變異

引 言新冠病毒變異株中最受關(guān)注的是Delta、Omicron、Alpha、Gamma、Beta、Lambda、Mu 變異株。以上變異株或是增加了毒性，或是增強(qiáng)了傳播性，某些變異株還會(huì)降低疫苗效用，對(duì)公共衛(wèi)生構(gòu)成重大威脅[1]。因此，對(duì)于新冠病毒突變的研究至關(guān)重要。考慮到DNA 序列的特殊性，已經(jīng)有許多專(zhuān)門(mén)針對(duì)DNA序列挖掘的算法，如ToMMSA、ATRHunter 等[2]。機(jī)器學(xué)習(xí)也被應(yīng)用到DNA 序列挖掘[3]。至今已經(jīng)有許多研究人員在針對(duì)SARS-

01)基因組結(jié)構(gòu)變異(Structural Variation，SV)是基因組上大尺度的核苷酸序列重排性變化，它包括長(zhǎng)度大于50 bp的插入(INS)、缺失(DEL)、倒位(INV)、重復(fù)(DUP)、易位(BND)[1]。相關(guān)研究表明，平均每個(gè)人類(lèi)個(gè)體上存在大約兩萬(wàn)個(gè)結(jié)構(gòu)變異[2]，結(jié)構(gòu)變異盡管相較于單核苷酸變異(SNV)、短插入缺失變異(INDEL)數(shù)量較少，但因其變異長(zhǎng)度較大，因此對(duì)基因組上核苷酸序列的影響是最廣泛的[3]。結(jié)構(gòu)變異會(huì)改變基因序列信息，

臘字母對(duì)新冠病毒變異株進(jìn)行命名。目前，有4種變異新冠病毒被WHO列為“須關(guān)切變異株”，另外6種變異新冠病毒則被列為“待觀察變異株”，這些變異病毒都會(huì)采用新命名法。據(jù)路透社1日?qǐng)?bào)道，按照WHO新的命名規(guī)則，最早在英國(guó)發(fā)現(xiàn)的學(xué)名為B.1.1.7變異病毒，將被稱(chēng)為“阿爾法”（Alpha）；最早在南非發(fā)現(xiàn)的B.1.351變異病毒，將被稱(chēng)為“貝塔”（Beta）；最早在巴西發(fā)現(xiàn)的P.1變異病毒，將被稱(chēng)為“伽馬”（Gamma）；以上三種均被列為“須關(guān)切變異株”。最早在印

質(zhì)逐漸降低、株型變異、葉色變化，抗性變差。四季海棠無(wú)性系建立是進(jìn)行種苗快速繁殖的有效方法之一[5]，而四季海棠品種無(wú)性系建立過(guò)程中，也會(huì)有一定變異性狀的出現(xiàn)。無(wú)性系變異的發(fā)生，嚴(yán)重影響了應(yīng)用組培技術(shù)進(jìn)行快繁的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)效益[2]。變異苗觀賞性及再生能力差，采用無(wú)性提純的方法剔除變異植株，篩選優(yōu)質(zhì)種苗。目前，對(duì)四季海棠組培苗變異的研究空白，但變異在建立無(wú)性系過(guò)程中日益突出的不利影響逐漸顯現(xiàn)，組培變異的篩選和控制顯得愈加重要。1 材料與方法1.1 材料以四季海

的一種常用方法是變異測(cè)試。變異測(cè)試將人工缺陷（變異體）種植到被測(cè)代碼中，并評(píng)估測(cè)試用例是否找到它們。當(dāng)一個(gè)測(cè)試用例檢測(cè)到一個(gè)變異體時(shí)，說(shuō)明該變異體被殺死[1]，否則變異體仍然存活。本文選擇Randoop 和Evosuite 這兩個(gè)積極維護(hù)的自動(dòng)化生成單元測(cè)試的工具，muJava 變異工具，以數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)教材中的基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)項(xiàng)目作為被測(cè)項(xiàng)目進(jìn)行變異測(cè)試，通過(guò)比較Evosuite、Randoop 生成的測(cè)試用例的變異檢測(cè)能力，以回答下面2 個(gè)研究問(wèn)題：?jiǎn)栴}1：兩個(gè)

注變化環(huán)境對(duì)水文變異的影響[1]。聯(lián)合國(guó)政府間氣候變化專(zhuān)門(mén)委員會(huì)(IPCC)在1990年就提出了氣候變化問(wèn)題，2014年發(fā)布的報(bào)告[2]則明確指出，全球性的水循環(huán)系統(tǒng)、冰雪消融情況、海平面變化以及極端天氣出現(xiàn)的頻率、程度都發(fā)生了顯著變化，與之關(guān)系緊密的氣候變化和人類(lèi)活動(dòng)引發(fā)了水文系列變異問(wèn)題。國(guó)內(nèi)外的相關(guān)研究表明，美國(guó)多條河流的水文系列在20世紀(jì)后期發(fā)生了明顯變異[3]，我國(guó)的海河、黃河、渭河等流域的徑流系列均發(fā)生了顯著變異[4-7]。在實(shí)際生產(chǎn)應(yīng)用中，水

010021)變異測(cè)試[1]是一種通過(guò)向源程序中人工注入缺陷來(lái)模擬軟件中實(shí)際缺陷的技術(shù),被注入缺陷的程序稱(chēng)為變異體.傳統(tǒng)的變異測(cè)試是指一階變異測(cè)試,即通過(guò)向源程序中人工注入一個(gè)缺陷來(lái)模擬軟件中的一個(gè)缺陷[2].但程序中的實(shí)際缺陷往往是由兩個(gè)或者更多個(gè)缺陷一起造成的[3,4],所以高階變異測(cè)試被提出來(lái)用以解決程序中復(fù)雜缺陷的問(wèn)題,在模擬程序的復(fù)雜缺陷方面有著重要意義[5].由一階變異體組合形成的高階變異體數(shù)量會(huì)大量增加,大大增加了執(zhí)行開(kāi)銷(xiāo)[6,7].因此,

m[3]提出一種變異測(cè)試的方法,并廣泛應(yīng)用在各個(gè)語(yǔ)言的軟件上.雖然變異測(cè)試已經(jīng)被證明了在提高測(cè)試用例的質(zhì)量上是有效的,但是測(cè)試成本也隨之增加,這取決于生成的變異體的數(shù)量和產(chǎn)生等價(jià)變異體的百分比.為了降低變異測(cè)試的成本,國(guó)際上許多學(xué)者提出了幾種可行的方法.A.J.Offutt和R.H.Untch[4]把這些方法分為了三類(lèi),即減少變異、更好的算法以及更快生成和運(yùn)行.將這三類(lèi)辦法應(yīng)用在變異測(cè)試分析中,可以大幅降低變異測(cè)試的成本,剔除測(cè)試過(guò)程中的不必要的開(kāi)銷(xiāo).A.

戰(zhàn)性問(wèn)題[3].變異測(cè)試是一種基于故障的軟件測(cè)試技術(shù)[4]，具有較強(qiáng)的故障檢測(cè)能力，廣泛用于評(píng)估測(cè)試用例集的完備性和測(cè)試技術(shù)的有效性[5].然而，由于變異測(cè)試產(chǎn)生的變異體數(shù)量龐大、等價(jià)變異體識(shí)別困難、缺乏相應(yīng)自動(dòng)化支持工具等原因，變異測(cè)試難以在實(shí)際中廣泛應(yīng)用.在WS-BPEL變異測(cè)試方面，人們提出面向WS-BPEL程序的變異算子[6]，為WS-BPEL程序的變異測(cè)試提供基礎(chǔ)[7].在課題組前期研究工作中[8-10]，我們提出了一種面向WS-BPEL程序的變

621010)變異測(cè)試[1](Mutation Testing)是一種基于缺陷的軟件測(cè)試方法，基本原理是使用變異算子(Mutants Operator)對(duì)被測(cè)程序做微小的合乎語(yǔ)法的變動(dòng)，改變過(guò)后得到的程序被稱(chēng)為變異體(Mutants)。在產(chǎn)生變異體后，分別在原程序和變異體上運(yùn)行測(cè)試用例，如果二者的結(jié)果相同，則表示該變異體是存活的(Alive)，如果二者的結(jié)果不同，則表示該變異體是被殺死的(Killed)。如果一個(gè)變異體在語(yǔ)義上和原程序保持一致，那么它將無(wú)

業(yè)界的高度重視。變異測(cè)試是一種基于錯(cuò)誤的軟件測(cè)試方法，自20世紀(jì)70年代產(chǎn)生以來(lái)，經(jīng)過(guò)近50年的發(fā)展，變異測(cè)試技術(shù)日趨成熟，大量實(shí)證研究表明[1-4]，相對(duì)于路徑分析、數(shù)據(jù)流分析和域分析等測(cè)試方法，變異測(cè)試能夠更為有效地檢測(cè)軟件故障。變異測(cè)試通過(guò)向待測(cè)程序注入微小的語(yǔ)法錯(cuò)誤，得到大量被稱(chēng)為變異體的錯(cuò)誤程序，從原程序生成變異體的轉(zhuǎn)換規(guī)則被稱(chēng)為變異算子，變異算子主要通過(guò)替換、刪除和插入三種方式更改程序中的變量或表達(dá)式，從而生成變異體，而變異發(fā)生的位置被稱(chēng)為變異

肝炎病毒YMDD變異的臨床意義陳繼梅1，胡婭嫻1，戴陽(yáng)2目的：探討拉米夫定治療慢性乙型肝炎期間發(fā)生乙型肝炎病毒HBV YMDD變異情況及其與病毒載量、肝功能的關(guān)系。方法:對(duì)慢乙肝患者分別檢測(cè)血清HBV YMDD變異、HBV DNA 載量及肝功能，并對(duì)檢驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果:3年間共發(fā)生HBV YMDD變異共59例，其中HBV YIDD變異29例(49.15%)，HBV YVDD變異41(69.49%)例，2者共同變異11(18.64%)例，YIDD與YVD

基本核心啟動(dòng)子區(qū)變異的生物學(xué)意義向 瑤 綜述，楊朝國(guó)△審校 (成都中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院，成都 610075)乙型肝炎病毒； 前C區(qū)基因； 基本核心啟動(dòng)子； 突變乙型肝炎病毒(HBV)基因組變異率約為其他DNA病毒的104倍，主要原因：(1)HBV復(fù)制是以mRNA為模板反轉(zhuǎn)錄合成子代病毒DNA，該過(guò)程中缺乏校對(duì)酶的作用，容易發(fā)生堿基錯(cuò)配；(2)在內(nèi)源性(宿主免疫清除)和外源性(疫苗接種、乙型肝炎免疫球蛋白注射、抗病毒藥物治療和診斷試劑檢測(cè))選擇性壓力下，H

可能存在每日血壓變異，迄今關(guān)于每日血壓變異與接受降壓治療的急性ICH 近期不良預(yù)后間關(guān)系尚不清楚，現(xiàn)就此進(jìn)行分析。受試對(duì)象為205例急性ICH 患者，平均年齡65歲。均于急性ICH 超急期(發(fā)?。? h 內(nèi))接受降壓治療，且初始收縮壓(SBP)均＞180 mm Hg(1 mm Hg=0.133 3 kPa)，降壓靶標(biāo)均為使SBP 降至120～160 mm Hg，降壓藥均為靜注尼卡地平。并于降壓頭2 h 內(nèi)每15 min 監(jiān)測(cè)1 次SBP，以后每小時(shí)監(jiān)測(cè)其S

寧大學(xué)文學(xué)院語(yǔ)言變異的種類(lèi)探析杜啟朕遼寧大學(xué)文學(xué)院語(yǔ)言變異是言語(yǔ)交際活動(dòng)中一種正常的語(yǔ)言現(xiàn)象，是語(yǔ)言中新質(zhì)要素不斷出現(xiàn)、舊質(zhì)要素不斷消亡的結(jié)果。根據(jù)不同的標(biāo)準(zhǔn)，語(yǔ)言變異可以分為不同的種類(lèi)。研究語(yǔ)言變異的種類(lèi)，具有重要的價(jià)值和意義。語(yǔ)言變異；種類(lèi)；模因；價(jià)值一、語(yǔ)言變異界說(shuō)語(yǔ)言是社會(huì)發(fā)展的產(chǎn)物，在社會(huì)發(fā)展的過(guò)程中不斷產(chǎn)生語(yǔ)言變異。美國(guó)著名社會(huì)語(yǔ)言學(xué)家威廉·拉波夫是語(yǔ)言變異理論的創(chuàng)始人，他認(rèn)為語(yǔ)言是一個(gè)有序的異質(zhì)體，是對(duì)同一事物存在的不同說(shuō)法。祝畹瑾指出：“語(yǔ)

。在遺傳算法中，變異算子通過(guò)模擬生物遺傳和進(jìn)化過(guò)程中的變異環(huán)節(jié)對(duì)個(gè)體進(jìn)行變異，雖然發(fā)生變異的可能性比較的小，但也是產(chǎn)生新物種的一個(gè)不可忽視的原因[1]。通過(guò)變異不斷在交叉算子產(chǎn)生的新個(gè)體的基礎(chǔ)上進(jìn)行微調(diào)、增加種群的多樣性、使遺傳算法在交叉算子決定的全局搜索能力的基礎(chǔ)上還具有一定的局部搜索能力。變異算子被認(rèn)為是必不可少的產(chǎn)生新個(gè)體的輔助方法，文獻(xiàn)[2]認(rèn)為變異算子能夠成為一個(gè)重要的遺傳算子，特別體現(xiàn)在維持種群的多樣性問(wèn)題上。正是變異算子在遺傳算法中的不可或缺

長(zhǎng)，HBV易產(chǎn)生變異耐藥，造成抗病毒治療的失敗。隨著核苷（酸）類(lèi)藥物種類(lèi)的增加，可通過(guò)聯(lián)合或替代的方法挽救變異耐藥，但是位于逆轉(zhuǎn)錄酶（reverse transcriptase，RT）區(qū)B亞區(qū)第181位氨基酸的變異給抗病毒治療提出了一個(gè)新的“挑戰(zhàn)”，因?yàn)槠?span id="j5i0abt0b" class="hl">變異后不僅僅對(duì)阿德福韋產(chǎn)生耐藥，而且對(duì)拉米夫定、恩替卡韋、替比夫定、替諾福韋的藥物敏感性均呈現(xiàn)下降，是一個(gè)交叉核苷和核苷酸兩類(lèi)藥物的耐藥位點(diǎn)[3]。一、rt181變異的概念野生型HBV rt181位氨基酸

例出現(xiàn)不同程度的變異，現(xiàn)分析如下。1 病例概況1．1 病例選擇收集2010年3月～2011年1月符合衛(wèi)生部頒布臨床路徑標(biāo)準(zhǔn)病例119例。其中，男性55例，女性64例;年齡25～83歲，平均年齡53．2歲;其中腸息肉 51例，急性胰腺炎29例，肝硬化腹水11例，膽總管結(jié)石取石(ERCP)27例，十二指腸潰瘍1例。共完成路徑例數(shù)/變異終止例數(shù)(102/17)例。其中腸息肉(47/4)例，急性胰腺炎(23/6)例，肝硬化腹水(7/4)例，膽總管結(jié)石(ERCP)取

殷玉明Continued from last issue Bone and cartilage disorders:Clinically, acute ankle pain caused by ankle fracture and dislocation can be adequately evaluated with routine ankle radiographs. Some subtle fractures can be diff i cult t