張如華,徐雙兵,武遠眾,康鐵邦
(華南腫瘤學國家重點實驗室∥中山大學腫瘤防治中心實驗研究部,廣東 廣州 510060)
細胞周期是一個復雜的過程,其精確調(diào)控是維持基因組穩(wěn)定性以及細胞正常功能的必要條件[1]。已有研究表明很多種調(diào)節(jié)蛋白參與調(diào)控細胞周期的進程,包括cyclins(細胞周期素),CDKs(Cyclin-dependent kinase 周期素依賴性激酶)以及 CDK 抑制分子[2,3]。為確保細胞周期正常運行,細胞內(nèi)自發(fā)形成了許多的調(diào)控機制。細胞周期檢測點就是其中重要的一種調(diào)控機制,如果其激活缺陷就會導致細胞周期的紊亂,從而有可能導致腫瘤的發(fā)生[4]。
hSSB1是最近發(fā)現(xiàn)的一種單鏈DNA結(jié)合蛋白,是參與調(diào)控細胞周期檢測點的一個重要分子[5]。缺失hSSB1的細胞表現(xiàn)為細胞檢測點的激活缺陷,放射敏感性增加以及基因組的不穩(wěn)定性[5]。本課題組前期研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)hSSB1可以和p21相互作用從而調(diào)控細胞周期檢測點的運行,而且hSSB1在人類肝癌組織中呈高表達[6],但其高表達后對腫瘤生物學行為的影響目前并不清楚。在本研究中,擬構(gòu)建hSSB1高表達的逆轉(zhuǎn)錄病毒載體pBABE-hSSB1,并進行高表達穩(wěn)定株的篩選,為進一步研究hSSB1的功能奠定基礎(chǔ)。
HeLa,HepG2和HEK293T細胞由中山大學腫瘤防治中心保存。pBABE-puro逆轉(zhuǎn)錄病毒載體(含有嘌呤霉素抗性基因)為中山大學公共衛(wèi)生學院陳雯教授饋贈。PIK病毒包裝質(zhì)粒由中山大學腫瘤防治中心曾木圣教授饋贈。BamH I、SalI內(nèi)切酶以及逆轉(zhuǎn)錄試劑盒均為MBI Fermentas公司產(chǎn)品,T4 DNA Ligase購自Takara公司,質(zhì)粒小提試劑盒和切膠回收試劑盒均購自Qiagen公司,2×Taq PCR MasterMix 購自北京天根公司。Trizol試劑和脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000購自Invitrogen公司。兔抗人hSSB1多克隆抗體為Bethyl公司產(chǎn)品,鼠抗人HSP70 抗體購自Santa Curz 公司,感受態(tài)細胞DH5α以及HRP羊抗兔和鼠二抗均購自北京鼎國生物技術(shù)有限公司。Polybrene和puromycin均購自Sigma公司。
1.2.1 HeLa細胞總RNA 的提取 按照Trizol 試劑說明書步驟提取總RNA。收集所培養(yǎng)的HeLa細胞,6孔板中每孔加入1 mL Trizol 試劑,室溫靜置5 min。加入氯仿0.2 mL,充分混勻,室溫靜置2~3 min 后,4 ℃ 12 000 r/min離心15 min。將上清轉(zhuǎn)移到一個新的無RNA酶的EP管中,加入500 μL的異丙醇,充分混勻,室溫靜置10 min。4 ℃,12 000 r/min離心10 min。棄上清,加入φ=75%乙醇1 mL,4 ℃ 7 500 r/min 離心5 min。棄上清,室溫干燥5~10 min,加入20 μL DEPC 處理水,58 ℃水浴10 min,得到的RNA保存于- 80 ℃。
1.2.2 引物設(shè)計 根據(jù)GenBank 的基因序列(NM_024068),設(shè)計擴增hSSB1編碼區(qū)cDNA上、下游引物。上、下游引物中分別引入BamHI、SalI酶切位點。GAPDH引物序列同前[7]。所有引物均由Invitrogen公司合成。引物序列見表1。
表1 擴增基因所需的引物
1.2.3 逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR) RNA用分光光度計測濃度后行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),選用MBI Fermentas 公司的RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit.按試劑說明書操作。合成的cDNA置于-20 ℃保存。取 1.5 μL cDNA進行PCR 反應(yīng),反應(yīng)條件:94 ℃預變性5 min; 94℃變性30 s,58 ℃退火30 s, 72 ℃延伸1 min,共30個循環(huán)。再于72 ℃ 延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)w=2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,然后切膠回收。膠回收根據(jù)Qiagen公司的膠回收試劑盒說明書進行。
1.2.4 pBABE-hSSB1重組逆轉(zhuǎn)錄病毒載體構(gòu)建
1)目的基因片段和載體雙酶切:用BamH I、SalI酶分別雙酶切回收的hSSB1目的片段以及載體pBABE,37 ℃酶切30 min。
2)切膠回收:雙酶切后的產(chǎn)物經(jīng)切膠回收,按試劑說明書操作。
3)目的片段與pBABE表達載體的連接:將回收的目的基因hSSB1片段以及載體pBABE在T4 DNA 連接酶作用下連接,16 ℃水浴反應(yīng)過夜。
4)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化: 各取5 μL過夜連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞DH5α,分別涂布于含氨芐抗性的LB 平板上,37 ℃恒溫箱培養(yǎng)過夜。從每個培養(yǎng)皿上各挑取3個單克隆菌落接種于6 mL 含氨芐抗性的LB 培養(yǎng)液中,37 ℃恒溫搖床培養(yǎng)過夜。
5)質(zhì)粒提取與酶切鑒定:按照質(zhì)粒小提試劑盒說明書提取質(zhì)粒,并分別用BamHI、SalI酶做酶切鑒定,同時也做PCR擴增驗證。酶切產(chǎn)物和PCR產(chǎn)物行w=1.5% 瓊脂糖凝膠電泳。
6)測序鑒定:將酶切及PCR擴增鑒定正確的克隆送Invitrogen公司測序分析。
1.2.5 制備病毒上清液 轉(zhuǎn)染前1 d,10 cm平皿鋪板HEK293T包裝細胞,待細胞密度達到30%~50%左右時進行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染對照載體pBABE-vector或pBABE-hSSB1和病毒包裝質(zhì)粒PIK,操作按Lipofectamine2000說明書進行。轉(zhuǎn)染后將細胞置于37 ℃,φ=5% 的CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),48 h后,收集病毒上清液,用0.45 μm過濾器過濾病毒上清,-80 ℃保存。
1.2.6 穩(wěn)定細胞株的建立 鋪板HeLa和HepG2細胞于6孔板中,培養(yǎng)過夜。待細胞密度達到50%時開始感染病毒。每孔加入2 mL病毒液(含8 μg/mL polybrene),37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。4 h后換另外2 mL病毒液繼續(xù)感染細胞。再過4 h后,棄去病毒液,換正常培養(yǎng)基過夜。感染24 h后,用puromycin(0.8 μg/mL)篩選5 d后,收集細胞提取蛋白,Western blot檢測目的蛋白表達。
1.2.7 Western blotting 檢測 收集HeLa和HepG2對照組和轉(zhuǎn)染組細胞,提取蛋白,用Bradford法測定蛋白濃度并定量,用w=10% 聚丙烯酰胺凝膠進行電泳,電泳結(jié)束后轉(zhuǎn)膜200 mA,2 h,用含w=5% 脫脂奶粉的TBST 室溫封閉1 h,孵育hSSB1一抗(1∶2 000)和HSP70(1∶1 000)4 ℃過夜;TBST 洗滌3次,每次10 min,加入辣根過氧化物酶標記的二抗,室溫孵育1.5 h;TBST 洗滌同前,X光片壓片,顯影、定影。
從HeLa細胞中提取RNA,經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄后得到其cDNA。以該cDNA為模板,經(jīng)RT-PCR 擴增出目的基因hSSB1和GAPDH基因的條帶。擴增產(chǎn)物電泳結(jié)果可見在300 bp左右的條帶(圖1),為GAPDH的擴增條帶,說明所抽提的RNA是完整的。同樣在500~750 bp處也有一特異性擴增條帶(圖1),與預期擴增的hSSB1片段大小相符。
將PCR擴增的目的基因片段用BamHI、SalI雙酶切后與同樣經(jīng)雙酶切的逆轉(zhuǎn)錄病毒載體pBABE-puro連接,連接產(chǎn)物經(jīng)轉(zhuǎn)化后挑菌,并提取質(zhì)粒。重組質(zhì)粒經(jīng)雙酶切鑒定,瓊脂糖凝膠電泳顯示得到了約650 bp 的目的片段和約5 100 bp的載體片段(圖2中第2泳道)。同時將得到的重組質(zhì)粒進行PCR擴增,可得到很明顯的目的條帶(圖2中第3泳道)。說明得到的陽性克隆質(zhì)粒是正確的。
圖1 RT-PCR 擴增獲得的hSSB1編碼區(qū)的電泳結(jié)果
圖2 重組質(zhì)粒經(jīng)BamHI、SalI酶切及PCR擴增后的電泳結(jié)果
將酶切和PCR鑒定正確的質(zhì)粒送去Invitrogen公司測序,測序結(jié)果表明克隆的hSSB1片段已成功插入pBABE中的指定位點,而且閱讀框架也正確無誤,其序列與基因文庫中完全一致,未見有堿基突變(圖3,框示為hSSB1的起始密碼子)。
將包裝好的pBABE-hSSB1和對照病毒液感染人腫瘤細胞系HeLa和HepG2細胞,經(jīng)嘌呤霉素(0.8 μg/mL)篩選后,得到了穩(wěn)定表達目的蛋白的陽性細胞株。篩選后的細胞提取蛋白做Western blotting鑒定。結(jié)果表明:hSSB1轉(zhuǎn)染的HeLa 和HepG2細胞中均可見到hSSB1特異性條帶,且hSSB1的表達明顯高于對照組(圖4)。證實穩(wěn)定篩選得到的HeLa和HepG2細胞株中有hSSB1蛋白的持續(xù)高表達。
圖3 pBABE-hSSB1的測序結(jié)果:框中所示為hSSB1的起始密碼子
圖4 Western blotting 檢測 hSSB1基因表達情況
hSSB1是一編碼211個氨基酸殘基,相對分子質(zhì)量為33 000 的新蛋白質(zhì)[5]。已有研究發(fā)現(xiàn)hSSB1可以招募MRN復合物到雙鏈DNA斷裂位點,激活ATM所依賴性的信號通路[8]。此外,hSSB1還可以和MRN復合物中的NBS1直接結(jié)合,從而增強MRN復合物的核酶內(nèi)切酶活性[9]。運用串聯(lián)親和純化的方法篩選出了一個與hSSB1相互作用的蛋白INTS3,進一步的研究發(fā)現(xiàn)INTS3可以通過調(diào)控hSSB1從而參與DNA損傷反應(yīng)[10-13]。因此hSSB1在DNA損傷應(yīng)答中發(fā)揮著重要的功能。
逆轉(zhuǎn)錄病毒載體能有效地將外源基因整合進宿主細胞基因組并可以穩(wěn)定表達外源基因,而且其病毒包裝過程簡單,因此成為構(gòu)建穩(wěn)定表達株最常用載體之一。在本實驗中我們將hSSB1基因構(gòu)建在逆轉(zhuǎn)錄病毒載體pBABE-puro,經(jīng)限制性核酸內(nèi)切酶酶切和PCR鑒定以及測序證實目的基因hSSB1序列正確,成功構(gòu)建了重組子pBABE-hSSB1。然后將所構(gòu)建的含hSSB1基因的重組質(zhì)粒以及對照質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到HeLa和HepG2 細胞,并用嘌呤霉素篩選穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細胞株。由于逆轉(zhuǎn)錄病毒載體pBABE-puro上含有嘌呤霉素抗性基因,加入嘌呤霉素后陽性克隆細胞才會存活,通過進一步擴大培養(yǎng),篩選出穩(wěn)定表達株。為了鑒定hSSB1基因是否已經(jīng)轉(zhuǎn)染到HeLa和HepG2 細胞中,我們通過western blot的方法檢測轉(zhuǎn)染對照質(zhì)粒和pBABE-hSSB1的細胞中hSSB1蛋白的表達,結(jié)果發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染了hSSB1基因的HeLa和HepG2細胞中,其hSSB1目的條帶比轉(zhuǎn)染了對照質(zhì)粒的細胞在蛋白水平表達量均明顯增加,表明hSSB1基因已經(jīng)轉(zhuǎn)染到HeLa和HepG2 細胞中并且有此蛋白的過量表達。本實驗中我們成功構(gòu)建hSSB1高表達的病毒載體,為今后進一步研究hSSB1的生物學功能奠定了良好的實驗基礎(chǔ)。
參考文獻:
[1]NAKANISHI M,SHIMADA M,NIIDA H.Genetic instability in cancer cells by impaired cell cycle checkpoints [J].Cancer Sci,2006,97(10): 984-989.
[2]FISHER R P.CDKs and cyclins in transition(s)[J].Curr Opin Genet Dev,1997,7(1): 32-38.
[3]SHERR C J,ROBERTS J M.CDK inhibitors: positive and negative regulators of G1-phase progression [J].Genes Dev,1999,13(12): 1501-1512.
[4]HARTWELL L H,KASTAN M B.Cell cycle control and cancer [J].Science,1994,266(5192):1821-1828.
[5]RICHARD D J,BOLDERSON E,CUBEDDU L,et al.Single-stranded DNA-binding protein hSSB1 is critical for genomic stability [J].Nature,2008,453(7195): 677-681.
[6]XU S,FENG Z,ZHANG M,et al.hSSB1 binds and protects p21 from ubiquitin-mediated degradation and positively correlates with p21 in human hepatocellular carcinomas [J].Oncogene,2011,30(19): 2219-2229.
[7]LIU X H,XU S B,YUAN J,et al.Defective interleukin-4/Stat6 activity correlates with increased constitutive expression of negative regulators SOCS-3,SOCS-7,and CISH in colon cancer cells [J].J Interferon Cytokine Res,2009,29(12): 809-816.
[8]RICHARD D J,SAVAGE K,BOLDERSON E,et al.hSSB1 rapidly binds at the sites of DNA double-strand breaks and is required for the efficient recruitment of the MRN complex [J].Nucleic Acids Res,2011,39(5):1692-1702.
[9]RICHARD D J,CUBEDDU L,URQUHART A J,et al.hSSB1 interacts directly with the MRN complex stimulating its recruitment to DNA double-strand breaks and its endo-nuclease activity [J].Nucleic Acids Res,2011,39(9): 3643-3651.
[10]HUANG J,GONG Z,GHOSAL G,et al.SOSS complexes participate in the maintenance of genomic stability[J].Mol Cell,2009,35(3): 384-393.
[11]LI Y,BOLDERSON E,KUMAR R,et al.HSSB1 and hSSB2 form similar multiprotein complexes that participate in DNA damage response [J].J Biol Chem,2009,284(35): 23525-23531.
[12]SKAAR J R,RICHARD D J,SARAF A,et al.INTS3 controls the hSSB1-mediated DNA damage response [J].J Cell Biol,2009,187(1): 25-32.
[13]ZHANG F,WU J,YU X.Integrator3,a partner of single-stranded DNA-binding protein 1,participates in the DNA damage response [J].J Biol Chem,2009,284(44): 30408-30415.