武紹龍, 唐 明, 張習(xí)敏, 唐 婧*
( 1. 貴州師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院, 貴陽 550025; 2. 貴州師范大學(xué), 貴州省植物生理與發(fā)育調(diào)控重點實驗室, 貴陽 550025; 3. 貴州師范大學(xué), 國家林業(yè)和草原局西南喀斯特山地生物多樣性保護重點實驗室, 貴陽 550025 )
馬纓杜鵑()屬于常綠灌木或小喬木,因其花色鮮艷,形狀酷似馬頭飾的瓔珞而得名,主要分布于西南地區(qū),包括四川西南部、云南全省和貴州西北部等(張長芹等,2015),其中貴州西北部以普底和金坡景區(qū)分布最為廣泛,為主要的建群種和優(yōu)勢種(李葦潔和陳訓(xùn),2005)。每年3月中旬前完成初花期(花瓣開始開張到10%花序開放);3月下旬到4月初進入為盛開期(10%花序開放到10%花序出現(xiàn)凋謝);4月中旬進入凋謝期(10%花序出現(xiàn)凋謝到70%花序出現(xiàn)凋謝),馬纓杜鵑整個花期為25~30 d。研究馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中的代謝組分變化,對延長和調(diào)節(jié)馬纓杜鵑花期,充分發(fā)揮馬纓杜鵑的觀賞價值和經(jīng)濟價值,對貴州省地方經(jīng)濟以及鄉(xiāng)村振興具有極其重要的研究意義。目前,關(guān)于馬纓杜鵑花主要包括花特征和花粉性狀的研究,以百里杜鵑保護區(qū)馬纓杜鵑為實驗材料研究花特征分化和資源分布情況(胡德美 等,2021);用顯微鏡觀察馬纓杜鵑花粉形態(tài)大小、外壁紋飾、孔溝形態(tài)等性狀(毛加寧,2000)。同時,在馬纓杜鵑花花期調(diào)控的研究則主要集中于營養(yǎng)元素、植物激素和溫度等處理方法,包括用不同濃度的N、P、K、Ca等營養(yǎng)元素處理馬纓杜鵑觀察對花芽發(fā)育和花期的影響(洪鯤等,2010);在馬纓杜鵑花芽發(fā)育初期和開花前期噴施外源激素對始花期、盛開期、末花期和開花數(shù)的影響(宋慶發(fā)等,2010);通過不同濃度的生長調(diào)節(jié)物質(zhì)及礦物質(zhì)營養(yǎng)處理馬纓杜鵑的花蕾,探索馬纓杜鵑花花期調(diào)控方法(岳保超,2015)。目前,僅有少量關(guān)于馬纓杜鵑莖和根代謝物的研究報道,利用各種色譜技術(shù)從馬纓杜鵑的莖分離鑒定得到10種化合物(徐金金等,2012),然而馬纓杜鵑花的發(fā)育進程中代謝物和代謝物途徑研究尚未見相關(guān)報道。
近年來,植物代謝組學(xué)研究已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用于分析果樹生長、發(fā)育、果實成熟過程中的代謝物變化(Aaron et al., 2008;Zhang et al., 2011;Li et al., 2020),目前也開始應(yīng)用于研究植物花形成、發(fā)育的代謝機制研究(賈巖等,2017;程少禹 等,2020);薛水玉等(2012)采用氣相色譜-質(zhì)譜法技術(shù)分析款冬花不同發(fā)育階段代謝組,發(fā)現(xiàn)款冬花蕾發(fā)育過程中部分特征代謝物呈現(xiàn)顯著變化;He等(2020)利用轉(zhuǎn)錄組和代謝組研究鐵皮石斛花的發(fā)育機制,發(fā)現(xiàn)次生代謝和碳水化合物的變化與花的發(fā)育有關(guān);徐紅霞等(2020)采用GC-MS技術(shù)檢測枇杷花發(fā)育進程中的代謝物質(zhì),揭示影響花發(fā)育進程的生理與代謝機制。代謝組學(xué)對植物花的發(fā)育代謝產(chǎn)物及代謝通路研究提供了方法。
本研究以貴州省畢節(jié)市大方縣百里杜鵑風景區(qū)為研究區(qū)域,以馬纓杜鵑花為研究對象。選取花苞期、開裂期、傳粉期、盛開期、衰老期和凋謝期的花為材料,采用非靶向代謝組學(xué)(LC-MS/MS)分析方法,研究馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中6個階段的代謝產(chǎn)物及代謝通路,擬探討以下問題:(1)馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中不同階段代謝物如何變化;(2)分析馬纓杜鵑花差異顯著的代謝物和相關(guān)的代謝通路;(3)篩選出與馬纓杜鵑花發(fā)育相關(guān)的重要代謝物。本研究結(jié)果為馬纓杜鵑花花期調(diào)控提供理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。
實驗材料為貴州省畢節(jié)市大方縣百里杜鵑風景區(qū)馬纓杜鵑。
2020年選取長勢基本一致馬纓杜鵑,分別在花苞期(3月20日)、開裂期(3月24日)、傳粉期(3月30日)、盛開期(4月3日)、衰老期(4月10日)、凋謝期(4月15日),從6株樹上采集適量馬纓杜鵑花樣本,經(jīng)液氮冷凍后運回實驗室進行代謝組學(xué)檢測,每個時期取6個生物學(xué)重復(fù)樣本。
基于液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS/MS)技術(shù)(Warwick et al., 2011;Want et al., 2010)進行非靶向代謝組學(xué)研究。取100 mg液氮研磨的馬纓杜鵑花樣本,置于EP管中,加入500 μL含0.1%甲酸的80%甲醇水溶液,渦旋震蕩,冰浴靜置5 min,15 000 r·min、4 ℃離心10 min,取100 μL的上清加超純?nèi)ルx子水稀釋至甲醇含量為53%,并置于離心管中15 000、4 ℃離心10 min,收集上清液,進樣LC-MS/MS進行檢測分析。
從每個實驗樣本中取等體積樣本混勻作為(quality control)QC樣本??瞻讟颖緸楹?.1%甲酸的53%甲醇水溶液代替實驗樣本,前處理過程與實驗樣本相同。
采用Thermo Hyperil Gold column色譜柱(C18),柱溫40 ℃,流速0.2 mL·min。正離子模式:流動相A為0.1%甲酸,流動相B為甲醇;負離子模式:流動相A為5mmol醋酸銨(pH 9.0),流動相B為甲醇;梯度洗脫(0 ~ 1.5 min,98%A,2%B;1.5 ~ 12 min,100%B;12 ~ 14 min,100%B;14 ~ 14.1 min,98%A,2%B;14.1 ~ 17.0 min,98%A,2%B)。進樣量為10 μL。利用Thermo Vanquish UHPLC液相色譜Thermo QE系列質(zhì)譜分別進行正、負離子模式采集。掃描范圍選擇70 ~ 1 050;ESI源的設(shè)置如下:Spray voltage為3.2 kV;Sheath gas flow rate為35 arb;Aux gas flow rate為10 arb;Capillary temp為320 ℃。Polarity:positive;negative;MS/MS二級掃描為data-dependent scans。每10個分析樣本進行一次QC樣本,評價整個實驗過程中儀器狀態(tài)的穩(wěn)定性和檢測數(shù)據(jù)結(jié)果的準確性。
將采集到的原始數(shù)據(jù)導(dǎo)入CompoundDiscoverer 3.1(CD)軟件中,通過保留時間、質(zhì)荷比對數(shù)據(jù)進行過濾,然后根據(jù)保留時間偏差0.2 min和質(zhì)量偏差5 μg·mL進行峰對齊,隨后根據(jù)質(zhì)量偏差5 μg·mL、信號強度偏差30%(Dai et al., 2017)等信息進行峰提取,同時對峰面積進行定量,再整合目標離子,然后通過分子離子峰和碎片離子進行分子式的預(yù)測并與mzCloud、mzVault和MassList數(shù)據(jù)庫進行比對,用blank樣本去除背景離子,并對定量結(jié)果進行歸一化,最后得到數(shù)據(jù)的鑒定和定量結(jié)果。
使用MetaX(Wen et al., 2017)軟件對數(shù)據(jù)進行對數(shù)轉(zhuǎn)換處理,將所有實驗樣本和QC樣本導(dǎo)入SIMCA14.1軟件進行多元統(tǒng)計分析(阿基業(yè),2010),采用主成分分析(PCA)觀察各樣本的整個過程的穩(wěn)定性,然后進一步使用有監(jiān)督的正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)來區(qū)分各組間代謝物的差異性。根據(jù)多變量OPLS-DA模型分析中變量權(quán)重(>1)、結(jié)合檢驗的值(<0.05)和單變量分析差異倍數(shù)(fold-change,>2或<0.5)篩選差異代謝物。維恩圖由TB tools 0.6軟件完成,代謝通路富集分析基于KEGG數(shù)據(jù)庫。
將馬纓杜鵑花開花至凋謝過程分為6個時期,如圖1所示?;ò?A):花未開,表現(xiàn)為花苞狀態(tài),內(nèi)部花藥還未成熟,雄蕊未開裂;開裂期(B):花苞已經(jīng)初步打開,雄蕊剛開裂,雌蕊柱頭上未有花粉;傳粉期(C):花苞較為開發(fā),雄蕊完全裂開,雌蕊柱頭上已經(jīng)結(jié)合覆蓋花粉;盛開期(D):花朵呈現(xiàn)完全盛開,顏色艷麗,雄蕊已經(jīng)完全開裂,且花粉已經(jīng)全部裂出,雌蕊柱頭上花粉已經(jīng)不多,傳粉受精已完成;衰老期(E):花朵開始凋謝,出現(xiàn)萎蔫狀態(tài);凋謝期(F):花朵完全枯萎、凋謝和萎蔫。
A. 花苞期; B. 開裂期; C. 傳粉期; D. 盛開期; E. 衰老期; F. 凋謝期。A. Bud stage; B. Dehiscence stage; C. Pollination stage; D. Blooming stage; E. Senescence stage; F. Withering stage.圖 1 馬纓杜鵑花開花至凋謝過程的形態(tài)變化Fig. 1 Morphological changes of Rhododendron delavayi from flowering to withering
為分析馬纓杜鵑花各個時期間代謝組的相互關(guān)系,采用主成分分析(PCA)通過建立數(shù)學(xué)模型進行正交變換簡化降維分析樣本間代謝譜的內(nèi)部結(jié)構(gòu)關(guān)系。馬纓杜鵑花主成分分析(圖2)表明,不同時期代謝物各組間存在明顯的分離趨勢,每個樣本的數(shù)據(jù)處理結(jié)果可信,每個樣本之間存在明顯差異,且組內(nèi)生物學(xué)重復(fù)重疊效果好,說明在實驗過程中數(shù)據(jù)組的重現(xiàn)性好,可用于后續(xù)差異代謝物分析。花苞期和開裂期、傳粉期、盛開期代謝物的變化相對較大,衰老期與凋謝期的代謝物相對最大。
A. 正離子模式; B. 負離子模式。 QC. 質(zhì)控樣本; B. 花苞期; PD. 開裂期; P. 傳粉期; AP. 盛開期; S. 衰老期; F. 凋謝期。下同。A. Positive ion mode; B. Negative ion mode. QC. Quality control sample; B. Bud stage; PD. Dehiscence stage; P. Pollination stage; AP. Blooming stage; S. Senescence stage; F. Withering stage. The same below.圖 2 馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中代謝物PCA模型得分圖Fig. 2 PCA model scores of metabolites from flowering to withering of Rhododendron delavayi
為篩選出馬纓杜鵑開花至凋謝進程中的差異代謝物,采用正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)區(qū)分6個時期代謝物的總體差異,結(jié)果如圖3所示。馬纓杜鵑開花至凋謝進程中,花苞期、開裂期、傳粉期、盛開期、衰老期、凋謝期6個時期的代謝物明顯分離,表明各組樣本代謝物存在顯著性的差異變化。該模型質(zhì)量參數(shù)和均大于0.9,說明當前OPLS-DA分析模型穩(wěn)定可靠,具有良好的預(yù)測能力,有利于尋找潛在的馬纓杜鵑開花至凋謝進程中的差異代謝物。
圖 3 馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中代謝物OPLS-DA得分圖Fig. 3 OPLS-DA scores of metabolites from flowering to withering of Rhododendron delavayi
研究馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中代謝物的變化,采用LC-MS/MS檢測馬纓杜鵑花6個時期的代謝物多峰圖,花苞期代謝物色譜圖見圖4。共檢測到973種代謝物,正離子模式587種,負離子模式386種,其中黃酮類114種;有機酸114種;酚酸類112種;氨基酸及其衍生物75種;脂類61種;生物堿57種;萜類45種;核苷酸及其衍生物43種;糖類及其衍生物36種;苯丙素類33種;醇和多元醇33種;鞣質(zhì)11種;甾體3種;其他類236種。
圖 4 LC-MS/MS代謝物檢測多峰圖Fig. 4 LC-MS/MS metabolite detection multimodal graph
根據(jù)OPLS-DA模型的變量重要性投影值篩選馬纓杜鵑花6個時期的差異代謝物(>1、<0.05和>2 或<0.5)。從花苞期、開裂期、傳粉期、盛開期、衰老期到凋謝期進行相鄰兩個時期的代謝組比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn):馬纓杜鵑花開花到凋謝進程中共有591種差異代謝物。其中,花苞期與開裂期有170種差異代謝物(正離子模式87,負離子模式83),48種上調(diào),122種下調(diào);開裂期與傳粉期有144種差異代謝物(正離子模式89,負離子模式55),68種上調(diào),76種下調(diào);傳粉期與盛開期有111種差異代謝物(正離子模式67,負離子模式44),75種上調(diào),36種下調(diào);盛開期與衰老期有284種差異代謝物(正離子模式184,負離子模式100),177種上調(diào),107種下調(diào);衰老期與凋謝期有314種差異代謝物(正離子模式180,負離子模式134),260種上調(diào),54種下調(diào)。在馬纓杜鵑花期進入衰老期和凋謝期后差異代謝物數(shù)量明顯增多于開花過程,且大部分是表達量顯著上升的差異代謝物。而在馬纓杜鵑花苞期至開裂期過程中,差異代謝物中大部分的表達量顯著下調(diào)。差異代謝物維恩圖分析表明(圖5),絕大部分(≥46.8%)的差異代謝物都只出現(xiàn)在一個相鄰變化時期,沒有任何差異代謝物出現(xiàn)在整個開發(fā)至凋謝過程。
A. 上調(diào)代謝物; B. 下調(diào)代謝物。A. Up-regulated metabolites; B. Down-regulated metabolites.圖 5 馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中差異代謝物維恩圖Fig. 5 Venn diagram of differential metabolites from flowering to withering of Rhododendron delavayi
通過KEGG Pathway富集分析顯著差異代謝物(Kanehisa & Goto, 2000;Lin et al., 2014),如圖6所示。注釋到68條代謝通路,顯著代謝通路(<0.05)要有6條,分別是苯丙素類生物合成,植物激素的生物合成,類黃酮生物合成,精氨酸和脯氨酸代謝,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成鳥氨酸、賴氨酸和煙酸生物堿的生物合成。其中,極顯著的代謝通路(<0.01)包括苯丙素類生物合成、植物激素的生物合成和類黃酮生物合成。
圖 6 馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中差異代謝物主要代謝通路富集分析Fig. 6 Enrichment analysis of main metabolic pathways of differential metabolites from flowering to withering of Rhododendron delavayi
本研究根據(jù)代謝組學(xué)分析差異代謝物與代謝通路的關(guān)系,挖掘與馬纓杜鵑花開花至凋謝相關(guān)的差異代謝物,推測代謝物可能的作用機制。結(jié)合代謝通路圖(圖7),共篩選到10種差異代謝物,包括苯丙氨酸(L-phenylalanine)、反式肉桂酸(-cinnamic acid)、 查耳酮 (chalcone)、 柚皮素(naringenin)、對香豆?;Р菟?-coumaroyl shikimic acid)、阿魏酸(ferulic acid)、松柏醇(coniferyl alcohol)、芥子酸(sinapic acid)、紫丁香苷(syringin)、槲皮素(quercetin)。在馬纓杜鵑花的6個時期,代謝物含量表達如圖6所示,苯丙素類生物合成相關(guān)的差異代謝物包括苯丙氨酸、反式肉桂酸、對香豆酰莽草酸、松柏醇、芥子酸、紫丁香苷在衰老期(S)和凋謝期(F)兩個時期均為上調(diào)表達,特別是在凋謝期(F)達到最高值;而黃酮類生物合成相關(guān)的代謝物柚皮素、槲皮素和查爾酮隨著花的生長發(fā)育含量呈現(xiàn)下調(diào)表達。在‘夏黑’葡萄二季果冬芽分化關(guān)鍵時期,CCC處理會誘導(dǎo)苯丙素合成和類黃酮合成通路中部分基因的上調(diào)或下調(diào)表達,通過改變與成花相關(guān)的基因表達和次級代謝產(chǎn)物的合成和代謝來實現(xiàn)促進成花(時曉芳等,2021)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析不同發(fā)育階段款冬葉,發(fā)現(xiàn)葉片生長發(fā)育的過程中苯丙素類生物合成相關(guān)基因表達量不斷增多(聶佳慧等,2018)。馬纓杜鵑花開花至代謝進程中苯丙素類代謝物表達量逐漸升高,而黃酮類代謝物表達量逐漸降低,苯丙素類和黃酮類代謝物表達可能與馬纓杜鵑花發(fā)育有關(guān)。
圖 7 苯丙素類、黃酮類等有效成分生物合成通路Fig. 7 Biosynthesis pathway of active components about phenylpropanes and flavones
代謝物是生物體表型的基礎(chǔ),能幫助我們更直觀有效地了解生物學(xué)過程及其機理(熊歡歡等,2019;霍冬敖等,2021)。采用GC-MS技術(shù)對枇杷花整個發(fā)育進程中代謝物質(zhì)分析,C/N含量比是決定花發(fā)育進程的重要因素之一(徐紅霞等,2020)。長期以來馬纓杜鵑花花期調(diào)控一直都是研究熱點,馬纓杜鵑花的開花至凋謝進程是十分復(fù)雜的生理過程,該過程可能與代謝物種類和含量密切相關(guān)。本研究采用非靶向代謝組學(xué)方法,研究馬纓杜鵑花開花至凋謝的6個時期(花苞期、開裂期、傳粉期、盛開期、衰老期和凋謝期)代謝物變化。通過代謝組學(xué)分析,共篩選獲得591種差異表達代謝物,主要包括黃酮類、有機酸、酚酸類、氨基酸,及其衍生物、脂質(zhì)和生物堿等,這些差異代謝物在花的生長發(fā)育不同時期表達情況不相同,隨著馬纓杜鵑花的生長發(fā)育差異代謝物在花苞期至盛開期逐漸減少,進入衰老期和凋謝期后顯著增加;而上調(diào)代謝物在整個開花至凋謝進程中逐漸增加,并且在凋謝期達到最大值;下調(diào)代謝物則在花苞期至盛開期逐漸減少,衰老期增加,凋謝期減少。本研究表明,馬纓杜鵑花的不同發(fā)育階段差異代謝物種類和表達可能與花的開花至凋謝進程密切相關(guān)。
基于KEGG PATHWAY數(shù)據(jù)庫對差異代謝物富集分析,注釋到68條代謝通路,其中3條極顯著的代謝通路(< 0.01)分別是苯丙素類生物合成、植物激素的生物合成和類黃酮生物合成。其中,苯丙素類生物合成是最顯著的代謝通路,苯丙氨酸為下游次生代謝產(chǎn)物提供原料。本研究基于苯丙素類、黃酮類等有效成分生物合成通路共篩選獲得10種有效成分生物合成有關(guān)的差異代謝物。進一步研究發(fā)現(xiàn),苯丙素類生物合成相關(guān)的代謝物表達量同馬纓杜鵑花的其他時期相比,在衰老期和凋謝期代謝物表達量逐漸升高,而黃酮類生物合成相關(guān)的代謝物隨著花的生長發(fā)育含量呈現(xiàn)下調(diào)表達,這些代謝物可能對馬纓杜鵑花凋謝有重要調(diào)控作用。在馬纓杜鵑花的花苞期苯丙氨酸表達量相對較低,隨著花的生長發(fā)育代謝物表達量逐漸升高,代謝通路上相關(guān)代謝也發(fā)生相應(yīng)變化,說明它對整個代謝通路的完成具有重要調(diào)控作用。
現(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),苯丙素類生物合成是最重要的植物次生代謝途徑之一(Dong & Lin, 2021),植物的苯丙素類生物合成代謝途徑及其分支途徑會產(chǎn)生許多次生代謝產(chǎn)物,如色素、酚酸、黃酮、類黃酮、木質(zhì)素等(文歡等,2017)??疃ú煌L發(fā)育階段的次生代謝物代謝組成明顯不同,苯丙素類代謝物在發(fā)育初期至中后期表達量較高;黃酮類代謝物在發(fā)育的各個階段表達量均有波動,但總體變化不大,次生代謝物累積促進花的發(fā)育(賈巖等,2017)。采用高通量測序技術(shù)對川佛手不同發(fā)育時期轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)苯丙素生物合成中7個相關(guān)基因隨著果實的發(fā)育及變色呈現(xiàn)顯著差異表達,提高其表達從而促進果實發(fā)育(潘媛等,2020)。苯丙素類生物合成途徑的前端苯丙氨酸轉(zhuǎn)化為反式肉桂酸,再由肉桂酸羥化酶(C4H)產(chǎn)生對羥基香豆酸,再經(jīng)4-香豆酰-CoA 連接酶(4CL)催化生成4-香豆酸CoA,進一步向下游特異性合成途徑,轉(zhuǎn)化為不同的苯丙素類代謝產(chǎn)物,包括香豆素、黃酮類、萜類和木質(zhì)素等(王玉等,2019;霍冬敖等,2021)。在馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中苯丙素類生物合成相關(guān)的差異代謝物苯丙氨酸、反式肉桂酸、對香豆酰莽草酸、松柏醇、芥子酸、紫丁香苷代謝物隨著花的生長發(fā)育含量呈現(xiàn)上調(diào)表達,特別是在凋謝期(F)達到最高值;而黃酮類生物合成相關(guān)的代謝物柚皮素、槲皮素和查爾酮在花的生長發(fā)育過程中下調(diào)表達。對不同發(fā)育時期大白菜花的轉(zhuǎn)錄組研究,發(fā)現(xiàn)花香的主要成分是苯丙素,而黃酮類化合物是花、果實和種子的主要顯色物質(zhì),此外它還能影響花瓣的伸長,促進花粉的萌發(fā)(李改珍等,2017)。在苯丙素類生物合成中L-苯丙氨酸(侯思宇等,2015)、柚皮素(Tu et al., 2016)、阿魏酸(Louie et al., 2010)等作為中間體,它們的表達量高低直接限制到下游代謝途徑的進行,從而影響花的開花至凋謝過程。苯丙素類、黃酮類等代謝物作為重要次生代謝產(chǎn)物,推測其可能為馬纓杜鵑花開花至凋謝進程具有重要的調(diào)控作用。更好地了解代謝物的生物合成與馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中的關(guān)系還需通過進一步的深入分子水平研究。
本研究通過非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對馬纓杜鵑花開花至凋謝進程中不同階段的代謝成分進行分析,基于KEGG數(shù)據(jù)庫對差異代謝物進行注釋并獲得了相應(yīng)通路,構(gòu)建了馬纓杜鵑花中苯丙素類、黃酮類等有效成分生物合成途徑,為進一步研究代謝物的基因調(diào)控作用以及全面解析代謝途徑提供代參考,為延長馬纓杜鵑花花期調(diào)控機制提供了理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。