靶點
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接研究人參治療糖尿病腎病中的作用*
由于其多成分、多靶點、多通路且副作用小的作用特點,在臨床上的應用越來越廣泛。有研究發(fā)現(xiàn),中藥及其活性成分可以調節(jié)DN的多種發(fā)病機制,在腎功能保護方面有著可觀的臨床效應[4]。因此,研究中藥治療DN的相關機制是非常有必要的。人參為五加科植物人參的干燥根和根莖,據(jù)《神農(nóng)本草經(jīng)》記載人參“味甘微寒,主補五臟,安精神,定魂魄,止驚悸,除邪氣”?，F(xiàn)代藥理學研究[5]發(fā)現(xiàn),人參具有抗炎、抗氧化和調節(jié)免疫等藥理活性。由于中藥具有多成分、多靶點、多通路聯(lián)合發(fā)揮作用的特點,
湖北科技學院學報(醫(yī)學版) 2023年6期2024-01-12
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接技術探討補骨脂二氫黃酮甲醚治療阿爾茨海默病的分子作用機制Δ
擔。AD是由不同靶點觸發(fā)的系統(tǒng)性多功能障礙疾病,且其發(fā)病機制尚不十分清楚[2-3]。因此,運用多靶點治療方法將比單一靶點治療更具優(yōu)勢。中藥及其提取物在疾病的多靶點、多途徑治療中具有優(yōu)勢[4]。中藥補骨脂具有補腎固精、溫脾止瀉和平喘等功效[5]。有研究結果發(fā)現(xiàn),補骨脂二氫黃酮甲醚可有效治療AD,但其作用機制尚不明確[6-7]。隨著生物信息技術的迅速發(fā)展,網(wǎng)絡藥理學在中藥機制研究中得到了廣泛應用。本研究基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接技術,探討補骨脂二氫黃酮甲醚在AD
中國醫(yī)院用藥評價與分析 2023年10期2023-11-24
- 基于網(wǎng)絡藥理學技術探討桑椹治療便秘的作用機制
要活性成分、作用靶點與調控機制等尚不明確。因此，本研究以桑椹為研究對象，運用網(wǎng)絡藥理學方法篩選桑椹治療便秘的有效成分及潛在靶點，并進行生物信息學分析，得到桑椹分子作用機制，為進一步理論研究及臨床應用提供科學依據(jù)。1 數(shù)據(jù)來源1.1 桑椹化學成分篩選及靶點獲取從TCMSP（https：//old.tcmsp-e.com/tcmsp.php）數(shù)據(jù)庫中輸入“桑椹”，檢索藥物化學組分及該組分靶基因，以口服生物利用度（OB）＞30%，并且化合物類藥性（DL）＞0.1
蠶桑通報 2023年1期2023-11-03
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接技術探討益氣活血方治療糖尿病腎病的作用機制*
性成分、潛在作用靶點及作用機制,旨在為 DN 的臨床治療提供新的治療思路。1 材料與方法1.1 自擬益氣活血方中活性成分的獲得 益氣活血方組成:黃芪30 g,山藥30 g,五指毛桃30 g,菟絲子 20 g,補骨脂20 g,桃仁20 g,丹參15 g,三七15 g,益母草15 g。在 TCMSP 數(shù)據(jù)庫中進行檢索藥物活性成分,口服生物利用度(Oral bioavailability,OB)≥30%、類藥性(Drug-likeness,DL)≥ 0.18為篩
西部醫(yī)學 2023年6期2023-07-07
- 天麻素抗偏頭痛作用機制的網(wǎng)絡藥理學與分子對接研究*
鍵分子通路及關鍵靶點，為臨床應用提供分子機制基礎?，F(xiàn)報道如下。1 資料與方法1.1 網(wǎng)絡藥理學研究收集天麻素抗偏頭痛靶點：在TCMSP 數(shù)據(jù)庫（https：// old. tcmsp. e. com/ index. php）中獲取天麻素的化學結構；在SwissTargetPrediction 數(shù)據(jù)庫（https：//www.SwissTargetPrediction.cn/）中選擇的物種為“人”，獲取天麻素的作用靶點，以靶基因的縮寫表示；在GeneCard
中國藥業(yè) 2023年9期2023-05-11
- 神經(jīng)膠質細胞炎癥反應的RNA 調控及其作為中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病治療靶點的潛力
RNA Regulation of Inflammatory Responses in Glia and Its Potential as a Therapeutic Target in Central Nervous System DisordersAbhishek Guha1,Mohammed Amir Husain1,Ying Si1,2,L Burt Nabors1,Natalia Filippova1,Grace Promer1,Reed Smi
神經(jīng)損傷與功能重建 2023年2期2023-04-05
- 基于整體化學和生物效應譜推演的中藥靶點研究新模式及應用
效應譜推演的中藥靶點研究新模式及應用李 鵬1，張浩然1，張元媛1，詹靈敏1，陳建新21. 山西農(nóng)業(yè)大學 基礎部，中獸醫(yī)藥現(xiàn)代化山西省重點實驗室，山西 太谷 030801 2. 北京中醫(yī)藥大學中醫(yī)學院，北京 100029中藥的生物靶點是中藥和機體互作的核心元件，明確中藥靶點對闡明中藥的物質基礎和作用機制至關重要。通過對中藥和靶點的作用方式進行總結和定義，系統(tǒng)闡述了當前中藥靶點研究發(fā)現(xiàn)的思路和方法，評述其特點和缺陷，在此基礎上，將幾種思路凝練整合，提出一種“基
中草藥 2023年6期2023-03-21
- 基于網(wǎng)絡藥理學與分子對接探討補陽還五湯治療冠心病的作用機制
是通過比較分散的靶點來探討其治療冠心病的作用機制，很少從整體的角度闡釋補陽還五湯的作用機制，且其藥效物質基礎及分子機制等方面的研究也尚未完全闡明。故本研究基于網(wǎng)絡藥理學整合多成分、多靶點探究補陽還五湯治療冠心病的作用機制，為其臨床應用提供科學依據(jù)，以期獲得新的研究思路。1 材料與方法1.1 復方靶點收集利 用BATMAM-TCM（http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/）和TCMSP數(shù)據(jù)庫（http://tcmspw.c
中國醫(yī)藥科學 2023年3期2023-03-15
- 基于網(wǎng)絡藥理學探討柴胡-黃芩治療慢性腎功能衰竭的作用機制*
芩活性成分及相關靶點的篩選基于中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform，TCMSP)[9]檢索柴胡、黃芩的化學成分，根據(jù)口服生物利用度(oral bioavailability，OB)≥30%且類藥性(drug-likeness，DL)≥0.18進行初步篩選，獲得柴胡、黃芩的活性成分和其對應的蛋白質靶點，將
河南中醫(yī) 2023年1期2023-02-09
- 基于網(wǎng)絡藥理學的多葉棘豆總黃酮抗炎作用機制研究
從蒙藥多成分、多靶點的特點出發(fā)，整體上分析闡述蒙藥的作用機制，利于推進蒙藥作用機制的深入研究［14］。為了深入探討多葉棘豆總黃酮類成分抗炎藥效機理，筆者擬通過網(wǎng)絡藥理學方法和技術，預測蒙藥多葉棘豆總黃酮類成分發(fā)揮抗炎藥效的靶點和通路，進而闡明蒙藥多葉棘豆總黃酮類成分抗炎作用機制。1 材料與方法1.1 材料本研究使用的數(shù)據(jù)庫、研究平臺等詳見表1。表1 網(wǎng)絡藥理學研究使用的數(shù)據(jù)庫和平臺Tab. 1 Databases and platforms for net
內蒙古民族大學學報(自然科學版) 2022年6期2023-01-17
- 腦深部電刺激治療難治性抑郁癥的靶點研究進展☆
能精準地植入腦區(qū)靶點、刺激策略可調控等諸多技術優(yōu)勢，在帕金森病治療中廣泛使用[2,5-6]。近年研究將DBS應用于TDR的治療上，meta分析和綜述顯示大約50%TRD患者使用DBS治療有效[7-9]。不同神經(jīng)解剖學靶點可作為DBS治療TRD的靶目標，但最佳的治療靶點仍存在爭議，因此本文對DBS治療TRD的靶點研究進行綜述，以期為進一步研究提供參考。1 概述臨床研究已證實和嘗試的DBS靶點包括胼胝體扣帶回（Brodmann area 25/subcallo
中國神經(jīng)精神疾病雜志 2022年5期2022-08-30
- 基于網(wǎng)絡藥理學的靈芝作用機制研究
現(xiàn)靈芝多成分-多靶點-多通路的作用特點,以及化合物間、作用途徑間的協(xié)同作用。網(wǎng)絡藥理學理念于2007 年由Hopkins 等[10]提出,該理念以系統(tǒng)生物學為基礎,融合了藥理學、信息網(wǎng)絡學和計算機科學,從藥物和疾病間相互作用的整體性和系統(tǒng)性出發(fā),通過虛擬篩選潛在藥效物質、作用靶點及通路等,預測藥物的作用機制,并結合體內體外研究,對預測結果進行驗證,其研究的整體性與中藥 “多成分-多靶點-多途徑” 的特點吻合,已被廣泛用于中藥活性成分的靶點預測及中藥作用機制
浙江農(nóng)業(yè)科學 2022年8期2022-08-11
- 基于系統(tǒng)藥理學探討莪術醇調控鐵死亡和細胞自噬的作用機制
莪術醇化學成分靶點預測本研究使用中藥系統(tǒng)藥理學分析平臺(TCMSP)(http:ibts.hkbu.edu.hk/LSP/tcmsp.php)收集莪術醇藥效成分信息，保存為mol2格式文件，然后將其上傳PharmMapper(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/)。基于反向藥效團匹配法，選擇藥物的藥效團模型, 設置最終產(chǎn)生300個蛋白構象，得到與化合物相關的靶點名稱、基因名稱、Uniprot ID等結果。借助Uni
安徽醫(yī)科大學學報 2022年4期2022-05-12
- 骨康方君臣佐使藥治療骨質疏松藥理機制探討
，具有多成分、多靶點的特點，不同中藥的配伍有著不同的功效，目前大多數(shù)的研究方法仍是選取某個中藥或成分進行研究，不能精準解釋方劑發(fā)揮療效的物質基礎及組方規(guī)律等問題[3]，而網(wǎng)絡藥理學的出現(xiàn)，可作為疾病與中藥方劑之間的橋梁，整體、系統(tǒng)地對方劑進行研究。方劑配伍組成的基本原則是君臣佐使，因此君臣佐使各藥物的配伍決定方劑治療及作用的方向。我院經(jīng)驗方骨康方，在臨床上可顯著緩解OP患者腰腿痛及腎陽虛癥狀，并且已有研究[4]證明骨康方具有抑制骨吸收和促進骨形成的雙重作用
中國骨質疏松雜志 2022年3期2022-03-29
- 羥基紅花黃色素A抗氧化作用網(wǎng)絡藥理學研究
限于單一的成分、靶點和疾病，來闡明中藥 “多組分-多靶點-多通路 ”的特點[5-6]。因此，本研究利用網(wǎng)絡藥理學方法，深入探討HSYA抗氧化的成分-多靶點-多途徑整體調節(jié)的作用機制，為后續(xù)基礎研究及臨床應用提供一定的理論依據(jù)。1 材料與方法1.1 HSYA相關作用靶點的獲取通過 PubChem數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)[7]檢索HSYA 的 2D 結構，保存為SDF格式文件；將SDF文件上傳至 SwissT
牡丹江醫(yī)學院學報 2022年6期2022-02-13
- 基于網(wǎng)絡藥理學探討玉女煎治療糖尿病作用機制
通路的多成分、多靶點、多途徑調節(jié)作用綜合分析,系統(tǒng)觀察藥物對疾病網(wǎng)絡的干預與影響[2-3]。本文采用網(wǎng)絡藥理學方法探討玉女煎治療糖尿病的生物學機制,為玉女煎治療糖尿病實驗研究奠定了基礎。1 資料與方法1.1 玉女燕各中藥活性成分及靶點收集為收集玉女煎中5種藥材的化合物成分,利用TCMSP數(shù)據(jù)庫以玉女煎全方“石膏”“熟地黃”“麥冬”“知母”“牛膝”為關鍵詞,以口服生物利用度(Oral bioavailability,OB)N30%,類藥性(Drug like
牡丹江醫(yī)學院學報 2022年6期2022-02-13
- 黃芩抗前列腺癌作用的網(wǎng)絡藥理學分析
藥具有多成分、多靶點、多途徑的特點。而網(wǎng)絡藥理學是基于藥材、成分、靶點、疾病相互作用網(wǎng)絡的系統(tǒng)方法[12]。網(wǎng)絡藥理學整合多種信息來源，采用生物信息學、網(wǎng)絡分析等計算方法，進而分析藥物作用靶點及可能的機制。本研究利用網(wǎng)絡藥理學方法對黃芩治療PCa的潛在機制及靶點進行了探索性分析，現(xiàn)報告如下。對象與方法一、網(wǎng)絡藥理學分析流程本研究使用網(wǎng)絡藥理學的方法來探尋黃芩治療PCa的潛在機制及靶點，具體分析流程如圖1所示。該分析過程主要包括黃芩活性成分的篩選及作用靶點的
現(xiàn)代泌尿生殖腫瘤雜志 2021年5期2022-01-26
- 基于網(wǎng)絡藥理學的丹參-葛根藥對治療2 型糖尿病作用機制研究
化學成分篩選及靶點預測以丹參、葛根藥對為研究對象，通過中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫和分析平臺（TCMSP）（http：//tcmspw.com/tcmsp.php）進行化學成分的查詢及篩選［3］，選取口服利用度（oral bioavailability，OB≥30% 且類藥性（drug-likeness，DL≥0.18 的化學成分作為候選成分，并查閱相關文獻資料對化學成分進行補充［4，5］。篩選結束后，在Pubchem 數(shù)據(jù)庫（https：//pubchem.nc
海南醫(yī)學院學報 2021年23期2021-12-21
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接探討紫蘇籽抗癌抗腫瘤的分子機制
著一種藥物—一個靶點—一種疾病的模式，無疑這種模式局限了研制藥物的思路，實際上臨床上許多疾病都是多基因多靶點的，治療起來十分的復雜，這時網(wǎng)絡藥理學應運而生。網(wǎng)絡藥理學是以系統(tǒng)生物學和多學科藥理學為基礎，提供了一種“多靶點、多效應、復雜疾病”的新型網(wǎng)絡模式[15]，中醫(yī)藥本身也遵循著整體觀和辨證論治，這與網(wǎng)絡藥理學不謀而合，近年來，基于網(wǎng)絡藥理學對中藥的研究越來越多，也取得了較好的成效[16]。分子對接是應用計算機模擬配體和受體的結合，通過結合能的大小來判斷
糧油食品科技 2021年6期2021-12-07
- 基于網(wǎng)絡藥理學方法研究紫草對癌癥疾病的作用機制＊
紫草活性成分和靶點篩選在TCMSP數(shù)據(jù)庫中收集紫草的化學成分，時間截至2021年1月。并以類藥性（drug-likeness，DL）≥0.18、口服生物利用度（oral bioavailability，OB）≥30%為條件篩選紫草的有效活性化合物，利用UniProt數(shù)據(jù)庫除去非人源基因，把相應靶點蛋白名稱轉化為對應的靶點的Uniprot ID。1.3 紫草活性成分-靶點網(wǎng)絡的構建通過TCMSP數(shù)據(jù)庫收集“1.2”項下紫草中的活性成分的對應靶點，利用Cyt
中外醫(yī)學研究 2021年27期2021-11-02
- 基于網(wǎng)絡藥理學的穿山龍治療糖尿病足機制研究
分的特點，通過多靶點、多通路發(fā)揮治療作用[7]，其中傳統(tǒng)中藥穿山龍具有祛風除濕、舒筋通絡、活血止痛的作用，各醫(yī)家在運用其治療風濕痹證、四肢麻木、血脈瘀滯等方面有較好的療效與經(jīng)驗[8-11]；現(xiàn)代藥理學研究也證實了穿山龍部分活性成分具有治療糖尿病及其并發(fā)癥的作用[12-17]，但其藥效物質基礎和作用機制尚不完全明確。網(wǎng)絡藥理學是醫(yī)學、生物學、計算機科學、生物信息學等多學科基礎與研究手段綜合的結果，能夠系統(tǒng)反映藥物多成分對疾病的干預機制。本研究從網(wǎng)絡藥理學出發(fā)
亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥 2021年9期2021-10-26
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接的“當歸-川芎”藥對作用機制研究
通過構建“藥物-靶點-通路”多層次網(wǎng)絡，系統(tǒng)綜合地觀察中藥對整個疾病網(wǎng)絡的調控作用，有利于闡明中藥多成分、 多靶點、 多途徑協(xié)同作用的機制[4-5].本研究通過TCMSP，SEA數(shù)據(jù)庫和文獻檢索，收集“當歸-川芎”藥對活性成分及其靶點，構建“成分-靶點”網(wǎng)絡，分析得到關鍵靶點，尋找其與美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準藥物靶點的共同靶點，利用TTD和TCMSP數(shù)據(jù)庫分析與共同靶點相關的疾病，建立“共同靶點-疾病”網(wǎng)絡．對關鍵靶點進行基因功能和KEGG通路
西南大學學報（自然科學版） 2021年10期2021-10-21
- 基于網(wǎng)絡藥理學與分子對接探討水陸二仙丹治療糖尿病腎病的潛在分子機制
接驗證，明確作用靶點及分子機制，為進一步探索DN的發(fā)病機制及開發(fā)新的治療藥物提供借鑒。1 材料與方法1.1 藥物相關靶點的篩選通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫尋找2 味中藥化學組成成分，并進行ADME 篩選，按照口服生物利用度≥30%和類藥性≥0.18 兩個閾值初步獲得藥物有效活性成分及其作用的蛋白質靶點，并通過TCMID 及中國知網(wǎng)、萬方搜集2015 年1 月至2020 年9 月的文獻補充未預測到的靶點，刪除未預測到的靶點有效活性成分，將篩選后得到的靶點統(tǒng)一在U
中國醫(yī)藥導報 2021年23期2021-09-26
- 基于網(wǎng)絡藥理學的柴胡在小柴胡湯中治療發(fā)熱的作用分析
每種成分所對應的靶點較多，該藥對多種疾病都有治療作用。目前已發(fā)表的文獻中基于網(wǎng)絡藥理學方法介紹了小柴胡湯治療發(fā)熱的作用機制，但是通過對symmap 數(shù)據(jù)庫（https：//www.symmap.org/search/）進行檢索發(fā)現(xiàn)小柴胡湯中對發(fā)熱有效的中藥僅有柴胡一味，而且臨床中也廣泛的使用柴胡注射液治療發(fā)熱。為進一步闡釋柴胡干預發(fā)熱的作用機制，本研究基于網(wǎng)絡藥理學方法從數(shù)據(jù)庫中提取藥物和疾病的靶點，對靶點進行分析從而得出柴胡治療發(fā)熱的關鍵靶點及其可能的作
海南醫(yī)學院學報 2021年16期2021-08-24
- 基于網(wǎng)絡藥理學的甲潑尼龍治療腹膜纖維化作用機制研究*
成分－疾?。饔?span id="j5i0abt0b" class="hl">靶點網(wǎng)絡，從整體上揭示MP 治療PF 多靶點、多途徑的作用機制，為進一步探討MP 治療PF 的療效提供參考?，F(xiàn)報道如下。1 資料與方法1.1 運用數(shù)據(jù)庫和工具數(shù) 據(jù) 庫 ：PubChem（https：／ ／pubchem.ncbi.nlm.nih.gov ／），Swiss Target Prediction （http：／ ／www. swisstargetprediction.ch ／），GeneCards（https：／ ／www.Ge
中國藥業(yè) 2021年15期2021-08-16
- 當歸-川芎藥對治療原發(fā)性痛經(jīng)的網(wǎng)絡藥理學研究
究中藥多成分、多靶點作用機制成為研究熱點，本文擬采用該方法探究當歸-川芎藥對治療PD 的作用機制，以期為其臨床應用提供參考。1 資料與方法1.1 活性成分及靶點的篩選 基于TCMSP 數(shù)據(jù)庫，以“當歸”“川芎”為關鍵詞檢索，收集藥材的化學成分，然后以OB≥30%和DL≥0.18 為條件篩選有效成分[6，7]。收集數(shù)據(jù)庫中成分對應的靶點，并使用Uniprot 數(shù)據(jù)庫，將靶點轉換標準基因名。1.2 當歸-川芎藥對治療PD 的靶點的篩選 基于Genecards
醫(yī)學信息 2021年14期2021-07-29
- 基于網(wǎng)絡藥理學的半夏瀉心湯治療胃癌作用機制研究
瀉心湯化學成分與靶點篩選通過TCMSP數(shù)據(jù)庫(http:∥tcmspw.com/tcmsp.php)，分別以“半夏”“黃芩”“干姜”“人參”“黃連”“甘草”“大棗”為關鍵詞進行檢索，并調整條件為“OB≥30%、DL≥0.18”，得到所有化學成分及靶點。所得靶點通過UniProt(https:∥www.uniprot.org/)校正，去除非人及未收錄靶點。去重后，得到半夏瀉心湯化學成分及對應靶點。1.2 胃癌相關疾病靶點收集以“gastric cancer”
吉林醫(yī)藥學院學報 2021年4期2021-07-06
- 基于網(wǎng)絡藥理學探究1-脫氧野尻霉素治療2 型糖尿病作用機制
方法，研究藥物、靶點、通路之間的網(wǎng)絡關系，旨在為闡明DNJ 治療T2DM 的作用機制提供理論參考。1 資料與方法1.1數(shù)據(jù)庫 PubChem 數(shù)據(jù)庫（https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/）；SwissTargetPrediction 網(wǎng) 站（http://www.swisstargetprediction.ch/）；Genecard 數(shù)據(jù)庫（https://www.genecards.org/）；OMIM 數(shù)據(jù)庫（https:
浙江中西醫(yī)結合雜志 2021年6期2021-06-22
- 那如三味丸治療類風濕關節(jié)炎的網(wǎng)絡藥理分析*
雖然明確，但是其靶點及作用機制尚有待探究。網(wǎng)絡藥理學于2007年被提出，是建立在高通量組學數(shù)據(jù)分析、虛擬計算及網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫檢索基礎上，基于藥物、成分、靶點之間的關聯(lián)性，通過生物信息網(wǎng)絡構建及網(wǎng)絡拓撲結構分析，構建“藥物-成分-靶點”網(wǎng)絡；基于藥物與藥物之間的相同成分、功效和內在結構，構建“藥物-藥物”網(wǎng)絡，探索藥物有效成分的具體作用靶點和藥物功效。綜上，本次研究應用網(wǎng)絡藥理學方法全面解析那如三味丸治療RA的機制，為后期生物學驗證提供理論基礎。1 材料與方法1
包頭醫(yī)學院學報 2021年1期2021-05-19
- 熱毒寧與血必凈“同病異治”新型冠狀病毒肺炎的網(wǎng)絡藥理學作用機制研究
.1 藥物成分與靶點的篩選 本研究采用計算系統(tǒng)生物學實驗室的中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform，TCMSP，http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php) 檢索熱毒寧(處方中含金銀花、青蒿、梔子)與血必凈(處方中含丹參、紅花、當歸、赤芍、川芎)的潛在活性成分。根據(jù)化合物口服生物利用度
藥學服務與研究 2021年2期2021-05-10
- 姜黃素治療甲狀腺乳頭狀癌的藥理學作用機制研究
基礎，尋找其作用靶點和涉及的信號通路，探究黃素治療甲狀腺癌的具體作用機制，現(xiàn)報道如下。1 資料與方法1.1姜黃素作用靶點的預測 采用TCMSP 數(shù)據(jù)庫、檢索詞Curcumin檢索得到姜黃素相關靶點蛋白名稱，并通過Uniprot 數(shù)據(jù)庫轉換為相對應的基因名稱。PubChem 數(shù)據(jù)庫中找出姜黃素的smile號和3D 結構(保存為SDF模式)，在Swiss Target Prediction平臺中輸入該smile號預測姜黃素的靶點。3D結構SDF模式文檔上傳至
中國保健營養(yǎng) 2021年34期2021-04-03
- 金匱腎氣丸防治絕經(jīng)后骨質疏松癥的物質基礎探索※
成分并預測其作用靶點,有助于深入理解中醫(yī)藥治療作用的物質基礎[6]。本研究通過篩選、預測金匱腎氣丸組方中各中藥的有效活性成分及其治療PMOP的靶點基因,探索該藥物治療作用的物質基礎,以期為后續(xù)研究提供思路。1 材料與方法1.1 金匱腎氣丸 通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)分析平臺(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)收集金匱腎氣丸組成藥物的活性成分,以口服生物利用度(OB)＞30%、類藥性(DL)＞0.18為口服中藥的有效活性成分篩選
中國民間療法 2021年3期2021-04-01
- 基于網(wǎng)絡藥理學探討清熱活血方抗類風濕性關節(jié)炎的作用機制
n數(shù)據(jù)庫預測藥物靶點，同時通過藥物數(shù)據(jù)庫（Drugbank）和在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫（OMIM）收集疾病靶點。將藥物靶點與疾病靶點取交集，拓展并拓撲獲取關鍵靶點，利用DAVID數(shù)據(jù)庫對關鍵靶點進行基因本體論（GO）分類富集分析和京都基因和基因組百科全書（KEGG）通路富集分析，通過Centiscape計算獲取hub節(jié)點。結果：從清熱活血方中篩選出活性成分31個，預測靶點419個，數(shù)據(jù)庫挖掘疾病靶點共430個。將藥物靶點與疾病靶點取交集、拓撲分析獲得清熱活
世界中醫(yī)藥 2021年22期2021-01-03
- 基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接研究蟲草素抗癌的分子機制
挖掘蟲草素的抗癌靶點，進行靶點的蛋白互作分析、基因本體(GO)功能分析，以及京都靶點與靶點組百科全書(KEGG)通路分析，并對主要靶點進行分子對接驗證，以期全面闡明蟲草素的抗癌機制。1 材料與方法1.1數(shù)據(jù)庫與軟件①活性成分靶點數(shù)據(jù)庫：BATMAN-TCM (http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)、CTD(http://ctdbase.org/)；②疾病靶點數(shù)據(jù)庫：GeneCards(https://www.genecar
湖北民族大學學報(醫(yī)學版) 2020年4期2020-12-11
- 雷公藤多苷與呋塞米聯(lián)用治療腎病綜合征人體內相互作用機制的網(wǎng)絡藥理學通路預測*
實驗室研究前預測靶點與通路，以期探索在雷公藤多苷與呋塞米共同進入人體后可能發(fā)生的藥物相互作用機制。1 資料與方法1.1 主要活性成分預測 通過檢索TCMSP、ChEMBL、PubChem Compound數(shù)據(jù)庫和已發(fā)表文獻獲得TG的化學成分、分子結構及其化學性質和呋塞米的分子結構及其化學性質。保存兩種藥所包含化學成分的結構式（.sdf格式）或Smiles號。根據(jù)類藥五原則[5]篩選TG主要活性成分。類藥五原則要求化合物分子質量（MW）≤500、氫鍵給體（n
天津中醫(yī)藥 2020年10期2020-10-23
- 腦立體定向技術靶點誤差影響因素分析
獻報道，但是對于靶點誤差的范圍，手術中靶點相關指標對靶點誤差的影響報道寥寥無幾。本研究利用顱骨模型，建立模擬靶點模擬立體定向手術過程，采用Leksell-G手術方法，測量靶點誤差范圍，分別對不同靶點位置的誤差進行分析，探索靶點相關指標對立體定向活檢術誤差的影響因素，為臨床工作中目標靶點的設置及穿刺路徑的選擇提供參考。1 材料與方法1.1 模擬靶點制作選取成人顱骨標本沿冠狀縫、雙側頂骨鱗縫、乙狀縫去掉頂骨，完全暴露顱腔內部，其內設計模擬靶點，模擬靶點以特制鈦
延安大學學報(醫(yī)學科學版) 2020年3期2020-10-13
- 基于網(wǎng)絡藥理學的金蓮花活性成分抗炎機制研究
中藥的多成分、多靶點的協(xié)同作用[9]。網(wǎng)絡藥理學的研究思路與中醫(yī)藥整體觀念一致，可應用于解決中藥及復方研究中多成分、多靶點、協(xié)同作用特點帶來的難題[10]。目前已經(jīng)建立了若干數(shù)據(jù)庫，提供有關中藥的各方面信息，包括疾病、方劑、草藥或天然產(chǎn)物、生物活性成分和靶點。這些數(shù)據(jù)庫成為中醫(yī)藥與現(xiàn)代生物醫(yī)學之間的橋梁，在中藥藥理學研究中發(fā)揮了重要作用。本研究利用中藥網(wǎng)絡藥理學研究方法，探究金蓮花抗炎功能的作用靶點和相關基因，為金蓮花抗炎的機制研究和臨床應用提供理論依據(jù)。
中醫(yī)藥學報 2020年8期2020-10-10
- 基于網(wǎng)絡藥理學的金水六君煎治療慢性阻塞性肺疾病作用機制研究
COPD的成分-靶點網(wǎng)絡，分析該方多成分-多靶點間復雜網(wǎng)狀關系，預測其防治COPD的潛在靶標和作用機制，為臨床研究和實驗研究提供依據(jù)。1 資料與方法1.1 金水六君煎方源金水六君煎出自《景岳全書·新方八陣》：“治肺腎虛寒，水泛為痰，或年邁陰虛，血氣不足，外受風寒，咳嗽嘔惡，多痰喘急等證”[5]，由熟地、當歸、陳皮、半夏、茯苓、炙甘草、生姜組成。1.2 金水六君煎的化學成分及其對應靶點挖掘采用中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP：Traditional
南京中醫(yī)藥大學學報 2020年3期2020-05-29
- 基于網(wǎng)絡藥理學的梔子柏皮湯治療肝炎作用機制研究Δ
成分、多途徑和多靶點進行較為全面地揭示。故本研究擬應用網(wǎng)絡藥理學分析方法，分析、預測梔子柏皮湯治療肝炎的作用機制，進一步分析其作為肝病治療用藥的合理性及針對性，以期為后續(xù)實驗研究及為臨床用藥提供參考依據(jù)。1 資料與方法1.1 梔子柏皮湯藥物靶點篩選通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform，TCMSP)(
中國醫(yī)院用藥評價與分析 2020年1期2020-03-05
- 甘草苷治療抑郁癥和糖尿病共病的網(wǎng)絡藥理學作用機制研究
用，構建“成分-靶點-疾病”之間的復雜網(wǎng)絡來探討藥物的作用機制[6]。網(wǎng)絡藥理學研究策略的整體性、系統(tǒng)性特點與中藥及其方劑的多成分、多途徑、多靶點協(xié)同作用的原理異曲同工。與此同時，網(wǎng)絡藥理學的研究方法與中醫(yī)藥理論相結合，可以推動單藥物單靶點向多組分多靶點的研究模式轉變，從整體上預測藥物靶點信息，為藥物研發(fā)提供了新的途徑和方法[7]?！爱惒⊥巍笔侵嗅t(yī)臨床的重要治則，以“辨證論治”理論為基礎，也是中醫(yī)學區(qū)別于現(xiàn)代醫(yī)學的基本特征之一[8]，其科學內涵為異病-同
天然產(chǎn)物研究與開發(fā) 2019年11期2019-12-05
- 計算機輔助藥物設計在天然產(chǎn)物多靶點藥物研發(fā)中的應用淺談
5年全球第一個多靶點藥物索拉非尼上市以來，多靶點藥物的研發(fā)就開始進入到了高速發(fā)展階段，由于多靶點藥物對癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、糖尿病、高血壓及艾滋病等復雜性疾病有較好的治療效果，且相對單靶點藥物而言，有著同時調節(jié)多靶點、調節(jié)疾病網(wǎng)絡多個環(huán)節(jié)、毒副作用低的優(yōu)勢，近年來更是成為藥物研發(fā)的主要方向；多靶點藥物有著不良反應未知、藥物作用于多個靶點的濃度不同等問題的存在，早期多靶點藥物研發(fā)主要以化學合成或者通過對已有物質的篩選而獲得，而天然產(chǎn)物因結構多樣性、多靶點活性較
智慧健康 2019年26期2019-01-29
- 叢式井平臺井口布置方法
于平臺井口位置與靶點的分配問題[3］，國內外學者以“水平位移之和最小”、“總井深之和最小”、“總井深與總水平位移之和最小”[4］等作為評價指標進行了相關的分析研究[5-6］，得出了一些有價值的結論。而在進行叢式井設計時，設計人員大多憑借經(jīng)驗對井口和靶點進行分配，沒有科學的計算方法和手段。因此，筆者在借鑒前人研究成果的基礎上，根據(jù)現(xiàn)場實際需要，對靶點的分配問題進行了研究，提出了井口與靶點的連線在水平面上的投影不相交且水平位移平方和最小的方法，即不相交水平位移
石油鉆探技術 2013年2期2013-11-27
- 藥物靶點篩選的研究
術的進步, 基于靶點的藥物發(fā)現(xiàn)模式逐漸取代了傳統(tǒng)的基于藥物化學結構的發(fā)現(xiàn)模式，成為現(xiàn)代創(chuàng)新藥物研發(fā)的主流模式。本文主要總結了藥物靶點篩選的全部流程，并重點介紹了靶點確認及驗證的成熟方法。1 藥物靶點篩選的三個階段1.1 小分子藥物的篩選藥物靶點的篩選首先要篩選感興趣的藥物，主要有兩種基本方式：基于靶點的篩選和表型篩選。1.1.1 基于靶點的篩選 到目前為止，很多藥物都是通過這種方法篩選得到的，基于靶點的篩選可以有效的篩選到具有生物活性的小分子物質，這種篩選
中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè) 2013年14期2013-08-15