王 東 , 宋 君 , 尹 全 , 陶 李 , 雷紹榮 ,劉 勇
(1.四川省農(nóng)業(yè)科學院分析測試中心,四川 成都 610066;2.農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗測試中心(成都),四川 成都 610066)
隨著近年生物技術(shù)的迅猛發(fā)展,大豆、玉米、棉花、油菜等100多個轉(zhuǎn)基因作物品種已經(jīng)商業(yè)化種植[1]。據(jù)不完全統(tǒng)計,由轉(zhuǎn)基因作物加工生產(chǎn)的轉(zhuǎn)基因食品約達4000種[2(]其中豆制品最多),包括部分食用油、醬油、番茄醬、薯條(片)、玉米片、漢堡包等。轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的食用安全問題,雖然一直受到世界各國政府和公眾的極大關(guān)注[3],但目前沒有科學證據(jù)表明食用轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品對身體有害。目前很多國家對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品實施標識管理,因此,轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測鑒定已成為各主要貿(mào)易國的一項重要工作[4]。
在轉(zhuǎn)基因成分檢測的DNA分離純化過程中,三氯甲烷和乙醇往往不能完全除盡而成為后期PCR反應的抑制劑。迄今,關(guān)于三氯甲烷和乙醇這2種有機試劑在轉(zhuǎn)基因食品安全檢測中的抑制作用未見報道。該文以抗除草劑(CP4-EPSPS)轉(zhuǎn)基因大豆(GTS40-3-2)為研究材料,模擬三氯甲烷和乙醇在反應體系中的殘留,探討這2種有機試劑的殘留量對Lectin基因擴增的影響。
抗除草劑(CP4-EPSPS)轉(zhuǎn)基因大豆GTS-40-3-2,購自歐盟標準物質(zhì)和計量研究所(institute for reference materials and measurements,IRRM)。
1.2.1 基因組DNA的分離純化
采用GB/T 19495.3-2004《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測核酸提取純化方法》附錄C中CTAB法提取DNA[5]。
1.2.2 Lectin基因擴增
采用GB/T 19495.4-2004《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測核酸定性PCR檢測方法》的引物和反應條件[6]。擴增轉(zhuǎn)基因大豆內(nèi)標基因Lectin引物序列,former:5′-GCCCTCTACTCCACCCCCATCC-3′,reverse:5′-GCCCATCTGCAAGCCTTTTTGTG-3′。擴增條件:預變性為95℃ 10 min,1個循環(huán);PCR反應為95℃20s,60℃ 40s,72℃ 40s,共 40 個循環(huán);延伸為 72℃3min。
1.2.3 三氯甲烷殘留的PCR反應體系
25 μL反應體系,各成分終濃度為2×Taq PCR Master Mix(Tiangen 公司)12.5 μL,上、下游引物0.4 μmol/L,DNA 模板 2 ng/μL,三氯甲烷摩爾濃度梯度見表1,最后補充滅菌超純水至總體積25 μL。
表1 三氯甲烷摩爾濃度梯度表
1.2.4 乙醇殘留的PCR反應體系
25 μL反應體系,各成分終濃度為2×Taq PCR Master Mix(Tiangen 公司)12.5 μL,上、下游引物0.4μmol/L,DNA 模板 2ng/μL,乙醇濃度梯度見表2,最后補充滅菌超純水至總體積25 μL。
表2 乙醇摩爾濃度梯度表
轉(zhuǎn)基因大豆GTS-40-3-2內(nèi)標基因Lectin的擴增實驗結(jié)果顯示,未加三氯甲烷時,內(nèi)標基因Lectin正常擴增,設置的空白對照正常,說明反應體系能正常工作,實驗條件無污染。在25 μL反應體系中,逐次增加三氯甲烷的含量,其PCR反應受到的抑制作用也相應增強,直至PCR反應完全受到抑制。電泳結(jié)果顯示如圖1所示,在25 μL反應體系中,三氯甲烷的含量在 1~5 μL(0.50~2.51 mol/L)時,條帶信號(亮度)逐漸減弱,但信號衰減不明顯,表明PCR對三氯甲烷的耐受性較強,三氯甲烷對PCR有一定的抑制作用,但并不明顯;當加入6~7μL(3.02~3.52 mol/L)三氯甲烷時,條帶信號(亮度)衰減明顯,說明PCR擴增反應在3.02~3.52 mol/L濃度范圍內(nèi)受到三氯甲烷明顯的抑制作用;在反應體系中,當三氯甲烷含量達到 7.5 μL(3.77 mol/L)時,PCR擴增反應被徹底抑制。
圖1 三氯甲烷對PCR反應的抑制作用
當未加乙醇時,設置的對照正常,說明轉(zhuǎn)基因大豆GTS-40-3-2內(nèi)標基因Lectin的擴增體系和實驗條件符合實驗要求。添加乙醇的實驗結(jié)果表明,乙醇對轉(zhuǎn)基因檢測的PCR反應有較強的抑制作用,其抑制程度隨乙醇濃度的增加而加大。在25μL反應體系中,當乙醇殘留量未超過1μL(0.70mol/L)時,與不含乙醇的對照反應體系相比,擴增產(chǎn)物的信號衰減不明顯,PCR反應受到的抑制作用較弱(圖2);當乙醇殘留量超過1μL(0.70mol/L)時,擴增產(chǎn)物的信號衰減明顯,PCR反應受到的抑制作用明顯增強;25 μL 反應體系中乙醇殘留量達到 2μL(1.39mol/L)時,PCR反應幾乎完全受到抑制;超過此濃度時,則PCR徹底被抑制。
圖2 乙醇對PCR反應的抑制作用
對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測主要是基于核酸的PCR檢測,轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的PCR檢測技術(shù)是國際認可的首選方法。基于常規(guī)PCR的轉(zhuǎn)基因成分檢測具有實驗流程長、中間步驟多、易污染等特點。雖然轉(zhuǎn)基因成分檢測技術(shù)發(fā)展較為成熟,但仍然存在很多問題,尤其是未商業(yè)化轉(zhuǎn)基因植物及產(chǎn)品的檢測以及轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品DNA的分離與純化,這2個問題已經(jīng)成為轉(zhuǎn)基因成分檢測的瓶頸。
目前已經(jīng)商業(yè)化生產(chǎn)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品種類多、數(shù)量大。轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品生產(chǎn)過程中,一般都要經(jīng)過若干道加工程序,原料的理化性質(zhì)發(fā)生很大變化,營養(yǎng)成分重新搭配同時引入了各種添加劑,在很大程度上增加了DNA分離與純化的難度。常用的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品DNA的分離與純化方法主要有酚-三氯甲烷法、PVP法、CTAB法、硅土法、胍-三氯甲烷法等,其中三氯甲烷和乙醇是常用的2種有機試劑。乙醇易溶于水,DNA是水溶性物質(zhì),在DNA抽提中乙醇不易完全揮發(fā),所以在轉(zhuǎn)基因成分檢測的后續(xù)PCR反應中往往殘留了一定量的乙醇。三氯甲烷幾乎不溶于水(25℃時,僅0.5%體積分數(shù)),但是由于在水相和有機相的分離、轉(zhuǎn)移過程中,DNA水溶液中往往混合了少量的三氯甲烷。高質(zhì)量(高濃度、高純度)的DNA是PCR反應正常工作的首要條件,不含或者低含量的乙醇和氯仿等有機試劑的DNA模板直接影響轉(zhuǎn)基因成分檢測的成敗。實驗結(jié)果表明:當反應體系中存在的三氯甲烷摩爾濃度≥3.77 mol/L時,則會徹底抑制PCR的進行;和三氯甲烷相比,乙醇對PCR的抑制作用非常大,當在體系中加入1.39 mol/L的乙醇,就能使大部分DNA聚合酶失活從而抑制PCR反應,降低擴增效率。因此,在轉(zhuǎn)基因食品DNA提取過程中,要特別注意轉(zhuǎn)移DNA水相時不要吸到有機相,以免給后續(xù)步驟殘留更多的有機試劑。在轉(zhuǎn)基因食品DNA提取過程中,應多次純化,最大限度地減少三氯甲烷等有機試劑在核酸中的殘留。由于乙醚具有較強的揮發(fā)性,所以在轉(zhuǎn)基因食品DNA純化中,為了徹底除去DNA水溶液中殘留的三氯甲烷等有機試劑,可以加入少量的乙醚幫助溶解三氯甲烷等有機試劑,最后揮發(fā)完全。在DNA提取中乙醇的完全去除也是很關(guān)鍵的一個環(huán)節(jié)。乙醇是DNA熱聚合酶(蛋白質(zhì))的變性劑,PCR反應體系中乙醇的殘留將會降低擴增反應效率或者抑制擴增反應,所以在DNA純化完畢后應盡可能去除乙醇。
對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測方法主要是以針對外源蛋白的蛋白質(zhì)檢測方法和以外源基因為對象的DNA檢測方法兩大類。因DNA檢測方法的準確性較高和適用范圍相對較大,所以在實際檢測工作中常用DNA檢測方法[7]。高質(zhì)量的DNA是保證轉(zhuǎn)基因檢測準確的關(guān)鍵和前提,因此,在DNA的分離和純化過程中,應盡量減少三氯甲烷和乙醇等有機試劑的殘留,最大可能地減少它們對PCR反應的抑制作用。
[1] 賈士榮.轉(zhuǎn)墓因作物的安全性爭論及其對策[J].生物技術(shù)通報,1999(6):1-7.
[2] James C.2002 Global review of commercialized transgenic crops[EB/OL].[2002-10-10].http://www.isaaa.org,2002.
[3] Office of Food Additive Safety.U.S.food and drug administration[EB/OL].[2002-10-10].http://www.fdacfsan/biotech-nology.
[4] 宋君,王東,劉勇,等.轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測技術(shù)標準存在的問題及建議[J].中國測試,2009,6(35):88-90.
[5] GB/T 19495.3—2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測核酸提取純化方法[S].北京:中國標準出版社,2004.
[6] GB/T 19495.4—2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測核酸定性PCR檢測方法[S].北京:中國標準出版社,2004.
[7] 邵碧英,陳文,江樹勛,等.轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測方法概述[J].生物技術(shù)通報,2004,5(15):516-518.