黃建華
(南通大學附屬中學 江蘇南通 226019)
2009年江蘇高考卷的34題以農桿菌轉化法培育轉毒素蛋白基因的植物為背景,考查基因工程的相關知識,其基本過程如圖1所示。
圖1 農桿菌轉化法培育轉Bt毒素蛋白基因的植物
圖1過程采用轉移法,將重組質粒轉入農桿菌,再與Ti質粒重組為共整合載體,然后轉化植物細胞。共整合載體是農桿菌轉化法中Ti質粒轉化載體系統(tǒng)中的一種。這與高中教材介紹的農桿菌轉化法不一樣,人教版高中教材介紹的農桿菌轉化法是將目的基因插入到農桿菌Ti質粒的T-DNA中構成重組質粒,再將重組質粒導入農桿菌,通過農桿菌的轉化作用,將目的基因插入到植物細胞染色體DNA中,其過程如圖2所示。
圖2 人教版教材中所示的農桿菌轉化法
高中教材介紹的僅是農桿菌轉化法的思路,并不是具體操作步驟,而試題將教材中的轉化思路具體為轉化步驟,揭秘了質粒載體系統(tǒng)的構建、結合轉移法轉移質粒等,以期讓教師和學生通曉真實的操作過程,拓寬認知的視野。
農桿菌Ti質粒中有T-DNA(包含生長素基因、細胞分裂素基因、冠癭堿合成基因)、冠癭堿代謝基因、復制起始位點、基因,其結構如圖3所示。
圖3 農桿菌Ti質粒結構示意圖
T-DNA的轉移功能與其兩端25 bp的末端重復順序有關,特別是右邊界序列。農桿菌把T-DNA整合到植物細胞核DNA上后,生長素基因和細胞分裂素基因的表達使植物細胞過度分裂、生長轉化為腫瘤;冠癭堿合成基因的表達使瘤細胞合成大量冠癭堿,供農桿菌代謝利用,加速農桿菌的繁殖,這是農桿菌為自己巧妙設計的內共生體系。但在培育轉基因植物時,導入外源生長素基因、細胞分裂素基因會打破內源激素的平衡,阻礙受體植物細胞的脫分化和再分化;導入冠癭堿合成基因、冠癭堿代謝基因會消耗植物細胞的谷氨酸和精氨酸,影響植物細胞的生長。所以設計農桿菌Ti質粒運載目的基因時,應將這些基因去除。農桿菌Ti質粒上沒有大腸桿菌的復制起點和選擇標記基因,目的基因不能在大腸桿菌中保存和復制。并且,農桿菌Ti質粒上一種限制性內切酶的酶切位點有多個,很難找到單一的酶切位點用于插入目的基因。這些因素都決定了Ti質粒不能直接作為運載目的基因的載體,必須要對Ti質粒進行改造,添加大腸桿菌的復制起點、選擇標記基因、多克隆位點后才能作為轉基因植物的載體。T-DNA的轉移需要基因表達產生的12種蛋白激活、協(xié)助,如構建單一載體運載目的基因轉化植物細胞。而基因高達40 kb,會增加載體的體積,降低導入農桿菌成功率。所以,農桿菌轉化法中不采用單一載體運載目的基因轉化植物細胞。
農桿菌轉化植物細胞的機制是:植物細胞分泌乙酰丁香酮(或羥基乙酰丁香酮)誘導Ti質粒上的基因以及農桿菌染色體上的基因等10個基因的表達。這些基因的表達產物共同作用將T-DNA整合到植物細胞染色體DNA中。從農桿菌轉化植物細胞的機制分析,基因的表達產物是成功轉化的必備條件,基因是否與T-DNA在同一質粒上不是必備條件。所以,可在體外構建攜帶目的基因、不攜帶基因的中間載體,農桿菌細胞內的質粒保留基因、去除非必須基因,然后將中間載體轉入農桿菌實現(xiàn)轉化。這為構建質粒轉化載體系統(tǒng)提供了理論基礎。
有的大腸桿菌細胞中含有轉移協(xié)助質粒,含有轉移協(xié)助質粒的大腸桿菌與農桿菌接合,能將質粒高效的轉移入到農桿菌中。若大腸桿菌中同時含有中間載體和轉移協(xié)助質粒則采用接合轉移法轉移中間載體,即把大腸桿菌和農桿菌一起培養(yǎng),大腸桿菌通過與農桿菌的直接接合將中間載體轉入農桿菌中(轉移協(xié)助質粒也一起轉入農桿菌中)。若大腸桿菌中有中間載體、沒有轉移協(xié)助質粒,則采用三親雜交轉移法,即把含有中間載體的大腸桿菌、含有轉移協(xié)助質粒的大腸桿菌、農桿菌混合培養(yǎng),通過雜交使轉移協(xié)助質粒先轉移到含有中間載體的大腸桿菌中,然后通過與農桿菌結合將中間載體轉入到農桿菌中。這樣就簡化從大腸桿菌中提取質粒導入農桿菌的步驟了,現(xiàn)常用的方法是三親雜交轉移法。
由兩種或兩種以上的質粒構成的復合型載體稱為載體系統(tǒng),農桿菌轉化法主要有兩種載體系統(tǒng):一元載體系統(tǒng)和雙元載體系統(tǒng)。
這類載體是中間載體與農桿菌內改造的Ti質粒通過同源重組形成一種復合型載體。農桿菌內改造后的Ti質粒也稱為受體Ti質粒。根據(jù)同源重組序列的不同可分為共整合載體和拼接末端載體(也稱TDNA邊界拼接載體)。
3.1.1 共整合載體
共整合載體系統(tǒng)中的中間載體由E.Coli質粒改造而來,其中含有大腸桿菌的復制原點、細菌的選擇基因、植物選擇標記基因、目的基因、pBR322序列;受體Ti質粒含有農桿菌的復制原點、基因、T-DNA的左右邊界、pBR322序列(位于T-DNA的左右邊界之間)。當中間質粒導入含受體Ti質粒的農桿菌后,中間質粒和受體Ti質粒通過pBR322序列進行同源重組,中間載體整合到受體Ti質粒的T-DNA中形成共整合質粒(圖4)。中間載體不能在農桿菌中復制,不能穩(wěn)定遺傳而消失。共整合質粒既能在農桿菌中復制,又帶有細菌選擇基因,所以含有共整合質粒的農桿菌能在選擇培養(yǎng)基中生長,可以被篩選出來。含共整合質粒的農桿菌細胞中含有T-DNA(目的基因)、基因和基因,所以這樣的農桿菌可用于植物的轉化。
圖4 形成共整合質粒的過程示意圖
3.1.2 拼接末端載體(T-DNA邊界拼接載體)
拼接末端載體的中間載體含有大腸桿菌的復制原點、細菌和選擇基因、T-DNA的右邊界、植物選擇標記基因、目的基因、T-DNA的左邊界內部序列;受體Ti質粒含有農桿菌的復制原點、基因、T-DNA的左邊界內部序列、T-DNA的左邊界。當中間質粒導入含受體Ti質粒的農桿菌后,中間質粒和受體Ti質粒通過T-DNA的左邊界內部序列同源重組,形成拼接末端載體(圖5)。含拼接末端載體的農桿菌含有選擇基因、T-DNA(目的基因)、基因和基因,能在選擇培養(yǎng)基中生長,可用于植物的轉化。
圖5 拼接末端載體的形成示意圖
共整合載體和拼接末端載體系統(tǒng)的中間載體、受體Ti質粒、同源序列不同。共整合載體轉化的植物中帶有重復的pBR322序列,這可能會影響轉化植物中目的基因的穩(wěn)定性,而拼接末端載體不存在這種可能性,所以拼接末端載體的轉化更有效。
雙元載體系統(tǒng)由兩個分別含T-DNA和基因的Ti質粒構成,含T-DNA的Ti質粒稱為微型Ti質粒。微型Ti質粒含大腸桿菌的復制原點、農桿菌的復制原點,細菌選擇基因、完整的T-DNA(帶有目的基因和植物選擇標記基因),含基因的Ti質粒為協(xié)助Ti質粒,如圖6所示。
圖6 雙元載體系統(tǒng)示意圖
最常用的含協(xié)助Ti質粒的農桿菌是農桿菌LBA4404,導入微型Ti質粒的農桿菌LBA4404就具有了轉化植物的能力。雙元載體系統(tǒng)中的2個質粒不含同源序列,分子量較小,體外易操作,不需要進行同源重組,T-DNA較小,轉化效率較高,但雙元載體構建成功后,工程菌的穩(wěn)定性較差,容易丟失。