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      基于NF-κB熒光蛋白報(bào)告基因抗腫瘤藥物篩選平臺(tái)的建立

      2023-01-11 08:06:02王瑞萍程浩杰黃明敏譚擁軍
      激光生物學(xué)報(bào) 2022年6期
      關(guān)鍵詞:報(bào)告基因靶點(diǎn)質(zhì)粒

      王瑞萍,程浩杰,余 靂,黃明敏,譚擁軍

      (湖南大學(xué)生物學(xué)院,長沙 410082)

      近年來,隨著惡性腫瘤的發(fā)病率逐漸增高[1],癌癥成為僅次于心腦血管疾病致死率第二的“殺手”,使人類健康受到嚴(yán)重的危害,因此,抗腫瘤藥物的研發(fā)迫在眉睫。據(jù)統(tǒng)計(jì),目前國際上常見的臨床抗腫瘤藥物約80余種[2],大致可分為6類:細(xì)胞毒類藥物[3]、激素類藥物[4]、生物反應(yīng)調(diào)節(jié)劑[5]、單克隆抗體藥物[6]、其他類藥物、輔助藥。為提高新藥的研發(fā)速度,降低癌癥的死亡率,建立一種高效的藥物篩選平臺(tái)是很有必要的。

      目前,藥物篩選平臺(tái)可分為3類:基于靶點(diǎn)的細(xì)胞模型[7]、基于表型的細(xì)胞模型[8]、抗病毒藥物篩選的細(xì)胞模型[9]。其中,基于靶點(diǎn)的細(xì)胞模型是目前用于藥物篩選的主要模型,根據(jù)靶點(diǎn)的不同可以分為4類:以受體為靶點(diǎn)的細(xì)胞模型、以通道為靶點(diǎn)的細(xì)胞模型、以信號(hào)通路為靶點(diǎn)的細(xì)胞模型、以報(bào)告基因和其他類型連用為靶點(diǎn)的細(xì)胞模型。事實(shí)上,前3種藥物篩選細(xì)胞模型通常均是與報(bào)告基因聯(lián)用建立起來的,這樣可以快速且直觀地觀察到藥物作用于細(xì)胞后的變化。

      常用的報(bào)告基因有5種,分別是熒光素酶(luciferase,Luc)[10]、 氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶(chloramphenicol acetyltransferase,CAT)[11]、 β-半乳糖苷酶(β-galactosidase,β-gal)[12]、 分泌性人胎盤堿性磷酸酶(secreted alkaline phos-phatase,SEAP)[13]和GFP[14]。這些報(bào)告基因在細(xì)胞內(nèi)受到調(diào)控后表達(dá)量的改變可對應(yīng)于它們的酶活性或發(fā)光強(qiáng)度的改變。對螢火蟲熒光素酶和海參熒光素酶而言,檢測利用的是它對底物的發(fā)光強(qiáng)度;對β-半乳糖苷酶報(bào)告基因而言,利用的是它催化底物后的顯色反應(yīng);對于GFP等熒光蛋白而言,則利用的是它們被激活后特定波長的發(fā)光強(qiáng)度。在試驗(yàn)時(shí)可根據(jù)報(bào)告基因質(zhì)粒的使用方便性、成本及現(xiàn)有條件進(jìn)行選擇。

      這些報(bào)告基因的工作原理[15]是通過把已確定的順式調(diào)控序列剪接到報(bào)告基因上來控制基因的活性。這些反應(yīng)元件可以對宿主細(xì)胞中基因調(diào)控和表達(dá)的變化起反應(yīng),因此就可以直觀地報(bào)道細(xì)胞內(nèi)與基因表達(dá)有關(guān)的信號(hào)級(jí)聯(lián)。

      在細(xì)胞中,NF-κB的活性水平與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[16]。如在乳腺癌、結(jié)腸癌、淋巴癌等癌癥中,NF-κB的持續(xù)性激活可導(dǎo)致與細(xì)胞周期相關(guān)的蛋白活性異常,如周期蛋白D1(cyclinD1)、周期蛋白依賴激酶Cdk2(cyclin-dependent kinases)、c-myc等[17];其次,持續(xù)性激活的NF-κB能提高一些促進(jìn)腫瘤生長的細(xì)胞因子水平,如IL-1β(急性白血病生長因子)、TNF(惡性淋巴肉芽腫瘤、T細(xì)胞淋巴癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤生長因子)、IL-6(多發(fā)性骨髓瘤的生長因子)[18];此外,在腫瘤細(xì)胞的生長和組織侵潤過程中,NF-κB參與調(diào)節(jié)新血管生成的相關(guān)蛋白的基因表達(dá),如血管內(nèi)皮細(xì)胞生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF),持續(xù)性激活的NF-κB能增強(qiáng)VEGF基因的轉(zhuǎn)錄[19];最后,NF-κB的持續(xù)性激活也能導(dǎo)致細(xì)胞的抗凋亡,抵抗化療藥物的誘導(dǎo)凋亡作用[20]。因此,NF-κB是研究抗腫瘤藥物的關(guān)鍵靶點(diǎn)之一[21]。

      為了高效地篩選出以NF-κB為靶點(diǎn)的抗腫瘤藥物,根據(jù)報(bào)告基因質(zhì)粒的工作原理,本課題成功構(gòu)建了pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒,用于指示細(xì)胞中NF-κB的轉(zhuǎn)錄活性水平,并且使用一線抗癌藥物如雷帕霉素[22]、紫杉醇[23]、吉西他濱[24]及本實(shí)驗(yàn)室研究開發(fā)的多肽類藥物M1-20[25]、M1-21[26],驗(yàn)證了該報(bào)告基因體系的有效性。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      HEK-293T細(xì)胞購自美國模式培養(yǎng)物保藏所(American Type Culture Collection,ATCC)。DH5α感受態(tài)、pGL6-Enhancer、金牌Mix、GFP抗體、Rabbit二抗購買于碧云天生物技術(shù)公司;BamH I、Hind III限制性內(nèi)切酶購自Thermo fisher;T4 DNA Ligase 購自Ferments公司;PCR引物、1kb Marker購自北京擎科生物技術(shù)有限公司;DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒小提試劑盒購自O(shè)mega;Dulbecco改良Eagle培養(yǎng)基(Dulbecco’s modified Eagle medium,DMEM)以及胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)購自GIBCO公司。

      1.2 方法

      1.2.1 pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定

      以實(shí)驗(yàn)室保存的pcDNA3.1-Flag-GFP質(zhì)粒為模板擴(kuò)增GFP基因。上游引物為AAGCTTATGGTGAGCAAGGGCGAGGA,下游引物為GGATCCTTACTTGTACAGCTCGTCCA。PCR反應(yīng)體系(50 μL):上游引物 F 2 μL、下游引物 R 2 μL、模板 50 ng(1 μL)、金牌Mix 45 μL。擴(kuò)增條件為98℃ 2 min、98℃ 10 s、65℃ 10 s、72℃ 10 s、72℃ 5 min,30個(gè)循環(huán)。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物做膠回收,隨后用BamH I和Hind III限制性內(nèi)切酶對膠回收產(chǎn)物及pGL6-NF-κB-Luc質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,用1%的瓊脂糖凝膠電泳并回收目的片段,用T4 DNA連接酶22℃、2 h水浴連接,連接后的產(chǎn)物加入50 μL DH5α感受態(tài)進(jìn)行轉(zhuǎn)化、涂板、挑取單克隆、搖菌,送擎科生物有限公司測序,測序正確的菌液進(jìn)行質(zhì)粒小提。

      1.2.2 報(bào)告基因質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染與檢測

      HEK-293T細(xì)胞用體積分?jǐn)?shù)為10%的FBS和1%青霉素-鏈霉素的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng),待細(xì)胞長滿培養(yǎng)皿后,傳代到6 cm盤中;細(xì)胞密度達(dá)到80%~90%時(shí),轉(zhuǎn)染6 μg pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒;12 h后去除培養(yǎng)基,用1×磷酸緩沖鹽溶液(phosphate buffered saline,PBS)洗一遍細(xì)胞,更換新鮮培養(yǎng)基;待36~48 h后用熒光顯微鏡觀察細(xì)胞拍照。然后收集細(xì)胞,加300 μL IP(immunol precipitation)細(xì)胞裂解液和3 μL蛋白酶抑制劑,冰上裂解20 min,15 000 r/min、4℃離心10 min,取上清,即為細(xì)胞中的蛋白;加入5×蛋白電泳上樣緩沖液,于100℃金屬浴中10 min進(jìn)行蛋白變性,通過蛋白質(zhì)印記(Western blot,WB)檢測GFP蛋白。

      1.2.3 細(xì)胞流式分析

      將HEK-293T細(xì)胞接種于6 cm盤中,待細(xì)胞密度達(dá)到80%~90%時(shí),轉(zhuǎn)染pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒6 μg;12 h后換新鮮培養(yǎng)基,48 h后用0.5%的胰酶將細(xì)胞消化下來,用1×PBS清洗細(xì)胞2次,最后用500 μL的1×PBS重新懸浮細(xì)胞,用流式細(xì)胞儀上機(jī)檢測表達(dá)GFP細(xì)胞的比例。

      1.2.4 抗腫瘤藥物的篩選

      將HEK-293T細(xì)胞接種于6孔板中,待細(xì)胞密度達(dá)到80%~90%時(shí),每孔轉(zhuǎn)染pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒3 μg;12 h后換新鮮的培養(yǎng)基,同時(shí),分別加入0.04 μmol的紫杉醇、0.02 μmol的吉西他濱、20 μmol的雷帕霉素、10 μmol的M1-20、10 μmol的M1-21處理細(xì)胞24 h,收集細(xì)胞進(jìn)行流式檢測,同時(shí)收集蛋白,通過WB檢測細(xì)胞中GFP蛋白表達(dá)量的變化。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 報(bào)告載體的調(diào)控模式

      報(bào)告載體包括最基本的兩個(gè)部分,即響應(yīng)序列和報(bào)告基因。通過把已確定的順式調(diào)控序列剪接到報(bào)告基因上來控制基因的活性,這些反應(yīng)元件可以對宿主細(xì)胞中基因調(diào)控和表達(dá)的變化起反應(yīng),從而就可以直觀地報(bào)道細(xì)胞內(nèi)與基因表達(dá)有關(guān)的信號(hào)級(jí)聯(lián)(圖1)。

      圖1 報(bào)告基因載體工作模式圖Fig.1 Shows a pattern of gene vector operation

      2.2 NF-κB報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建

      pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建是以pGL6-NF-κB-Luc為載體,酶切去除Luc基因,同時(shí)將GFP基因連接在響應(yīng)序列之后。pGL6-NF-κBGFP報(bào)告基因質(zhì)粒的調(diào)控模式及報(bào)告序列(圖2a、2b)、質(zhì)粒圖譜(圖2c)和單克隆測序結(jié)果(圖2d)證明了質(zhì)粒構(gòu)建成功。

      圖2 報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建Fig.2 Construction of the reporting gene plasmid

      2.3 pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒的驗(yàn)證

      在HEK-293T細(xì)胞中轉(zhuǎn)染構(gòu)建成功的pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒,48 h后在熒光顯微鏡下觀察細(xì)胞(圖3a),結(jié)果顯示,細(xì)胞呈現(xiàn)綠色熒光,證明報(bào)告基因質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)可正常表達(dá)。同時(shí)為進(jìn)一步證明構(gòu)建質(zhì)粒的正確性,收取轉(zhuǎn)染報(bào)告基因質(zhì)粒的細(xì)胞蛋白做WB分析(圖3b),通過抗體進(jìn)一步證明GFP基因的表達(dá)及所構(gòu)建的質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)可以正常響應(yīng)。最后,用流式細(xì)胞儀對轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行定量分析(圖3c),結(jié)果同樣證明了報(bào)告基因質(zhì)粒的正確性。

      圖3 報(bào)告基因質(zhì)粒的驗(yàn)證Fig.3 Validation of the reported gene plasmid

      2.4 pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因體系響應(yīng)抗腫瘤藥物

      為證明構(gòu)建成功的pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒可以做為抗腫瘤藥物篩選的工具,在體外培養(yǎng)的HEK-293T細(xì)胞中轉(zhuǎn)染pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒,然后使用臨床上常用的抗癌藥物紫杉醇(0.04 μmol)、吉西他濱(0.02 μmol)、雷帕霉素(20 μmol)、M1-20(10 μmol)、M1-21(10 μmol)處理細(xì)胞,進(jìn)行流式細(xì)胞分析(圖4a)以及WB檢測GFP蛋白的表達(dá)量(圖4b),探究此類抗腫瘤藥物對細(xì)胞中NF-κB轉(zhuǎn)錄活性的影響。其結(jié)果為紫杉醇、吉西他濱、雷帕霉素、M1-20、M1-21均抑制NF-κB的轉(zhuǎn)錄活性。該結(jié)果證明了報(bào)告基因體系可以正常響應(yīng)抗腫瘤藥物。

      圖4 抗腫瘤藥物對NF-κB信號(hào)通路的影響Fig.4 Effects of antineoplastic drugs on the NF-κB signaling pathway

      3 討論

      腫瘤是一種嚴(yán)重危害人類健康的疾?。?7]。幾十年來,人們一直在開發(fā)研究新的藥物以期能有效抑制腫瘤的惡性增長。在研究過程中,尋找一種能快速篩選出有效的抗腫瘤藥物的有效方法極為重要?,F(xiàn)如今,常用的一些篩選體系可以分為生化篩選體系和細(xì)胞篩選體系兩大類?;诩?xì)胞的篩選方法包括細(xì)胞活力(cell viability)、報(bào)告基因(reporter gene)、第二信使(second messenger)、高通量顯微鏡篩選(high-throughput microscopy assays)和基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的篩選。而基于報(bào)告基因建立的藥物篩選平臺(tái),應(yīng)用熒光或化學(xué)發(fā)光法對報(bào)告基因進(jìn)行檢測更簡單、更靈敏。如Zlokarnik等[28]在進(jìn)行轉(zhuǎn)錄定量和單一活細(xì)胞克隆篩選的研究中,用β內(nèi)酰胺酶基因作為報(bào)告基因,在細(xì)胞株轉(zhuǎn)染受體表達(dá)后,再轉(zhuǎn)染構(gòu)建好的NF-κB內(nèi)酰胺酶質(zhì)粒。報(bào)告基因的表達(dá)產(chǎn)物可以水解細(xì)胞內(nèi)的一種跨膜脂蛋白,每一個(gè)酶分子可以催化很多底物分子的化學(xué)鍵斷裂,從而改變底物分子的共振能。在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,這種變化可以通過胞內(nèi)顏色由綠到藍(lán)的改變來探測到。報(bào)告基因可以實(shí)時(shí)檢測細(xì)胞活動(dòng)和生理化學(xué)物質(zhì)的變化情況,并且具有實(shí)時(shí)性、可靠性等優(yōu)點(diǎn),因此,在植物基因工程、動(dòng)物基因工程等中也被廣泛應(yīng)用。

      用報(bào)告基因?qū)蜻x藥物進(jìn)行篩選,其最大的優(yōu)點(diǎn)在于整個(gè)篩選過程可以直接在存活細(xì)胞中進(jìn)行,不必破碎細(xì)胞,報(bào)告基因表達(dá)的定性定量分析可以簡單地通過胞內(nèi)顏色的變化來探測。如采用不同藥物處理細(xì)胞,根據(jù)報(bào)告基因質(zhì)粒的表達(dá)情況判斷藥物分子對細(xì)胞的影響,從而篩選得到有效的藥物,或者用同一藥物分子處理細(xì)胞,檢測不同報(bào)告基因質(zhì)粒的表達(dá),判斷該藥物對細(xì)胞中某些信號(hào)通路或關(guān)鍵基因表達(dá)的影響,進(jìn)而高效地篩選出抗腫瘤藥物。但是報(bào)告基因系統(tǒng)也存在一定的缺陷,如這種瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的方法不能建立穩(wěn)定篩選的細(xì)胞株,每次篩選都要重新轉(zhuǎn)染,此外,對一些難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞(如原代細(xì)胞、不分化的細(xì)胞等)會(huì)出現(xiàn)轉(zhuǎn)染效率低下及浪費(fèi)昂貴的轉(zhuǎn)染試劑等問題。

      在本文中,我們運(yùn)用基因工程技術(shù)[29],基于pGL6-NF-κB-GFP報(bào)告基因質(zhì)粒,建立了一個(gè)抗腫瘤藥物篩選平臺(tái),并在分子及細(xì)胞水平上證明了報(bào)告基因體系可以響應(yīng)藥物對細(xì)胞的影響,從而實(shí)現(xiàn)對抗腫瘤藥物的篩選。在之后的研究工作中,我們考慮將這些報(bào)告基因質(zhì)粒構(gòu)建為穩(wěn)定的細(xì)胞株,建立完整的活細(xì)胞示蹤體系,從而為研究抗腫瘤藥物提供更好的技術(shù)體系。

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