申玉華,白玉東,范天寧,李守坤,梁耕源,陳煥,任秀鵬,郭芡芡,王浩安,林景衛(wèi)
(1.赤峰學院化學與生命科學學院,內(nèi)蒙古 赤峰 024001;2.沈陽農(nóng)業(yè)大學生物科學技術(shù)學院,沈陽 110161)
轉(zhuǎn)錄因子作為分子開關(guān)與其靶基因上的順式作用元件在時間與空間上調(diào)控基因的表達[1]。NAC蛋白是植物中已知最大的特異轉(zhuǎn)錄因子家族之一,1992年首次在擬南芥中報道NAC蛋白編碼基因RD26[2],隨著基因克隆技術(shù)的發(fā)展,已經(jīng)在植物中鑒定出110多個NAC同源蛋白[3]。NAC蛋白N端高度保守,大約由160多個氨基酸殘基組成,并且該家族所有蛋白質(zhì)都有一個保守的N-末端DNA結(jié)合域,稱為NAC結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域最先在無頂端分生組織(NAM)、擬南芥轉(zhuǎn)錄激活因子(ATAF1/2)和杯狀子葉蛋白(CUC2)中被鑒定[4],其C端保守性較低,但已有不少例子證明,其C端有轉(zhuǎn)錄激活功能[5-7]。NAC超家族的成員不僅存在于被子植物中,同時也存在于松樹和苔蘚植物中。其參與植物發(fā)育和非生物或生物脅迫反應(yīng)有著緊密的關(guān)聯(lián)[8]。功能研究表明,NAC蛋白在植物的生長發(fā)育中起重要作用,包括芽頂端分生組織的形成和維持、花的發(fā)育和形成、側(cè)根的發(fā)育、激素信號、種子萌發(fā)和衰老等[9-11]。不僅如此,NAC轉(zhuǎn)錄因子還具有調(diào)節(jié)免疫作用,NAC基因可以在植物受到創(chuàng)傷或在細菌感染期間上調(diào)來增強免疫能力,也可以抵抗病毒的感染[12-13]。NAC基因表達量的降低也會導致植物免疫能力的下降。水稻中OsNAC6基因的敲除會損害植物對富營養(yǎng)化白粉病真菌的抗性[14]。絕大多數(shù)NAC基因?qū)Ψ巧锩{迫敏感,并起著重要的調(diào)節(jié)作用。在分析擬南芥和水稻中的幾種全基因組表達時,發(fā)現(xiàn)NAC基因至少由一種非生物脅迫誘導,如鹽度、干旱、寒冷或ABA等[15-16]。NAC控制的過程主要取決于它們的轉(zhuǎn)錄特性,NAC既可以作為激活劑,也可以作為抑制劑。此外,它們的同源/異源二聚化能力也會影響其與DNA結(jié)合和激活特性[17]。由于NAC調(diào)節(jié)植物的生長發(fā)育和脅迫反應(yīng),因此對它們的深入了解有助于指導未來的作物改良研究。
紫花苜蓿是豆科蝶形花亞科苜蓿屬,多年生優(yōu)質(zhì)牧草,富含蛋白質(zhì)、維生素和多種礦物質(zhì)元素,有著“牧草之王”的美譽[18]。申玉華等[19-20]利用RT-PCR和RACE技術(shù)在紫花苜蓿中克隆得到了2個新基因MsNAC2和MsNAC3,對其進行生物信息學分析和亞細胞定位試驗,結(jié)果表明紫花苜蓿MsNAC2和MsNAC3屬于NAC家族轉(zhuǎn)錄因子。運用real-time PCR方法研究在多種非生物逆境脅迫下的表達特性,表明MsNAC2和MsNAC3基因可能參與紫花苜蓿冷害、干旱、鹽和ABA等非生物脅迫的生理響應(yīng)。為進一步了解MsNAC2和MsNAC3的生物學功能,本研究從紫花苜蓿cDNA中克隆MsNAC2和MsNAC3基因,將其構(gòu)建到pPIC9載體上,轉(zhuǎn)化野生畢赤酵母,并以轉(zhuǎn)pPIC9空載體酵母作為對照,在逆境脅迫條件下對轉(zhuǎn)基因株系進行相關(guān)表型分析,為揭示Ms-NAC2和MsNAC3在紫花苜蓿逆境調(diào)控中的分子遺傳機制奠定基礎(chǔ),同時為應(yīng)用苜蓿NAC轉(zhuǎn)錄因子基因開展紫花苜蓿抗逆基因機理研究,以及通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)改善紫花苜蓿抗逆能力和提高其品質(zhì)奠定基礎(chǔ),為進一步通過基因工程手段應(yīng)用于植物抗逆轉(zhuǎn)基因育種提供了理論依據(jù)。
1.1.1 供試材料紫花苜蓿(Medicago sativaL.)、野生畢赤酵母、畢赤酵母對照株系(CK:轉(zhuǎn)pPIC9載體)、pPIC9載體為實驗室保存,大腸桿菌TOP10感受態(tài)細胞購自天根生化科技有限公司。
1.1.2 試劑盒和藥品質(zhì)粒小提試劑盒、膠回收試劑盒、pGM-T試劑盒、Frozen-EZ Yeast TransformationⅡKit-TM試劑盒為北京天根生化科技有限公司產(chǎn)品。氨芐青霉素、X-Gal、IPTG、限制性內(nèi)切酶和T4連接酶購自大連Takara公司。
1.1.3 培養(yǎng)基LB培養(yǎng)基:蛋白胨10g·L-1,酵母粉5g·L-1,NaCl 10g·L-1(NaOH調(diào)節(jié)pH值至7.0)固體培養(yǎng)基添加瓊脂粉15g·L-1,121℃,滅菌25min。YPD培養(yǎng)基:胰蛋白胨20g·L-1,酵母粉10g·L-1,葡萄糖20g·L-1(固體培養(yǎng)基加瓊脂粉15g·L-1)110℃滅菌30min。BMMY培養(yǎng)基:YNB13.4g·L-1,胰蛋白胨20g·L-1,生物素4×10-5g·L-1,磷酸鈉緩沖液20mL·L-1,甲醇1%(使用磷酸調(diào)pH=5.0)過濾滅菌30min。MD培養(yǎng)基:YNB13.4g·L-1,生物素4×10-5g·L-1,葡萄糖20g·L-1(pH溶于自然,固體培養(yǎng)基加瓊脂粉15g·L-1),過濾滅菌30min。
1.1.4 PCR引物根據(jù)已知基因序列,通過primier5.0設(shè)計并合成MsNAC2和MsNAC3基因的全長引物,分別命名為A2-R、A2-F、A3-R和A3-F,在其C端引入6×His標簽編碼序列,并添加酶切位點(表1)。
1.2.1 目的片段的基因克隆提取野生紫花苜蓿基因組DNA,用A2和A3上下游引物擴增MsNAC2和MsNAC3基因。反應(yīng)程序:94℃3min;94℃30s;60℃30s;72℃30s(30個循環(huán));72℃10min。PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,分別回收1020bp(MsNAC2)和1014 bp(MsNAC3)的片段,與克隆載體pGM-T連接,送上海生工測序。
1.2.2 pPIC9-His-MsNAC2、pPIC9-His-MsNAC3的載體構(gòu)建MsNAC2和MsNAC3基因分別與T載體連接,測序。載體pGM-T-MsNAC2和pGM-T-MsNAC3和pPIC9分別用EcoRI和NotI進行酶切,膠回收,連接轉(zhuǎn)化,測序。
1.2.3 重組載體轉(zhuǎn)化酵母和PCR檢測重組表達載體pPIC9-His-MsNAC2、pPIC9-His-MsNAC3用SacⅠ線性化,回收。用Frozen-EZ Yeast TransformationⅡKitTM試劑盒進行酵母轉(zhuǎn)化,菌液涂布MD固體培養(yǎng)基30℃黑暗培養(yǎng)2d進行篩選,挑取MD培養(yǎng)基上的單菌落進行PCR檢測。
1.2.4 重組酵母NAC蛋白檢測SDS-PAGE檢測:吸取PCR陽性菌株菌液加入YPD液體30℃培養(yǎng)至OD=1.0,將培養(yǎng)完的菌液離心,重溶于BMMY液體培養(yǎng)基30℃黑暗培養(yǎng)4d,每24h進行一次1%甲醇補加并繼續(xù)誘導培養(yǎng)。離心取發(fā)酵液上清,水浴鍋變性5min,進行SDS-PAGE凝膠電泳,G250考馬斯亮藍染色。West Bolt檢測:將樣品進行SDS-PAGE凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜、封閉、一抗和二抗孵育、ECL顯色、PVDF膜直接顯色。
1.2.5 重組酵母溫度脅迫酵母細胞在30°C的YPD培養(yǎng)基中培養(yǎng)至對數(shù)中期。離心收集細胞沉淀,并用無菌生理鹽水清洗。將細胞懸液濃度調(diào)整為OD600=1.0。制備細胞懸液的10-1,10-2,10-3系列稀釋液用于斑點試驗。于37℃和16℃在固體YPD板上觀察等量的細胞生長狀況拍照記錄。
1.2.6 重組酵母鹽脅迫酵母細胞在30℃的YPD培養(yǎng)基中培養(yǎng)至對數(shù)中期。離心收集細胞沉淀,用無菌生理鹽水清洗。將細胞懸液濃度調(diào)整為OD600=1.0。制備細胞懸液的10-1,10-2,10-3系列稀釋液用于斑點試驗。在100mmol·L-1和200mmol·L-1NaCl濃度的固體YPD板上觀察等量的細胞生長狀況,2d后拍照記錄。
由圖1可知,在引物上C端引入6×His標簽克隆MsNAC2和MsNAC3基因,在1020bp和1014bp處目的條帶單一,膠回收與克隆載體pGM-T連接,測序結(jié)果正確,表明MsNAC2和MsNAC3基因被成功克隆。
用EcoRI和NotI進行分別對克隆載體pGM-T-MsNAC2、pGM-T-MsNAC3和pPIC9進行雙酶切,回收,連接,轉(zhuǎn)化。對菌落進行菌落PCR鑒定,提質(zhì)粒,進行雙酶切檢測。由圖2可知,酶切結(jié)果和已知克隆片段大小一致,成功構(gòu)建酵母重組表達載體pPIC9-His-MsNAC2和pPIC9-His-MsNAC3(圖3)。
圖1 MsNAC2和MsNAC3基因PCR結(jié)果Figure 1 MsNAC2和MsNAC3 gene PCR result
圖2 pPIC9-His-MsNAC2、pPIC9-His-MsNAC3酶切結(jié)果Figure 2 pPIC9-His-MsNAC2,pPIC9-His-MsNAC3 digestion
分別將重組載體pPIC9-His-MsNAC2和pPIC9-His-MsNAC3用SacⅠ進行單酶切,酶切回收產(chǎn)物用酵母轉(zhuǎn)化試劑盒轉(zhuǎn)入野生畢赤酵母當中,對長出的單菌落進行PCR鑒定,在1000bp處存在明顯DNA條帶,表明線性化載體成功轉(zhuǎn)入畢赤酵母當中,確定了陽性轉(zhuǎn)化子進行下一步試驗(圖4)。
對重組酵母轉(zhuǎn)化子的發(fā)酵液上清進行SDS-PAGE和Western Bolt檢測,圖5中1號泳道為野生畢赤酵母,2號和3號泳道為MsNAC2重組酵母,4號和5號泳道為MsNAC3重組酵母。在2號、3號、4號和5號泳道中可見明顯單一蛋白條帶。其為Western bolt結(jié)果與SDS-PAGE結(jié)果對應(yīng),表明重組蛋白rMsNAC2和rMsNAC3得以表達,重組酵母正確,并分別將MsNAC2和MsNAC3的重組轉(zhuǎn)化子命名為A2和A3。
圖3 表達載體pPIC9-His-MsNAC2和pPIC9-His-MsNAC3示意圖Figure 3 pPIC9-His-MsNAC2 and pPIC9-His-MsNAC3 vector
圖4 pPIC9-His-MsNAC2和pPIC9-His-MsNAC3畢赤酵母轉(zhuǎn)化子菌落PCR鑒定圖Figure 4 PCR of pPIC9-His-MsNAC2 and pPIC9-His-Ms-NAC3 P.pastoris transformants colonies
圖5 rMsNAC2、rMsNAC3的SDS-PAGE和Western Bolt檢測結(jié)果Figure 5 SDS-PAGE detection results of rMsNAC2 and rMsNAC3
由圖6可知,A2、A3和CK在非脅迫條件下(30℃,YPD)表現(xiàn)出相似的生長力,生命力和成活率無明顯差異,表明轉(zhuǎn)入MsNAC2和MsNAC3對酵母的正常生長發(fā)育未產(chǎn)生較大的影響。在16℃處理5d時,CK幾乎不生長,A2和A3仍可以生長,并且A2表現(xiàn)出更好的耐受性;在37℃處理2d時,酵母稀釋10倍的情況下,明顯可以看出A2和A3依然保持著較高的成活率,而CK的成活率明顯低于A2和A3。在溫度脅迫下,轉(zhuǎn)基因酵母成活率明顯高于野生型,且A2>A3>CK。在100mmol·L-1NaCl處理2d,酵母稀釋1000倍的情況下,A2和A3的生長情況略好于CK;將NaCl濃度提高到200mmol·L-1時處理2d,酵母稀釋10倍的情況下,CK無生長跡象,而A2和A3依然可以生長,并且A2成活率最高。試驗表明,酵母中轉(zhuǎn)入MsNAC2和MsNAC3有助于提高其對溫度、鹽脅迫的耐受性,且酵母A2在成活率和生命力上表現(xiàn)得最為優(yōu)異。
圖6 CK、A2、A3酵母在不同處理下斑點圖Figure 6 Spots of CK,A2 and A3 yeast under different treatments
非生物脅迫對植物生長和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)有著不利的影響。NAC蛋白作為植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,在調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育過程和非生物脅迫反應(yīng)中起著重要作用。大量研究表明,許多響應(yīng)脅迫的NAC轉(zhuǎn)錄因子已被用于基因工程來提高作物的抗逆性。
近年來,利用酵母表達系統(tǒng)對抗逆基因的功能進行分析已經(jīng)成為常規(guī)手段。GAO等[21]將ThVHAc1基因轉(zhuǎn)入酵母,對其進行抗鹽、干旱、活性氧、重金屬、低溫、高溫等脅迫的功能分析。楊桂燕等[22]從檉柳中克隆獲得ThGSTZ1基因,將其構(gòu)建到表達載體pYES2上,轉(zhuǎn)化酵母并獲得了過表達酵母株系(pYES2-ThGSTZ1),對過表達ThGSTZ1基因酵母進行不同的脅迫處理,從而研究該基因在酵母中的抗逆功能。這種例子還有很多,如粟莉圓等[23]將轉(zhuǎn)JrDSTau1基因酵母進行鹽、鎘、溫度的脅迫處理,相較于對照組,轉(zhuǎn)基因酵母展現(xiàn)出更強的生命力和更高的成活性。眾多的試驗也證明了酵母表達系統(tǒng)是研究抗逆基因功能的良好材料。本研究也利用了酵母表達系統(tǒng),先在紫花苜蓿cDNA中克隆MsNAC2和MsNAC3基因,構(gòu)建pPIC9-His-MsNAC2和pPIC9-His-MsNAC3真核穿梭載體,轉(zhuǎn)入畢赤酵母,最后通過PCR、SDS-PAGE、West bolt的分子手段鑒定得到MsNAC2和MsNAC3轉(zhuǎn)基因株系A(chǔ)2、A3。在試驗設(shè)計中,為保證轉(zhuǎn)基因菌株篩選正確,規(guī)避PCR檢測的假陽性,在基因的C端引入組氨酸標簽用來蛋白表達檢測。劉昀等[24]在探究外源PM2蛋白及缺失多肽的表達可提高酵母的耐鹽能力時,分別用了帶組氨酸標簽和不帶組氨酸標簽的轉(zhuǎn)基因菌株進行了試驗,兩種方法耐鹽的保護作用大小均為:PM2C>PM2B>PM2A≈PM2,表明組氨酸標簽的存在并未影響LEA3融合蛋白的耐鹽能力[24]。說明引入組氨酸標簽不僅不會影響基因在酵母中的功能,并且有利于轉(zhuǎn)基因酵母的篩選和鑒定。
NAC轉(zhuǎn)錄因子一旦被激活,可以與基因啟動子中的NAC識別序列(NACR)結(jié)合,通過調(diào)節(jié)下游非生物脅迫耐受性的靶基因轉(zhuǎn)錄從而提高植物的耐受性。本研究以轉(zhuǎn)pPIC9空載體酵母作為對照,比較MsNAC2和Ms-NAC3轉(zhuǎn)基因菌株A2、A3與CK的抗逆能力差異。試驗結(jié)果表明,在鹽脅迫處理下A2、A3和CK具有明顯差異,酵母的成活率呈現(xiàn)出A>A3>CK的趨勢。在香蕉中用組成型啟動子過表達MusaNAC68基因,其許多應(yīng)激反應(yīng)基因的表達量有所提高,包括DREB、CBF和LEA基因等,并提高了香蕉的耐鹽性[25]。根據(jù)XU等[26]的研究表明,馬鈴薯StNAC2基因可以響應(yīng)多種非生物脅迫和SA、AB的應(yīng)用誘導,其過度表達還賦予轉(zhuǎn)基因馬鈴薯植株耐旱和耐鹽性。類似的,菊花DgNAC1基因在轉(zhuǎn)基因煙草中的過度表達明顯增強了煙草對鹽的耐受性[27]。鷹嘴豆CANAC3基因和番茄SlNAC3的異源表達分別提高了轉(zhuǎn)基因楊樹和番茄的耐旱性和耐鹽性[28-29]。在番茄中沉默SlNAC11基因降低了番茄耐鹽性和耐旱性,并影響了一些生理指標[30]。大多數(shù)NAC基因具有耐鹽和耐旱性,但在一些例子中也顯示了其具有耐溫度脅迫的能力。擬南芥中過度表達小麥TaNAC2L轉(zhuǎn)錄因子,可以激活下游AtHsfA3、AtDREB2A、LEA等熱相關(guān)基因的表達來增強植株耐熱性;在擬南芥植株中過度表達Gm-NAC20和GmNAC11基因分別增強了植株冷和鹽的耐受性,可能與這些基因參與DREB/CBF途徑和其他脅迫相關(guān)基因的交互作用導致的[31]。本研究中也對MsNAC2和MsNAC3基因響應(yīng)溫度脅迫進行了試驗,溫度脅迫處理下A2、A3和CK也同樣有顯著差異,在37℃和16℃條件下酵母的成活率呈現(xiàn)出A2>A3>CK的趨勢。本研究表明,紫花苜蓿MsNAC2和MsNAC3可以提高酵母的抗逆性,MsNAC2基因的抗逆功能優(yōu)于MsNAC3,推測可能與有轉(zhuǎn)錄激活功能又高度變異的C端有關(guān)。MsNAC2和MsNAC3基因能積極地響應(yīng)非生物脅迫應(yīng)答,Ms-NAC2和MsNAC3基因可作為植物逆境適應(yīng)機制研究的重要候選基因。