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      舟山海島地區(qū)蜱媒病原體多樣性及其基因同源性分析

      2022-11-03 08:01:56李科峰梁思慧戴亞欣劉潔楠仝振東
      關(guān)鍵詞:立克次體形體病原體

      李科峰 梁思慧 戴亞欣 劉潔楠 仝振東

      舟山市疾病預(yù)防控制中心傳防科,舟山 316021

      蜱屬體外寄生生物,寄生于兩棲類(lèi)、鳥(niǎo)類(lèi)、爬行類(lèi)和哺乳類(lèi)等動(dòng)物,部分種類(lèi)可侵襲人類(lèi),傳播多種病原體。研究表明,蜱的整個(gè)生命周期均可攜帶病原體[1-2],其造成的危害僅次于蚊類(lèi)[3-4]。據(jù)報(bào)道,全球以發(fā)熱伴血小板減少綜合征為代表的蜱媒傳染病(TBD)發(fā)病率不斷上升[5-6]。舟山市蜱密度高,有學(xué)者在岱山采集到的長(zhǎng)角血蜱中檢測(cè)出無(wú)形體和一種新的埃立克體病原體[7]。本研究采集舟山各縣區(qū)環(huán)境中的游高蜱或者動(dòng)物身上的寄生蜱,開(kāi)展TBD病原體的檢測(cè),了解其分布,為舟山市TBD防控提供科學(xué)依據(jù),現(xiàn)報(bào)告如下。

      材料與方法

      一、蜱樣本的采集與分類(lèi)

      2020年4—11月采集舟山各縣區(qū)不明原因發(fā)熱伴血小板減少征病例居住環(huán)境中的游離蜱及家畜身上的寄生蜱。選用布旗法,采集野外草地上的游離未吸血蜱;選用畜體檢查法,采集家畜身上的寄生蜱,于實(shí)驗(yàn)室解剖顯微鏡下進(jìn)行分類(lèi)。

      二、試劑與儀器

      一步法實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR試劑盒(RR064A)、一步法RT-PCR試劑盒(RR055A)、PCR試劑盒(RR902A)均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司,新布尼亞病毒、腹地病毒、流行性出血熱病毒(漢城型)、流行性出血熱病毒(漢灘型)、嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體的實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR的引物、探針、測(cè)序用引物以及陽(yáng)性重組質(zhì)粒委托寶生物工程(大連)有限公司合成與構(gòu)建。嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體與查菲埃立克體巢式PCR引物委托第三方生物技術(shù)公司合成。

      主要儀器有Ⅱ級(jí)生物安全柜(美國(guó)LABCONCO公司)、ViiA7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(美國(guó)ABI公司)、普通PCR儀(美國(guó)ABI公司)、成像儀(美國(guó)ABI公司)、LEGEND MICRO冷凍高速離心機(jī)(德國(guó)Thermo公司)、MM400混合球磨儀(德國(guó)Retsch公司)。

      三、核酸制備

      將采集的蜱樣本根據(jù)體型大小選取3~6只為1組,放入2 mL EP管中,用25%酒精消毒蜱體表1 min后,去除上清液。加入1 mL 2-甲氧基乙氧基甲基氯(MEM)渦旋清洗,8 000轉(zhuǎn)/min離心(離心半徑8.4 cm),5 min去除上清液,反復(fù)3次。加入500 μL MEM后,于低溫下在MM400混合球磨儀中以50 Hz研磨2 min,反復(fù)2次。8 000轉(zhuǎn)/min低溫離心5 min后(離心半徑8.4 cm),取上清液200 μL提取RNA進(jìn)行熒光RT-PCR檢測(cè)。余下300 μL上清液,其中200 μL用于復(fù)核,100 μL用于病毒分離。

      四、核酸檢測(cè)

      實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒(SFTS)RNA參照《發(fā)熱伴血小板減少綜合征防治指南(2010版)》[8]檢測(cè)方案,熒光RT-PCR引物探針序列參考中國(guó)CDC提供的序列[9];巢式PCR檢測(cè)嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體DNA參照中華人共和國(guó)出入境檢驗(yàn)檢疫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)-國(guó)境口岸蜱類(lèi)攜帶嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體的PCR檢測(cè)方法(SN/T 4009-2014);巢式PCR檢測(cè)查菲埃立克體DNA參照湖北省CDC張令要等[10]報(bào)道方法,運(yùn)用PCR對(duì)采集的蜱樣本進(jìn)行嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體16S rRNA基因片段進(jìn)行擴(kuò)增和序列分析。蜱樣本中嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體與立克次體通用引物PCR電泳陽(yáng)性條帶者再用特異引物進(jìn)行電泳。熒光RT-PCR引物探針和巢式PCR引物詳見(jiàn)表1和表2。

      表1 五種病原體實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)引物探針序列

      表2 嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體與相關(guān)體巢式PCR外套引物序列

      結(jié) 果

      一、蜱樣本采集及檢測(cè)情況

      共采集蜱樣本99只,其中游離蜱樣本39只,寄生蜱樣本60只。根據(jù)是否游離蜱進(jìn)行分組,分為20組,每組3~6只蜱蟲(chóng),1~7組為游離蜱(共7組),8~20組為寄生蜱(共13組)。

      本研究未檢出查菲埃立克體、新型布尼亞病毒、漢坦與漢城病毒。在7組游離蜱樣本和13組寄生蜱樣本中,分別有3組和1組檢測(cè)出嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體。此外,在游離蜱樣本中,分別有2組和1組檢測(cè)出立克次體和沃爾巴克體;在寄生蜱樣本中檢測(cè)出1組山羊無(wú)形體。其余組別的病原體檢出均陰性。蜱蟲(chóng)樣本PCR檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖1和圖2。

      圖1 舟山海島地區(qū)蜱樣本中嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體與立克次體通用引物PCR電泳圖

      圖2 舟山海島地區(qū)蜱樣本中嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體與立克次體特異引物PCR電泳圖

      二、序列分析結(jié)果

      巢式PCR檢測(cè)陽(yáng)性結(jié)果經(jīng)16S rRNA[11]基因測(cè)序顯示,2號(hào)組樣本為沃爾巴克體,與日本報(bào)道的沃爾巴克體(AB025965)同源性為98.70%,與無(wú)形體16S rRNA基因序列相似度為88.50%~88.70%。3和6號(hào)組樣本為立克次體,與中國(guó)云南立克次體03(KY433580)、日本立克次體LA16[12]同源性為99.83%,與無(wú)形體16S rRNA基因序列相似度達(dá)82.60%~83.90%。4、5、7、18號(hào)組為嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體(同源性為97.74%~99.75%),在基因進(jìn)化中可分為2個(gè)分支,5和18號(hào)組為一個(gè)進(jìn)化分支與安徽桐城(MK045683)及韓國(guó)濟(jì)州島(GU064903)的嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體同源性為100%;4和7號(hào)組與安徽金寨的嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體 (MK045694)同源性為99.70%。詳見(jiàn)圖3和4。

      圖3 舟山海島地區(qū)無(wú)形體、立克次體與沃爾巴克16SrRNA基因進(jìn)化樹(shù)

      圖4 舟山海島地區(qū)無(wú)形體16S rRNA基因進(jìn)化樹(shù)

      討 論

      自2011年舟山市首次報(bào)告發(fā)熱伴血小板減少綜合征病例以來(lái),疫情逐年上升,一度成為浙江省發(fā)熱伴血小板減少綜合征發(fā)病率最高的地區(qū)[13]。在監(jiān)測(cè)中發(fā)現(xiàn),每年均有部分有蜱叮咬史的病例檢測(cè)新型布尼亞病毒呈陰性,分析原因可能攜帶其他病原體。在本次研究中,我們首次在舟山海島地區(qū)蜱發(fā)現(xiàn)攜帶日本立克次體、嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體、山羊無(wú)形體、沃爾巴克體等病原體,提示舟山居民有多種TBD病原體的暴露風(fēng)險(xiǎn),為當(dāng)?shù)豑BD的防控提供科學(xué)依據(jù),為其他地區(qū)相關(guān)研究提供參考。

      無(wú)形體感染會(huì)引起無(wú)形體病,該病是一種以發(fā)熱伴白細(xì)胞血小板減少和多臟器功能損害為主要臨床表現(xiàn)的人畜共患自然疫源性疾病[14-15]。立克次體屬分斑點(diǎn)熱群和斑疹傷寒群,是一類(lèi)能引起人感染而引發(fā)斑點(diǎn)熱的細(xì)菌,其中日本立克次體可引起日本斑點(diǎn)熱。浙江省學(xué)者曾在杭州臨安區(qū)的病例中分離到日本立克次體[12]。本文作者在舟山捕獲的游離蜱樣本中檢測(cè)出嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體、日本立克次體和沃爾巴通體3種病原體,在寄生蜱中檢出山羊無(wú)形體和嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體2種病原體,其中立克次體與中國(guó)云南立克次體03(KY433580)、日本立克次體LA16[12]同源性為99.83%;檢出的嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體其中一個(gè)進(jìn)化分支與安徽桐城(MK045683)及韓國(guó)濟(jì)州島(GU064903)的嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體同源性達(dá)100.00%,主要為游離蜱;另外一支與安徽金寨的嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體(MK045694)同源性為99.70%,包括游離蜱和寄生蜱。以上結(jié)果提示舟山市是嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體、山羊無(wú)形體和日本立克次體的自然疫源地,暴露居民存在感染風(fēng)險(xiǎn)。雖然本研究在捕獲的蜱蟲(chóng)中未檢出新型布尼亞病毒核酸,但舟山市是發(fā)熱伴血小板減少綜合征的疫區(qū),仍需要高度重視。

      利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

      作者貢獻(xiàn)聲明李科峰:課題設(shè)計(jì)、研究、論文撰寫(xiě);梁思慧、戴亞欣:數(shù)據(jù)分析、論文修改;劉潔楠、仝振東:蜱蟲(chóng)捕獲、檢測(cè)

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