申 悅,勞敏軍,王當(dāng)豐,崔方超*,林 洪,李婷婷,勵建榮
(1 渤海大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院 生鮮農(nóng)產(chǎn)品貯藏加工及安全控制技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心 遼寧錦州 121013 2 浙江興業(yè)集團(tuán)有限公司 浙江舟山 316120 3 中國海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院 山東青島 266100 4 大連民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 遼寧大連 116600)
微生物的生長代謝是導(dǎo)致水產(chǎn)品腐敗的主要原因之一。在水產(chǎn)品腐敗過程中,通常只有1 種或幾種微生物起主要作用,這些細(xì)菌就是優(yōu)勢腐敗菌(Specific spoilage organisms,SSOs)[1]。隨著微生物的繁殖,細(xì)菌密度逐漸增大,細(xì)菌通過自身合成并釋放自誘導(dǎo)物——信號分子,來調(diào)控其生物行為(如生物發(fā)光、生物被膜形成、毒力因子表達(dá)及浮游等),這一過程稱為群體感應(yīng)(Quorum sensing,QS)[2]。López-Martín 等[3]發(fā)現(xiàn)鮑曼不動桿菌的QS 系統(tǒng)在調(diào)節(jié)表面運動、生物膜形成和毒力方面起著重要作用。熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)是水產(chǎn)品貯藏過程中常見的嗜冷菌,屬于好氧或兼性厭氧的革蘭氏陰性細(xì)菌。因其適應(yīng)性強、生長周期短、胞外酶活性高,故被公認(rèn)為動物和水產(chǎn)品中的SSOs[4]。熒光假單胞菌能分泌N-?;呓z氨酸內(nèi)酯 (N-acyl-homoserine lactones,AHLs)作為信號分子,來調(diào)控水產(chǎn)品的腐敗[5]。對QS 系統(tǒng)的干擾或破壞有助于控制許多致腐菌腐敗表型的表達(dá),從而延長水產(chǎn)品貨架期。
通常將能夠以QS 為靶標(biāo),干擾信號通路的物質(zhì)稱為群體感應(yīng)抑制劑 (Quorum sensing inhibitors,QSIs)[6]。它們能在不殺死或不干擾細(xì)菌正常生命活動的前提下有效調(diào)控菌群的結(jié)構(gòu)和功能[7]。目前QSIs 主要從3 個方面抑制QS:①通過阻斷LuxI 型合酶中斷AHL 信號合成;②通過群體感應(yīng)淬滅酶(Quorum quenching enzymes)降解AHLs 信號傳播,減少AHLs 的積累;③干擾信號受體或阻斷AHL/LuxR 復(fù)合物[8]。這些方法旨在減少群體感應(yīng)介導(dǎo)的表型表達(dá),而不會對細(xì)菌產(chǎn)生其它破壞性的影響。群體感應(yīng)淬滅酶中,研究最廣泛的是AHL 乳糖酶和AHL ?;?,這兩類的酶均以AHLs 為底物。AHL 乳糖酶通過水解內(nèi)酯環(huán)上的酯鍵產(chǎn)生?;呓z氨酸,使短鏈和長鏈AHLs失活。相比之下,AHL ?;竿ǔ?cè)鏈長度超過10 個碳的AHLs 最有效[9]。AHL ?;缚梢苑纸釧HLs 的酰胺鍵,產(chǎn)生相應(yīng)的脂肪酸和高絲氨酸內(nèi)酯(HSL),其作用方式與青霉素酰化酶的作用方式非常相似。通過詳細(xì)的結(jié)構(gòu)研究,已證實AHL?;概c其它青霉素?;笇儆谕籒tn 水解酶超家族。由此可推測:青霉素酰化酶和其它Ntn 水解酶超家族酶可能具有切割A(yù)HLs 的能力[10]。2014年,Mukherji 等[11]首次報道了產(chǎn)自檸檬克魯維酵母(Kluyvera citrophila)的青霉素G ?;福↘cPGA)活性,通過生化分析和分子對接驗證了無論是否經(jīng)過3-氧基修飾,KcPGA 對含6~8 個碳原子的AHLs 都具有活性。
產(chǎn)自巨大芽孢桿菌的青霉素?;钢饕脕砗铣汕嗝顾鼗蝾^孢霉素類抗生素,為了方便工業(yè)應(yīng)用[12],越來越多的研究集中于酶的性質(zhì)方面。由于固定化酶靈敏度高、穩(wěn)定性好、操作簡單、成本低,因此被廣泛應(yīng)用于在食品工業(yè)中,降低了食品生產(chǎn)成本,也減少了生產(chǎn)過程中造成的污染[13]。迄今為止,尚未有文獻(xiàn)報道固定化青霉素酰化酶對QS 的淬滅作用。本文以市售青霉素?;笧閷ο?,研究其對水產(chǎn)腐敗菌的QS 淬滅作用,以期為其在抑制水產(chǎn)品腐敗方面的研究奠定理論基礎(chǔ)。
紫色桿菌 (Chromobacterium violaceum 026,CV026) 為紫色桿菌ATCC 31532 的mini-Tn5 突變體,卡那霉素抗性,僅當(dāng)存在外源短鏈AHLs(C4-HSL、C6-HSL、C8-HSL)時,菌株CV026 產(chǎn)生特征性紫色色素。供試菌株熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)從腐敗大菱鲆中分離、鑒定。兩種菌株均保藏于渤海大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院水產(chǎn)品貯藏與加工研究所。
固定化青霉素?;福a(chǎn)自巨大芽孢桿菌(酶活力:≥240 U/g),上海笛柏生物科技有限公司;卡那霉素、冰醋酸,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;乙酸乙酯,天津風(fēng)船化學(xué)試劑有限公司;結(jié)晶紫,天津致遠(yuǎn)化學(xué)試劑有限公司;載玻片,江蘇飛舟玻塑有限公司;LB 肉湯培養(yǎng)基、LB 營養(yǎng)瓊脂,北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司;Skim Milk 脫脂奶粉,北京索萊寶科技有限公司;瓊脂糖,美國Sigma公司。
SW-CJ-2FD 超凈工作臺,蘇景集團(tuán)蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;Biofuge Stratos 臺式高速離心機,美國Thermo Fisher 公司;LDZX-50KB 立式壓力蒸汽滅菌器,上海申安醫(yī)療器械廠;MS105UD電子分析天平,瑞士梅特勒-托利儀器有限公司;imark 酶標(biāo)儀,美國BIO-RAD;Nikon80i 顯微鏡,日本尼康公司;Agilent 7890N/5975 氣質(zhì)聯(lián)用(GC-MS)儀,美國Agilent 公司;LRH 系列生化培養(yǎng)箱,上海一恒科技有限公司。
1.3.1 固定化青霉素酰化酶抑菌活性確定及QSIs活性檢測 參考梅永超等[14]的方法略加修改,將CV026 和熒光假單胞菌過夜培養(yǎng)對數(shù)期(106CFU/mL),按1 ∶100 的體積比接種于LB 肉湯中(培養(yǎng)CV026 的LB 肉湯中需含有20 μg/mL 卡那霉素;培養(yǎng)熒光假單胞菌的肉湯中分別含有0,2.5,5,10,15,20,25 mg/mL 的固定化青霉素酰化酶),28 ℃,160 r/min 振蕩培養(yǎng)16~18 h。吸取200 μL 加入不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;概囵B(yǎng)的熒光假單胞菌菌液添加到96 孔板中,用酶標(biāo)儀于波長595 nm 測定OD 值,觀察酶對菌株生長的影響。將用牛津杯提前放入平板中的10 mL CV026 與100 mL LB 營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基混合,倒平板,孔中加入不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;概囵B(yǎng)過的熒光假單胞菌上清液,以沒有加固定化青霉素酰化酶培養(yǎng)的熒光假單胞菌上清液為空白對照,28 ℃靜置培養(yǎng)24~48 h 后,觀察紫色菌素的產(chǎn)生情況。
1.3.2 固定化青霉素?;笇ψ仙禺a(chǎn)生的影響 根據(jù)參考文獻(xiàn)[15],菌株CV026 過夜活化后,按1∶100 的體積比接種于含有不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;?(0,2.5,5,10,15,20,25 mg/mL)的LB 肉湯中,并加入200 μL 的AHLs 粗提液,160 r/min,28 ℃振蕩培養(yǎng)48 h。而后依次吸取300 μL 培養(yǎng)液于1.5 mL 離心管中,加入150 μL 10%十二烷基硫酸鈉,振蕩10 s,加入600 μL 正丁醇,振蕩5 s,10 000 r/min 離心5 min,吸取200 μL 紫色上清液添加到96 孔板中,用酶標(biāo)儀測定OD595nm,以不加信號分子的試驗組作為對照。
1.3.3 固定化青霉素?;笇晒饧賳伟锉荒さ挠绊?/p>
1) 酶標(biāo)板法測定生物被膜 將過夜培養(yǎng)的熒光假單胞菌,按1∶100 的體積比接種于LB 肉湯中,分裝至無菌離心管,每管4 mL,加入終質(zhì)量濃度為0,2.5,5,10,15,20,25 mg/mL 的固定化青霉素酰化酶,培養(yǎng)36 h,以沒有加酶為對照,每組3次重復(fù),具體參照孫曉佳等[16]的方法。取菌液測定波長595 nm 處的菌液密度后,棄去菌液,用無菌水清洗3 次,無菌風(fēng)干燥30 min,使生物被膜固定在離心管內(nèi)壁后,取1 mL 0.2%的結(jié)晶紫染色15 min。棄去染色液,無菌水清洗3~5 次至干凈透明。用33%(φ)冰乙酸溶解固定著的染色液。用酶標(biāo)儀測定波長595 nm 下的吸光度,每處理組取3 個平行。生物被膜的相對生成率按公式(1)計算:
2) 光學(xué)顯微鏡觀察固定化青霉素酰化酶對生物被膜形態(tài)的影響 載玻片(普通載玻片,25.4 mm×76.2 mm,厚度1~2 mm)預(yù)處理:置于體積分?jǐn)?shù)75%乙醇溶液中浸泡24 h 后,用蒸餾水洗凈、烘干,滅菌備用。
在無菌培養(yǎng)皿中加入10 mL 含有1%熒光假單胞菌的LB 肉湯,并分別加入終質(zhì)量濃度為0,2.5,5,10,15,20,25 mg/mL 的固定化青霉素酰化酶,混合均勻后放入處理后的載玻片,28 ℃靜置培養(yǎng)36 h。同時,設(shè)立沒有添加酶的陰性對照組。36 h 后取出載玻片,無菌水沖洗,除去浮游菌及黏液,置于無菌培養(yǎng)皿中,加入適量甲醇固定15 min,再加入適量2%結(jié)晶紫溶液染色5 min 后,用無菌水沖洗干凈,室溫下干燥,干燥后在光學(xué)顯微鏡下觀察,拍照記錄。
3) 掃描電鏡觀察固定化青霉素?;笇ι锉荒ば螒B(tài)的影響 將載玻片換成鋅片,前期操作同1.3.3(2),培養(yǎng)36~48 h。結(jié)束后用無菌水反復(fù)沖洗,洗去表面的浮菌。將鋅片放入4 ℃預(yù)冷的體積分?jǐn)?shù)2.5%戊二醛溶液中浸泡4 h,取出用50%,70%,80%,90%,100%的乙醇梯度脫水,自然干燥后噴金處理,用掃描電子顯微鏡觀察。
1.3.4 固定化青霉素酰化酶對熒光假單胞菌胞外蛋白酶活力的影響 參照趙陽潔[17]的方法稍作改動,制作牛奶平板,用牛津杯打孔,加入用不同質(zhì)量濃度(2.5,5,10,15,20,25 mg/mL)的固定化青霉素?;高^夜培養(yǎng)的熒光假單胞菌上清液,28℃靜置培養(yǎng)18~24 h。蛋白酶水解酪蛋白后,在孔周圍出現(xiàn)明顯的水解圈,水解圈越大,說明胞外蛋白酶活力越高。以不加固定化青霉素酰化酶的上清液為陰性對照。
1.3.5 GC-MS 測定固定化青霉素?;笇晒饧賳伟a(chǎn)AHLs 的影響 參照張清霞等[18]的方法稍作修改,熒光假單胞菌用400 mL LB 肉湯培養(yǎng)。在28 ℃,160 r/min 振蕩培養(yǎng)24 h,5 000 r/min離心30 min 去沉淀,等體積乙酸乙酯(含體積分?jǐn)?shù)0.1%冰乙酸溶液) 萃取,35 ℃旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)有機相后,用2 mL 甲醇溶解,粗提液保存于-20 ℃?zhèn)溆?。向上述粗提液中加入固定化青霉素酰化酶使其終質(zhì)量濃度為25 mg/mL,以不添加固定化青霉素?;笧閷φ铡?8 ℃作用40 min 后,將樣品用有機濾膜過濾于GC-MS 檢測確定加酶前、后AHLs 的變化情況。參照孫曉佳[19]的方法設(shè)置GC-MS條件。
1.3.6 分子對接分析青霉素?;概cAHLs 的相互作用 將PDB 數(shù)據(jù)庫中獲得的青霉素?;福óa(chǎn)自巨大芽孢桿菌)6nvy 的3D 結(jié)構(gòu),使用Discovery Studio(DS)軟件進(jìn)行3D 蛋白結(jié)構(gòu)的優(yōu)化。從ZINC 數(shù)據(jù)庫 (http://zinc.docking.org/) 中得到C4-HSL、C6-HSL、C8-HSL、C10-HSL、C12-HSL、C14-HSL 的3D 結(jié)構(gòu),在DS 軟件中優(yōu)化結(jié)構(gòu)后,采用半柔性對接分析酶和配體之間的作用方式,以及酶對不同碳鏈的AHLs 的作用差異[20]。
經(jīng)過測定培養(yǎng)結(jié)束后的菌液密度,發(fā)現(xiàn)添加不同質(zhì)量濃度的固定化青霉素酰化酶對熒光假單胞菌的生長沒有影響。因此直接選取培養(yǎng)后的上清液加入孔中與培養(yǎng)基中的CV026 作用,結(jié)果如圖1所示。當(dāng)熒光假單胞菌同25 mg/mL 的固定化青霉素?;概囵B(yǎng)后,使得CV026 產(chǎn)生紫色菌素不明顯,說明固定化青霉素?;缚赡軠p少了熒光假單胞菌中的信號分子的產(chǎn)量。
圖1 固定化青霉素?;笇V026 紫色菌素的抑制作用Fig.1 Inhibition of immobilized penicillin acylase on CV026
通過觀察CV026 產(chǎn)紫色菌素的差異性能夠看出不同酶濃度對QS 的干擾程度不同,從圖2a中能夠直觀看出酶添加量越多紫色越淺,說明固定化酰化酶的QSI 活性呈劑量依賴性。從顏色變化來看,與不加酶的對照組相比,5 mg/mL 固定化青霉素?;柑幚砜梢悦黠@降低紫色菌素的產(chǎn)量。從圖2b 可知,隨著酶質(zhì)量濃度的增大,紫色菌素逐漸減少,當(dāng)酶質(zhì)量濃度為25 mg/mL 時,對紫色菌素的抑制率達(dá)到38.63%,由此推斷固定化青霉素?;缚赏ㄟ^干擾QS 現(xiàn)象,使得在外源AHLs 存在的情況下,抑制CV026 紫色菌素的產(chǎn)生??梢酝茰y固定化青霉素?;缚赏ㄟ^降解AHLs 達(dá)到抑制腐敗菌間信息交流的目的,從而減少致腐因子的產(chǎn)生以達(dá)到水產(chǎn)品保鮮的效果。
圖2 固定化青霉素酰化酶對CV026 的QSI 效應(yīng)Fig.2 QSI effect of immobilized penicillin acylase on CV026
2.3.1 固定化青霉素?;笇晒饧賳伟锉荒ば纬闪康挠绊?生物被膜的形成是水產(chǎn)品污染的常見來源。研究發(fā)現(xiàn)有氧冷凍條件下貯藏時,QS 會參與新鮮肉制品的腐敗以及其表面生物被膜的形成[21]。從腐敗食品中分離到的熒光假單胞菌具有快速產(chǎn)生生物膜的特性[22]。從圖3中可看出,固定化青霉素?;傅奶砑硬]有對熒光假單胞菌的生長造成影響,隨著酶質(zhì)量濃度的升高,生物膜的生成率逐漸減小,當(dāng)酶質(zhì)量濃度為25 mg/mL 時,對生物被膜形成的抑制率達(dá)到57.41%。由此可知固定化酰化酶能夠有效抑制熒光假單胞菌生物膜的形成,減少其在水產(chǎn)品表面定殖。
圖3 不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;笇晒饧賳伟锉荒ば纬陕实挠绊慒ig.3 Effects of different mass concentrations of immobilized penicillin acylase on biofilm formation rate of P.fluorescens
2.3.2 固定化青霉素酰化酶對熒光假單胞菌生物被膜形態(tài)的影響 通過光學(xué)顯微鏡可以觀察到不同質(zhì)量濃度的固定化青霉素?;概囵B(yǎng)后的熒光假單胞菌生物被膜形態(tài)的微觀結(jié)構(gòu)。從圖4a 可看出隨著固定化青霉素?;纲|(zhì)量濃度的升高,生物膜的形成量逐漸減少。未加固定化青霉素?;傅臒晒饧賳伟纳锉荒ぶ忻懿嫉木w連接成緊密的膜狀物。隨著酶濃度的升高,菌體越來越稀疏,生物被膜的產(chǎn)量難以在載體上牢固附著,因此菌體無法聚集形成膜狀物。由此推斷固定化青霉素?;改軌蚪档蜔晒饧賳伟锉荒さ男纬闪?,從而減少其在水產(chǎn)品表面的附著,從而達(dá)到延緩腐敗的效果。
圖4 固定化青霉素?;笇晒饧賳伟锉荒さ挠绊慒ig.4 Light microscope observation of the effect of immobilized penicillin acylase on P.fluorescens biofilm
通過掃描電鏡能夠更加直觀的觀察到生物膜表面的結(jié)構(gòu)情況。從圖4b 中可看出沒有加酶的對照組菌體形態(tài)最為致密,結(jié)構(gòu)均勻,具有一定的層次感,無法看到單一菌體。添加不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;概囵B(yǎng)后,隨著酶質(zhì)量濃度增大,生物被膜出現(xiàn)了破裂,失去原有的立體網(wǎng)格結(jié)構(gòu),單一菌體周圍的膜包圍狀物逐漸消失,當(dāng)酶質(zhì)量濃度為25 mg/mL 時,出現(xiàn)了明顯單菌,表明固定化青霉素酰化酶能夠有效減弱熒光假單胞菌的成膜能力。與生物被膜形成量的測定結(jié)果一致,證實了固定化青霉素?;笇晒饧賳伟锉荒さ挠绊懀茰y其可能通過調(diào)控了QS 相關(guān)基因的表達(dá),有效減少了胞外聚合物的生成。
假單胞菌具有較強的水解蛋白質(zhì)和脂肪的能力,可以產(chǎn)生吲哚、苯酚、腐胺、尸胺、硫化氫等有毒物質(zhì),并導(dǎo)致水產(chǎn)品產(chǎn)生感官不可接受性的黏液、異味[23]。通過測定胞外蛋白酶的變化,能夠了解固定化青霉素?;笇晒饧賳伟饷傅鞍酌副磉_(dá)量的影響。試驗結(jié)果如圖5所示,隨著酶質(zhì)量濃度的增加,透明圈逐漸減小,且當(dāng)添加15 mg/mL 酶后,可以完全抑制胞外蛋白酶的活性。由于QS 是一個轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng),可能通過調(diào)控編碼胞外蛋白酶的基因轉(zhuǎn)錄來實現(xiàn)對胞外蛋白酶表達(dá)的干預(yù)[24]。Li 等[25]發(fā)現(xiàn)銅綠假單胞菌中的QS 系統(tǒng)會干預(yù)其3 種胞外蛋白酶的表達(dá),通過構(gòu)建QS 突變體研究,表明QS 系統(tǒng)不只是通過轉(zhuǎn)錄來調(diào)節(jié)這些蛋白酶的活性,即使這些蛋白酶從細(xì)胞中分泌出來,QS 系統(tǒng)仍然控制著它們的活性?;诠潭ɑ嗝顾仵;傅墓δ?,可以推測通過淬滅AHLs可抑制胞外蛋白酶的表達(dá),而不影響其活性。
圖5 固定化青霉素?;笇晒饧賳伟獾鞍酌富钚缘挠绊慒ig.5 The effect of immobilized penicillin acylase on the extracellular protease activity of P.fluorescens
通過GC-MS 可以直觀看出樣品中AHLs 的變化。從圖6a 中可以看出供試菌株熒光假單胞菌主要產(chǎn)3 種信號分子,根據(jù)課題組前期的研究結(jié)果表明,出峰時間在6,8,11 min 左右所對應(yīng)的AHL 分別為C6-HSL、C8-HSL、C10-HSL。由圖6b 中可看出3 種AHLs 都有下降趨勢,其中C8-HSL 下降最多,說明固定化青霉素?;笇8-HSL 的降解活性最強。張爭等[26]從植物病原菌青枯菌中鑒定出了的1 種AHL ?;窤ac 淬滅細(xì)菌的群體感應(yīng)信號,控制細(xì)菌性病害,對C8-HSL 有較強的淬滅活性。
圖6 GC-MS 檢測固定化青霉素?;笇晒饧賳伟a(chǎn)AHLs 的影響Fig.6 Effect of immobilized penicillin acylase on AHLs production by P.fluorescens detected by GC-MS
分子對接是借助計算機模擬酶與底物之間的相互作用,預(yù)測其結(jié)合位點和結(jié)合強度。通過將酶與不同的底物對接可預(yù)測出與酶有相互作用的底物,為下一步試驗驗證提供理論依據(jù)。從表1可看出不同碳鏈的AHLs 與酶對接的打分情況,其中C14-HSL 的打分最高。有研究表明已知的大多數(shù)細(xì)菌AHL ?;甘荖 端親核酶(Ntn)-水解酶的成員,這類酶由多種酶組成,它們識別不同種類的底物,然而具有共同的性質(zhì),如自動催化活化、N 端催化親核(蘇氨酸、絲氨酸或半胱氨酸)的存在和酰胺鍵的斷裂,青霉素酰化酶也是其中的一員[28]。具有AHL ?;腹δ艿那嗝顾仵;笇﹂L鏈的AHLs 作用效果較好,一般都是含有α 和β 2 個亞基的二聚體,在α 亞基上都含有1 個保守的絲氨酸活性位點,該位點與周圍的氨基酸殘基盤曲折疊成一個疏水結(jié)合囊,更適合與長鏈AHLs 結(jié)合,因此與短鏈的AHLs 作用力較弱[28]。從表1可知隨著碳鏈長度的增加,分值越來越大,說明該酶的最佳底物更偏向于長鏈AHLs。
圖7 固定化青霉素?;笇晒饧賳伟鶤HLs 的影響Fig.7 Effect of immobilized penicillin acylase on AHLs of P.fluorescens
表1 青霉素?;福óa(chǎn)自巨大芽孢桿菌)與AHLs 分子對接打分Table 1 Molecular docking score of penicillin acylase (from Bacillus megaterium) and AHLs
從上述打分結(jié)果中選擇短鏈、中長鏈、長鏈3種AHLs 進(jìn)行作用力分析,結(jié)果見圖8。圖中呈現(xiàn)了青霉素?;?nvy 與C4-HSL、C8-HSL、C14-HSL 對接的活性位點2D 圖??梢钥闯鯝HLs 與酶之間的相互作用力,C4-HSL 與活性位點中A 鏈的天冬酰胺形成2 個氫鍵;C8-HSL 與活性位點中A鏈上的絲氨酸和天冬酰胺形成3 個氫鍵,與纈氨酸形成1 個碳?xì)滏I;C14-HSL 與活性位點中A 鏈上的蘇氨酸、酪氨酸和絲氨酸形成3 個碳?xì)滏I。僅依靠2D 圖無法確定酶與底物間的空間構(gòu)象,也無法確定酶對長鏈AHLs 偏好的原因,故又對C4-HSL 和C14-HSL 與酶結(jié)合的3D 圖進(jìn)行分析。
圖8b 分別顯示了短鏈和長鏈AHL 與青霉素?;阜肿訉拥?D 圖,從中可看出C4-HSL 與酶的結(jié)合沒有C14-HSL 緊密。C14-HSL 被結(jié)合囊周圍的氨基酸殘基全部包裹,相互以氫鍵連接,與C4-HSL 相比,氫鍵的數(shù)量較多。可能是由于C14-HSL 具有更長的碳鏈,能夠形成更多氫鍵。
圖8 青霉素?;?nvy 與AHLs 結(jié)合活性位點示意圖Fig.8 Schematic diagram of binding active sites of penicillin acylase 6nvy with AHLs
本文研究了固定化青霉素?;福óa(chǎn)自巨大芽孢桿菌)對熒光假單胞菌的QS 抑制作用。通過紫色桿菌CV026 驗證了不同質(zhì)量濃度固定化青霉素?;笇晒饧賳伟鶤HLs 的抑制作用,表明酶的加入能夠使紫色菌素的產(chǎn)量減少,當(dāng)質(zhì)量濃度為25 mg/mL 時,抑制率達(dá)到38.63%。在酶的作用下,熒光假單胞菌的生物被膜和胞外蛋白酶活力均受到影響,且呈濃度依賴性,當(dāng)酶質(zhì)量濃度為25 mg/mL 時,對生物被膜形成的抑制率達(dá)到57.41%;當(dāng)酶質(zhì)量濃度為15 mg/mL 時,完全抑制了胞外蛋白酶的活性,推測是由于酶的加入干擾了熒光假單胞菌的QS 系統(tǒng),使得蛋白酶的表達(dá)受到影響。GC-MS 結(jié)果表明,酶能夠降低熒光假單胞菌的AHLs,從而進(jìn)一步證明酶是通過與AHLs作用來干擾QS。分子對接結(jié)果表明酶對長鏈和短鏈AHLs 都有作用,然而更偏好長鏈AHLs。3D 對接圖顯示酶的活性中心會與C14-HSL 形成更多的氫鍵,從而增大兩者間的相互作用。前人已經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)多種青霉素?;付加写銣鏏HLs 的作用,并且已經(jīng)利用蛋白質(zhì)工程的方法來生產(chǎn)更加穩(wěn)定、特異性和活性更強的AHLs 淬滅酶[29],本文中酶與熒光假單胞菌的AHLs 作用后的產(chǎn)物還未清晰,需要進(jìn)一步驗證其作用機理。