從液基涂片中再提取DNA進(jìn)行BRAFV600E檢測的應(yīng)用價值得到了證實,但是此項操作還有一些方面需要我們進(jìn)一步討論。
液基涂片上的腫瘤細(xì)胞數(shù)量是決定實驗成敗的關(guān)鍵,因為操作過程不可避免地會損失部分細(xì)胞,所以需要選取有豐富濾泡細(xì)胞團(tuán)的涂片,如果原本涂片上腫瘤細(xì)胞也很少,本文所述方法的應(yīng)用就會受到限制。
涂片回收過程中多次使用到乙醇,乙醇作為固定劑能夠快速穿透細(xì)胞,凝固核蛋白,并且不改變DNA的一級結(jié)構(gòu),可用于分子生物學(xué)技術(shù)[14],為我們回收DNA提供了理論基礎(chǔ)。在脫蠟過程中,用乙醇置換二甲苯,這時候乙醇要揮發(fā)干凈,因為它的殘留不僅會影響蛋白酶K的活性,降低DNA提取效率,還會使維持DNA雙螺旋穩(wěn)定性的氫鍵斷裂,破壞堿基間的堆積力,引起DNA變性,產(chǎn)生一定量的單鏈DNA,使得A260處的吸光度增加,這也許是實驗組的A260/A280比對照組稍大的原因。但是乙醇揮發(fā)時間長,又容易使得DNA暴露在空氣中過久,引起為數(shù)不多的DNA降解,所以這個組織吹干時間的長短是我們需要把握好的。
據(jù)報道[15],染色劑與DNA結(jié)合,會抑制Taq酶的活性,表現(xiàn)為樣本內(nèi)控Ct值升高,也有報道[16]認(rèn)為DNA提取用的硅膠模吸附柱有濾過純化作用,可以最大限度地除去染色劑分子,本文結(jié)果顯示巴氏染色后的實驗組內(nèi)控均在要求的范圍內(nèi),但我們未與未染色組進(jìn)行比較,后續(xù)會進(jìn)步一研究證實。
我們一般從濃度、純度和完整性三個方面對DNA質(zhì)量進(jìn)行評估,細(xì)胞經(jīng)過液基制片以及再提取過程,是否會引起DNA的片段化,本文基于研究側(cè)重點,主要關(guān)注BRAFV600E突變狀態(tài)的變化,后續(xù)也會對DNA的完整性進(jìn)一步探討。
本實驗需要先得到細(xì)胞學(xué)結(jié)果,再進(jìn)行BRAFV600E的檢測,延長了發(fā)報告的時間,同時這也限制了此方法的常規(guī)應(yīng)用。
從液基涂片中重新提取D N A再次進(jìn)行BRAFV600E檢測在實際應(yīng)用有一定的局限性,那是否還有其他來源的標(biāo)本可以替代呢?根據(jù)文獻(xiàn)報道[17],BRAFV600E檢測標(biāo)本還可以來自于液基保存液中的剩余標(biāo)本,它有一定的優(yōu)勢,比如細(xì)胞學(xué)與分子病理報告使用同一份標(biāo)本,結(jié)果更加客觀,對病人來說可以少穿刺一針,降低穿刺過程的痛苦和風(fēng)險。但是在細(xì)胞量少時,由于大部分樣本已用于液基制片,剩余樣本中的組織量會很少,并且當(dāng)涂片制作不滿意,需要再次制片時,會面臨無標(biāo)本可用的情況,因此我們不將其作為常規(guī)基因檢測標(biāo)本使用。在遇到本文所述的情況需要重新檢測時,仍然不考慮用其作為標(biāo)本來源,其一是因為相比較于直接從涂片上獲取細(xì)胞,我們無法對保存液中的腫瘤細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行直觀的評估,其二樣本中細(xì)胞由于未經(jīng)過巴氏染色,均為透明狀,在進(jìn)行離心的操作中,肉眼看不到細(xì)胞沉淀,會誤吸導(dǎo)致?lián)p失大量細(xì)胞。標(biāo)本還可以來源于細(xì)胞蠟塊[18],一般留存液基所需的標(biāo)本量后,其余收集做成細(xì)胞蠟塊,這樣除了基因檢測以外,還可以連續(xù)切片進(jìn)行免疫組化,大大拓展了術(shù)前診斷的內(nèi)容。這項技術(shù)在胸腹水、痰等標(biāo)本中已經(jīng)廣泛應(yīng)用,但是前提仍然是需要大量的細(xì)胞,而目前我們甲狀腺的細(xì)針穿刺標(biāo)本經(jīng)過離心后,幾乎得不到細(xì)胞沉淀物,還不能滿足此項目的常規(guī)使用,需要穿刺醫(yī)生積累經(jīng)驗,精準(zhǔn)穿刺。還有報道[19]使用穿刺洗脫液進(jìn)行基因檢測,穿刺洗脫液用于甲狀腺球蛋白含量的測定已經(jīng)得到了廣泛應(yīng)用,但是在基因檢測方面,由于其得到的腫瘤細(xì)胞量非常少,所以其實際應(yīng)用價值仍待研究。
綜上所述,當(dāng)我們常規(guī)進(jìn)行BRAFV600E檢測時,遇到腫瘤細(xì)胞含量特別少,導(dǎo)致檢測結(jié)果出現(xiàn)模棱兩可的情況,而這份病例對應(yīng)的液基涂片又細(xì)胞含量豐富,那么從中再提取DNA重新進(jìn)行一次基因檢測不失為提高術(shù)前診斷結(jié)果準(zhǔn)確率的好方法。由于本文所述的情況較為特殊,我們還沒有收集到更多的病例,后續(xù)會擴(kuò)大樣本量,優(yōu)化實驗條件,繼續(xù)探討。