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      水稻OsDCL3b基因組織表達(dá)分析和沉默載體的構(gòu)建

      2012-04-29 09:07:53岳怡涵張健廖鵬飛李紹波
      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年24期
      關(guān)鍵詞:水稻基因

      岳怡涵 張健 廖鵬飛 李紹波

      摘要:采用熒光定量PCR方法分析了秈稻93-11根、莖、葉和花藥中OsDCL3b基因的表達(dá),發(fā)現(xiàn)水稻不同組織OsDCL3b的表達(dá)量存在明顯差異,花藥中表達(dá)量最多,根中表達(dá)量最少。重點(diǎn)構(gòu)建了水稻OsDCL3b基因的沉默載體,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化粳稻中花11,獲得了轉(zhuǎn)基因T0代陽性植株,為進(jìn)一步研究OsDCL3b基因的功能打下了基礎(chǔ)。

      關(guān)鍵詞:OsDCL3b基因;組織表達(dá);載體構(gòu)建;基因沉默;水稻

      中圖分類號(hào):Q943.2 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2012)24-5788-03

      Dicer或Dicer-like(DCL)蛋白通過產(chǎn)生siRNA(silencingRNA)和miRNA(microRNA)等小分子非編碼RNAs(non-codingRNAs,ncRNAs)[1]來調(diào)控其他相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)而影響真核生物的生長發(fā)育、抗病抗蟲性和逆境適應(yīng)性等[2-4]。

      在水稻中,已報(bào)道至少存在8個(gè)可能的DCL蛋白基因[5]。最初,Liu等[6,7]對OsDCL1和OsDCL4進(jìn)行了功能分析,發(fā)現(xiàn)OsDCL1與miRNA的生物形成密切相關(guān),缺失OsDCL1的生物個(gè)體在幼苗期出現(xiàn)發(fā)育停滯現(xiàn)象,如植株矮化、葉片卷曲、根扭曲等現(xiàn)象。OsDCL4主要影響大小為21nt的siRNA的生物形成,與擬南芥同源基因AtDCL4不同的是,沉默或缺失OsDCL4既影響生物個(gè)體的營養(yǎng)生長,又影響生物個(gè)體的生殖生長,而AtDCL4僅影響生物個(gè)體的營養(yǎng)生長。隨后,Urayama等[8]的研究表明,敲除OsDCL2的轉(zhuǎn)基因植株中內(nèi)源性dsRNA病毒的含量水平將明顯降低,植株表現(xiàn)為矮化和育性降低等。Wu等[9]證實(shí),OsDCL3a與lmiRNA(longmicroRNA)的產(chǎn)生密切相關(guān)。最近,Song等[10]進(jìn)一步報(bào)道了OsDCL4、OsDCL3b和OsDCL1的功能;其中OsDCL3b的功能為首次報(bào)道,報(bào)道中僅指出了OsDCL3b的直接生物學(xué)功能是加工產(chǎn)生大小為24nt的小RNA,但這些小RNA究竟調(diào)控哪些相關(guān)功能基因的表達(dá),以及相關(guān)功能基因的表達(dá)變化又如何影響轉(zhuǎn)基因植株的生長發(fā)育、抗病抗蟲性或逆境適應(yīng)性等尚未見報(bào)道。基于在秈稻93-11花藥中獲得的OsDCL3b的全長cDNA序列(GenBank登錄號(hào):DQ208406),采用熒光定量PCR方法研究了秈稻93-11不同組織部位OsDCL3b基因的表達(dá)差異,并利用RNA干擾技術(shù)構(gòu)建了OsDCL3b基因的沉默載體,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化粳稻中花11,獲得了轉(zhuǎn)基因T0代陽性植株,為進(jìn)一步研究OsDCL3b基因加工產(chǎn)生的各種小分子ncRNA究竟調(diào)控了哪些相關(guān)基因的表達(dá)、進(jìn)而影響轉(zhuǎn)基因植株的生長發(fā)育、抗病抗蟲性或逆境適應(yīng)性等打下了重要的基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 植物材料、菌種與質(zhì)粒 秈稻93-11和遺傳轉(zhuǎn)化所用材料粳稻中花11種子均由南昌大學(xué)生命科學(xué)與食品工程學(xué)院植物遺傳研究室保存。用于基因沉默的質(zhì)粒pYL為改造的RNAi-Ubi[11],由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)劉耀光教授惠贈(zèng)。大腸桿菌Top10F′、農(nóng)桿菌EHA105由南昌大學(xué)生命科學(xué)與食品工程學(xué)院植物遺傳研究室保存。

      1.1.2 主要試劑 DL2000DNAMarker、PCR反應(yīng)所用DNA聚合酶購自天根生化科技(北京)有限公司,質(zhì)粒小量提取試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司,植物RNA提取試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Invitrogen公司,T4DNA連接酶、限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、HindⅢ、MluⅠ和PstⅠ購自Fermentas公司,PCR引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

      1.2 方法

      1.2.1 總RNA的提取和正向干涉片段的RT-PCR擴(kuò)增 按Invitrogen公司的TRIzol試劑盒提取秈稻93-11花藥的總RNA后,將其反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再用引物OsDCL3b-Si:5′-AATTGGATCCTCTAGACTCGAGGGTAAAGG-3′和OsDCL3b-Xi:5′-CCGGAAG

      2 結(jié)果與分析

      2.1 OsDCL3b在秈稻93-11根、莖、葉和花藥中的表達(dá)結(jié)果

      2.2 沉默載體的構(gòu)建結(jié)果

      2.3 轉(zhuǎn)基因T0代陽性植株的鑒定結(jié)果

      3 討論

      前人的研究結(jié)果表明,粳稻OsDCL3b在營養(yǎng)組織中往往低水平表達(dá),在花器官和種子發(fā)育初期則高水平表達(dá)[5]。本研究結(jié)果進(jìn)一步顯示,秈稻OsDCL3b基因在秈稻93-11的花藥中表達(dá)量最高,在其他組織中表達(dá)量均較低,尤其是在根中的表達(dá)量幾乎只有花藥中的50%。由此推測,OsDCL3b基因在水稻花藥中高水平表達(dá)可能是水稻穗子的生長發(fā)育所必需的,但有待于進(jìn)一步試驗(yàn)證實(shí)。

      最近,Song等[10]首次報(bào)道了OsDCL3b的直接生物學(xué)功能是加工產(chǎn)生24nt的?。遥危?,但是,這些?。遥危辆唧w調(diào)控了哪些相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)而可能會(huì)導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因植株出現(xiàn)哪些差異表型等尚未見報(bào)道。研究獲得的轉(zhuǎn)基因T0代陽性植株為進(jìn)一步研究OsDCL3b基因的功能打下了重要基礎(chǔ)。

      參考文獻(xiàn):

      [1]XIEZ,JOHANSENLK,GUSTFSONAM,etal.GeneticandfunctionaldiversificationofsmallRNApathwaysinplants[J].PLoSBiol,2004,2(5):642-652.

      [2]BERNSTEINE,CAUDYA,HANNONG,etal.RoleforabidentateribonucleaseintheinitiationstepofRNAinterference[J].Nature,2001,409(6818):363-365.

      [3]LEEYS,NAKAHARAK,PHYAMJW,etal.DistinctrolesforDrosophiladicer-1anddicer-2inthesiRNA/miRNAsilencingpathways[J].Cell,2004,117(1):69-81.

      [4]MARGISAR,FUSAROAAF,SMITHANA,etal.Theevolutionanddiversificationofdicersinplants[J].FEBSLetter,2006,580(10):2442-2450.

      [5]KAPOORM,ARORAR,LAMAT,etal.Genome-wideidentification,organizationandphylogeneticanalysisofDicer-like,ArgonauteandRNA-dependentRNApolymerasegenefamiliesandtheirexpressionanalysisduringreproductivedevelopmentandstressinrice[J].BMCGenomics,2008,9(1):451.

      [6]LIUB,LIPC,LIX,etal.LossoffunctionofOsDCL1affectsmicroRNAaccumulationandcausesdevelopmentaldefectsinrice[J].PlantPhysiol,2005,139(1):296-305.

      [7]LIUB,CHENZY,SONGXW,etal.OryzasativaDicer-like4revealsakeyroleforsmallinterferingRNAsilencinginplantdevelopment[J].PlantCell,2007,19(9):2705-2718.

      [8]URAYAMAS,MORIYAMAH,AOKIN,etal.Knock-downofOsDCL2inricenegativelyaffectsmaintenanceoftheendogenousdsRNAvirus,Oryzasativaendornavirus[J].PlantCellPhysiol,2010,51(1):58-67.

      [9]WUL,ZHOUH,ZHANGQ,etal.DNAmethylationmediatedbyamicroRNApathway[J].MolCell,2010,38(3):465-475.

      [10]SONGX,LIP,ZHAIJ,etal.RolesofDCL4andDCL3binricephasedsmallRNAbiogenesis[J].PlantJ,2011,69(3):462-474.

      [11]胡旭霞,劉耀光.植物RNA干涉載體的構(gòu)建及其在水稻基因表達(dá)沉默中的應(yīng)用[J].分子植物育種,2006,4(5):621-626.

      [12]韋靖鸞,陳 深,曾列先,等.水稻白葉枯病抗性基因Xa7候選基因的實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)分析[J].分子植物育種,2011,9(1):9-16.

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