鄒智 喬雪瑩 鄭玉皎 陽(yáng)江華
關(guān)鍵詞:乳管;水通道蛋白;亞細(xì)胞定位;雙分子熒光互補(bǔ);酵母雙雜交
質(zhì)膜內(nèi)在蛋白(plasma membrane intrinsic protein,PIP)是一類原始而高度保守的水通道蛋白(aquaporin,AQP)[1]。根據(jù)進(jìn)化關(guān)系和序列特征,PIP 可分為PIP1 和PIP2 兩個(gè)亞類,前者具有較長(zhǎng)的N 端,而后者具有較長(zhǎng)的C 端[2-7]。在蟾蜍卵母細(xì)胞中的體外分析顯示,PIP2 具有高效的水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性,而PIP1 無(wú)活性或活性極低,究其原因主要是因PIP1 不能有效定位到細(xì)胞膜所致[8-14]。在玉米原生質(zhì)中亞細(xì)胞定位分析顯示,隸屬于PIP2 亞類的ZmPIP2;1 和ZmPIP2;5 定位在細(xì)胞膜,而屬PIP1 亞類的ZmPIP1;1、ZmPIP1;2 和ZmPIP1;6 均定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[9]。雖然PIP 單體本身就具有水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性,但其在生物膜上以四聚體的形式起作用[15]。PIP 不僅可形成同源四聚體,同時(shí)也可以形成異源四聚體[15-18]。
橡膠樹(shù)(Hevea brasiliensis Muell. Arg.)隸屬于大戟科,是天然橡膠的主要商業(yè)來(lái)源[19-21]。生產(chǎn)上,橡膠通過(guò)用膠刀周期性地切割樹(shù)皮收集膠乳而獲得。膠乳系乳管細(xì)胞的胞質(zhì)成分,水分含量60%~70%,水分通過(guò)調(diào)節(jié)膠乳的粘稠度和乳管膨壓進(jìn)而影響橡膠樹(shù)的產(chǎn)排膠能力,是決定膠乳產(chǎn)量的關(guān)鍵因素[4, 11, 14, 22]。通過(guò)前期研究,本團(tuán)隊(duì)鑒定到1 個(gè)在乳管中高豐度表達(dá)的AQP 基因,即HbPIP2;3,發(fā)現(xiàn)該基因的表達(dá)水平與品系的膠乳產(chǎn)量和水分含量呈正相關(guān),且該基因在蟾蜍中過(guò)表達(dá)可顯著提高卵母細(xì)胞的水分透性[4, 14]。為揭示HbPIP2;3 調(diào)控乳管水分平衡的分子機(jī)制,本研究在前期工作基礎(chǔ)上對(duì)其編碼蛋白的亞細(xì)胞定位和多聚化特征進(jìn)行分析,以增進(jìn)對(duì)乳管水分平衡的分子認(rèn)知,并為利用生物技術(shù)手段提高膠乳產(chǎn)量提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 基因克隆所用橡膠樹(shù)品系為熱研7-33-97;亞細(xì)胞定位和雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)所用材料為本氏煙草。
1.1.2 菌株及載體 大腸桿菌DH5α、根癌農(nóng)桿菌GV3101、pNC-Cam1304-SubN、pNC-BiFC-ENN和pNC-BiFC-ECN 由本實(shí)驗(yàn)室保存;Y2HGold 購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;酵母雙雜交載體購(gòu)自寶日醫(yī)生物技術(shù)(大連)有限公司。
1.1.3 主要試劑 各類酶、試劑盒及生化試劑詳見(jiàn)文獻(xiàn)[23-24]。
1.2 方法
1.2.1 RNA 提取和反轉(zhuǎn)錄 膠乳總RNA 的提取及cDNA 第一鏈的合成參照文獻(xiàn)[4]。
1.2.2 基因克隆與載體構(gòu)建 根據(jù)本地?zé)嵫?-33-97 的基因組序列設(shè)計(jì)引物(表1),并以膠乳來(lái)源的cDNA 作為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。參照文獻(xiàn)[24],利用同源重組法將HbPIP2;3 構(gòu)建到pNC-Cam1304-SubN、pNC-BiFC-ENN、pNC-BiFCECN、pGADT7 和pGBKT7。
1.2.3 生物信息學(xué)分析 蛋白的理化特性、保守結(jié)構(gòu)域、亞細(xì)胞定位和二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分別采用Protparam(https://web.expasy.org/protparam/)、CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd)、WoLF PSORT(https://www.genscript.com/wolf-psort.html)和SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html)等在線工具分析。根據(jù)與菠菜SoPIP2;1[15]進(jìn)行序列比對(duì)界定相應(yīng)的跨膜螺旋區(qū),并利用其晶體結(jié)構(gòu)作為模板通過(guò)SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/interactive)在線軟件進(jìn)行3D 建模。
1.2.4 亞細(xì)胞定位和雙分子熒光互補(bǔ) 含重組質(zhì)粒農(nóng)桿菌浸染液的制備及煙草葉片的瞬時(shí)轉(zhuǎn)化參照文獻(xiàn)[24],其中,煙草幼苗約為5 周齡,轉(zhuǎn)化48 h 后用共聚焦顯微鏡進(jìn)行熒光觀察。
1.2.5 酵母雙雜交 誘餌載體pGBKT7-HbPIP2;3的自激活檢測(cè)及點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的酵母雙雜交參照寶日醫(yī)酵母雙雜交試劑盒說(shuō)明書(shū)。
2 結(jié)果與分析
2.1 基因克隆與載體構(gòu)建
以HbPIP2;3F/R 為引物的首輪PCR 成功擴(kuò)增到1 條約860 bp 的目的條帶。隨后,以第一輪PCR產(chǎn)物作為模板,分別以pCam1304-HbPIP2;3F/R、pNC-BiFC-HbPIP2;3F/R、pGADT7-HbPIP2;3F/R或pGBKT7-HbPIP2;3F/R 為引物進(jìn)行第二輪PCR擴(kuò)增,目的條帶切膠回收后分別構(gòu)建pCam1304-HbPIP2;3、pNC-BiFC-ECN-HbPIP2;3、pNC-BiFCENN-HbPIP2;3、pGADT7-HbPIP2;3 和pGBKT7-HbPIP2;3 等載體。
2.2 序列的生物信息學(xué)分析
測(cè)序及序列分析表明,HbPIP2;3 的CDS 全長(zhǎng)為861 bp,預(yù)測(cè)編碼286 個(gè)氨基酸,理論分子量為30.58 kDa,等電點(diǎn)為8.50,脂肪族指數(shù)為100.38,總平均疏水指數(shù)為0.449,不穩(wěn)定系數(shù)為31.68。CDD 分析顯示,該蛋白含有1 個(gè)高度保守的MIP 結(jié)構(gòu)域,即32~267 位,共包含236 個(gè)殘基(圖1A)。序列比對(duì)顯示,HbPIP2;3 與HbPIP1;1、SoPIP2;1 的序列相似性分別為72.1%和85.1%,擁有6 個(gè)典型的跨膜螺旋(即TM1~6)和2 個(gè)半螺旋(即HB 和HE),其中,位于2 個(gè)半螺旋上的NPA 基序,以及位于TM2、TM5 和LE 上的ar/R 選擇性濾器完全一致,均為F-H-T-R;在5個(gè)Froger 位點(diǎn)(即P1~5)中,僅P1 存在變異,分別為Q-S-A-F-W、E-S-A-F-W 和M-S-A-F-W;此外,對(duì)應(yīng)于SoPIP2;1 S115 的磷酸化位點(diǎn)和L197門控位點(diǎn)也完全一致,而對(duì)應(yīng)于SoPIP2;1 S274 的磷酸化位點(diǎn)則只存在HbPIP2;3 和SoPIP2;1 中(圖1B)。SOPMA 分析顯示,HbPIP2;3 的α-螺旋占36.36%,延伸鏈結(jié)構(gòu)占17.48%,β-轉(zhuǎn)角占3.50%,無(wú)規(guī)則卷曲占42.66%;同源建模進(jìn)一步證實(shí)該蛋白含有6 個(gè)跨膜螺旋,同時(shí)也顯示其可以形成同源四聚體( 圖1C)。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示,HbPIP2;3 定位在細(xì)胞膜。
2.3 亞細(xì)胞定位分析
以空載pNC-Cam1304-SubN 為對(duì)照,將含pCam1304-HbPIP2;3 的農(nóng)桿菌工程菌微量注射煙草葉片后進(jìn)行熒光觀察,結(jié)果如圖2 所示,轉(zhuǎn)空載的熒光信號(hào)散布于細(xì)胞的各個(gè)區(qū)域,包括細(xì)胞核,而實(shí)驗(yàn)組僅見(jiàn)于細(xì)胞膜,這表明HbPIP2;3 定位在細(xì)胞膜。
2.4 BiFC 分析
以轉(zhuǎn)pCam1304-HbPIP2;3 的為陽(yáng)性對(duì)照、單轉(zhuǎn)pNC-BiFC-ENN-HbPIP2;3 或pNC-BiFC-ECNHbPIP2;3 的為陰性對(duì)照,將分別含有pNC-BiFCENN-HbPIP2;3 和pNC-BiFC-ECN-HbPIP2;3 的農(nóng)桿菌工程菌等量混合后轉(zhuǎn)化煙草,熒光觀察結(jié)果如圖3 所示,2 個(gè)陰性對(duì)照均為未見(jiàn)信號(hào),而實(shí)驗(yàn)組和陽(yáng)性對(duì)照在細(xì)胞膜均發(fā)現(xiàn)強(qiáng)烈的熒光信號(hào),這表明HbPIP2;3 可在細(xì)胞膜上形成多聚體。
2.5 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)
自激活檢測(cè)顯示(圖4),轉(zhuǎn)pGADT7/pGBKT-7-HbPIP2;3 的陽(yáng)性對(duì)照在二缺(SD-TL)、三缺(SD-TLH)和四缺(SD-TLHA)營(yíng)養(yǎng)平板上生長(zhǎng)旺盛,而實(shí)驗(yàn)組與陰性對(duì)照類似,在四缺板上均無(wú)生長(zhǎng),這表明pGBKT7-HbPIP2;3 無(wú)自激活活性。進(jìn)一步的酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)顯示(圖5),實(shí)驗(yàn)組和陽(yáng)性對(duì)照類似,在四缺板上生長(zhǎng)旺盛,而陰性對(duì)照無(wú)生長(zhǎng),這表明HbPIP2;3 在體外也可形成多聚體。
3 討論
作為天然橡膠合成和貯藏的場(chǎng)所,橡膠樹(shù)乳管是一類高度分化的單一細(xì)胞類型組織[19]。與成熟葉片等組織不同,乳管無(wú)中央大液泡,取而代之的是成百上千的分散性小液泡,即所謂的黃色體[4, 19]。在成熟葉片中,水分的平衡由PIP 和液泡定位的液泡內(nèi)在蛋白(tonoplast intrinsic protein,TIP)共同決定,而乳管的水分平衡則主要由PIP決定[7],因此,分離和鑒定乳管表達(dá)的PIP 具有重要理論意義和應(yīng)用價(jià)值[4, 11-14]。在3 個(gè)乳管高豐度表達(dá)的PIP 中,HbPIP1;4 和HbPIP2;7 在蟾蜍卵母細(xì)胞中異源表達(dá)均無(wú)水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性[13],而HbPIP2;3 的活性與HbPIP2;1 相當(dāng)[11, 14]。由于HbPIP2;1 在乳管中的表達(dá)豐度很低, 因此,HbPIP2;3 被認(rèn)為是調(diào)控乳管水分平衡的關(guān)鍵基因[4, 14]。
本研究結(jié)果顯示,HbPIP2;3 含有一個(gè)AQP 家族特有的MIP 結(jié)構(gòu)域(Pfam 登錄號(hào)為PF00230),其中包含6 個(gè)典型的跨膜螺旋和2 個(gè)半螺旋,等電點(diǎn)>7.0,總平均疏水指數(shù)>0,不穩(wěn)定系數(shù)為<40,屬于穩(wěn)定的疏水型堿性蛋白。與隸屬于PIP1 亞類的HbPIP1;1 相比,HbPIP2;3 與SoPIP2;1 的序列相似性更高,具有較短的N 端和較長(zhǎng)的C 端,且C 端含有1 個(gè)PIP2 亞類特有的磷酸化位點(diǎn)[15]。與生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果一致,在煙草葉片中的亞細(xì)胞定位分析顯示HbPIP2;3 定位在細(xì)胞膜。與基于同源建模的3D 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)一致,BiFC 和點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)均表明HbPIP2;3 可形成同源四聚體。HbPIP1;1 雖然在煙草中也定位在細(xì)胞膜[24],但與HbPIP2;3 和SoPIP2;1 不同的是,其在蟾蜍中并無(wú)水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性[12]。雖然本研究試圖通過(guò)序列比較尋求答案,但HbPIP1;1 具有HbPIP2;3 和SoPIP2;1 類似的ar/R 選擇性濾器(F-H-T-R)以及典型的NPA 基序,理論上HbPIP1;1 應(yīng)具有高效的水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性,因此,相關(guān)的決定因子還有待進(jìn)一步研究。另外一種可能是,HbPIP1;1 自身原本不能定位到細(xì)胞膜,但可以跟煙草中的PIP2蛋白互作進(jìn)而有效定位。事實(shí)上,PIP1 和PIP2之間的異源互作廣泛存在于不同植物中,如玉米、擬南芥、煙草、葡萄、甜菜、草莓、棉花、大麥,甚至還包括卷柏[8-9, 16-18, 25-27]。因此,進(jìn)一步篩選和鑒定與HbPIP1;1 互作的PIP2 蛋白有助于闡明復(fù)雜的調(diào)控機(jī)制。
綜上,本研究證實(shí)HbPIP2;3 在細(xì)胞膜上可通過(guò)同源四聚體的方式調(diào)控橡膠樹(shù)乳管的水分平衡,但是否存在異源互作模式還有待進(jìn)一步研究。