關(guān)鍵詞 細(xì)胞外囊泡;核酸遞送;基因治療;癌癥治療;納米流式檢測技術(shù);評述
核酸療法(Nucleic acid therapy)是一種基于核酸分子的醫(yī)學(xué)治療方法,主要利用核酸(如DNA 和RNA 等)調(diào)節(jié)基因表達(dá)和修復(fù)遺傳缺陷,從而實現(xiàn)疾病治療[1]。核酸療法不僅在治療遺傳病、癌癥和感染性疾病等方面顯示出巨大的應(yīng)用潛力,還為疑難疾病和罕見病提供了新的治療選擇。核酸療法中的藥物包括質(zhì)粒DNA(Plasmid DNA, pDNA)、mRNA、miRNA、反義寡核苷酸(Antisense oligonucleotides,ASO)及小干擾RNA(Small interfering RNA, siRNA)等,應(yīng)用范圍包括基因編輯、基因添加和基因沉默。迄今為止,已有十余種核酸藥物獲得美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)并上市[2]。然而,核酸類藥物在體內(nèi)發(fā)揮有效作用的過程中面臨諸多挑戰(zhàn),包括易受血清核酸酶降解、被免疫系統(tǒng)清除、與非靶細(xì)胞發(fā)生非特異性相互作用等[2-4]。因此,開發(fā)高效的遞送載體是核酸療法在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中取得成功的關(guān)鍵。目前,遞送載體主要分為病毒載體和非病毒載體兩類。盡管包括慢病毒、腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒和腺相關(guān)病毒在內(nèi)的病毒載體在遞送效率上具有優(yōu)勢,但病毒載體在安全性和大規(guī)模生產(chǎn)方面存在限制。相對而言,開發(fā)高效且安全的非病毒載體成為了核酸類藥物遞送研究的主要關(guān)注點。
細(xì)胞外囊泡(Extracellular vesicles, EVs)是細(xì)胞分泌到胞外的具有磷脂雙層膜結(jié)構(gòu)的納米小泡[5-7]。幾乎所有細(xì)胞均能分泌EVs,根據(jù)其分泌途徑的不同, EVs 主要分為多泡體與細(xì)胞膜融合后釋放的外泌體(Exosomes, 30~150 nm)及細(xì)胞膜直接出芽形成的微囊泡(Microvesicles, MVs, 50~1000 nm)[5]。與脂質(zhì)納米顆粒(Lipid nanoparticles, LNPs)等傳統(tǒng)非病毒載體相比, EVs 作為天然的脂質(zhì)納米顆粒,展現(xiàn)出多方面優(yōu)勢。EVs 在體液中更加穩(wěn)定,不易被巨噬細(xì)胞或網(wǎng)狀內(nèi)皮系統(tǒng)去除,具有高生物相容性、低免疫原性,并可跨越血腦屏障,被認(rèn)為是極具應(yīng)用前景的核酸藥物遞送載體[8-10]。此外,不同細(xì)胞來源的EVs 所攜載的生物活性分子(如蛋白質(zhì)、核酸和脂質(zhì)等)存在顯著差異,這種差異賦予了EVs 不同的生物學(xué)功能,如靶向特定細(xì)胞、激活特定信號通路等,極大地拓展了EVs 的生物應(yīng)用范圍[11]。傳統(tǒng)的納米顆粒被內(nèi)吞進(jìn)入細(xì)胞后,易被困于內(nèi)體,并進(jìn)一步被遞送至溶酶體進(jìn)行降解。研究表明,一部分EVs 可通過獨特的機(jī)制逃避溶酶體途徑,使裝載物在內(nèi)體中的有效釋放率達(dá)到10%~25%。相比之下,傳統(tǒng)納米顆粒通過溶酶體途徑的逃逸效率僅為1%~2%[12],這使得EVs 在遞送效率上表現(xiàn)出顯著的優(yōu)勢。本文對近年來EVs 作為核酸遞送載體的研究進(jìn)行了綜述(圖1),簡要介紹了現(xiàn)有裝載方法(內(nèi)源性裝載和外源性裝載)的性能及應(yīng)用、核酸裝載質(zhì)量的評估策略等,總結(jié)了EVs 介導(dǎo)的核酸遞送在癌癥治療中的應(yīng)用,并分析了現(xiàn)存的問題和挑戰(zhàn),最后對其未來的發(fā)展前景進(jìn)行了展望。
1 內(nèi)源性裝載
細(xì)胞內(nèi)部存在復(fù)雜的分選機(jī)制,在轉(zhuǎn)運內(nèi)體分選復(fù)合體(Endosomal sorting complex required for transport)及核酸結(jié)合蛋白等的作用下,可識別并分選特定的核酸分子(如mRNA、miRNA 和tRNA 等),并通過EVs 的形式釋放,在細(xì)胞之間進(jìn)行信息傳遞[13]。因此,通過調(diào)控EVs 的生物發(fā)生途徑,可以實現(xiàn)特定核酸分子的EVs內(nèi)源性裝載。
1.1 提升胞質(zhì)核酸裝載物濃度
基于EVs 的分泌途徑, EVs內(nèi)部的裝載物濃度與胞質(zhì)的內(nèi)容物濃度成正比。在細(xì)胞培養(yǎng)過程中,通過一定的外部刺激可以促進(jìn)胞質(zhì)內(nèi)特定核酸分子濃度增加,從而提高EVs內(nèi)的核酸濃度。Jiang 等[14]發(fā)現(xiàn),低氧應(yīng)激下的心臟祖細(xì)胞會增加EVs 中miRNA-21 的含量;利用攜帶miRNA-21 的EVs處理心肌細(xì)胞,可以下調(diào)細(xì)胞凋亡相關(guān)蛋白PDCD4 的表達(dá)水平。此外,通過母細(xì)胞轉(zhuǎn)染的方式也能增強(qiáng)特定核酸的表達(dá),從而提高EVs 的內(nèi)源性核酸負(fù)載。Sharif 等[15]利用miRNA-124 對母細(xì)胞進(jìn)行脂質(zhì)轉(zhuǎn)染,產(chǎn)生攜帶miRNA-124 的EVs,這些EVs 可用于增強(qiáng)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞的化療敏感性。除了直接轉(zhuǎn)染相應(yīng)的核酸,還可采用編碼治療性的pDNA 進(jìn)行轉(zhuǎn)染。Wang 等[16]在pDNA 轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞所分泌的EVs 中發(fā)現(xiàn)了由pDNA 轉(zhuǎn)錄得到的HChrR6 mRNA,這種mRNA 可以編碼一種細(xì)菌酶,可將前藥CNOB 激活為治療乳腺癌的細(xì)胞毒性藥物。Katakowski 等[17]通過pDNA 轉(zhuǎn)染間充質(zhì)干細(xì)胞的方法,獲得了負(fù)載miRNA-146b 的EVs,用于治療大鼠模型中的腦腫瘤。然而,以轉(zhuǎn)染方式獲得的EVs 通常難以控制轉(zhuǎn)染后除目的裝載物之外的其它相關(guān)產(chǎn)物負(fù)載至EVs 中。
1.2 增強(qiáng)裝載物分揀能力
EVs 生物發(fā)生及其裝載物分揀研究的不斷深入為EVs內(nèi)特定裝載物的富集研究提供了新思路。其中, RNA 因其體積小、豐度高且可與生物膜特異性結(jié)合而易被富集到EVs 中[13]。Villarroya-Beltri 等[18]發(fā)現(xiàn), miRNA 中某些特定序列(如miR-575、miR-451、miR-125a-3p 和miR-198 等)可自主地被富集至EVs 中。這些序列可優(yōu)先結(jié)合RNA 結(jié)合蛋白(RNA binding protein, RBP)hnRNPA2B1,并伴隨hnRNPA2B1被優(yōu)先分揀至EVs 中。hnRNPA2B1 的過表達(dá)可以增加特定miRNA 在EVs 中的負(fù)載量。此外,將RBP與EVs 特征蛋白構(gòu)建融合蛋白,也可實現(xiàn)EVs內(nèi)特定RNA 的富集。Hung 等[19]將MS2 噬菌體外殼蛋白與EVs腔內(nèi)蛋白Lamp2b 融合,顯著增加了HEK293FT 細(xì)胞來源EVs內(nèi)具有MS2 外殼蛋白結(jié)合能力的mRNA 的負(fù)載量。相較于未融合MS2 外殼蛋白的EVs,改造后的EVs內(nèi)mRNA 的負(fù)載量增加了6 倍(圖2A)。同樣, Li 等[20]將EVs膜蛋白CD9 與RNA 結(jié)合蛋白HuR 融合,構(gòu)建了CD9-HuR 功能化EVs。這些功能化EVs 可高效富集特異性RNA(如富含AU 堿基的RNA),并將dCas9 mRNA 遞送至肝臟細(xì)胞,成功實現(xiàn)了對增殖和分化相關(guān)靶基因C/ebpα表達(dá)的下調(diào)。與游離dCas9 mRNA 相比,使用功能化EVs 可使目的基因的表達(dá)量降低約20 倍,極大地提升了基因編輯的效果(圖2B)。
1.3 EVs內(nèi)封裝腺相關(guān)病毒載體
EVs 作為細(xì)胞分泌的納米小泡,除了可主動裝載小分子核酸外,還可封裝多種病毒載體,有效規(guī)避體內(nèi)已有的中和抗體(Neutralizing antibodies, NAbs)的作用,從而實現(xiàn)更高效的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效果。腺相關(guān)病毒載體(Adeno-associated virus vector, AAV Vector)因具有安全性高、免疫原性低和表達(dá)時程長等優(yōu)勢,成為了基因治療領(lǐng)域極具應(yīng)用前景的病毒載體[21]?,F(xiàn)階段全球共有7 款基于AAV 載體的基因治療藥物獲批上市,超過200 種基于AAV 載體的基因治療候選藥物處于臨床研究階段[22]。然而, NAbs 可與游離AAV 結(jié)合,導(dǎo)致其快速清除和脫靶效應(yīng),極大地影響了基因治療的效果[23]。研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞自然分泌的EVs內(nèi)封裝有AAV(EV-AAV),并且該組分可通過超速離心純化富集[24]。相較于傳統(tǒng)的AAV 載體, EVAAV可更有效地穿過包括血腦屏障或視網(wǎng)膜內(nèi)界膜在內(nèi)的多種生物屏障,規(guī)避NAbs 的影響,展現(xiàn)出更佳的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。2017 年, Gy?rgy 等[24]通過EV-AAV 將外源基因遞送至小鼠的耳蝸和前庭毛細(xì)胞中。與傳統(tǒng)AAV 載體20%的轉(zhuǎn)導(dǎo)率相比, EV-AAV 在耳中目標(biāo)細(xì)胞的轉(zhuǎn)導(dǎo)率高達(dá)50%~65%(圖2C)。2023年,Li 等[25]使用5 種不同的體內(nèi)和體外模型系統(tǒng),證明在NAbs 存在的情況下,與游離AAV 相比, EV-AAV載體的轉(zhuǎn)導(dǎo)效力和治療效果明顯提高(圖2D),該結(jié)果證明了EV-AAV 載體作為治療心力衰竭的基因遞送工具的潛力。此外,與AAV 復(fù)雜的純化方案相比, EV-AAV 的生產(chǎn)成本較低,通過超速離心沉淀法即可完成純化,無需繁瑣的密度梯度離心。
2 外源性裝載
相較于利用EVs 的生物生成途徑實現(xiàn)核酸裝載的內(nèi)源性裝載方式,外源性裝載是一種更直接且靈活的策略。外源性裝載是在分離純化得到EVs 后,通過被動孵育、膜透化或機(jī)械破壞EVs膜以及EVs 與脂質(zhì)體膜融合等策略實現(xiàn)EVs 對核酸的裝載。
2.1 被動孵育
被動孵育是一種非侵入性的裝載方式,可最大程度地保持EVs 結(jié)構(gòu)的完整性。然而,由于核酸分子本身具有負(fù)電性,難以跨過EVs膜進(jìn)入EVs內(nèi)部,因此,被動孵育的方法通常用于將經(jīng)膽固醇或其它疏水分子化學(xué)修飾的核酸分子嵌入到EVs 的膜表面。Haraszti 等[26]通過將膽固醇修飾的siRNA 與EVs共孵育,獲得了膜表面結(jié)合有siRNA 的EVs。除了治療性核酸分子外,被動孵育也常用于對EVs 表面進(jìn)行核酸適體(Aptamer)的修飾。Zou 等[27]利用可特異性識別酪氨酸蛋白激酶7 的核酸適體sgc8 對EVs 進(jìn)行功能化,成功實現(xiàn)了載有化療藥物多柔比星(Doxorubicin, Dox)的EVs 對腫瘤的靶向殺傷。此外,還可通過與EVs 表面特征蛋白結(jié)合實現(xiàn)核酸分子的嵌入。Gao 等[28]將CP05(一種與CD63 結(jié)合的錨定肽)與ASO偶聯(lián),并與EVs共孵育,實現(xiàn)了EVs 表面ASO 的修飾,其結(jié)合效率達(dá)到82.5%。經(jīng)過修飾后的EVs 在肌營養(yǎng)不良小鼠模型中展現(xiàn)出增加肌營養(yǎng)不良蛋白活性的功能(圖3A)。然而,被動孵育的方式大多只能將核酸分子負(fù)載于EVs 表面,因此該方法更適用于siRNA 和ASO 等穩(wěn)定性較強(qiáng)的核酸分子。
2.2 化學(xué)膜透化
表面活性劑(包括皂素和Triton X-100等)具有膜透化功能,可通過改變EVs膜的通透性,有利于核酸分子包封進(jìn)入EVs內(nèi)部。與其它負(fù)載方法相比,膜透化處理可盡可能地保持EVs 的粒徑不變。Zhang 等[29]利用具有膜透化活性的細(xì)菌毒素(鏈球菌溶血素)將腫瘤抑制性DNA-miRNA 復(fù)合物載入EVs 中,有效抑制了與腫瘤生長和轉(zhuǎn)移相關(guān)的miRNA-155 的表達(dá)。此外,在熱休克條件下, CaCl2 可介導(dǎo)包括miRNA 和siRNA 等在內(nèi)的小核酸分子進(jìn)入EVs 中。該方法的作用機(jī)制是在低滲CaCl2 溶液中,通過熱休克引起EVs膜通透性的改變,促進(jìn)EVs 對CaCl2-核酸復(fù)合物的吸收。Zhang 等[30]通過改良的CaCl2 轉(zhuǎn)染方法,成功地增加了特定的miRNA 模擬物及抑制劑在EVs 中的負(fù)載量,并證明通過該方法負(fù)載的miRNA 可發(fā)揮正常功能。Sayyed 等[31]利用CaCl2 轉(zhuǎn)染法將miRNA-155 抑制劑負(fù)載入EVs內(nèi),實現(xiàn)了對口腔癌化療耐藥性的逆轉(zhuǎn)。
2.3 電穿孔膜透化
電穿孔是最常用的EVs 中核酸的裝載方法之一。該方法通過高強(qiáng)度電場瞬時改變膜通透性,使EVs膜表面產(chǎn)生孔隙,進(jìn)而使外源核酸分子可進(jìn)入EVs內(nèi)腔。2011年, Alvarez-Erviti 等[32]利用電穿孔技術(shù)將siRNA 裝載至未成熟樹突狀細(xì)胞分泌的EVs 中,用于治療阿爾茲海默癥。此后,電穿孔技術(shù)的應(yīng)用范圍不斷拓展,涵蓋了包括miRNA[33-34]、mRNA[35]以及其它核酸分子[36-37]的EVs裝載。2022年, Wan等[38]利用電穿孔技術(shù)在肝星狀細(xì)胞來源的EVs中負(fù)載CRISPR-Cas9基因編輯的核糖核蛋白復(fù)合物(Ribonucleoprotein,RNP),實現(xiàn)了對肝臟疾病的精確組織特異性治療(圖3B)。盡管電穿孔技術(shù)已被廣泛應(yīng)用,但仍存在一些問題。首先,有研究指出,電穿孔技術(shù)在裝載siRNA 時會產(chǎn)生大量siRNA 聚集體,這些聚集物難以通過離心去除,導(dǎo)致EVs內(nèi)siRNA負(fù)載量被高估[39]。此外, Hood等[40]利用動態(tài)光散射(Dynamic light scattering,DLS)分析電穿孔前后EVs 的粒徑,發(fā)現(xiàn)電穿孔可能破壞EVs 結(jié)構(gòu)的完整性,并誘導(dǎo)EVs 顆粒團(tuán)聚。Usman 等[41]評估了通過電穿孔方式在紅細(xì)胞EVs 中裝載3 種不同大小核酸分子(ASO、Cas9 mRNA 和pDNA)的效果,結(jié)果顯示,電穿孔法可使20%~24%的ASO 和18%的Cas9 mRNA 裝載至EVs 中,并且這些負(fù)載核酸可正常發(fā)揮功能。然而,裝載分子量較大的pDNA 時,裝載效果顯著降低。此外,部分研究指出,電穿孔法裝載DNA 時,裝載效率依賴于DNA 分子的大??;當(dāng)DNA 長度超過750 bp 時, EVs 的封裝能力顯著受限[38]。Kim 等[37]采用電穿孔技術(shù)在EVs 中裝載CRISPR/Cas9 表達(dá)質(zhì)粒,用于抑制細(xì)胞程序性死亡蛋白PARP-1 的表達(dá),但EVs內(nèi)質(zhì)粒的封裝效率僅為1.75%。因此,在使用電穿孔技術(shù)時,需要謹(jǐn)慎考慮聚集問題,并優(yōu)化電穿孔所使用的緩沖液成分、脈沖容量、場強(qiáng),以及電穿孔前的EVs 濃度、核酸濃度和后續(xù)純化策略等多個關(guān)鍵參數(shù)。
2.4 超聲及擠壓處理
超聲處理技術(shù)通過在EVs 的膜上產(chǎn)生微孔,實現(xiàn)核酸在其內(nèi)部的封裝。Lamichhane 等[42]提出,超聲處理可作為電穿孔技術(shù)的替代方法,用于將siRNA 裝載至EVs 中,以治療HER2 陽性乳腺癌。與被動孵育相比,超聲處理顯著提高了siRNA 在EVs 中的裝載效率,包封率提高了3 倍。與電穿孔技術(shù)相比,超聲處理所產(chǎn)生的的siRNA 聚集現(xiàn)象僅約為電穿孔技術(shù)的1/12。然而,當(dāng)超聲處理超過30 s 時,在35 kHz頻率下,超聲處理可能會導(dǎo)致siRNA 降解。此外,通過施加剪切應(yīng)力也可引起EVs膜的缺陷,從而促進(jìn)核酸的封裝。Grossen 等[43]通過擠出和微流控混合的方法,將ASO 封裝到牛奶來源的EVs 中。該研究結(jié)果表明,裝載有化學(xué)修飾ASO 的EVs 可有效實現(xiàn)靶基因的敲低,并進(jìn)一步通過體內(nèi)實驗驗證其治療效果。
2.5 脂質(zhì)體與EVs膜融合
前述方法在對EVs 進(jìn)行核酸負(fù)載時,通常難以實現(xiàn)大分子核酸的高效負(fù)載。作為一種人工合成的納米顆粒,脂質(zhì)體具有與EVs 類似的磷脂雙層膜結(jié)構(gòu),并因其高載藥效率而備受關(guān)注。當(dāng)脂質(zhì)體與EVs相互接近并發(fā)生膜融合時,內(nèi)腔水溶液可融合為一個整體。基于此特性, EVs 與脂質(zhì)體的融合已被廣泛應(yīng)用于EVs內(nèi)容物的分析[44-46]及EVs 載藥等研究。通過EVs 與脂質(zhì)體的融合,不僅能充分利用脂質(zhì)體的高載藥和易修飾的優(yōu)勢,還能結(jié)合EVs 良好的生物相容性、低免疫原性和長循環(huán)時間的特性,賦予融合體較長的體內(nèi)循環(huán)時間及特異性的腫瘤靶向能力。因此,脂質(zhì)體與EVs 的膜融合成為了EVs 高效裝載大分子核酸的有效解決方案之一。2018 年, Lin 等[47]通過EVs 與脂質(zhì)體膜融合的方式獲得了雜化EVs,用于將CRISPR/Cas9 表達(dá)質(zhì)粒遞送至間充質(zhì)干細(xì)胞中。結(jié)果表明,與僅含有Runx2 sgRNAs 的CRISPR/dCas9 系統(tǒng)對照組相比,攜帶CRISPR/Cas9 表達(dá)質(zhì)粒的雜化EVs 可使靶基因Runx2 的表達(dá)下調(diào)2 倍(圖3C)。2022 年, Liang 等[48]通過基因工程改造,在EVs 表面蛋白Lamp2b 的N 端融合軟骨細(xì)胞親和肽(CAP),構(gòu)建了軟骨細(xì)胞靶向的EVs。將這些CAP 工程化的EVs 與包封了靶向基質(zhì)金屬蛋白酶13(MMP-13)的CRISPR/Cas9 質(zhì)粒的脂質(zhì)體進(jìn)行膜融合,形成雜化EVs,可有效抑制軟骨細(xì)胞中MMP-13 的表達(dá),減弱軟骨細(xì)胞外基質(zhì)蛋白的降解,從而實現(xiàn)對骨關(guān)節(jié)炎的治療。EVs 與脂質(zhì)體融合的策略不僅提升了EVs 作為核酸遞送載體的負(fù)載效率,還為解決EVs自身遞送效率不均一、靶向能力不可控等問題提供了新的思路。
內(nèi)源性裝載的優(yōu)勢在于通過對母細(xì)胞進(jìn)行改造自動地將核酸“貨物”精準(zhǔn)分揀至EVs 的內(nèi)腔或表面。然而,由于EVs 的分泌依賴細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜的“貨物”分揀機(jī)制,母細(xì)胞的改造可能對EVs 的生成途徑、分泌水平以及蛋白質(zhì)含量產(chǎn)生影響,進(jìn)而影響其下游應(yīng)用[49-50]。此外,內(nèi)源性裝載僅限于細(xì)胞培養(yǎng)衍生的EVs,難以應(yīng)用于牛奶和植物來源EVs 中核酸分子的裝載。與之相比,外源性裝載方法表現(xiàn)出更廣泛的適用性。不同的外源性裝載技術(shù)由于工作原理各異,表現(xiàn)出不同的優(yōu)勢及局限性。研究者可根據(jù)具體需求,選擇最合適的外源性裝載方法,用于EVs 中核酸分子的裝載。
3 EVs 核酸裝載質(zhì)量評估
盡管基于EVs 的核酸藥物遞送體系具有眾多顯著優(yōu)勢,但目前缺乏有效的評估EVs 核酸裝載效果的方法。EVs 核酸裝載系統(tǒng)的顆粒濃度、粒徑分布、核酸裝載比例和裝載量等理化性質(zhì)是決定其體內(nèi)行為及藥效的關(guān)鍵指標(biāo)[51-52],因此,亟需建立準(zhǔn)確且快速的定量表征方法。其中,顆粒濃度直接影響核酸藥物在疾病部位的濃度以及藥物的體內(nèi)循環(huán)時間,同時可用于評估藥物保存的長期穩(wěn)定性;粒徑分布對藥物的體內(nèi)分布具有重要影響;核酸裝載比例和裝載量的評估是衡量EVs 核酸裝載效率的關(guān)鍵指標(biāo)之一,不僅可用于不同產(chǎn)品和批次之間的對比,還為后續(xù)給藥方案的設(shè)計提供了重要參考。
Grossen 等[43]通過高效液相色譜結(jié)合波長為260 nm 的紫外檢測器,成功測定了牛奶來源的EVs 中負(fù)載的ASO。此外,實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)[53-54]和32P-放射性標(biāo)記[55]等技術(shù)也可用于評估EVs 的核酸裝載效率。然而,由于細(xì)胞來源、細(xì)胞狀態(tài)以及分泌途徑等的不同, EVs 在粒徑、分子組成及生物學(xué)功能方面存在顯著的個體差異性和多樣性。因此,不同EVs 核酸藥物的裝載能力也存在較大的差異,集權(quán)平均的分析方法無法在單顆粒水平對這種異質(zhì)性進(jìn)行探究。流式細(xì)胞術(shù)(Flow cytometry,F(xiàn)CM)是一種可對懸液中的細(xì)胞或細(xì)胞大小的顆粒進(jìn)行快速、高通量和多參數(shù)定量分析的先進(jìn)技術(shù),已被廣泛應(yīng)用于EVs 的單顆粒多參數(shù)定量檢測[56-58]。其中,散射光可反映顆粒的粒徑或顆粒度等物理特性,而多色熒光信號可揭示EVs 的蛋白質(zhì)、核酸等生物化學(xué)信息。2018 年, van der Pol 等[59]評估了多種商品化流式細(xì)胞儀對EVs 粒徑范圍的檢測能力,結(jié)果表明,常規(guī)配置的流式細(xì)胞儀僅適用于檢測較大尺寸的EVs,只有少數(shù)高靈敏設(shè)備(如Apogee A50-Micro、BD nflux 和BD LSRⅡ)可檢測300~600 nm 粒徑范圍內(nèi)的EVs。然而,大多數(shù)EVs 的粒徑小于100 nm,因此,流式細(xì)胞儀難以有效檢測小粒徑的EVs。通過熒光染料標(biāo)記并采用熒光觸發(fā)模式,檢測靈敏度顯著提升。Zhupanyn 等[60]利用ImageStream 成像流式細(xì)胞儀分析脂膜染料PKH67 標(biāo)記的EVs 與DY647 標(biāo)記的siRNA 共定位情況,可驗證EVs 是否成功裝載siRNA。然而,傳統(tǒng)FCM 難以檢測熒光亮度小于200 或500 個異硫氰酸熒光素(Fluorescein isothiocyanate,F(xiàn)ITC)分子的信號。此外,隨著EVs 尺寸減小,其可負(fù)載的核酸含量顯著減少,這進(jìn)一步增加了FCM 對EVs 核酸裝載分析的難度。
2014年,本課題組結(jié)合瑞利光散射與鞘流單分子熒光檢測技術(shù),成功研發(fā)出具有自主知識產(chǎn)權(quán)的納米流式檢測技術(shù)(Nano-flow cytometry, nFCM)。與傳統(tǒng)流式細(xì)胞儀相比, nFCM 的散射檢測靈敏度提升了4~5個數(shù)量級,熒光檢測靈敏度提升了1~2 個數(shù)量級。此前,本課題組利用SYTO 82 核酸染色技術(shù)協(xié)助美國Alnylam Pharmaceuticals公司對其臨床Ⅱ期基因沉默納米藥物siRNA 載荷脂質(zhì)納米顆粒(LNPs)進(jìn)行了表征,成功區(qū)分了載有siRNA 的LNPs 和空白LNPs,并測定了siRNA 載荷LNPs 的顆粒濃度、包封率及單顆粒藥物載量分布等參數(shù)(圖4A)[61]。EVs 本身攜帶核酸分子, EV-DNA 在維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)以及腫瘤進(jìn)展中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。2022 年, Liu 等[62]采用SYTO 16 核酸染料和核酸內(nèi)切酶處理策略,對EV-DNA 進(jìn)行了單顆粒水平的分析(圖4B)。通過散射與熒光信號的雙參數(shù)檢測,實現(xiàn)了對游離DNA、攜帶DNA 的EVs 和不含DNA 的EVs 及其它雜質(zhì)顆粒的單顆粒分辨, 3類群體的占比分別為42.4%、22.7%和34.9%。研究表明, DNA 陽性EVs 主要分為兩大亞群,即表面黏附DNA 的小粒徑EVs(lt;100 nm)和內(nèi)腔攜帶DNA 的較大粒徑EVs(80~200 nm)。此外,南方醫(yī)科大學(xué)鄭磊課題組[63]基于DNA 納米線誘導(dǎo)的核酸放大技術(shù),利用nFCM 在單顆粒水平實現(xiàn)了對乳腺癌細(xì)胞系來源EVs 中miR-1246的定量檢測。nFCM 對單顆粒的分析結(jié)果表明,采用電穿孔技術(shù)將FAM 標(biāo)記的siRNA 裝載入EVs時,存在電擊緩沖液、siRNA 和EVs 的自團(tuán)聚問題,這些聚集體無法通過離心去除,導(dǎo)致雜質(zhì)顆粒的產(chǎn)生及裝載效率的高估(圖4C)。因此, nFCM 在評估EVs內(nèi)核酸裝載效果方面展現(xiàn)出顯著潛力,未來有望成為該領(lǐng)域的重要工具。
4 EVs 介導(dǎo)的核酸遞送在癌癥治療中的應(yīng)用
癌癥是目前全球范圍內(nèi)導(dǎo)致人類死亡的主要原因之一,亟需開發(fā)具有高特異性和安全性的治療方法[64]。近年來, EVs 介導(dǎo)的核酸療法已成為癌癥治療的一種強(qiáng)大工具。EVs 攜載著來源于母細(xì)胞的生物活性分子,這種分子的多樣性使得不同細(xì)胞來源的EVs具備獨特的功能。因此,使用EVs 作為核酸分子的遞送載體,可以根據(jù)核酸分子的靶向作用選擇特定來源的EVs,用于癌癥治療。
4.1 腫瘤細(xì)胞來源的EVs
與正常細(xì)胞相比,腫瘤細(xì)胞表面通常過表達(dá)CD47(整合素相關(guān)蛋白),這種蛋白可觸發(fā)巨噬細(xì)胞上的抑制性受體SIRPα,逃避吞噬作用和抗腫瘤免疫[65]。腫瘤來源的EVs(Tumor-derived extracellular vesicles,TDEVs)繼承了母細(xì)胞逃逸吞噬的特性。在藥物裝載后,這些TDEVs 可類似于特洛伊木馬般逃過巨噬細(xì)胞的識別[66-67]。此外, TDEVs 可通過其表面的特征蛋白實現(xiàn)對相似腫瘤細(xì)胞的自我識別,從而發(fā)揮靶向功能[67-68]。Kim 等[37]利用卵巢癌細(xì)胞來源的EVs 負(fù)載CRISPR/Cas9 表達(dá)質(zhì)粒,成功實現(xiàn)了對母細(xì)胞的基因編輯。相比于上皮細(xì)胞來源的EVs,同源的EVs 可選擇性地在卵巢癌腫瘤中積累,表現(xiàn)出更有效的體內(nèi)遞送和基因編輯效果。然而,研究發(fā)現(xiàn), TDEVs 可通過其負(fù)載的物質(zhì)(如mRNA、DNA 和蛋白質(zhì)等)在細(xì)胞間傳遞信息,將腫瘤細(xì)胞的分子和遺傳信息傳播到鄰近或遠(yuǎn)端組織,從而促進(jìn)腫瘤的增殖和轉(zhuǎn)移[69]。盡管有研究表明, TDEVs 可根據(jù)其表面蛋白的表達(dá)進(jìn)入特定的受體細(xì)胞,但由于TDEVs 攜帶的裝載物是致癌轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵組成部分,這極大地限制了TDEVs 在藥物遞送中的應(yīng)用[68]。Zhou 等[70]通過去除肝癌細(xì)胞EVs 的內(nèi)容物,并將EVs膜與磷脂雜合,制備了脂質(zhì)納米囊泡(Lipid nanovesicles, LEVs),用于siRNA 的穩(wěn)定負(fù)載和遞送。LEVs具有良好的生物相容性,可以防止siRNA 在血漿中降解,并通過硫酸肝素蛋白聚糖介導(dǎo)的途徑,促進(jìn)其被同源的肝癌細(xì)胞特異性攝取,從而實現(xiàn)“歸巢”靶向。進(jìn)入細(xì)胞后,LEVs 可規(guī)避內(nèi)涵體降解途徑,通過高爾基體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的細(xì)胞內(nèi)“高速路徑”實現(xiàn)轉(zhuǎn)運,顯著提高siRNA的轉(zhuǎn)染效率,在癌癥治療領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景(圖5A)。
4.2 免疫細(xì)胞來源的EVs
免疫細(xì)胞主要存在于血液和組織中,承擔(dān)著抵御病原體入侵,清除病變或衰老細(xì)胞的職責(zé),其數(shù)量和生理狀態(tài)與人體健康密切相關(guān)[71-72]。免疫細(xì)胞來源的EVs 在免疫調(diào)節(jié)過程中發(fā)揮了核心作用,對包括腫瘤、心血管和神經(jīng)退行性疾病在內(nèi)的多種疾病起到了至關(guān)重要的作用[73-75]。因此,免疫細(xì)胞來源的EVs 在免疫治療中具有巨大的應(yīng)用潛力。目前,包括巨噬細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞(Natural killer cells,NK cells)等多種免疫細(xì)胞來源的EVs 與核酸療法協(xié)同用于抗腫瘤治療。
巨噬細(xì)胞來源的EVs 繼承了巨噬細(xì)胞固有的腫瘤靶向特性,可被腫瘤組織的細(xì)胞因子招募[76]。此外,巨噬細(xì)胞具有優(yōu)異的生物相容性和高代謝率,使其可大量分泌EVs,因而巨噬細(xì)胞成為理想的EVs 藥物遞送平臺供體細(xì)胞[77]。Gong 等[78]利用巨噬細(xì)胞來源的EVs 作為載體,將膽固醇修飾的miRNA 和化療藥物Dox 共遞送至三陰性乳腺癌細(xì)胞中,實現(xiàn)了基因療法與化療的協(xié)同抗腫瘤作用。在腫瘤微環(huán)境中,巨噬細(xì)胞通常存在M1 和M2 兩種亞群。M1 型巨噬細(xì)胞可分泌促炎因子,直接殺傷腫瘤細(xì)胞,或通過調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境中其它免疫細(xì)胞的功能抑制腫瘤細(xì)胞的生長[79-81]。相反, M2 型巨噬細(xì)胞通過分泌生長因子促進(jìn)腫瘤生長,或者通過分泌免疫抑制因子抑制腫瘤微環(huán)境中的免疫細(xì)胞功能,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞生長。Liu 等[82]通過基因工程改造母細(xì)胞,獲得了水泡性口炎病毒糖蛋白(VSV-G)修飾的M1 型巨噬細(xì)胞EVs(M1 EVs),并通過電穿孔技術(shù)將抗PD-L1 的siRNA 裝載到EVs內(nèi)部。由于M1 EVs具有天然的腫瘤靶向能力, EVs 可定向歸巢至腫瘤部位,其表面的VSV-G 誘導(dǎo)EVs 與靶細(xì)胞膜融合,繞過內(nèi)吞途徑實現(xiàn)siPD-L1 的胞質(zhì)遞送,進(jìn)而有效觸發(fā)PD-L1 的沉默效果。該體系有效阻斷了PD-L1/PD-1 的相互作用,提高了CD8 陽性T 細(xì)胞的比例,并與M1 EVs內(nèi)的細(xì)胞因子協(xié)同作用,促進(jìn)了M2 型巨噬細(xì)胞向M1 型巨噬細(xì)胞的轉(zhuǎn)變,展現(xiàn)出令人滿意的抗腫瘤效果(圖5B)。
NK 細(xì)胞是淋巴細(xì)胞家族的一員,與T 細(xì)胞和B 細(xì)胞同屬,作為先天免疫的重要效應(yīng)因子,在抗腫瘤方面具有重要作用。源自NK 細(xì)胞的EVs 保持了NK 細(xì)胞的免疫刺激能力,因此在腫瘤免疫治療方面具有巨大的應(yīng)用潛力[83-84]。研究表明,源自NK 細(xì)胞的EVs具有特定的腫瘤細(xì)胞殺傷特性,對正常細(xì)胞沒有細(xì)胞毒性[85]。2019 年, Neviani 等[86]的研究表明,攜帶腫瘤抑制因子microRNA-186 的NK 的EVs 表現(xiàn)出針對神經(jīng)母細(xì)胞瘤的細(xì)胞毒性,并可抑制免疫逃逸。2022 年, Zhang 等[87]通過NK 細(xì)胞來源的EVs 負(fù)載siRNA 和光敏劑Ce6,實現(xiàn)了光動力治療(Photodynamic therapy, PDT)與核酸療法的協(xié)同腫瘤免疫治療。在激光照射下, ROS 的產(chǎn)生實現(xiàn)了有效的PDT,促進(jìn)了M1 巨噬細(xì)胞的極化和DC 成熟,同時促進(jìn)了siRNA 的內(nèi)體逃逸和胞質(zhì)釋放,展現(xiàn)出理想的癌癥治療效果(圖5C)。
4.3 間充質(zhì)干細(xì)胞來源的EVs
間充質(zhì)干細(xì)胞(Mesenchymal stem cells, MSCs),又稱多能間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞,是一類多能成體干細(xì)胞,可從骨髓[88]、臍帶[89]、胎盤[90]和脂肪[91]等多種組織中獲得。這些細(xì)胞展現(xiàn)出極強(qiáng)的再生能力,能主動遷移至炎癥部位并調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)[92]。有研究表明, MSCs能通過分泌EVs 而發(fā)出信號,促進(jìn)或抑制不同癌癥腫瘤發(fā)展[93-94]。此外, MSCs 衍生的EVs 對腫瘤部位具有強(qiáng)烈的遷移性,在抗腫瘤藥物遞送方面展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力。O′Brien 等[95]通過轉(zhuǎn)染獲得負(fù)載腫瘤抑制miR379 的MSCs EVs 用于乳腺癌的體內(nèi)治療。Zhou 等[96]采用電穿孔技術(shù)在骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞來源的EVs內(nèi)裝載Galectin-9 siRNA,并通過表面修飾負(fù)載奧沙利鉑(Oxaliplatin, OXA)前藥的方式構(gòu)建了基于EVs 的雙功能胰腺癌治療納米材料。在被胰腺癌細(xì)胞內(nèi)化后, Galectin-9 siRNA 可阻斷Galectin-9/dectin-1,逆轉(zhuǎn)M2 極化腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞以增強(qiáng)免疫治療;同時, OXA 觸發(fā)胰腺腫瘤部位的免疫原性死亡,并通過抑制DNA 合成和修復(fù)殺死腫瘤細(xì)胞(圖5D)。目前, MSCs 來源的EVs 在癌癥治療方面的應(yīng)用仍處于起步階段,有待進(jìn)一步研究以加速其臨床應(yīng)用。
不同來源的EVs 因其攜載的生物活性分子的差異性,在用于癌癥治療的核酸遞送過程中展現(xiàn)出多樣的生物功能,可根據(jù)治療策略的需求選擇相應(yīng)的EVs 類型[13,67,97]。此外,核酸療法還可與化療藥物、光動力治療等其它癌癥治療策略聯(lián)合應(yīng)用,以獲得更好的療效。
5 總結(jié)與展望
相較于傳統(tǒng)的納米載體, EVs具有更低的免疫原性、更小的細(xì)胞毒性和更強(qiáng)的跨越生物屏障的能力,是理想的核酸遞送載體。這些優(yōu)點使EVs 可保護(hù)核酸分子免受宿主免疫系統(tǒng)的降解和清除。此外,EVs 還具有母細(xì)胞賦予的靶向特定細(xì)胞和激活特定信號通路的能力,這使其在疾病治療領(lǐng)域展現(xiàn)出了極大的應(yīng)用潛力。其中,外泌體是目前臨床前研究和臨床試驗中應(yīng)用最廣泛的EVs 類型。截至2024 年8 月,根據(jù)美國臨床試驗數(shù)據(jù)庫(www.ClinicalTrials.gov)的檢索,已有229 項與外泌體相關(guān)的臨床試驗,其中90 項涉及癌癥治療,例如,美國MD 安德森癌癥中心,正在開展一項I 期臨床試驗,旨在利用裝載有KrasG12D siRNA 的間充質(zhì)干細(xì)胞來源外泌體治療攜帶KrasG12D 突變的轉(zhuǎn)移性胰腺癌患者。本文綜述了EVs 作為核酸遞送載體的貨物裝載方法及其在癌癥治療領(lǐng)域的研究進(jìn)展。盡管現(xiàn)階段EVs 介導(dǎo)的核酸遞送已經(jīng)取得了顯著的研究進(jìn)展,但仍然存在一些挑戰(zhàn)。首先, EVs 的規(guī)?;a(chǎn)是其應(yīng)用轉(zhuǎn)化的瓶頸,尤其在大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)和高效分離方面,設(shè)備開發(fā)至關(guān)重要。目前,多種策略被用于提高EVs 產(chǎn)量,包括生物反應(yīng)器[98]、微載體3D 培養(yǎng)[99]以及微流控裝置[100-101]等技術(shù)。結(jié)合切向流過濾和色譜分離技術(shù),可實現(xiàn)EVs 的高效分離和純化。其次,如何更高效地將核酸裝載至EVs 中仍面臨挑戰(zhàn)。與合成納米顆粒相比, EVs 的核酸封裝效率(尤其對于大分子量的核酸分子)還有待進(jìn)一步提升。最后,在以EVs 作為核酸遞送載體用于疾病治療的研究中,個性化精準(zhǔn)治療備受關(guān)注。鑒于EVs 的異質(zhì)性及人體內(nèi)復(fù)雜的生理環(huán)境,來自患者自身細(xì)胞的EVs 有望成為最佳的遞送載體。例如,通過微創(chuàng)或手術(shù)獲取患者的腫瘤細(xì)胞后,進(jìn)行體外擴(kuò)增培養(yǎng),生產(chǎn)出相應(yīng)的EVs。此類EVs 不僅可裝載特定的核酸分子,還攜帶腫瘤特異性抗原,未來有望成為個性化的天然腫瘤疫苗[67]。雖然存在上述多方面的挑戰(zhàn),但基于EVs 的核酸遞送已經(jīng)進(jìn)入臨床研究階段,相信未來一定可進(jìn)一步發(fā)揮EVs 作為核酸遞送載體的潛在臨床應(yīng)用價值。