唐瓊英,俞 丹,楊金權(quán),劉煥章,*
(1. 中國科學(xué)院水生生物研究所 水生生物多樣性與保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖北 武漢 430072;2. 上海海洋大學(xué) 魚類研究室,上海 201306)
犁頭鰍屬魚類物種地理分化過程
唐瓊英1,俞 丹1,楊金權(quán)2,劉煥章1,*
(1. 中國科學(xué)院水生生物研究所 水生生物多樣性與保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖北 武漢 430072;2. 上海海洋大學(xué) 魚類研究室,上海 201306)
犁頭鰍屬為中國的特有屬,包括犁頭鰍和長鰭犁頭鰍兩個(gè)物種。犁頭鰍廣泛分布于長江中上游,而長鰭犁頭鰍則局限分布于閩江水系。該研究對(duì)采自長江中上游的犁頭鰍20個(gè)個(gè)體和閩江水系的長鰭犁頭鰍8個(gè)個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素b(cytb)基因序列進(jìn)行分析,以期對(duì)犁頭鰍屬魚類的物種地理分化過程進(jìn)行研究。結(jié)果顯示,犁頭鰍不同單倍型之間的遺傳變異水平為0.1%~1.8%,平均為0.7%;長鰭犁頭鰍各單倍型之間的遺傳變異水平為0.6%~1.3%,平均為0.7%;犁頭鰍和長鰭犁頭鰍單倍型之間的遺傳差異也較小,僅為0.2%~1.8%,平均為0.9%。采用鄰接(NJ)法和貝葉斯(BI)法構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹都一致顯示,該研究中的犁頭鰍屬魚類構(gòu)成一個(gè)單系;所有長鰭犁頭鰍樣本構(gòu)成一個(gè)單系,位于系統(tǒng)發(fā)育樹的頂部位置;犁頭鰍的樣本不構(gòu)成單系,而是形成并系。從形態(tài)上看,犁頭鰍和長鰭犁頭鰍均為有效種。由此推測,在第四紀(jì)冰期,長江中下游的犁頭鰍沿東海大陸架向南擴(kuò)散到東南沿海水系,長鰭犁頭鰍可能是犁頭鰍的一個(gè)種群擴(kuò)散到閩江水系后,由于適應(yīng)新的環(huán)境條件而分化成的一個(gè)新物種,剩下的長江流域的犁頭鰍種群則構(gòu)成一個(gè)并系類群。該文對(duì)于類似的地理物種形成方式也進(jìn)行了討論。
犁頭鰍屬;物種地理分化;東海大陸架;長江水系;閩江水系
物種分化是指一個(gè)物種產(chǎn)生分化而形成新物種的進(jìn)化過程。物種分化是物種多樣性形成的基本過程,是生物多樣性起源的重要組成部分。對(duì)物種分化的研究是進(jìn)化生物學(xué)最熱門的研究課題之一。2009年是達(dá)爾文誕辰200周年和《物種起源》發(fā)表150周年紀(jì)念,因此,關(guān)于物種分化的研究再次成為最活躍最熱門的研究課題。
引起物種分化的因素有很多,其中隔離是一個(gè)重要的影響因素。在物種分化過程中,隔離(包括地理隔離和生殖隔離)起著十分關(guān)鍵的作用。隔離是物種形成的一個(gè)極為重要的條件,隔離導(dǎo)致遺傳物質(zhì)交流中斷,使群體歧化不斷加深,直至新種形成。隔離(主要是環(huán)境隔離)既是物種形成的重要條件,隔離(主要是生殖隔離)同時(shí)又是物種形成的重要標(biāo)志(Xia,2005)。關(guān)于物種的分化過程,Avise(2000)認(rèn)為要經(jīng)歷復(fù)系、并系、單系三個(gè)階段,即在進(jìn)化初期由一個(gè)祖先分化出A種群和B種群,它們分別分化出很多分支。隔離的出現(xiàn)使這些分支隨機(jī)分布在不同的生境,此時(shí)這兩個(gè)種群間存在基因交流,相互構(gòu)成復(fù)系關(guān)系;在后來的進(jìn)化過程中,由于自然選擇、瓶頸效應(yīng)等各種因素的作用,種群B成為一個(gè)單系群,而種群A 則可能成為一個(gè)并系群。再后來,隨著時(shí)間的推移,種群A也會(huì)進(jìn)化為一個(gè)單系群。 這樣A和B分別構(gòu)成各自的單系群,成為兩個(gè)分化完全的物種。根據(jù)這一假說,一個(gè)物種為單系,其祖先種為并系,這一狀態(tài)成為物種處于早期分化階段的一個(gè)標(biāo)記。
研究物種分化過程的方法有很多,譜系生物地理學(xué)(phylogeography)是近年來隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展而興起的一門學(xué)科,它是采用分子系統(tǒng)發(fā)育分析的方法,探討近緣物種或種內(nèi)族群間的演化與地質(zhì)歷史事件之間的關(guān)系,分析種間或種內(nèi)支系現(xiàn)有地理分布格局的形成過程(Avise, 2000; Zhang, 2003),進(jìn)而探討物種的分化機(jī)制。近年來,利用線粒體DNA(mtDNA)作為分子標(biāo)記對(duì)動(dòng)植物進(jìn)行譜系生物地理學(xué)研究已成為熱點(diǎn),也取得了不少成果,尤其在淡水魚類中。這是因?yàn)榈~類的分布受水系的嚴(yán)格限制,地理隔離廣泛存在。
犁頭鰍屬(Lepturichthys)隸屬于鯉形目(Cypriniformes)鰍超科(Cobitoidea)平鰭鰍科(Balitoridae)平鰭鰍亞科(Balitorinae),是中國的特有屬。Regan(1911)以Homaloptera fimbriataGünther為模式建立了新屬——犁頭鰍屬(Lepturichthys),該屬以具細(xì)長的尾柄而顯著區(qū)別于Homaloptera屬。后來,Hora (1932)認(rèn)為采自四川岷江和湖南洞庭湖的犁頭鰍標(biāo)本不同于采自湖北宜昌的犁頭鰍模式標(biāo)本,并根據(jù)胸鰭不分支鰭條數(shù)目、背鰭最長鰭條的長度、全身是否具疣狀刺突、體色體斑等特征分別將采自四川岷江、湖南洞庭湖的標(biāo)本命名為兩個(gè)新種:Lepturichthys guntheri和Lepturichthys nicholsi,但當(dāng)時(shí)描述新種時(shí)采用的標(biāo)本分別僅2尾。陳宜瑜(Chen, 1978)認(rèn)為L. guntheri和L. nicholsi都應(yīng)是犁頭鰍L. fimbriata的同物異名。Dai(1985)描述了采自福建南平的一個(gè)新種——長鰭犁頭鰍(Lepturichthys dolichopterus)。因此,到目前為止,犁頭鰍屬魚類共包括兩個(gè)有效種——犁頭鰍和長鰭犁頭鰍。其中,犁頭鰍廣泛分布于長江中上游,而長鰭犁頭鰍則局限分布于閩江水系(Chen & Tang,2000)。
與大多數(shù)鯉科魚類相比,犁頭鰍屬魚類的分布范圍較窄,兩個(gè)種呈現(xiàn)間斷分布,為典型的東洋區(qū)淡水魚類類群。犁頭鰍屬魚類目前的分布格局是如何形成的;屬內(nèi)兩個(gè)物種的分化過程如何等問題的研究目前還未見報(bào)道。
快速進(jìn)化的線粒體DNA(mtDNA)在進(jìn)行淡水魚類的譜系生物地理學(xué)研究時(shí)可以作為一個(gè)很好的分子標(biāo)記。其中細(xì)胞色素b(cytb)基因?yàn)榈鞍踪|(zhì)編碼基因,目前已廣泛地運(yùn)用于各淡水魚類類群的物種分化研究(如:Perdice et al, 2004; Xia et al, 2005; Yang & He, 2008; Zhang et al, 2008; Yang et al, 2009)。本研究擬采用線粒體cytb基因?qū)珙^鰍屬魚類的物種地理分化過程進(jìn)行研究,討論其現(xiàn)今分布格局的形成原因,以探討物種分化的規(guī)律和機(jī)制。
本研究共包括33個(gè)樣本,其中采自長江中上游的犁頭鰍共20個(gè)個(gè)體,閩江水系的長鰭犁頭鰍共8個(gè)個(gè)體,并選擇同屬于平鰭鰍亞科的四川華吸鰍(Sinogastromyzon szechuanensis)、下司華吸鰍(S. hsiashiensis)、臺(tái)灣間吸鰍(Hemimyzon formosanum)、臺(tái)東間吸鰍(H. taitungensis)及廣西華平鰍(Sinohomaloptera kwangsiens)作為外類群進(jìn)行比較。實(shí)驗(yàn)所用標(biāo)本均為95%酒精固定樣本,保存于中國科學(xué)院水生生物研究所淡水魚類博物館。標(biāo)本名稱及采集地等詳細(xì)信息見表1,犁頭鰍屬魚類的采集地點(diǎn)如圖1所示。
基因組DNA的提取采用高鹽抽提法(Tang et al, 2008)?;蛐蛄衅瓮ㄟ^PCR擴(kuò)增所得。擴(kuò)增所用引物為L14724和H15915(Xiao et al, 2001)。PCR反應(yīng)的總體積為60 μL,用大約50 ng的基因組DNA作為模板,反應(yīng)體系包括:10×Buffer 6 μL,dNTPs0.75 μL(10 mmol/L),引物各1.5 μL(10 μmol/L),TaqDNA聚合酶1.5 U,加滅菌雙蒸水至60 μL。PCR反應(yīng)條件為:94℃ 預(yù)變性3 min;94℃ 變性45 s,52~58℃退火45 s,72℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);最后在72℃延伸8 min。將獲得的PCR產(chǎn)物送基因公司進(jìn)行純化回收,采用擴(kuò)增所用引物對(duì)回收產(chǎn)物進(jìn)行測序。序列遞交GenBank,獲得的序列號(hào)見表1。
表 1 研究所用樣本的物種名、編號(hào)、個(gè)體數(shù)、采集地及GenBank序列號(hào)等信息Tab. 1 Species, symbols, sample size, sample locations and GenBank accession numbers in the present study
圖 1 本研究中犁頭鰍屬魚類的采集地點(diǎn)Fig. 1 Sample locations for the genus Lepturichthys in the present study
DNA序列的排列使用Clustal X軟件,并在SEAVIEW程序中對(duì)序列進(jìn)行手工調(diào)整。單倍型多樣性和核苷酸多樣性的統(tǒng)計(jì)采用DNAsp4.9軟件(Rozas et al, 2003)。單倍型之間成對(duì)的遺傳距離、各類群內(nèi)及類群間的平均遺傳差異情況在Mega4軟件(Tamura et al, 2007)中采用Kimura雙參數(shù)模型進(jìn)行計(jì)算;序列中各堿基組成、堿基變異情況在PAUP軟件中進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。序列的核苷酸替代飽和性分析是通過對(duì)轉(zhuǎn)換(transitions, Ts)、顛換(transversions, Tv)的絕對(duì)數(shù)目和遺傳距離進(jìn)行作圖分析(替代的絕對(duì)數(shù)目和遺傳距離均在PAUP軟件中進(jìn)行統(tǒng)計(jì))。分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建采用鄰接(neighbor joining, NJ)法和貝葉斯法(Bayesian analysis)。鄰接法采用Mega4軟件,各分支的置信度都采用1000次自展分析(Bootstrap analysis)進(jìn)行重復(fù)檢驗(yàn)。貝葉斯法采用MrBayes 3.0b軟件(Huelsenbeck & Ronquist, 2001),各分支的置信度以后驗(yàn)概率(Posterior probability)來表示。
對(duì)測序獲得的犁頭鰍屬魚類cytb基因序列進(jìn)行比對(duì)分析后,刪去首尾測序信號(hào)較差的堿基,最終用于分析的cytb基因序列長為1 074 bp。20個(gè)犁頭鰍個(gè)體中共檢測到12個(gè)單倍型,單倍型多樣性的平均值為0.937,核苷酸多樣性的平均值為0.00 468;8個(gè)長鰭犁頭鰍個(gè)體中有4個(gè)單倍型,單倍型多樣性的平均值為0.643,核苷酸多樣性的平均值為0.00349。犁頭鰍屬魚類單倍型的分布情況見表2。犁頭鰍樣本中,采自四川樂山與湖北金口的個(gè)體存在共享單倍型(LS2和JK2共享單被型Hap1,LS1、LS3、JK8及JK11共享單倍型Hap4),采自湖南桃源的個(gè)體與湖北金口的個(gè)體存在共享單倍型(TY1和JK14共享單倍型Hap3),湖北金口的個(gè)體間也存在共享單倍型(Hap7, Hap9),剩下的7個(gè)單倍型為獨(dú)有,其中1個(gè)為貴州赤水的個(gè)體擁有,其它6個(gè)為湖北金口的個(gè)體擁有。8個(gè)長鰭犁頭鰍樣本中,有5個(gè)個(gè)體共享一個(gè)單倍型hap1,其余3個(gè)個(gè)體擁有獨(dú)有的單倍型。
表 2 犁頭鰍屬魚類單倍型的分布情況Tab. 2 The information of haplotypes of the genus Lepturichthys species
對(duì)本研究中獲得的所有單倍型及外類群進(jìn)行序列分析,結(jié)果顯示,該基因序列片段中A、C、G、T的平均含量分別為28.0%、29.6%、14.4%和28.0%,A+T的含量(56.0%)明顯高于C+G的含量(44.0%),同時(shí)表現(xiàn)出強(qiáng)烈的低G堿基含量的堿基組成偏向性,尤其在第三位點(diǎn)表現(xiàn)更為明顯,G的含量僅為3.4%。所有序列轉(zhuǎn)換顛換比(Ts/Tv)的平均值為5.21。在1074個(gè)位點(diǎn)中,變異位點(diǎn)有217個(gè),其中簡約信息位點(diǎn)有108個(gè)。序列中核苷酸替代的飽和性分析結(jié)果表明,轉(zhuǎn)換和顛換均未達(dá)飽和(圖2),因此,所有堿基均可用于系統(tǒng)發(fā)育分析。
基于Kimura雙參數(shù)模型計(jì)算的犁頭鰍屬魚類單倍型之間的遺傳變異情況表明,犁頭鰍不同單倍型之間的遺傳變異水平為0.1%~1.8%,平均為0.7%,長鰭犁頭鰍各單倍型之間的遺傳變異水平為0.6%~1.3%,平均為0.7%,犁頭鰍和長鰭犁頭鰍單倍型之間的遺傳差異也較小,僅為0.2%~1.8%,平均為0.9%,這和犁頭鰍及長鰭犁頭鰍種內(nèi)單倍型之間的差異類似。犁頭鰍屬魚類和外類群華吸鰍屬、間吸鰍屬及華平鰍間的平均差異較大,分別為5.4%、8.9%和9.5%。
圖 2 Cyt b基因序列中核苷酸替代的飽和性分析圖Fig. 2 Plot of transition and transversion substitutions versus the HKY distance for all positions of the cytochrome b gene sequences
采用鄰接法和貝葉斯法構(gòu)建的犁頭鰍屬魚類單倍型之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系如圖3。鄰接(NJ)樹和貝葉斯(BI)樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)大致類似,只在單倍型的分支順序上存在差異。這兩棵系統(tǒng)發(fā)育樹都一致顯示,該研究中的犁頭鰍屬魚類構(gòu)成一個(gè)單系,且得到較強(qiáng)的支持(NJ樹中自展值為100,BI樹中的后驗(yàn)概率為1.00)。分布于閩江水系的長鰭犁頭鰍構(gòu)成一個(gè)單系,位于系統(tǒng)發(fā)育樹的頂部位置,但在NJ樹中支持率不高,僅為49,在BI樹中支持率為1.00。所有犁頭鰍的樣本不構(gòu)成單系,而是形成并系,其中采自湖北金口的兩個(gè)個(gè)體(JK9和JK1)位于犁頭鰍屬魚類的最基部位置,其它犁頭鰍個(gè)體位于系統(tǒng)發(fā)育樹的中間位置,犁頭鰍的這種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系在NJ樹和BI樹中幾乎是一致的。
本研究結(jié)果顯示,犁頭鰍屬魚類中犁頭鰍和長鰭犁頭鰍這兩個(gè)物種間的遺傳差異較小,幾乎和物種內(nèi)不同個(gè)體間的遺傳變異相當(dāng)。分子系統(tǒng)發(fā)育分析的結(jié)果表明,長鰭犁頭鰍的個(gè)體可以形成單系,但犁頭鰍的樣本不能聚為單系,犁頭鰍的部分樣本與長鰭犁頭鰍具有更近的親緣關(guān)系。這兩個(gè)物種是否均為有效種,僅用遺傳差異的大小是不能界定物種的,因?yàn)椴煌惾旱奈锓N間及不同基因間遺傳差異變異的范圍很大。另外,物種的劃分也不能簡單地以分支關(guān)系來處理(Xia et al, 2005)。長鰭犁頭鰍和犁頭鰍在形態(tài)上存在顯著的區(qū)別特征:長鰭犁頭鰍偶鰭均較長,體長為胸鰭長的4.1~4.8倍(VS. 6.5~7.9倍),為腹鰭長的4.8~5.7倍(VS. 6.5~8.3倍);腹鰭末端接近或稍為超過肛門(VS. 腹鰭末端伸至腹鰭腋部至臀鰭起點(diǎn)間的中點(diǎn));肛門約在腹鰭腋部至臀鰭起點(diǎn)間的2/3稍后(VS.約在腹鰭腋部至臀鰭起點(diǎn)間的2/3處)(Chen & Tang, 2000)。另外,我們對(duì)所研究樣本的體色體斑進(jìn)行了檢視,發(fā)現(xiàn)長鰭犁頭鰍樣本較為單一,而犁頭鰍樣本變異較大。長鰭犁頭鰍樣本的體色均為棕黑色,橫跨體背部具7~8個(gè)橢圓形的大斑塊,被窄小的淺黃色條紋隔開;犁頭鰍樣本的體色從淺黃色到棕黑色,背部斑紋有的為褐色的橢圓形斑塊,有的呈圓形眼斑,有的為不規(guī)則斑紋,有的斑紋不明顯。這兩個(gè)物種在形態(tài)上存在顯著的區(qū)別特征,分布區(qū)也不重疊,因此我們認(rèn)為這兩個(gè)物種均為有效種。目前的分子數(shù)據(jù)表明,這兩個(gè)物種間的遺傳差異極小,我們推測,長鰭犁頭鰍可能是新近分化出來的一個(gè)物種。環(huán)境的改變導(dǎo)致犁頭鰍的一個(gè)地理種群在形態(tài)上發(fā)生迅速改變,但在遺傳上還沒有足夠長的時(shí)間來積累其遺傳差異。魚類中還有很多在形態(tài)上存在差異但在遺傳上差異卻不明顯的例子,尤其在非洲湖泊的麗魚中這種現(xiàn)象更為普遍,盡管這些魚類之間的遺傳差異較小,但都是有效種(Meyer et al, 1990; Wilson et al, 2000)。
犁頭鰍廣泛分布于長江中上游水域,之前所記錄的分布范圍是長江水系的湖南洞庭湖至四川境內(nèi)。郭治之和劉瑞蘭(Guo & Liu, 1995)、張鶚等(Zhang et al, 1996)發(fā)現(xiàn)在江西鄱陽湖水系的信江中也有犁頭鰍的分布。長鰭犁頭鰍局限分布于福建閩江水系。信江發(fā)源于浙贛兩省交界的懷玉山南的玉山水和武夷山北麓的豐溪水,閩江水系發(fā)源于武夷山東南。因此,武夷山是長江中下游鄱陽湖水系與閩江水系的天然分水嶺。本研究中犁頭鰍和長鰭犁頭鰍單倍型之間的遺傳差異為0.2%~1.8%,按cytb基因在淡水魚類中進(jìn)化速率為每百萬年1%計(jì)算(Durand et al, 2002),犁頭鰍和長鰭犁頭鰍發(fā)生分歧的時(shí)間在0.9~0.1百萬年前,屬于更新世。根據(jù)犁頭鰍屬魚類目前的分布模式,其分布格局的形成有兩種可能的途徑:一種途徑為信江和閩江曾經(jīng)相連接,犁頭鰍屬魚類曾經(jīng)廣布,武夷山的隆升才造成它們的隔離;另一種途徑為,第四紀(jì)冰期海平面下降后,長江流域的犁頭鰍順長江口的水系進(jìn)入閩江。由于犁頭鰍和長鰭犁頭鰍的遺傳分化很小,說明其隔離的時(shí)間很晚。武夷山的隆升相對(duì)久遠(yuǎn),造成的隔離應(yīng)該比較大(Liu, 1984),第四紀(jì)冰期的發(fā)生則較為晚近。因此,對(duì)于犁頭鰍屬魚類的分布,第四紀(jì)冰期的擴(kuò)散更有可能。
圖 3 基于cyt b基因構(gòu)建的犁頭鰍屬魚類單倍型間的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系Fig. 3 The molecular phylogenetic trees of the haplotypes identified from the genus Lepturichthys species
綜合本文的研究結(jié)果以及歷史資料,本文對(duì)犁頭鰍屬魚類的物種分化過程作如下推測:青藏高原的隆升及東亞季風(fēng)氣候的形成,使犁頭鰍屬這類適應(yīng)激流環(huán)境的魚類衍生出來,廣泛分布于長江水系。在第四紀(jì)冰期全球氣溫下降,海平面降低,較現(xiàn)在下降超過100 m,東海大陸架露出海面成為陸地,部分水系可能相互貫通(Li & Fang, 1990)。分布于長江中下游的犁頭鰍逐漸擴(kuò)散至東南沿海各水系。在間冰期,全球氣候變暖,海平面上升,大陸架被海水淹沒,各沿海水系被隔離。犁頭鰍屬于產(chǎn)漂流性卵的魚類,在產(chǎn)卵場的下游需要有足夠長的河道才能滿足受精卵漂流孵化的時(shí)間要求。因此,犁頭鰍只在少部分水系中被保留下來,如閩江水系。由于閩江水系環(huán)境的差異,擴(kuò)散到閩江水系的犁頭鰍快速地發(fā)生一些分化以適應(yīng)新的環(huán)境,從而分化形成長鰭犁頭鰍。相對(duì)說來,長鰭犁頭鰍表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性,而分布廣泛的犁頭鰍則具有更為豐富的遺傳多樣性,且形成一個(gè)并系。
在本研究中,我們推測犁頭鰍的擴(kuò)散路徑是從長江中下游經(jīng)沿海大陸架向南進(jìn)行擴(kuò)散的。采用沿海大陸架作為遷移路徑的例子在其他動(dòng)物中也有報(bào)道,如長江下游四大家魚向珠江流域、海南島等地的擴(kuò)散(Li & Fang, 1990),淮河過渡動(dòng)物群的南遷(Cai, 2002)等。在第四紀(jì)大冰期期間,各物種向南遷移到“避難所”的現(xiàn)象是較為普遍的,而沿海大陸架是物種向南遷移的一個(gè)主要路徑。
關(guān)于物種分化過程,Avise (2000)認(rèn)為一般需要經(jīng)歷從復(fù)系到并系再到單系3個(gè)發(fā)展階段。Zhang et al (2008)研究了采自長江的華鳈(Sarcocheilichthys sinensis sinensis) 和閩江的福建華鳈 (Sarcocheilich-thys sinensis fukiensis)這兩個(gè)亞種的物種分化,發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)亞種都不能分別構(gòu)成單系,而是相互混雜聚在一起形成復(fù)系。因此,推測這兩個(gè)亞種可能還處于物種分化的早期階段,這也正支持了兩者的亞種地位。另外,Zhang et al (2008)對(duì)克氏鳈(Sarcocheilichthys czerskii)和黑鰭鳈(S. nigripinnis)的物種分化過程也進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)黑鰭鳈的一個(gè)北方種群與克氏鳈有更近的譜系關(guān)系。由此他們推測,分布于黑龍江水系的克氏鳈可能是黑鰭鳈北方種群的一個(gè)分支向中國東北擴(kuò)散后分化出來的一個(gè)物種,剩下的黑鰭鳈則形成一個(gè)并系類群。Shields et al(2000)指出,北極熊由棕熊的一個(gè)種群分化成種后,剩下的棕熊種群也是形成一個(gè)并系類群。
本研究中長鰭犁頭鰍可以構(gòu)成一個(gè)單系,但犁頭鰍為一并系。犁頭鰍和長鰭犁頭鰍的物種分化過程與克氏鳈和黑鰭鳈及北極熊和棕熊的物種分化過程極為相似,即一個(gè)地理種群為適應(yīng)新的環(huán)境而演化成另一個(gè)物種,從而使得原來物種的其他地理種群形成一個(gè)并系,它們?cè)谶z傳上還沒有完全分化成兩個(gè)獨(dú)立的物種,還處于物種分化的并系階段。而上面所提及的華鳈和福建華鳈則還處于復(fù)系這一物種分化的起始階段。因此,本文的研究結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)和豐富了物種形成的地理隔離過程假說。
致謝:感謝浙江大學(xué)的周卓誠先生、武漢中國地質(zhì)大學(xué)的黃偉先生、中科院水生生物研究所的曾燏博士和熊玉宇博士在收集樣本上給予的幫助。另外,本所的劉思情和周健同學(xué)在實(shí)驗(yàn)上也提供了大力支持,在此一并表示衷心的感謝。
Avise JC. 2000. Phylogeography, the History and Formation of Species [M]. England: Harvard University.
Cai BQ. 2002. The evidence of dry land of the Taiwan straits during late Würm glaciation [J].Mar Sci, 26(6): 51-54. [蔡保全. 2002. 晚玉木冰期臺(tái)灣海峽成陸的證據(jù). 海洋科學(xué), 26(6): 51-54.]
Chen YY, Tang WQ. 2000. Homalopteridae [M]//Yue PQ. Fauna Sinica. Osteichthyes. Cypriniformes III. Beijing: Sciences Press, 438-567. [陳宜瑜, 唐文喬. 2000. 平鰭鰍科 [M]// 樂佩琦. 中國動(dòng)物志(硬骨魚綱·鯉形目·下卷). 北京: 科學(xué)技術(shù)出版社, 438-567.]
Chen YY. 1978. Systematic studies on the Fishes of the family Homalopteridae of China I. classification of the fishes of the subfamily Homalopterinae [J].Acta Hydrobiol Sin, 6(3): 331-348. [陳宜瑜. 1978.中國平鰭鰍科魚類系統(tǒng)分類的研究I. 平鰭鰍亞科魚類的分類. 水生生物學(xué)集刊, 6 (3): 331-348.]
Dai DY. 1985. A new species of the genusLepturichthysfrom China (Cypriniformes: Homalopteridae) [J].Acta Zootax Sin, 10 (2): 221-224. [戴定遠(yuǎn). 1985. 中國犁頭鰍屬一新種. 動(dòng)物分類學(xué)報(bào), 10 (2): 221-224.]
Durand J, Tsigenopoulos C, ünlü E, Berrebi P. 2002. Phylogeny and biogeography of the family Cyprinidae in the Middle East inferred from cytochromebDNA-evolutionary significance of this region [J].Mol Phylogenet Evol, 22: 91-100.
Guo ZZ, Liu RL. 1995. The fishes of Jiangxi Province [J].J Nanchang Univ:Nat Sci, 19(3): 222-232. [郭治之, 劉瑞蘭. 1995. 江西魚類的研究.南昌大學(xué)學(xué)報(bào): 理科版, 19(3): 222-232.]
Huelsenbeck JP, Ronquist F. 2001. MrBayes: Bayesian inference of phylogeny [J].Bioinformatics, 17: 754-755.
Li SZ, Fang F. 1990. On the geographical distribution of the four kinds of pond-cultured carps in China [J].Acta Zool Sin, 36(3): 244-250. [李思忠, 方 芳. 1990. 鰱、鳙、青、草魚地理分布的研究. 動(dòng)物學(xué)報(bào), 36(3): 244-250.]
Liu ZZ. 1984. The origin and morphological characteristics of the Wuyi Mountain, Fujian Province [J].J Nanjing Univ:Nat Sci, 3: 567-576. [劉振中. 1984. 武夷山的形成與地貌發(fā)育特征. 南京大學(xué)學(xué)報(bào): 自然科學(xué)版, 3: 567-576.]
Meyer A, Kocher TD, Basasibwaki P, Wilson AC. 1990. Monophyletic origin of Lake Victoria cichlid fishes suggested by mitochondrial DNA sequences [J].Nature, 347: 550-553.
Perdices A, Cunha C, Coelho MM. 2004. Phylogenetic structure ofZacco platypus(Teleostei, Cyprinidae) populations on the upper and middle Chang Jiang (= Yangtze) drainage inferred from cytochromebsequences [J].Mol Phylogenet Evol, 31(1): 192-203.
Rozas J, Sanchez-DelBarrio JC, Messeguer X. 2003. DNASP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods [J].Bioinformatics, 19: 2496-2497.
Shields GF, Adams D, Garner G, Labelle M, Pietsch J, Ramsay M, Schwartz C, Titus K, Williamson S. 2000. Phylogeography of mitochondrial DNA variation in brown bears and polar bears [J].Mol Phylogent Evol, 15 (2): 319-326.
Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. 2007. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 [J].Mol Biol Evol, 24: 1596-1599.
Tang Q, Freyhof J, Xiong B, Liu H. 2008. Multiple invasions of Europe by East Asian cobitid loaches (Teleostei: Cobitidae) [J].Hydrobiologia, 605: 17-28.
Tang Q, Liu H, Mayden RL, Xiong B. 2006. Comparasion of evolution rates in the mitochondrial DNA cytochromebgene and control region and their implications for the phylogeny of the Cobitoidea [J].Mol Phylogent Evol, 39: 347-357.
Wilson AB, Noack-Kunnmannn K, Meyer A. 2000. Incipient speciation in sympatric Nicaraguan crater lake cichlid fished: sexual selection versus ecological diversification [J].Proc R Soc Lond B, 267: 2133-2141.
Xia X, Zhang X, Liu H. 2005. Molecular biogeography ofPseudogobio vaillanti(Cypriniformes, Cyprinidae, Gobioninae) [J].Prog Nat Sci, 15(9): 1064-1069. [夏曦中, 張訓(xùn)蒲, 劉煥章. 2000. 似鮈的分子生物地理學(xué)分析. 自然科學(xué)進(jìn)展, 15(9): 1064-1069.]
Xia XZ. 2005. Phylogeography and speciation of generaRhinogobioandPseudogobioin China [D]. Master’s Degree Dissertation, Huazhong Agricultural University, Wuhan. [夏曦中. 2005. 吻鮈屬和似鮈屬魚類物種分化的比較. 碩士學(xué)位論文, 華中農(nóng)業(yè)大學(xué), 武漢.]
Xiao WH, Zhang YP, Liu HZ. 2001. Molecular systematics of Xenocyprinae (Teleostei: Cyprinidae): Taxonomy, biogeography, and coevolution of a special group restricted in East Asia [J].Mol Phylogenet Evol, 18: 163-173.
Yang L, He S. 2008. Phylogeography of the freshwater catfishHemibagrus guttatus(Siluriformes, Bagridae): Implications for South China biogeography and influence of sea-level changes [J].Mol Phylogenet Evol, 49: 393-398.
Yang L, Mayden RL, He S. 2009. Population genetic structure and geographical differentiation of the Chinese catfishHemibagrus macropterus(Siluriformes, Bagride): evidence for altered drainage patterns [J].Mol Phylogenet Evol, 51: 405-411.
Zhang DX. 2003. Advances in historical biogeography: a brief perspective [J].J Trop Subtrop Bot, 11(3): 283-289. [張奠湘. 2003. 歷史生物地理學(xué)的進(jìn)展. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào), 11(3): 283-289.]
Zhang E, Liu HZ, He CC. 1996. Fish fauna in northeastern Jiangxi Province [J].Chn J Zool, 31(6): 3-12. [張 鶚, 劉煥章, 何長才. 2003. 贛東北地區(qū)魚類區(qū)系的研究. 動(dòng)物學(xué)雜志, 31(6): 3-12.]
Zhang L, Tang QY, Liu HZ. 2008. Phylogeny and speciation process of the eastern Asian cyprinid genusSarcocheilichthys[J].J Fish Biol, 72: 1122-1137.
Geographical Speciation Process of the GenusLepturichthys(Cypriniformes: Balitoridae)
TANG Qiong-Ying1, YU Dan1, YANG Jin-Quan2, LIU Huan-Zhang1,*
(1.The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation, Institute of Hydrobiology, the Chinese Academy of Sciences, Wuhan430072,China; 2.Laboratory of Fishes, Shanghai Ocean University, Shanghai200090,China)
The genusLepturichthysis endemic in China, including two valid species,L. fimbriataandL. dolichopterus. The former is widely distributed in the Upper and Middle Yangtze River, while the latter only in Minjiang River. In the present study, the mitochondrial cytochromebgene sequences were analyzed for 20 individuals ofL. fimbriatacollected from the Upper and Middle Yangtze River and eight individuals ofL. dolichopteruscollected from Minjiang River. This paper aimed to investigate the geographical speciation process of the genusLepturichthys. The results showed that the genetic variations among different haplotypes ofL. fimbriataranged from 0.1% to 1.8%, with an average of 0.7%, and from 0.6% to 1.3%, with an average of 0.7% among different haplotypes ofL. dolichopterus. The variations betweenL. fimbriataandL. dolichopteruswere also very low, ranging from 0.2% to 1.8%, with an average of 0.9%. Two methods, Neighbor Joining (NJ) and Bayesian analysis (BI), were used for constructing the molecular phylogenetic trees. Both NJ and BI trees indicated that allLepturichthysspecimens formed as a monophyletic group; theL. dolichopterussamples also formed as monophyletic group, having a derived position in the phylogenetic trees, while theL. fimbriatasamples formed as a paraphyletic group. BothL. fimbriataandL. dolichopterusare valid species in morphology. Based on molecular and morphological data, we presumed that the geographical speciation process of the genusLepturichthyscould be as following: during the Quaternary Glacial period,L. fimbriatain the Middle and Lower Yangtze River dispersed to the drainages of Southeast China along the Continental Shelf of East China Sea, one population spread to the Minjiang River and envolved as a new species (L. dolichopterus) because of considerable environmental difference, while the remainingL. fimbriatapopulations in the Yangtze River formed as a paraphyly. The other similar geographical speciation patterns are discussed in the present study as well.
book=3,ebook=136
Lepturichthys; Geographical speciation; Continental shelf of East China Sea; Yangtze River; Minjiang River
Q959.483; Q349
A
0254-5853-(2010)03-0230-09
10.3724/SP.J.1141.2010.03230
2009-10-10;接受日期:2010-03-01
國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30700072;40432003);美國自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目CToL?
Corresponding author),Tel:027-68780776,E-mail:hzliu@ihb.ac.cn