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      吉林省常見的幾種委陵菜ITS序列比對

      2011-04-25 09:37:18,,,,,
      關(guān)鍵詞:委陵菜藥典長春

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      (1.吉林大學(xué)再生醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所,吉林 長春 130021;2.長春中醫(yī)藥大學(xué),吉林 長春 130117;3.吉林省腫瘤醫(yī)院,吉林 長春 130012;4.吉林省中醫(yī)藥科學(xué)院,吉林 長春 130021;5.吉林大學(xué)第一醫(yī)院,吉林 長春 130021)

      委陵菜(Potentillachinesis)為薔薇科委陵菜屬植物,具有清熱解毒,涼血止痢之功能[1]。由于療效確切,在《中國藥典》歷版中均被收載[2]。該屬植物較多,僅吉林省境內(nèi)就有10種之多。由于它們的親緣關(guān)系接近,在同一生境內(nèi)或不同生境內(nèi)生長的各個物種間從外觀上很難區(qū)別,加之所含化學(xué)成分接近,因而,用傳統(tǒng)的外觀鑒別,顯微鑒別,薄層色譜鑒別很難達到滿意效果[3],導(dǎo)致誤采,誤用,影響療效。為此,我們采用ITS序列分析,對我省地產(chǎn)委陵菜屬植物進行鑒別,以彌補上述方法的不足。

      1 材料與方法

      1.1 材料 委陵菜,伏委陵菜,小叉葉委陵菜,霉葉委陵菜,蔓委陵菜為硅膠快速干燥的葉片。分別采集于長吉高速公路和長春南湖公園處。均由長春中醫(yī)藥大學(xué)鄧明魯教授鑒定(見表1)。

      1.2 DNA提取 稱取0.3 g各樣品葉片,置于培養(yǎng)皿中,加水少許,浸泡至充分展開,剪去病斑,用棉球擦拭葉片,去除雜質(zhì),再用70%乙醇擦拭葉片表面,然后用超純水清洗3次,置于超凈臺上干燥;在液氮中研磨成細(xì)粉,然后按說明用北京鼎國植物基因組DNA提取試劑盒提取其總DNA,溶于適量的超純水中。取5 μL用1%瓊脂糖凝膠電泳,檢查DNA質(zhì)量和數(shù)量。

      1.3 引物設(shè)計 選擇被子植物ITS通用引物[4],由寶生物(中國大連)合成,其序列如下:

      PCR引物:ITS-F:5→-TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G-3→ ITS-R:5→-CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT-3→

      測序用引物I:TS-1F:5→-TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G-3→ In-18S-25S-3→R:5→-GAC TCG ATG GTT CAC GGG ATT CT-3→ In-18S-25S-5→F:5→-TCT CGC ATC GAT GAA GAA CG-3→ 18S-25S-3→R:5→-CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT-3→

      1.4 DNA擴增 擴增采用50 μL體系,其中1.3引物各1 μL,模板各5 μL,10×Buffer 5 μL,dNTPs 5 μL,Taq DNA多聚酶1 μL,超純凈水32 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min。94 ℃ 1 min,55 ℃ 2 min,72 ℃2 min,循環(huán)35次。72 ℃延長循環(huán)10 min,4 ℃保存。

      1.5 測序 1.4 PCR產(chǎn)物經(jīng)Montage PCR Filter Units (Millipore Corporation,U.S.A.)純化后,進行測序反應(yīng)。反應(yīng)采用10 μL體系,用ABI BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems,U.S.A.)測序,其中含5×sequencing buffer 2.0 μL BigDye(3.1)0.5 μL,純化模板1.0 μL,1.3引物1.0 μL,純凈水5.5 μL。反應(yīng)條件:預(yù)變性96 ℃ 1 min。96 ℃ 30 s,50 ℃ 5 s,循環(huán)25次。60 ℃延長4 min。

      1.6 序列分析 采用網(wǎng)頁http://bioinfo.genopole-toulouse.prd.fr/multalin/multalin.html和Genetyx-SV/RC version 11.0 (Software Development Co.,Ltd.,Tokyo,Japan) 進行序列的比對和編輯。

      2 結(jié)果

      2.1 采集委陵菜的相關(guān)信息 見表1。

      2.2 5種委陵菜ITS序列比較 見圖1。

      表1 樣品的采集地點和時間

      圖1 5種委陵菜ITS序列比較

      3 結(jié)論

      如圖1所示,委陵菜各種間ITS序列差異明顯,故ITS序列分析及其衍生的方法可以用于鑒別委陵菜。 本研究所采取委陵菜樣本本身ITS序列也存在有一定的差異,序列分析顯示可能是由于雜交所致。

      委陵菜種類繁多,僅吉林省內(nèi)就有10余種之多,所以本研究僅僅是一個開始,在今后的研究中需要擴大研究樣本的種類,蓄積更多的資料,只有這樣才能更準(zhǔn)確地對委陵菜各種間進行鑒別。

      [1]趙川,喬衛(wèi),張彥文,等.委陵菜抗糖尿病有效部位及有效成分的研究[J].中國中藥雜志.2008(33):680-682.

      [2]中華人民共和國藥典委員會.中國藥典[M].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2010:199.

      [3]楊婷,孫海峰,曹思思,等.10種委陵菜生藥學(xué)研究[J].時珍國醫(yī)國藥.2008(19):3039-3041.

      [4]Takaiwa F,Oono K,Sugiura M.Nucleotide sequence of the 17S-25S spacer region from rice rDNA[J].Plant Molecular Biology,1985(4):355-364.

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