車(chē)凱　郭茂祖　劉曉燕　滕志霞

摘要： 植物抗性基因識(shí)別中的從頭預(yù)測(cè)方法可以看作機(jī)器學(xué)習(xí)中的分類(lèi)問(wèn)題。通常情況下，一個(gè)分類(lèi)器的訓(xùn)練需要正確標(biāo)記的正例和反例。然而，抗性基因識(shí)別中可用的信息僅有少數(shù)人工標(biāo)記的抗性基因，且不具有抗性功能的基因也不明確。為了消除由于正例太少和錯(cuò)誤的反例帶來(lái)的抗性基因識(shí)別的影響，基于抗性基因和其他基因在蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)中的距離，提出了一種新的樣本選擇方法，并對(duì)提出的樣本選擇方法和通常樣本選擇方法分別在四種分類(lèi)器上進(jìn)行了10倍交叉驗(yàn)證。結(jié)果表明，文中方法的SN值平均提高了6.9%，SP值平均提高了13.1%。因此，就敏感性和特異性而言，提出的方法獲得了更高效、更可靠的結(jié)果。

關(guān)鍵詞：

中圖分類(lèi)號(hào)：TP391文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：2095-2163（2012）04-0031-04