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      廣豐千金薯和鐵棍山藥脫毒微型塊莖的轉(zhuǎn)錄組分析

      2022-10-26 11:20:54尹明華陳舒敏程佳慧馮麗文
      關(guān)鍵詞:廣豐類黃酮千金

      尹明華,白 麗,陳舒敏,程佳慧,馮麗文

      (1.上饒師范學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院,江西 上饒 334001; 2.上饒農(nóng)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新研究院,江西 上饒 334001; 3.上饒市藥食同源植物資源保護(hù)與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江西 上饒 334001; 4.上饒市薯芋類作物種質(zhì)保存與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江西 上饒 334001)

      廣豐千金薯(Turczaninow. cv. Guangfeng Qianjin)是江西省上饒市廣豐區(qū)傳統(tǒng)名優(yōu)地方山藥品種,為薯蕷科薯蕷屬多年生草本植物。廣豐千金薯藥食部位為其地下塊莖,藥用食用效果俱佳,肉質(zhì)綿密粉嫩、軟糯爽口,具有健脾、助消化、補(bǔ)虛勞、益氣、祛痰、降脂、抗腫瘤、增加免疫作用等功效,被譽(yù)為“廣豐人參”。廣豐千金薯更是一種天然的纖體美食,纖維較多,食后易產(chǎn)生飽脹感,有控食減肥作用,聞名省內(nèi)外,深受消費(fèi)者青睞。有研究表明,廣豐千金薯尤以廣豐少陽(yáng)地產(chǎn)的千金薯質(zhì)量上乘、口感非凡、與眾不同。本課題組采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RAPD-PCR)技術(shù)對(duì)來(lái)自江西的11份山藥種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析,證實(shí)廣豐千金薯和鐵棍山藥(Turczaninow. cv. Tiegun,產(chǎn)地為河南溫縣)可以聚為一類,但廣豐千金薯和鐵棍山藥之間的分子差異尚無(wú)相關(guān)報(bào)道。隨著廣豐千金薯需求量劇增,其規(guī)?;a(chǎn)得到極大重視,而傳統(tǒng)廣豐千金薯多采用塊莖的栽子進(jìn)行營(yíng)養(yǎng)繁殖,導(dǎo)致其病毒感染嚴(yán)重,產(chǎn)量逐年下降,品質(zhì)不斷退化。因此,脫除廣豐千金薯病毒,改善廣豐千金薯品質(zhì),提高廣豐千金薯產(chǎn)量,已成為廣豐千金薯生產(chǎn)中亟待解決的問(wèn)題之一。利用植物莖尖培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)行脫毒快繁是培育脫毒苗的有效途徑,但通過(guò)此種方法獲得的脫毒苗植株細(xì)弱,移栽成活率偏低,且不利于包裝和長(zhǎng)途運(yùn)輸,這給脫毒苗的規(guī)?;瘧?yīng)用帶來(lái)了極大的局限。微型塊莖是山藥組織培養(yǎng)過(guò)程腋芽形成的變態(tài)小塊莖,可在黑暗低溫下長(zhǎng)期保存,且體積小便于運(yùn)輸,可用于山藥田間的規(guī)模化繁殖;利用脫毒苗獲得的脫毒微型塊莖更是山藥優(yōu)質(zhì)種苗的重要來(lái)源。微型塊莖的化學(xué)成分和山藥地下塊莖大致相同,藥理與臨床效果也相似,可抗氧化、降血糖、調(diào)節(jié)免疫、抗肝損傷、抗病毒等,具有重要的藥用價(jià)值。

      轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析已成為開展基因功能研究的重要方法。關(guān)于微型塊莖的研究主要集中在酶基因克隆和序列分析、遺傳轉(zhuǎn)化體系建立、誘導(dǎo)形成生理生化、萌發(fā)因素、誘變處理等方面,而關(guān)于薯蕷類植物品種間微型塊莖的轉(zhuǎn)錄組分析尚無(wú)報(bào)道。本研究以廣豐千金薯和鐵棍山藥的脫毒微型塊莖作為試驗(yàn)材料,對(duì)其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,探究廣豐千金薯脫毒微型塊莖生化成分代謝的分子機(jī)制,旨在為進(jìn)一步利用廣豐千金薯脫毒微型塊莖進(jìn)行遺傳育種和品種鑒定提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      脫毒微型塊莖是廣豐千金薯(以下簡(jiǎn)稱QJS,上饒市廣豐區(qū)少陽(yáng)鄉(xiāng))和鐵棍山藥(以下簡(jiǎn)稱TGSY,河南溫縣)脫毒苗(由上饒師范學(xué)院上饒市薯芋類作物種質(zhì)保存與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供)在統(tǒng)一時(shí)間(60 d)誘導(dǎo)形成的。

      1.2 方法

      1.2.1 RNA提取和檢測(cè)

      采用植物總RNA 提取試劑盒(Invitrogen Ambion)提取QJS和TGSY脫毒微型塊莖的RNA,用Agilent 2100 bioanalyzer精確檢測(cè)RNA完整性。

      1.2.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析

      QJS和TGSY脫毒微型塊莖的RNA交由北京諾禾致源生物科技有限公司利用Illumina HiSeqTM2500測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。首先通過(guò)Oligo(dT)磁珠富集帶有polyA尾的mRNA,隨后在NEB Fragmentation Buffer中用二價(jià)陽(yáng)離子將得到的mRNA隨機(jī)打斷,以片段化的mRNA為模版,以隨機(jī)寡核苷酸為引物,在M-MuLV逆轉(zhuǎn)錄酶體系中合成cDNA第一條鏈,隨后用RNaseH降解RNA鏈,并在DNA polymerase Ⅰ體系下,以dNTPs為原料合成cDNA第二條鏈。純化后的雙鏈cDNA經(jīng)過(guò)末端修復(fù)、加A尾并連接測(cè)序接頭,用AMPure XP beads篩選250~300 bp的cDNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增并再次使用AMPure XP beads純化PCR產(chǎn)物,最終獲得文庫(kù)。文庫(kù)構(gòu)建后,用Illumina平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序的基本原理是邊合成邊測(cè)序(sequencing by synthesis)。經(jīng)過(guò)原始數(shù)據(jù)過(guò)濾、測(cè)序錯(cuò)誤率檢查、GC含量分布檢查,獲得后續(xù)分析使用的clean reads再進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組重構(gòu),得到全部的轉(zhuǎn)錄本。

      1.2.3 差異表達(dá)基因的篩選和富集分析

      差異表達(dá)基因的篩選標(biāo)準(zhǔn)為差異倍數(shù)(FC)≥2,且錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)<0.01。篩選出的差異表達(dá)基因的富集分析:GO(gene ontology)富集分析是基于描述基因功能的綜合性數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.geneontology.org/)的分析;KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析是基于有關(guān)pathway主要公共數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html)的分析。

      1.2.4 SNP、InDel和SSR分析

      通過(guò)samtools和picard-tools等工具對(duì)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行染色體坐標(biāo)排序、去掉重復(fù)的read等處理,最后通過(guò)變異檢測(cè)軟件GATK3分別進(jìn)行SNP Calling和InDel Calling,并對(duì)原始結(jié)果進(jìn)行過(guò)濾(過(guò)濾掉質(zhì)量值小于40,距離小于2的SNP);采用MISA軟件(1.0版)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行SSR檢測(cè)和分析。

      1.3 差異表達(dá)基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)驗(yàn)證

      根據(jù)1.2.3節(jié)的結(jié)果,找出與淀粉合成、塊莖膨大、黃酮類代謝物相關(guān)的差異表達(dá)基因,以為內(nèi)參基因,設(shè)計(jì)基因引物(表1),進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。PCR反應(yīng)程序:95 ℃ 30 s;95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)。使用2-△△C法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)水平。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

      表1 差異表達(dá)基因的qRT-PCR引物

      所有數(shù)據(jù)表示為平均值,并使用SPSS19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,應(yīng)用單因素方差分析(One-way ANOVA)檢驗(yàn)與淀粉合成、塊莖膨大、黃酮類代謝物相關(guān)的差異表達(dá)基因在QJS和TGSY脫毒微型塊莖中表達(dá)的差異顯著性。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)

      經(jīng)過(guò)原始數(shù)據(jù)過(guò)濾、測(cè)序錯(cuò)誤率檢查、GC含量分布檢查,獲得后續(xù)分析使用的clean read(原始數(shù)據(jù)過(guò)濾后的read數(shù))(表2)。由表2可知,QJS組raw read(原始數(shù)據(jù)中的read數(shù))為22 686 888,clean read(原始數(shù)據(jù)過(guò)濾后的read數(shù))為21 821 043,clean bases(原始數(shù)據(jù)過(guò)濾后的堿基數(shù))為6.55 G,error rate(數(shù)據(jù)整體測(cè)序錯(cuò)誤率)為0.03%,Q20和Q30(Phred數(shù)值大于20或大于30的堿基占總堿基的百分比)分別為98%和94.1%,GC含量為46%;TGSY組raw read為22 152 964,clean read為21 470 765,clean bases為6.44 G,error rate為0.02%,Q20和Q30分別為98.08%和94.3%,GC含量為45.59%。

      表2 QJS組和TGSY組的測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)

      表3 QJS組和TGSY組的測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)

      2.2 拼接轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度分布

      將Trinity拼接得到的轉(zhuǎn)錄本序列作為后續(xù)分析的參考序列。以Corset層次聚類后得到的最長(zhǎng)cluster序列進(jìn)行后續(xù)分析。轉(zhuǎn)錄本與聚類序列長(zhǎng)度的統(tǒng)計(jì)結(jié)果見(jiàn)表3。由表3可知,300~500 bp的transcript數(shù)量和unigene數(shù)量分別為21 413和11 661,500~1 000 bp的transcript數(shù)量和unigene數(shù)量分別為25 033和9 924,1 000~2 000 bp的transcript數(shù)量和unigene數(shù)量分別為23 152和8 117,>2 000 bp的transcript數(shù)量和unigene數(shù)量分別為11 940和4 365,transcript和unigene的總數(shù)量分別為81 538和34 067。

      2.3 參考序列比對(duì)

      QJS組比對(duì)到參考序列上的read總數(shù)為43 642 086,能定位到參考序列上的測(cè)序序列數(shù)量和百分比為33 797 934、77.44%;TGSY組比對(duì)到參考序列上的read總數(shù)為42 941 530,能定位到參考序列上的測(cè)序序列數(shù)量和百分比為32 366 580、75.37%。

      2.4 樣本間相關(guān)性

      樣品間基因表達(dá)水平相關(guān)性是檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)可靠性和樣本選擇是否合理的重要指標(biāo)。相關(guān)系數(shù)越接近1,表明樣品之間表達(dá)模式的相似度越高。經(jīng)過(guò)分析可知,QJS組和TGSY組樣本間相關(guān)系數(shù)為0.42,表明QJS組和TGSY組2個(gè)樣本間的相關(guān)性較低。

      2.5 表達(dá)量統(tǒng)計(jì)

      由圖1-A可知,QJS組和TGSY組表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值在0~1.5,其中,QJS組表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值為0.2~1.2,TGSY組表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值為0.3~1.3,表明TGSY組基因的表達(dá)量比QJS組高。由圖1-B可知,QJS組和TGSY組表達(dá)量密度在0~1.0,其中,TGSY組表達(dá)量密度為0~0.6,QJS組表達(dá)量密度為0~0.9,表明QJS組基因的表達(dá)量密度比TGSY組高。

      圖1 QJS組和TGSY組FPKM盒形圖和FPKM密度分布圖Fig.1 FPKM distribution Boxplo and FPKM density distribution map in QJS and TGSY group

      2.6 差異表達(dá)基因數(shù)量統(tǒng)計(jì)

      與TGSY組相比,QJS組有4 765個(gè)基因下調(diào),有5 112個(gè)基因上調(diào)。圖2為QJS組和TGSY組差異表達(dá)基因Venn圖。Venn圖中重疊區(qū)域表示2個(gè)品種間共有的差異表達(dá)基因數(shù)量。從圖2可知,QJS組和TGSY組表達(dá)的共有基因數(shù)為25 207,QJS組單獨(dú)表達(dá)的基因數(shù)為5 261,TGSY組單獨(dú)表達(dá)的基因數(shù)量為3 571。

      圖2 QJS組和TGSY組差異表達(dá)基因Venn圖Fig.2 Venn map of differentially expressed genes in QJS group and TGSY group

      2.7 差異表達(dá)基因GO富集分析

      GO(gene ontology)是描述基因功能的綜合性數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.geneontology.org/),可分為生物過(guò)程(biological process)、細(xì)胞組成(cellular component)和分子功能(molecular function)3個(gè)部分。共有4 528個(gè)差異表達(dá)基因富集到3 892個(gè)GO term,上調(diào)基因富集到3 194個(gè)GO term,下調(diào)基因富集到3 181個(gè)GO term(圖3),富集顯著的前20個(gè)GO term見(jiàn)表4,包括核糖體的結(jié)構(gòu)成分(structural constituent of ribosome)、結(jié)構(gòu)分子活性(structural molecule activity)、細(xì)胞成分組織或生物發(fā)生(cellular component organization or biogenesis)、核糖體(ribosome)、細(xì)胞成分生物發(fā)生(cellular component biogenesis)、核糖體生物發(fā)生(ribosome biogenesis)等。

      1,細(xì)胞成分組織;2,細(xì)胞成分與生物發(fā)生;3,核糖體;4,核糖體結(jié)構(gòu)成分;5,結(jié)構(gòu)分子活性。1, Cellular component organization; 2, Cellular component biogenesis; 3, Ribosome; 4, Structural constituent of ribosome; 5, Structural molecule activity.圖3 QJS組和TGSY組差異表達(dá)基因GO富集分析柱形圖Fig.3 Column chart of GO enrichment analysis of differentially expressed genes in QJS group and TGSY group

      表4 部分差異表達(dá)基因GO富集結(jié)果

      2.8 SNP和InDel分析

      從表5可知,QJS組和TGSY組共發(fā)現(xiàn)611 498個(gè)SNP位點(diǎn)。SNP的堿基替換方式分為轉(zhuǎn)換和顛換2種類型,其中堿基轉(zhuǎn)換位點(diǎn)數(shù)量(237 083個(gè),6.56%)顯著少于顛換位點(diǎn)(374 415個(gè),10.37%)。在轉(zhuǎn)換類型中,C/T發(fā)生頻率(30.783%)大于A/G(3.28%);4種顛換類型中,A/T的發(fā)生頻率最高,為1.15%;其次是A/C和T/G,分別為0.95%、0.97%;C/G發(fā)生頻率最低,為0.73%。

      表5 SNP部分分析結(jié)果

      2.9 SSR分析

      采用MISA軟件對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行SSR檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)表6。同時(shí)還對(duì)不同SSR類型在基因轉(zhuǎn)錄本的密度分布進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果如圖4所示。從表6和圖4可知,大多數(shù)基因具有單堿基重復(fù)(p1)、2個(gè)堿基重復(fù)(p2)、3個(gè)堿基重復(fù)(p3)和4個(gè)堿基重復(fù)(p4),共發(fā)現(xiàn)12 056個(gè)SRR,其中包含1 179個(gè)混合型SSR和8 663個(gè)完整型SSR位點(diǎn),表明廣豐千金薯SSR標(biāo)記的數(shù)量極其豐富。

      表6 部分SSR檢測(cè)結(jié)果

      圖4 SSR在轉(zhuǎn)錄本上的密度分布Fig.4 Density distribution of SSR on transcripts

      2.10 差異表達(dá)基因的qRT-PCR驗(yàn)證

      為了驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測(cè)序差異表達(dá)基因表達(dá)的可靠性,選取與淀粉合成、塊莖膨大、黃酮類代謝物相關(guān)的差異表達(dá)基因進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。由表7可知,qRT-PCR測(cè)定的10個(gè)DEGs在QJS組和TGSY組中的表達(dá)水平趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序基因的表達(dá)趨勢(shì)一致,表明本研究中得到的DEGs是可信的。從表7還可以看出,與TGSY組相比,QJS組的淀粉合成酶3、α-淀粉酶3、β-淀粉酶、類黃酮3′-單加氧酶、類黃酮3′-羥化酶、花青素合酶基因上調(diào),而顆粒結(jié)合淀粉合酶2、蔗糖合酶1、擴(kuò)展蛋白2和苯丙氨酸解氨酶等基因下調(diào)。

      表7 差異表達(dá)基因的qRT-PCR驗(yàn)證

      3 討論

      山藥脫毒微型塊莖可代替脫毒苗應(yīng)用于大田生產(chǎn),也可用于食療和功能性食品,對(duì)一些疾病的治療起到重要的輔助作用。研究表明,SNP和Indel位點(diǎn)廣泛分布在基因組中。小果甜柿(Thunb.)的轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)到1 070 614個(gè)SNP位點(diǎn)。本試驗(yàn)共發(fā)現(xiàn)611 498個(gè)SNP位點(diǎn)。從理論上講,轉(zhuǎn)換的SNP位點(diǎn)與顛換的SNP位點(diǎn)比例一般為0.5,在本試驗(yàn)中,轉(zhuǎn)換的SNP位點(diǎn)與顛換的SNP位點(diǎn)比例為0.63,與理論值較為接近,而小果甜柿轉(zhuǎn)換的SNP位點(diǎn)與顛換的SNP位點(diǎn)比例為1.69,屬于轉(zhuǎn)換偏差,可能與進(jìn)化選擇相關(guān),并非隨機(jī)出現(xiàn)。SSR序列一般可以體現(xiàn)物種的進(jìn)化水平,并影響基因的功能。小果甜柿果實(shí)的轉(zhuǎn)錄組中發(fā)現(xiàn)SSR種類十分豐富,以單個(gè)堿基、2個(gè)堿基和3個(gè)堿基為主。本試驗(yàn)結(jié)果與此一致。李府貢棗(Mill.)轉(zhuǎn)錄組的42 570條基因組數(shù)據(jù)庫(kù)序列中發(fā)現(xiàn)18 016個(gè)SSR,其中包含1 442個(gè)混合型SSR和13 033個(gè)完整型SSR位點(diǎn)。在本試驗(yàn)中,廣豐千金薯轉(zhuǎn)錄組共發(fā)現(xiàn)12 056個(gè)SSR,其中包含1 179個(gè)混合型SSR和8 663個(gè)完整型SSR位點(diǎn),表明廣豐千金薯 SSR標(biāo)記的數(shù)量較為豐富。

      目前發(fā)現(xiàn)的淀粉合成酶基因主要有3種,包括淀粉合成酶1、淀粉合成酶2和淀粉合成酶3,三者高度同源,區(qū)別在于N-端氨基酸長(zhǎng)度存在差異。淀粉合成酶起到延伸支鏈淀粉和直鏈淀粉葡萄糖鏈的作用,顆粒結(jié)合淀粉合酶主要涉及直鏈淀粉的延長(zhǎng)。在本試驗(yàn)中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的淀粉合成酶3基因上調(diào)、顆粒結(jié)合淀粉合酶2下調(diào),表明與鐵棍山藥脫毒微型塊莖相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的淀粉合成酶3活性較強(qiáng),有利于支鏈淀粉的合成,顆粒結(jié)合淀粉合酶2活性較低,直鏈淀粉的合成稍微偏弱,這可能是廣豐千金薯脫毒微型塊莖肉質(zhì)綿密粉嫩、軟糯爽口的內(nèi)在原因。蔗糖合酶可參與蔗糖的運(yùn)輸和分配、淀粉和纖維素的合成、細(xì)胞壁組成、生物與非生物逆境等生理過(guò)程。在本試驗(yàn)中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的蔗糖合酶1基因下調(diào),表明與鐵棍山藥脫毒微型塊莖相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的蔗糖合酶1活性較弱,不利于其蔗糖的運(yùn)輸和分配。α-淀粉酶是一種內(nèi)切酶,可以將淀粉分解為麥芽糖、麥芽三糖、葡萄糖和少量大分子極限糊精,積極參與植物體的多種生命活動(dòng),響應(yīng)外界的生物與非生物脅迫。β-淀粉酶負(fù)責(zé)儲(chǔ)藏型淀粉的水解和過(guò)渡型淀粉的降解,產(chǎn)生β-極限糊精和β-麥芽糖,參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)。在本研究中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的α-淀粉酶3和β-淀粉酶基因上調(diào),表明與脫毒微型塊莖鐵棍山藥相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的α-淀粉酶3和β-淀粉酶活性較強(qiáng),有利于其淀粉轉(zhuǎn)化為麥芽糖,在調(diào)控廣豐千金薯脫毒微型塊莖生長(zhǎng)發(fā)育和非生物脅迫耐受過(guò)程中起到重要作用。油類黃酮3′-單加氧酶和類黃酮-3′-羥化酶均是類黃酮化合物生物合成途徑中的關(guān)鍵酶,花青素合酶可將無(wú)色花青素轉(zhuǎn)化為有色花青素,是花青素合成途徑的關(guān)鍵酶之一,可參與低溫、紫外線脅迫和植物病害防治。在本試驗(yàn)中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的類黃酮3′-單加氧酶、類黃酮-3′-羥化酶和花青素合酶基因上調(diào),表明與鐵棍山藥脫毒微型塊莖相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的類黃酮3′-單加氧酶和類黃酮-3′-羥化酶活性較強(qiáng),有利于其類黃酮化合物和花青素合成,在調(diào)控廣豐千金薯脫毒微型塊莖生長(zhǎng)發(fā)育和防御過(guò)程中起到重要作用。植物擴(kuò)展蛋白主要與植株抗逆性相關(guān),在高溫、高鹽、干旱等非生物脅迫,以及病害、蟲害等生物脅迫應(yīng)答中具有重要作用。在研究中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的擴(kuò)展蛋白2基因下調(diào),表明與鐵棍山藥脫毒微型塊莖相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的擴(kuò)展蛋白2活性較弱,打斷半纖維素和纖維素氫鍵、疏松細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)能力不足,導(dǎo)致纖維素含量較豐富,這也是廣豐千金薯脫毒微型塊莖是一種天然的纖體美食、食后易產(chǎn)生飽脹感、可控食減肥的內(nèi)在原因。苯丙氨酸解氨酶可以催化-苯丙氨酸或酪氨酸脫氨,產(chǎn)生反式肉桂酸,最終進(jìn)入類黃酮代謝、木質(zhì)素代謝、香豆素代謝等,可以抵御植物抗病原菌的入侵,免除病原生物的侵染。在本研究中,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的苯丙氨酸解氨酶基因下調(diào),表明與鐵棍山藥脫毒微型塊莖相比,廣豐千金薯脫毒微型塊莖的苯丙氨酸解氨酶活性較弱,木質(zhì)素和酚類等次生物質(zhì)的合成下降,導(dǎo)致次生壁中的木質(zhì)素含量下降,廣豐千金薯脫毒微型塊莖耐病程度降低。

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