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      泰山海棠抗旱基因MhDREB2A的克隆與功能鑒定

      2022-10-19 12:59:06黨明青王京平冉昆劉加芬李慧峰
      關(guān)鍵詞:海棠逆境擬南芥

      黨明青,王京平,冉昆,劉加芬,李慧峰

      (1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,南京 210095;2.棲霞市寺口鎮(zhèn)綜合服務(wù)站,山東 煙臺(tái) 265300;3.山東省果樹研究所,山東 泰安 271000)

      轉(zhuǎn)錄因子作為一類關(guān)鍵的調(diào)控因子,通過(guò)結(jié)合下游基因的啟動(dòng)子區(qū)域,調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá)。越來(lái)越多研究表明,轉(zhuǎn)錄因子在植物應(yīng)答逆境脅迫的信號(hào)途徑中起著重要的作用[1]。DREB轉(zhuǎn)錄因子(dehydration responsive element binding protein)是AP2/EREBP(APETALA 2/an ethylene responsive element binding protein)轉(zhuǎn)錄因子家族的一個(gè)亞家族,此類轉(zhuǎn)錄因子含有保守的AP2結(jié)構(gòu)域,能夠特異性地結(jié)合到抗逆基因啟動(dòng)子區(qū)域的DRE順式作用元件上[2-3]。在擬南芥中,DREB轉(zhuǎn)錄因子可分為DREB1/CBF和DREB2兩類,目前對(duì)DREB1/CBF類成員的功能研究比較透徹,主要與低溫脅迫應(yīng)答反應(yīng)有光;而DREB2類成員則主要參與干旱、高鹽、高溫等脅迫應(yīng)答反應(yīng)[4-6]。在逆境脅迫條件下,DREB2轉(zhuǎn)錄因子被迅速誘導(dǎo)表達(dá),然后與下游抗逆性相關(guān)的功能基因的啟動(dòng)子的DRE元件特異結(jié)合,調(diào)控下游基因的表達(dá),提高植物對(duì)非生物脅迫的抗性[1-2,6]。例如,過(guò)量表達(dá)At-DREB2A能夠提高擬南芥的抗旱性[7];OsDREB2A和OsDREB2B的轉(zhuǎn)基因水稻和大豆增強(qiáng)了植株對(duì)干旱和鹽脅迫的耐受性[8-9];在小麥和大麥中過(guò)表達(dá)TaDREB2基因能夠提高植株在干旱條件下的存活率[10]。在蘋果中,Mp-DREB2A和MdDREB2A都能夠受到多種逆境脅迫誘導(dǎo),轉(zhuǎn)基因擬南芥表型分析發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)基因材料的抗旱能力也不同程度提高[11-12]。

      泰山海棠(Malus hupehensis)是我國(guó)特有的蘋果屬種質(zhì)資源,具有抗旱等優(yōu)良性狀。研究組前期以泰山海棠為材料,分析了干旱和非干旱條件下泰山海棠的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)干旱條件下MhDREB2A基因明顯受到誘導(dǎo)表達(dá)。采用RACE方法成功克隆了完整的MhDREB2A基因,并通過(guò)遺傳轉(zhuǎn)化獲得MhDREB2A轉(zhuǎn)基因煙草植株,并對(duì)干旱脅迫處理下植株的表型和生理指標(biāo)變化進(jìn)行鑒定,為選育蘋果屬植物抗旱資源提供基礎(chǔ)依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      供試泰山海棠(Malus hupehensis)保存在山東省果樹研究所。供試ABA(分析純)購(gòu)于博奧拓達(dá)公司。

      1.2 方法

      2018年盆栽定植,對(duì)8a生盆栽苗外源噴施脫落酸(100μMol·L-1ABA),處理后0,1,2,6,12,24h分別采集樣品;干旱脅迫以盆栽土壤相對(duì)含水量為70%時(shí)為干旱處理起始點(diǎn),處理后0,1,2,3,4,5d取樣。每個(gè)處理大于5株盆栽苗,所有處理均在玻璃溫室中進(jìn)行,培養(yǎng)條件為16h(光照)/8h(黑暗)和(25±1)℃。所有的樣品采集后,放入液氮中迅速冷凍后置于-80℃冰箱保存。

      1.2.1MhDREB2A的克隆及序列分析取泰山海棠幼苗0.1g,利用Trizol的方法提取總RNA,參照大連寶生物(TaKaRa)的PrimeScript?RT reagent Kit with gDNA Eraser(RR047A)的說(shuō)明書,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。根據(jù)之前轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中的序列信息,利用Primer 5軟件設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增MhDREB2A全長(zhǎng)CDS(表1)。利用寶生物的高保真酶PrimeSTAR?Max DNA Polymerase(R045Q),以反轉(zhuǎn)錄的cDNA產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)程序:98℃變性10s,55℃退火10s,72℃延伸15s,30個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增后,PCR產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,根據(jù)預(yù)測(cè)的目的條帶的大小,切下相應(yīng)的條帶,連接到pEasy(北京全式金)克隆載體進(jìn)行測(cè)序。

      從NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫(kù)中下載所有擬南芥的AP2蛋白序列,使用MEGA 6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中下載AtDREB1A(ABD42992.1)、AtDREB2A(AED90871.1)、MdDREB2A(XP_008354169.1)、MpDREB2A(MG488272)、FvDREB2A(XP_004307690.1)、PbDREB2A(XP_009345422.1)、Pp-DREB2A(XP_020413813.1)和VvDREB2A(XP_002273838.1),使用DNAMAN進(jìn)行多序列比對(duì)。

      1.2.2 基因表達(dá)分析在8a生的泰山海棠樹上分別取根、莖、葉、花(盛花期)和果實(shí)(花后60d),將樣品放入液氮中速凍,然后提取RNA,反轉(zhuǎn)錄合成第1鏈cDNA后,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR進(jìn)行組織表達(dá)分析。內(nèi)參基因選用MdActin[13]。煙草轉(zhuǎn)基因和野生型植株提取RNA和反轉(zhuǎn)錄方法同上,內(nèi)參基因選用NtActin[14]。

      熒光定量分析參照ChamQTM Universal SYBR? qPCR Master Mix(Q711,Vazyme,南京)的說(shuō)明書,反應(yīng)體積為20μL:SYBR qPCR Master Mix 10μL,上、下游引物各1μL,cDNA 1μL,ddH2O 7μL。反應(yīng)條件為:95℃30s,95℃10s,60℃20s,40次循環(huán)。并采用2-ΔΔCT計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量[15]。試驗(yàn)設(shè)至少3個(gè)生物學(xué)重復(fù)。引物序列見表1。

      表1 供試引物Table 1 Primers used in this study

      1.2.3 亞細(xì)胞定位將MhDREB2A的CDS序列(去掉終止密碼子)構(gòu)建到pRI101-eGFP載體上,然后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌EHA105,挑選陽(yáng)性克隆搖菌。將農(nóng)桿菌溶液注射到本氏煙的葉片中,放置2~3d后,使用激光共聚焦顯微鏡觀察熒光定位情況。

      1.2.4 MhDREB2A過(guò)量表達(dá)載體的構(gòu)建和煙草的轉(zhuǎn)化將MhDREB2A的CDS序列構(gòu)建到植物過(guò)量表達(dá)載體pRI101上,得到35S::MhDREB2A過(guò)量表達(dá)載體。將重組質(zhì)粒通過(guò)冷凍法轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞。采用葉盤法[16],將帶有重組質(zhì)粒的農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)入煙草葉片中,經(jīng)過(guò)共生培養(yǎng)和篩選培養(yǎng)后將抗性芽轉(zhuǎn)入1/2培養(yǎng)基中繼代、生根,獲得T0代轉(zhuǎn)基因植株,移栽后,單株收種,選取T3代植株進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 MhDREB進(jìn)化樹及序列比對(duì)分析

      從NCBI網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的數(shù)據(jù)庫(kù)中下載擬南芥全部AP2蛋白序列,利用MEGA 6.0軟件,進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,結(jié)果表明本研究中克隆得到的泰山海棠DREB屬于DREB2亞家族,與DREB2A親緣關(guān)系最近,因此將此基因命名為MhDREB2A(圖1A)。

      將不同物種中的DREB2蛋白序列從NCBI中下載下來(lái),包含擬南芥(AtDREB2A,AED90871.1),蘋果(Md-DREB2A,XP_008354169.1)、海棠(MpDREB2A,MG488272),草莓(FvDREB2A,XP_004307690.1)、白梨(Pb-DREB2A,XP_009345422.1)、桃(PpDREB2A,XP_020413813.1)和葡萄(VvDREB2A,XP_002273838.1)。利用DNAman軟件進(jìn)行氨基酸序列比對(duì),結(jié)果表明泰山海棠MhDREB2A和其他物種的DREB2A蛋白在N端有保守性的AP2結(jié)構(gòu)域(圖1B)。

      2.2 MhDREB2A基因的表達(dá)分析

      由圖2a和2b可知,干旱和100μMol·L-1ABA處理均可不同程度地誘導(dǎo)MhDREB2A基因的表達(dá)。Mh-DREB2A基因的表達(dá)量在干旱處理后3 d達(dá)到最高值(12.3倍),然后下降;100μMol·L-1ABA處理后,MhDREB2A基因的表達(dá)量在2h時(shí)達(dá)到最高值(15.8倍),6h降至最低;表明MhDREB2A可能在蘋果應(yīng)對(duì)干旱脅迫中起著重要作用。

      進(jìn)一步通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)MhDREB2A在泰山海棠根、莖、葉、花(盛花期)和果實(shí)(花后60d)的相對(duì)表達(dá)水平。由圖2c可知,MhDREB2A在泰山海棠不同組織中均有表達(dá),其中在花中的表達(dá)量最高,在葉中表達(dá)最低。

      圖2 MhDREB2A的在泰山海棠中的表達(dá)水平分析Figure 2 Analysis in expression level of MhDREB2A in Malus hupehensis

      2.3 MhDREB2A的亞細(xì)胞定位分析

      將含有MhDREB2A基因的農(nóng)桿菌注射到本氏煙葉片中,利用激光共聚焦顯微鏡觀察煙草葉肉細(xì)胞中的熒光信號(hào)分布,發(fā)現(xiàn)綠色熒光(GFP)標(biāo)記的MhDREB2A蛋白集中分布于細(xì)胞核上(圖3)。

      圖3 MhDREB2A的亞細(xì)胞定位分析Figure 3 Subcellular localization of MhDREB2A

      2.4 MhDREB2A轉(zhuǎn)基因煙草抗旱性分析

      為了快速驗(yàn)證MhDREB2A基因在植物抗旱中的作用,在煙草中過(guò)量表達(dá)MhDREB2A基因,qRT-PCR結(jié)果表明在3個(gè)轉(zhuǎn)基因株系(L1、L2和L3)中MhDREB2A基因表達(dá)量均明顯高于對(duì)照(圖4a)。對(duì)生長(zhǎng)了35d的煙草植株進(jìn)行干旱處理,觀察其表型變化,結(jié)果表明,野生型煙草早于轉(zhuǎn)基因株系出現(xiàn)葉片萎蔫和變黃的現(xiàn)象(圖4b)。在對(duì)照組中,轉(zhuǎn)基因株系和野生型植株中葉綠素總含量、電導(dǎo)率(EL)和丙二醛(MDA)均沒(méi)有顯著差別;而在干旱條件下,轉(zhuǎn)基因株系中的葉綠素總含量明顯高于野生型植株,電導(dǎo)率(EL)和丙二醛(MDA)則明顯低于野生型植株(圖4c~圖4f)。

      圖4 MhDREB2A轉(zhuǎn)基因煙草干旱處理表型及葉綠素含量、電導(dǎo)率和丙二醛含量分析Figure 4 Phenotype of the transgenic tobaco with MhDREB2A and analysis on Chl,electrolyte leakages and MDA contents

      圖5 轉(zhuǎn)基因煙草逆境相關(guān)基因的表達(dá)分析Figure 5 Expression analysis of resistance-related genes in transgenic tobacco

      為了進(jìn)一步揭示MhDREB2A基因提高植物抗旱性的機(jī)制,檢測(cè)了脅迫相關(guān)基因的表達(dá)。由圖5可知,正常條件下逆境相關(guān)基因NtDREB3、NtERD10C、NtERD10D、NtNCED1和NtLEA5在轉(zhuǎn)基因煙草和野生型中表達(dá)量沒(méi)有差異;在干旱處理下,NtDREB3、NtERD10C、NtERD10D、NtNCED1和NtLEA5的表達(dá)均有所增強(qiáng),且轉(zhuǎn)基因植株的表達(dá)水平均顯著高于野生型植株。綜上可知,過(guò)量表達(dá)MhDREB2A能夠顯著提高植物的抗旱性。

      3 討論與結(jié)論

      AP2/ERF家族是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,包含一個(gè)或者多個(gè)AP2結(jié)構(gòu)域,該家族廣泛參與調(diào)控植物干旱、高鹽或低溫、高溫等非生物脅迫應(yīng)答過(guò)程[6]。本試驗(yàn)中對(duì)泰山海棠MhDREB2A在干旱脅迫方面的作用進(jìn)行了研究。通過(guò)對(duì)泰山海棠DREB和擬南芥AP2/ERF蛋白進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,發(fā)現(xiàn)該泰山海棠DREB蛋白屬于DREB2亞家族,與AtDREB2A親緣關(guān)系最近,因此將此基因命名為MhDREB2A。隨后進(jìn)一步對(duì)MhDREB2A序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)MhDREB2A蛋白包含1個(gè)非常保守的AP2結(jié)構(gòu)域,起始于第79個(gè)氨基酸,結(jié)束于第130個(gè)氨基酸,屬于AP2類家族成員。

      在無(wú)任何處理?xiàng)l件下,擬南芥DREB2A基因在根、莖、葉都有表達(dá)[17],在本研究中,采用RT-PCR檢測(cè)Mh-DREB2A在根、莖、葉、花、果的表達(dá)情況,結(jié)果表明蘋果MhDREB2A基因主要在花和根中表達(dá),這種表達(dá)的差異可能與草本和木本植物中DREB2A基因參與了不同組織抗性有關(guān)。不同物種的大多數(shù)DREB2基因都能夠響應(yīng)干旱、高鹽和高溫等脅迫,少數(shù)DREB2對(duì)低溫和ABA有響應(yīng),并且不同物種以及在不同組織部位對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)是不一樣。例如,OsDREB2A基因的表達(dá)均受干旱和高鹽脅迫的誘導(dǎo);AtDREB2正常生長(zhǎng)條件下表達(dá)較弱,但受干旱、極端溫度或高鹽的誘導(dǎo)[6]。本研究干旱脅迫處理時(shí),MhDREB2A的表達(dá)量在處理后3d時(shí)達(dá)到峰值,同時(shí)其表達(dá)量還受ABA的誘導(dǎo),暗示了MhDREB2A基因在蘋果響應(yīng)干旱脅迫起著重要作用。一般而言,轉(zhuǎn)錄因子大多數(shù)定位于細(xì)胞核中,在本研究中亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示MhDREB2A定位于細(xì)胞核中,但Mh-DREB2A發(fā)揮功能的機(jī)制目前還不清楚,可能與其他蛋白或者直接調(diào)控下游基因響應(yīng)干旱脅迫,有待進(jìn)一步試驗(yàn)驗(yàn)證。

      多數(shù)報(bào)道顯示,DREB2轉(zhuǎn)錄因子對(duì)生物和非生物脅迫具有正向調(diào)控作用。由于泰山海棠遺傳轉(zhuǎn)化體系尚不成熟,所以本研究中將MhDREB2A轉(zhuǎn)入煙草中進(jìn)行過(guò)量表達(dá)以探索其功能。當(dāng)干旱脅迫條件下野生型植株葉片萎蔫變黃時(shí),轉(zhuǎn)基因株系仍處于相對(duì)較好的生長(zhǎng)狀態(tài)。電導(dǎo)率和丙二醛是研究植物抗性的關(guān)鍵指標(biāo),反應(yīng)植物細(xì)胞膜脂過(guò)氧化程度及膜受損程度,植株丙二醛含量較低,表明膜脂受損較輕,具有較強(qiáng)的抗性[18-19]。本試驗(yàn)中,轉(zhuǎn)基因煙草在干旱脅迫下的電導(dǎo)率和丙二醛含量均低于野生型(對(duì)照),表明其細(xì)胞膜的受損程度較低,其抗旱性相應(yīng)提高。另外,NtDREB3、NtERD10C、NtERD10D、NtNCED1和NtLEA5均是逆境脅迫相關(guān)基因,與植物細(xì)胞的耐逆性相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn),干旱處理?xiàng)l件下這些抗逆相關(guān)基因在轉(zhuǎn)基因株系中的表達(dá)量高于野生型,暗示MhDREB2A可能正調(diào)控這些基因的表達(dá)來(lái)響應(yīng)干旱脅迫,但對(duì)于MhDREB2A能否直接調(diào)控這些表達(dá),還有待通過(guò)遺傳學(xué)及分子生物學(xué)試驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。

      ABA最重要的功能是作為信號(hào)分子激發(fā)一系列調(diào)節(jié)機(jī)制,提高植物在干旱、高溫、低溫、高鹽、重金屬等脅迫下的耐受力,因此又被稱為應(yīng)激激素或脅迫激素。低濃度ABA能夠增強(qiáng)水稻、馬鈴薯、番茄等作物對(duì)低溫、干旱、高鹽等逆境的耐受力。逆境脅迫下,植物體內(nèi)會(huì)大量積累ABA,進(jìn)而增強(qiáng)植物體對(duì)逆境脅迫的抵抗能力。蘋果矮化基因MbDREB1可以通過(guò)依賴ABA和不依賴ABA的途徑以增強(qiáng)對(duì)低溫、干旱和鹽脅迫的耐受性[20]。

      綜上所述,MhDREB2A基因過(guò)量表達(dá)提高了轉(zhuǎn)基因植株對(duì)干旱脅迫的抗性,為干旱脅迫響應(yīng)過(guò)程中的正調(diào)控因子,可以作為蘋果抗旱育種的候選基因。

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