王源朗,丁海生,趙輝玲,黃冬維
(安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,畜禽產(chǎn)品安全工程安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,合肥 230031)
家兔屬小型草食動(dòng)物,具有成本低、投資少、周期短、見效快等優(yōu)勢(shì),尤其適合欠發(fā)達(dá)地區(qū)大面積推廣飼養(yǎng)。家兔產(chǎn)業(yè)作為一種綠色經(jīng)濟(jì)型產(chǎn)業(yè),是中國節(jié)糧型畜牧業(yè)中極具代表性的產(chǎn)業(yè),但受供給和需求多重因素的影響,家兔產(chǎn)業(yè)在畜牧業(yè)中所占比重仍然較小。隨著中國耕地和水資源的日益稀缺,國家對(duì)糧食安全高度重視。家兔養(yǎng)殖中既有節(jié)約糧食,又有增加肉類供給的屬性,能夠較好地保障中國糧食安全[1]。家兔產(chǎn)業(yè)已迎來新的經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)點(diǎn),受到越來越多的關(guān)注,成為許多國家解決糧食短缺問題的有效途徑。種業(yè)是影響家兔產(chǎn)業(yè)發(fā)展的最重要環(huán)節(jié)之一,是決定家兔生產(chǎn)效率的最重要因素。中國養(yǎng)兔歷史悠久,但家兔育種工作起步較晚,目前仍處于初級(jí)階段,且由于長(zhǎng)期以“重引進(jìn)、輕培育、重改良,輕保種”為主,導(dǎo)致存在遺傳資源保護(hù)意識(shí)不強(qiáng),育種進(jìn)展緩慢,家兔生產(chǎn)發(fā)展與良種供需的矛盾日益突出[2]。自21世紀(jì)以來,隨著分子育種技術(shù)的高速發(fā)展,中國的育種工作有了長(zhǎng)足的進(jìn)步,逐步從傳統(tǒng)育種方式向傳統(tǒng)育種與分子育種相結(jié)合方式轉(zhuǎn)變,并不斷取得較好的進(jìn)展,如近年來川白獺兔、天府黑兔等新品種、新品系的成功培育[3-4]。作者綜述了2020年國內(nèi)外家兔遺傳育種及繁殖相關(guān)的研究進(jìn)展,以期為研究者提供新的思路,為家兔育種工作的新發(fā)展、新方向提供參考。
1.1.1 選擇效應(yīng)及性狀評(píng)估 雜交作為家畜育種的重要手段之一,通過合理選擇親本組合,將優(yōu)質(zhì)基因引入,再通過連續(xù)不斷的選擇培育出優(yōu)質(zhì)高效的雜交后代。隨著環(huán)保要求及消費(fèi)需求的不斷提升,集約化養(yǎng)殖和優(yōu)良肉質(zhì)供給將是動(dòng)物養(yǎng)殖業(yè)的普遍需求。同時(shí),也對(duì)選育過程中目標(biāo)性狀的精準(zhǔn)評(píng)估提出了新的要求。Suleman等[5]評(píng)估了4個(gè)不同品種家兔(荷蘭白兔、新西蘭白兔、美國黑兔、矮棕兔)及歐洲野兔在傳統(tǒng)飼養(yǎng)系統(tǒng)下的雄性斷奶仔兔的生長(zhǎng)性能和胴體品質(zhì),試驗(yàn)共選取50只斷奶雄性家兔,每個(gè)品種各10只,4周齡時(shí)對(duì)生長(zhǎng)性能進(jìn)行測(cè)定,于19周齡時(shí)進(jìn)行屠宰性能測(cè)定,結(jié)果表明,品種是決定家兔生長(zhǎng)性能和胴體品質(zhì)的最主要因素,生產(chǎn)中為獲得更高的屠宰重,建議使用歐洲野兔或新西蘭白兔。對(duì)于家兔來說,較高的體脂含量可以維系能量的攝取,而低體脂含量的群體卻是兔肉消費(fèi)市場(chǎng)的首選,因此,以瘦肉率為標(biāo)準(zhǔn)的篩選更符合市場(chǎng)需求[6]。Kasza等[7]將家兔劃分為脂肪型與瘦肉型群體,11周齡時(shí)屠宰并檢測(cè)生長(zhǎng)性能、屠宰率等指標(biāo),結(jié)果顯示,總脂肪含量的選擇對(duì)脂肪型與瘦肉型均有效,低體脂含量的選擇對(duì)終端父本更為有效,高脂肪含量的選擇使后代家兔的儲(chǔ)脂能力更具優(yōu)勢(shì)。
1.1.2 遺傳與環(huán)境互作 遺傳與環(huán)境既可以獨(dú)立又可以相互影響性狀,從而造成性狀變異,這種影響可能是由于環(huán)境的短期變化使不同基因型對(duì)環(huán)境變化產(chǎn)生反應(yīng)所致。Farghly等[8]將64只新西蘭白兔隨機(jī)分為4組(12 h光照,10:00至22:00;12 h光照,22:00至10:00;8 h光照,10:00至18:00;8 h光照,22:00至06:00),溫濕度指數(shù)(THI)控制在27.00~28.87,使各群體處于中度熱應(yīng)激環(huán)境下,對(duì)各群體相關(guān)生理指標(biāo)進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果表明,短時(shí)間的午后光照周期更適宜家兔生長(zhǎng),且對(duì)家兔生長(zhǎng)性能及其他生理指標(biāo)均有一定的促進(jìn)作用。Secci等[9]將81只新西蘭兔分為3組(開放組、封閉組、使用鏡子組)飼養(yǎng),49 d后屠宰對(duì)相關(guān)肉質(zhì)指標(biāo)進(jìn)行測(cè)定,以探究在散養(yǎng)區(qū)使用鏡子對(duì)家兔肉品質(zhì)和貯存穩(wěn)定性的影響,結(jié)果顯示,開放養(yǎng)殖是改善肉質(zhì)的最佳方案,使用鏡子可以最大限度地減少封閉環(huán)境飼養(yǎng)導(dǎo)致的負(fù)面影響,更貼合動(dòng)物福利的要求。
1.2.1 生長(zhǎng)及肉品質(zhì)相關(guān)基因 畜禽的肌肉生長(zhǎng)速度與肉品質(zhì)是畜牧生產(chǎn)中的重要經(jīng)濟(jì)性狀,肌肉生長(zhǎng)與脂肪沉積也受到多個(gè)基因和多條生物學(xué)通路的調(diào)控。因此,運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)探究相關(guān)基因的表達(dá)模式,對(duì)家兔產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有非常重要的意義。脂肪在畜禽肉產(chǎn)品的整體適口性中起著重要的作用,肌內(nèi)脂肪直接或間接影響肉的風(fēng)味、多汁性及嫩度等感官品質(zhì)性狀[10-11]。Madrid等[12]通過3種選擇方法分析鑒定2個(gè)被不同世代選擇的家兔群體與肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)的基因組區(qū)域,結(jié)果顯示,對(duì)肌內(nèi)脂肪的選擇會(huì)影響多個(gè)基因組區(qū)域,這可能是選擇效應(yīng)或選擇和遺傳漂變共同作用的結(jié)果,共檢測(cè)到73個(gè)候選基因,其中包括與機(jī)體能量、脂類代謝相關(guān)的基因,如ACER2、PLIN2、DENND4C、RPS6、RRAGA(OCU1)、ST8SIA6、VIM(OCU16)、RORA、GANC和PLA2G4B(OCU17)等。
1.2.2 繁殖性能相關(guān)基因 產(chǎn)仔數(shù)是家兔重要的經(jīng)濟(jì)性狀,是衡量家兔繁殖性能高低的主要指標(biāo)[13]。Casto-Rebollo等[14]結(jié)合全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association studies,GWAS)與全基因組測(cè)序(whole genome sequencing,WGS)方法分析了與高、低產(chǎn)仔數(shù)環(huán)境方差變化相關(guān)的基因及功能突變,發(fā)現(xiàn)相關(guān)的基因組區(qū)域被定位在家兔第3、7、10和14染色體上,共鑒定出16個(gè)新的候選基因,其中包括129個(gè)功能性突變,這些突變可能影響家兔產(chǎn)仔數(shù)環(huán)境方差的變異。Rodrigues等[15]研究表明,高排卵率的雌性動(dòng)物產(chǎn)前存活率降低的部分原因可能源于卵母細(xì)胞質(zhì)量較低,排卵率和產(chǎn)前存活率是影響家兔產(chǎn)仔數(shù)的主要因素,根據(jù)排卵率進(jìn)行選育可以更有效地提高家兔產(chǎn)仔數(shù)。Serna-Garcia等[16]利用微點(diǎn)陣對(duì)以排卵率為選擇標(biāo)準(zhǔn)選育10代的高排卵率家兔群體和對(duì)照組的卵巢組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,結(jié)果顯示,共發(fā)現(xiàn)1 357個(gè)差異表達(dá)基因和19個(gè)潛在生物標(biāo)記與產(chǎn)前死亡率相關(guān),家兔產(chǎn)仔數(shù)差異與產(chǎn)前細(xì)胞死亡呈顯著相關(guān)。穴兔與家兔的母性行為表現(xiàn)在筑巢及分娩后對(duì)后代的日常護(hù)理,這一系列的行為遵循一個(gè)特定的順序,并受到多種外部因素及遺傳因素的調(diào)節(jié),如視覺影響、激素水平等[17-19]。Benedek等[20]選取30只10~20月齡成年穴兔,評(píng)估黃體酮受體(PGR)基因多態(tài)性與家兔筑巢行為的相關(guān)性,結(jié)果表明,SNP(2464 G>A)位點(diǎn)可能影響家兔的就巢時(shí)機(jī),PGR基因可作為影響家兔成功繁殖的關(guān)鍵候選基因。
1.2.3 品種與遺傳多樣性 細(xì)胞色素B(cytochrome b,Cytb)基因位于線粒體環(huán)狀DNA中,在幾乎所有真核生物和許多原核生物中都有發(fā)現(xiàn),在種間、種內(nèi)群體間和群體內(nèi)具有廣泛的多態(tài)性,因此,Cytb基因是目前研究種間進(jìn)化關(guān)系的最佳基因之一[21]。Emam等[22]通過線粒體DNACytb基因序列比對(duì)分析,對(duì)埃及當(dāng)?shù)氐募彝闷贩N(ERB、EBB、EGS)及西班牙本地品種(SCR)共132個(gè)個(gè)體的多樣性、系統(tǒng)發(fā)育狀況與歐洲野兔(EWR)進(jìn)行種屬鑒定,共發(fā)現(xiàn)353個(gè)突變,290個(gè)多態(tài)位點(diǎn),14個(gè)單倍型,其中單倍型A在埃及本地家兔和EWR中分別占83.3%和11.7%,單倍型B在SCR和EGS中分別占63.8%和36.2%;通過與穴兔基因組序列進(jìn)行比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),單倍型A與已發(fā)表序列的重合性達(dá)44.7%,而單倍型B僅有8.5%的重合;聚類分析結(jié)果得出,埃及本地家兔品種與SCR及EWR的單倍型分布在同一聚類中。綜合以上結(jié)果推測(cè),ERB、EBB、SCR的遺傳多樣性非常低,ERB與EBB同屬于一個(gè)品種,埃及當(dāng)?shù)赝闷贩N與西班牙本地品種均來源于歐洲野兔。
2.1.1 選擇效應(yīng)及性狀評(píng)估 家兔育種工作的核心任務(wù)在于培育出具有較高經(jīng)濟(jì)價(jià)值與種用價(jià)值且有一定群體結(jié)構(gòu)的優(yōu)良家兔品種,對(duì)家兔的種質(zhì)特性進(jìn)行測(cè)定,有意識(shí)、系統(tǒng)性地進(jìn)行選育,才能長(zhǎng)久保持品種的適應(yīng)力、生命力和繁殖力[23]。劉策等[24]選取35日齡、斷奶體重(854±13)g的閩西南黑兔及斷奶體重(635±18)g的新西蘭白兔各20只,控制飼養(yǎng)管理?xiàng)l件,在(100±2)d時(shí)全部屠宰,測(cè)定屠宰性能和肉品質(zhì)指標(biāo),結(jié)果表明,相較于新西蘭白兔,閩西南黑兔的肌肉呈良好的色澤,不飽和脂肪酸沉積較少。劉福鑫等[25]將日齡相近繁殖胎次為3胎的24只猞猁色獺兔種母兔與8只種公兔進(jìn)行人工輔助交配,結(jié)果表明,猞猁色獺兔的繁殖性能及后代生長(zhǎng)性能均表現(xiàn)良好,適用于進(jìn)一步的選育工作。
2.1.2 遺傳與環(huán)境互作 家兔的生命活動(dòng)受多種環(huán)境因素的直接影響,包括環(huán)境溫度、相對(duì)濕度及光照等。熊飆等[26]比較了來自2個(gè)父系遺傳起源的家兔在連續(xù)出生季節(jié)(春季、夏季、秋季和冬季)及不同胎次(初產(chǎn)、二胎和多胎)的繁殖性能,試驗(yàn)選取2個(gè)品種70只肉兔(新西蘭兔和加利福尼亞兔),其中母兔58只、公兔12只,在適宜條件下飼養(yǎng),試驗(yàn)過程中環(huán)境條件隨季節(jié)變化,室內(nèi)溫度在10~30 ℃,相對(duì)濕度為60%~70%,(46±6)d時(shí)斷奶,對(duì)105窩(55窩來自品種1,50窩來自品種2)母兔的繁殖性能和數(shù)據(jù)進(jìn)行記錄,結(jié)果表明,春季時(shí)母兔和仔兔的繁殖行為和生長(zhǎng)性能最差,夏季高溫對(duì)母兔繁殖性能有負(fù)面影響,冬季相較于其他季節(jié)更宜于常規(guī)飼養(yǎng)。相較于其他家畜,家兔全身被毛功能性汗腺少,主要依靠呼吸散熱,對(duì)高濕熱環(huán)境適應(yīng)性差,當(dāng)機(jī)體溫度過高時(shí),易發(fā)生應(yīng)激性疾病,進(jìn)而對(duì)生產(chǎn)性能、繁殖性能和免疫能力產(chǎn)生影響,包括生長(zhǎng)緩慢、產(chǎn)量降低、繁殖性能下降等[27-28]。陳虹等[29]選取相同飼養(yǎng)條件下的健康成年伊拉母兔6只,隨機(jī)分為對(duì)照組與試驗(yàn)組,試驗(yàn)組所處環(huán)境THI為25.97~30.45 ℃,對(duì)照組伊拉兔處于自然環(huán)境下,THI為22.75~25.67 ℃,試驗(yàn)周期為15 d,記錄每只伊拉兔的心率、呼吸頻率及直腸溫度等數(shù)據(jù),結(jié)果表明,熱應(yīng)激對(duì)伊拉兔的呼吸頻率、心率、直腸溫度等生理指標(biāo)有直接影響,且熱應(yīng)激指數(shù)越大影響越嚴(yán)重。光照對(duì)家兔生產(chǎn)性能存在重要影響,周期性變化的光照會(huì)影響松果體合成、分泌褪黑素,進(jìn)而引發(fā)動(dòng)物繁殖性能的周期性變化[30]。羅剛等[31]為探索光色和光照強(qiáng)度對(duì)母兔繁殖力的影響,將225只伊拉配套系父母代種兔平均分成15個(gè)組,設(shè)置白、紅、黃、綠、藍(lán)5種光色和60、80、100 lx 3種光照度進(jìn)行試驗(yàn),結(jié)果顯示,在LED綠光且光照度為100 lx時(shí)空懷母兔的繁殖性能最好。
2.2.1 皮毛性狀相關(guān)基因 皮毛性狀是家兔生產(chǎn)中極為重要的經(jīng)濟(jì)性狀,目前國內(nèi)研究人員已對(duì)調(diào)控家兔皮毛相關(guān)性狀的基因進(jìn)行了大量、系統(tǒng)地研究。研究表明,毛囊生長(zhǎng)和循環(huán)過程中有大量信號(hào)通路參與調(diào)控,如Wnt、BMP、Hedgehog及JAK-STAT信號(hào)通路等[32-35]。 Liang等[36]構(gòu)建角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白11-1(keratin-associated protein 11-1,Krtap11-1)基因過表達(dá)載體及干擾序列,轉(zhuǎn)染RAB-9細(xì)胞,分析Krtap11-1基因在毛囊發(fā)育不同階段、不同組織中的表達(dá)情況及對(duì)其他與毛囊發(fā)育相關(guān)基因的影響,結(jié)果顯示,Krtap11-1基因mRNA表達(dá)水平在毛囊發(fā)育的退行期和休止期呈先升高后降低趨勢(shì),其對(duì)毛囊發(fā)育過程中的關(guān)鍵基因具有顯著促進(jìn)作用。Zhou等[37]構(gòu)建SIAH1基因過表達(dá)載體及干擾序列,采用皮膚毛囊毛乳頭細(xì)胞系進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染試驗(yàn),結(jié)果顯示,SIAH1基因?qū)彝闷つw和毛囊發(fā)育過程具有抑制作用。Zhao等[38]探究HIV-1 Tat結(jié)合蛋白(HIV-1 Tat binding protein,HTATIP2)基因在皖系長(zhǎng)毛兔毛囊發(fā)育過程中的作用,結(jié)果表明,HTATIP2基因在毛發(fā)生長(zhǎng)中期與休止期高表達(dá),過表達(dá)或敲低HTATIP2基因影響JAK-STAT通路中與毛囊發(fā)育相關(guān)基因的表達(dá),且HTATIP2基因可能促進(jìn)細(xì)胞凋亡并抑制細(xì)胞增殖。Ding等[39]以皖系長(zhǎng)毛兔為試驗(yàn)對(duì)象,利用組織切片和高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)研究了皖系長(zhǎng)毛兔不同毛囊發(fā)育周期皮膚組織學(xué)和miRNA表達(dá)譜差異,結(jié)果表明,皖系長(zhǎng)毛兔毛囊在拔毛后第1周時(shí)處于靜止期,第4~24周處于生長(zhǎng)期;共鑒定出185個(gè)差異表達(dá)的miRNAs,通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)的miRNA主要參與毛囊發(fā)育和脂類代謝過程及TGF-β、Wnt、凋亡和胞外基質(zhì)-受體相互作用等調(diào)控通路。
獺兔是一類理想的研究色素沉積的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型,哺乳動(dòng)物的毛發(fā)與皮膚顏色的多樣性可以歸因于色素的類型和數(shù)量,而色素的沉積受到不同基因與環(huán)境因素的相互作用[40]。 Yang等[41]通過RT-PCR測(cè)定POU2F1(POU domain,class 2,transcription factor 1)基因mRNA在不同顏色獺兔中的組織表達(dá)譜,構(gòu)建過表達(dá)載體及干擾序列,結(jié)果顯示,棕色和蛋白黃獺兔背部皮膚中POU2F1基因表達(dá)水平顯著高于黑色獺兔,POU2F1基因在肺臟中的表達(dá)水平最高。轉(zhuǎn)染黑色素細(xì)胞后,POU2F1顯著影響色素相關(guān)基因SLC7A11、MITF、SLC24A5、MC1R、ASIP的表達(dá),揭示了POU2F1基因?qū)ι爻恋淼恼{(diào)控作用。Hu等[42]采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR與Western blotting技術(shù)檢測(cè)不同毛色家兔體內(nèi)KIT基因mRNA及蛋白表達(dá)水平,結(jié)果顯示,KIT基因mRNA與蛋白在不同顏色獺兔皮膚中的表達(dá)水平存在顯著差異,其中在黑色獺兔皮膚中的表達(dá)水平最高,KIT基因顯著影響著色相關(guān)基因的表達(dá)。表明KIT基因顯著促進(jìn)家兔黑色素細(xì)胞增殖,是調(diào)控黑色素生成、控制黑色素細(xì)胞增殖與凋亡的關(guān)鍵基因。Li等[43]選取2個(gè)品種共40只家兔(20只黑色獺兔和20只青紫藍(lán)色獺兔),對(duì)黑素親和素(melanophilin,MLPH)基因多態(tài)性與獺兔被毛顏色的關(guān)系進(jìn)行探究,結(jié)果發(fā)現(xiàn),MLPH基因具有很高的GC含量,除g.606 C>A外,其余位點(diǎn)均處于Hardy-Weinberg平衡;2個(gè)品種獺兔的7個(gè)錯(cuò)義突變SNPs形成10個(gè)單倍型,其中黑色獺兔特殊的單倍型與青紫藍(lán)色獺兔表型一致,推測(cè)不同獺兔品系的毛色形成可能是由MLPH基因中的1個(gè)或多個(gè)突變引起的。盧婷婷等[44]研究了獺兔小眼畸形相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因不同可變剪接體對(duì)黑色素沉積的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),MITF基因N-端的剪接變化并不影響黑色素沉積功能,但不同剪接體的下游信號(hào)通路存在差異。Liu等[45]通過高通量全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)不同毛密度的30日齡獺兔差異表達(dá)miRNA進(jìn)行鑒定,結(jié)果顯示,miR-205在獺兔低毛密度的毛囊乳突細(xì)胞中表達(dá)水平高于高毛密度的毛囊乳突細(xì)胞,miR-205促進(jìn)了細(xì)胞增殖和細(xì)胞凋亡率,改變了細(xì)胞周期的進(jìn)程,并調(diào)控獺兔毛囊乳突細(xì)胞PI3K/Akt、Wnt、Notch和BMP信號(hào)通路中相關(guān)基因的表達(dá),同時(shí)抑制CTNNB1和GSK-3β蛋白的磷酸化,降低NOG蛋白水平,增加磷酸化Akt水平。
2.2.2 肉質(zhì)性狀相關(guān)基因 生長(zhǎng)、胴體特征及肉品質(zhì)是兔肉生產(chǎn)中最重要的性狀,與這些性狀顯著相關(guān)的標(biāo)記及基因的鑒定對(duì)家兔育種的發(fā)展起到十分重要的作用,如MC4R、LEP、GHR、TBC1D1等基因已被證明與家兔生長(zhǎng)及屠宰性能顯著相關(guān)[46-49]。Yang等[50]基于簡(jiǎn)化基因組測(cè)序(SLAF-seq)技術(shù)的GWAS分析與肉兔生長(zhǎng)、肉質(zhì)性狀相關(guān)的SNPs與功能基因,試驗(yàn)選取465只家兔,包括16只成年公加利福尼亞兔與17只康大5號(hào)配套系兔做親本,以及它們的后代群體(232公兔、200母兔),記錄35、42、49、56、63及70 d的生長(zhǎng)性狀,宰前活重(84 d)和凈屠宰率作為胴體性狀指標(biāo),蒸煮損失與滴水損失作為肉質(zhì)性狀指標(biāo),結(jié)果分別鑒定出28、81、10個(gè)與胴體指標(biāo)、生長(zhǎng)及肉質(zhì)性狀相關(guān)的SNPs;此外,在這些SNPs的上、下游100 kb范圍內(nèi)分別鑒定出16、71、9個(gè)候選功能基因,包括FGD4、DNM1L、ADAM7、SLC39A6等。 Luo等[51]采集天府黑兔4個(gè)生長(zhǎng)期的3個(gè)組織樣本,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)瘦素(leptin)基因在不同組織中的表達(dá)水平,結(jié)果表明,leptin基因在天府黑兔中的表達(dá)水平可影響相關(guān)肉質(zhì)性狀,leptin基因高表達(dá)的天府黑兔肉質(zhì)較好。因此,leptin基因可作為家兔肉質(zhì)性狀分子標(biāo)記的重要候選基因。李彥宏等[52]采用直接測(cè)序法檢測(cè)天府黑兔載脂蛋白A4(apolipoprotein A4,APOA4)基因第3外顯子編碼區(qū)內(nèi)的SNPs,并結(jié)合生物信息學(xué)軟件分析其蛋白結(jié)構(gòu)域和mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果發(fā)現(xiàn),APOA4基因第3外顯子編碼區(qū)內(nèi)存在3個(gè)遺傳變異位點(diǎn),其中c.1459 A→G可能與家兔肉品質(zhì)性狀有關(guān)。
2.2.3 繁殖性能相關(guān)基因 家畜繁殖性能的研究與養(yǎng)殖場(chǎng)的經(jīng)濟(jì)效益密切相關(guān)。家兔的繁殖性狀遺傳力相對(duì)較小,通過傳統(tǒng)育種方法相對(duì)緩慢,而分子育種對(duì)于高繁殖力家兔的育種具有明顯作用[57]。牛曉艷等[58]選取白色獺兔品系的70只母兔和海貍色獺兔品系的100只母兔,研究卵泡刺激素(follicle stimulating hormone,F(xiàn)SHβ)基因SNPs與繁殖性狀之間的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn),F(xiàn)SHβ基因外顯子1和3中的3個(gè)SNPs(FSH2、FSH30、FSH31)在聯(lián)合群體中與繁殖性狀呈強(qiáng)相關(guān),對(duì)于FSH2,與TT基因型相比,GG基因型與總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)顯著相關(guān);對(duì)于FSH30,AA基因型總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)顯著高于GG和AG基因型;對(duì)于FSH31,GG基因型總產(chǎn)仔數(shù)、初生窩重和21日齡活仔數(shù)顯著高于AG基因型,表明FSHβ基因與獺兔的繁殖性狀相關(guān)聯(lián),因此,F(xiàn)SH2、FSH30和FSH31可作為獺兔選育的分子標(biāo)記。
2.2.4 品種或遺傳多樣性 家兔育種工作的開展離不開特色多樣的遺傳資源,尤其是對(duì)地方種質(zhì)資源的開發(fā)利用。目前,線粒體DNA、全基因組選擇、微衛(wèi)星標(biāo)記等技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于家兔遺傳結(jié)構(gòu)與生物多樣性的分析工作中[53-55]。周彤等[56]利用PCR高保真擴(kuò)增技術(shù)和生物信息學(xué)軟件對(duì)福建黃兔線粒體基因組進(jìn)行獲取、拼接與注釋,結(jié)果發(fā)現(xiàn),福建黃兔線粒體基因組全長(zhǎng)17 kb(GenBank登錄號(hào):MN518689),主要包括tRNAs(22個(gè))、rRNAs(2個(gè))、蛋白編碼基因(13個(gè))和控制區(qū)(1個(gè))4部分;22個(gè)tRNAs基因中,除tRNA-Ser(AGY)基因由于缺失DHU臂不能形成三葉草結(jié)構(gòu)外,其余21種tRNAs基因均可折疊形成經(jīng)典的三葉草結(jié)構(gòu);控制區(qū)含有3種結(jié)構(gòu)域:延長(zhǎng)終止序列區(qū)(ETAS1和ETAS2)、中央保守區(qū)、保守序列區(qū)(CSB1、CSB2和CSB3),其中,CSB1和CSB2間存在200 bp的短重復(fù)序列,CSB3和tRNA-Phe間存在306 bp的長(zhǎng)重復(fù)序列;基于線粒體基因組控制區(qū)序列構(gòu)建10種兔形目動(dòng)物的系統(tǒng)發(fā)生樹發(fā)現(xiàn),福建黃兔可能起源于穴兔。
2020年國內(nèi)外家兔遺傳育種技術(shù)研究進(jìn)展各具特點(diǎn)。國外在傳統(tǒng)育種、分子育種等方面均有不少研究,傳統(tǒng)育種主要包括選擇與性狀評(píng)估、遺傳與環(huán)境互作等;分子育種主要以相關(guān)基因及功能區(qū)域篩選為主,主要涉及生長(zhǎng)及肉質(zhì)、毛色和繁殖等性狀。國內(nèi)在傳統(tǒng)育種與分子育種方面的研究相較國外更多,傳統(tǒng)育種主要集中在雜交組合研究、性狀評(píng)估及遺傳與環(huán)境互作等方面;分子育種主要集中在皮毛性狀方面,以篩選與毛囊發(fā)育、皮膚黑色素沉積等相關(guān)功能基因?yàn)橹?,其次,分子育種還涉及與品種遺傳多樣性、肉質(zhì)及繁殖性狀相關(guān)的研究。2020年家兔遺傳育種與繁殖研究領(lǐng)域取得了較多成果,但相較于其他家畜(如豬、羊、雞等),整體研究水平仍相對(duì)滯后。建議對(duì)家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀和特色性狀進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)估,為家兔種質(zhì)資源利用與保護(hù)提供更多的理論依據(jù)。