俱樂部始建于 2005年 12月，時稱上海東亞足球俱樂部，由上海東亞（集團(tuán)）有限公司和上海根寶足球俱樂部基地有限公司共同出資建立。

球隊首次參加職業(yè)聯(lián)賽，獲得中國足球協(xié)會乙級聯(lián)賽（南區(qū)）第7名。

奪得中國足球乙級聯(lián)賽冠軍，成功沖甲。

代表上海隊參加全運會男子足球甲組比賽并奪得冠軍。該賽季，上海東亞足球俱樂部獲得中國足球協(xié)會甲級聯(lián)賽第4名。

首次代表上海參加滬港球會杯并擊敗香港公民足球俱樂部，獲得冠軍。

以中甲冠軍的身份升入中超，武磊以17個進(jìn)球衛(wèi)冕中甲聯(lián)賽本土最佳射手。11月獲得滬港球會杯三連冠。

成為首支蟬聯(lián)全運會男子足球項目冠軍的球隊。獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第9名，武磊首次獲得中超聯(lián)賽本土最佳射手。11月實現(xiàn)滬港球會杯四連冠。

因凈勝球的劣勢屈居中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第5名，武磊以12球蟬聯(lián)聯(lián)賽本土最佳射手。11月18日，上港集團(tuán)完成對俱樂部的整體收購。

獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第2名，首次獲得亞洲冠軍聯(lián)賽資格，武磊以14球第三次蟬聯(lián)聯(lián)賽本土最佳射手。

上港集團(tuán)足球俱樂部獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第3名，武磊連續(xù)4年加冕聯(lián)賽本土最佳射手。12月23日，切爾西足球俱樂部中場奧斯卡加盟上港集團(tuán)足球俱樂部。

連續(xù)三屆獲得全運會男足甲組比賽冠軍。獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第2名，顏駿凌獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽最佳門將，武磊連續(xù)第5年獲聯(lián)賽本土最佳射手。

提前1輪獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽冠軍，武磊榮膺聯(lián)賽最佳射手獎、最有價值球員獎，顏駿凌獲最佳守門員獎。這是該隊歷史上和上海足球歷史上第一個中超聯(lián)賽冠軍。

首次奪得中國足協(xié)超級杯冠軍。獲得中國足球協(xié)會超級聯(lián)賽第3名。

1月13日，上海上港俱樂部正式更名為上海海港足球俱樂部。

10月29日，上海海港提前一輪在主場拿下中超冠軍。這是海港隊史的第二個中超冠軍。