從大規(guī)模泛癌擾動(dòng)篩選中發(fā)現(xiàn)合成致死相互作用

癌癥治療的發(fā)展受藥物靶標(biāo)有限的限制。潛在的候選藥物靶標(biāo)可以基于合成致死（SL）的概念來(lái)鑒定。合成致死是指一對(duì)基因，其中任一基因單獨(dú)出現(xiàn)畸變都是非致死性的，但同時(shí)出現(xiàn)畸變對(duì)細(xì)胞是致死性的。在這里，研究人員提出了R中的合成致死識(shí)別（SLIdR），這是一種用于從大規(guī)模擾動(dòng)篩選中識(shí)別合成致死對(duì)（SL對(duì)）的統(tǒng)計(jì)框架。SLIdR 成功地預(yù)測(cè)了SL對(duì)，即使樣本量較小，同時(shí)最大限度地減少了假陽(yáng)性靶標(biāo)的數(shù)量。研究將SLIdR應(yīng)用于Project DRIVE數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)已建立的和潛在的泛癌和癌癥類(lèi)型特異性SL對(duì)，與文獻(xiàn)和藥物反應(yīng)篩選數(shù)據(jù)的結(jié)果一致。該研究通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了肝細(xì)胞癌中2種預(yù)測(cè)SL對(duì)的相互作用（ARID1ATEAD1和AXIN1-URI1），從而證實(shí)了SLIdR鑒定潛在藥物靶標(biāo)的能力。