接中國科學技術信息研究所通知，經(jīng)中國精品科技期刊遴選指標體系綜合評價，《生態(tài)環(huán)境學報》2011年被評選為中國精品科技期刊。這一屆中國精品科技期刊評選300種。

目前，《生態(tài)環(huán)境學報》的各項學術質(zhì)量指標都較高。據(jù)中國科學技術信息研究所2012年12月發(fā)布的《2012版中國期刊引證報告（核心版）》，《生態(tài)環(huán)境學報》2011年的核心總被引頻次為3018次，核心影響因子0.845，核心他引率0.92，基金論文比0.95（即95%）。被引頻次、影響因子、綜合評價總分在環(huán)境科學技術、安全科學技術類37種核心期刊中分別列第5、第11和第6位，在全國1998種核心期刊中分別列第106、第179和120位。該引證報告指出，根據(jù)綜合評價指標的設計原理，綜合評價總分已經(jīng)屏蔽了各個學科之間總體指標背景值的差異，可以進行跨學科比較。

另據(jù)中國知網(wǎng)、中國科學文獻計量評價中心2012年11月發(fā)布的《中國學術期刊影響因子年報》（自然科學與工程技術·2012版），《生態(tài)環(huán)境學報》2011年的總被引頻次為7676次，影響因子1.715，他引影響因子1.573，基金論文比0.97（即97%），該年在中國知網(wǎng)的全篇下載量為21.97萬次。