黃 智,王發(fā)左,張 偲*
中國科學(xué)院南海海洋研究所中國科學(xué)院海洋生物資源可持續(xù)利用重點實驗室中國科學(xué)院海洋微生物研究中心廣東省海洋藥物重點實驗室,廣州 510301;2中國科學(xué)院研究生院,北京 100049
特殊的生態(tài)環(huán)境造就了特殊的生物,特殊的生物往往孕育著特殊的化學(xué)結(jié)構(gòu)和特異的生物活性。目前從陸地微生物資源中尋找具有良好生物活性和結(jié)構(gòu)新穎代謝產(chǎn)物的概率越來越低,海洋微生物作為新興的生物資源,具有極大的吸引力[1]。作為海洋微生物中的重要類群,海洋真菌具有代謝產(chǎn)物結(jié)構(gòu)與活性豐富多樣、“創(chuàng)新指數(shù)”高、產(chǎn)量大等特點,已經(jīng)成為海洋微生物次生代謝產(chǎn)物研究的熱點[1,2]。據(jù) Rateb 等統(tǒng)計,僅 2006-2010 年來自海洋真菌新化合物的數(shù)量就達到690個,但其中海洋沉積環(huán)境來源的僅占16%[3]。作為地球上最大面積的覆蓋層,海洋沉積環(huán)境是富含化學(xué)物質(zhì)和微生物的特殊生態(tài)環(huán)境,從海岸帶、近海至深海蘊育著高度多樣的微生物物種、基因、生理生化和生態(tài)功能物質(zhì)[4,5]。海岸帶是陸地向海洋過渡的生態(tài)系,如海灘和紅樹林沉積物,受周期行潮水侵淹,光照良好,氧氣充足,適合微生物生長;近海作為大陸架的水下延伸,由于大量的外部徑流搬運和海蝕作用,沉積物來源豐富,微生物的種類繁多;在低于1000 m的深海區(qū)域,覆蓋了50%以上的地球表層,是一個永久高壓、低溫、寡營養(yǎng)和無光照的環(huán)境,生活在這種極端環(huán)境下的深海微生物必然有其特殊的代謝機制和獨特的代謝產(chǎn)物[6,7]。
目前,海洋沉積環(huán)境來源的真菌次生代謝產(chǎn)物的研究多集中于海岸帶和近海,深海研究相對較少。海洋沉積環(huán)境來源真菌的化學(xué)結(jié)構(gòu)出新率高,抗菌、抗腫瘤等生物活性顯著,具有潛在應(yīng)用價值,是開發(fā)新抗菌、抗腫瘤等藥物的新興資源[2,3,8,9]。本文收集了1995~2011年間200個海洋沉積環(huán)境來源真菌的次生代謝產(chǎn)物,包括物堿類(86個)、萜類(42個)、聚酮類(42個)、肽類(15個)、甾體類(5個)、腦苷脂類(4個)和其他類(6個),分布于真菌的16個屬中。
1.1.1 生物堿類
1995年,KAKEYA從日本內(nèi)浦灣海底沉積物來源真菌Penicillium sp.中分離到能促進神經(jīng)細胞神經(jīng)突生長作用的化合物Epolactaene(1),這是首次從微生物中得到對人類成神經(jīng)細胞瘤細胞的軸突生長有效的化合物的報道。最近研究顯示它還能有效抑制哺乳動物DNA聚合酶和DNA拓撲異構(gòu)酶Ⅱ[10-12]。Du等從5080 m深海沉積物中分離到真菌Penicillium sp.,經(jīng)培養(yǎng)后得到四個生物堿類化合物Meleagrins B、C(2、3)和 Roquefortines F、G(4、5),其中 meleagrins B(2)對 A-549、HL-60、BEL-7402 和MOLT-4細胞株表現(xiàn)出較強的細胞毒活性,IC50值分別為 2.7、6.7、1.8 和 2.9 μM[13]。
化合物6~8分離自真菌Penicillium sp.(南極Prydz灣海泥)[14]?;衔?ShearinineD-F(9 ~11)是從真菌Penicillium janthinellum(海底沉積物)中分離到,在濃度小于200 μM時這三個化合物對小鼠表皮JB6 P+Cl41細胞株沒有毒活性,但Shearinine E能有效抑制表皮生長因子(EGF)介導(dǎo)的小鼠表皮JB6 P+Cl41細胞惡性轉(zhuǎn)化。此外,研究還發(fā)現(xiàn)Shearinine D(9)、E(10)對白血病細胞株HL-60具有一定的抑制作用,濃度為100 μM時,抑制率分別為39% 和 34%[15,16]。喹諾酮化合物 Penicillazine(12)分離自真菌 Penicillium sp.(香港海灘)[17]。Zhou等從真菌 Penicillium griseofulvum(深海沉積物)中分離到四個化合物(13~16),其中前三個表現(xiàn)出微弱的抗細胞增殖活性,IC50值分別為135、120和 91 μM[18]。
1.1.2 萜類
Acetophthalidin(17)是從真菌Penicillium sp.分離到的單萜類化合物,在濃度6.25 μgmL-1時,能夠有效阻斷tsFT210細胞進入M期進行有絲分裂[19]。倍半萜類化合物18~22是從南極Prydz灣海泥來源真菌Penicillium sp.中分離到,其中化合物18顯示出良好的細胞毒活性,對HL-60、A-549細胞株的IC50值為11.8和12.2 μM,另外化合物19、20對 A-549 細胞株的 IC50值為 59.7 和 82.8 μM[14]?;衔?3~28分離自Penicillium sp.(白令海峽海泥),對HL-60、A-549、P-388和BEL-740細胞株具有不同程度的生長抑制作用,其中具有環(huán)氧結(jié)構(gòu)的化合物24、25和27對4種細胞株的細胞毒活性(IC50值介于0.065~11.8 μM)明顯強于無環(huán)氧結(jié)構(gòu)的化合物23、26和28,這說明環(huán)氧結(jié)構(gòu)是發(fā)揮其藥效的主要功能基團,進一步分析發(fā)現(xiàn)帶乙?;沫h(huán)氧化合物24活性最強,對四種上述細胞株的IC50值分別為0.065、0.096、0.073 和 4.59 μM,證明乙?;拇嬖谠鰪娖浼毎净钚裕?0]。
2009年,Du等上述同一株深海沉積物真菌Penicillium sp.中分離到六個萜類化合物Conidiogenones B-G(29~34),這些化合物對四種腫瘤細胞株A-549、HL-60、BEL-7402和 MOLT-4具有一定強度的細胞毒活性作用,其中Conidiogenones C(30)對HL-60和BEL-7402細胞株的IC50值達0.038和0.97 μM[13,21]。同年,Breviane spiroditerpenoid 類衍生物Breviones F-H(35~37)首次被報道從深海極端環(huán)境真菌Penicillium sp.中分離到,這些化合物對HeLa細胞株具有中等程度抑制作用,此外,Brevione F(35)還能有效抑制HIV1在C8166細胞株中增殖[22]。林等從南極Prydz灣海泥 Penicillium sp.中分離出10個化合物(38~47),其中化合物44對A-549細胞株的毒活性實驗顯示 IC50值為5.2 μM[14]。
1.1.3 聚酮類
聚酮類化合物48、49是由兩株青霉真菌(日本Fiji/Matuka深海沉積物)混合培養(yǎng)得到,化合物48能選擇性地抑制白血病細胞,另外對人乳腺癌細胞株 MDA-MB-435 的 IC50值為 2.9 μgmL-1[23]。Penicillones A和B(50、51)是兩個分離自Penicillium terrestre(青島膠州灣沉積物)的新聚酮類化合物,MTT法評價其對A-549和P-388細胞株的毒活性結(jié)果顯示這兩個化合物都具有弱細胞毒活性[24,25]。龍膽醇二聚體化合物52~58和龍膽醇三聚體化合物59分離自真菌Penicillium terrestre,微生物來源的龍膽醇及其衍生物大多是單體的,而二聚體和三聚體的衍生物是非常罕見的?;衔?2~59對HL-60、BEL-7402、A-549和MOLT-4四種癌細胞株都具有不同程度的抑制作用,其中化合物56對這四種癌細胞的抑制活性較強。此外,在濃度為10 μM時化合物56對酪氨酸激酶KDR和Src具有一定強度的抑制作用,抑制率分別為31.8%和35.9%[26]。
1.1.4 肽類和其他類
對來源于南極Prydz灣海泥的青霉菌Penicillium sp.的研究,從中分離得到了一個環(huán)狀苯丙氨酸-酪氨酸縮合肽60和一個苯并呋喃類化合物61[14]。
1.2.1 生物堿類
Spicaria elegans是從青島膠州灣海底沉積物分離得到的一株真菌,Liu等通過靜置培養(yǎng)的的方式從中分離到了12元環(huán)細胞松弛素Cytochalasins Z7-Z9、E、K(62~66),化合物62~64對 P-388和 A-549細胞株有毒活性作用,IC50值為 8.8、21.0、8.7 μM,其結(jié)構(gòu)中C-6/C-7位是主要的藥效基團,其他基團變化對其活性的影響較?。?7]。2008年,liu等又發(fā)表該真菌來源的7個細胞松弛素(67~73),其中Cytochalasins Z10-Z15(67~72)具有開環(huán)型結(jié)構(gòu),化合物67和68對A-549細胞株的IC50值分別為9.6和 4.3 μM[28]。
隨后該研究小組人員通過發(fā)酵調(diào)控的方式對該株真菌開展了系列的化學(xué)多樣性和活性研究。2009年,Lin等將真菌Spicaria elegans發(fā)酵方式由靜置培養(yǎng)改變成搖瓶培養(yǎng),從中分離到另一類細胞松弛素化合物74~83,其中化合物Spicochalasin A(76)具有獨特的五元環(huán)體系,對人類白血病HL-60細胞株有中等程度的細胞毒活性,IC50值為19.9 μM?;衔顰spochalasin D(82)對腫瘤細胞株BEL-7402的IC50值達 2.3 μM[29、30]。2010 年,Lin 又從通過延長培養(yǎng)時間(14 d)的方式,從中發(fā)現(xiàn)了新化合物Aspochalsins(R-T)(84~86),研究顯示延長培養(yǎng)時間可以促進代謝產(chǎn)物的氧化還原反應(yīng),進而產(chǎn)生更多的衍生物[31]。2011年,Wang等采用高鹽度培養(yǎng)方法,在10%的鹽度培養(yǎng)條件下從真菌Spicaria elegans中分離到4個生物堿類化合物87~90,這四個化合物都表現(xiàn)出中等強度的抗菌活性,在低鹽度培養(yǎng)時該菌株沒有產(chǎn)生化合物87和90[32]。同年,該團隊的Wang等通過在培養(yǎng)基中加入L和D型色氨酸,從該真菌中分離到6個松胞菌素91~96,其中化合物91、92和95對A-549細胞株的IC50值分別為 8.2、20.0、3.1 μM[33]。以上研究也表明,通過簡單發(fā)酵調(diào)控方式是可以有效地拓展海洋真菌化學(xué)多樣性,在一定程度上達到深入可持續(xù)利用菌株資源的目的。
1.2.2 聚酮類
聚酮類化合物97、98也是上述真菌Spicaria elegans中分離到,這兩個化合物都具有抗菌活性,其中化合物97對細菌Pseudomonas aeruginosa和Escherichia coli的 MIC 值為0.038 和0.767 mM[32]。
1.3.1 生物堿類
化合物Cottoquinazoline A(99)分離自真菌Aspergillus versicolor(澳大利亞科特斯魯沙灘)[34]。Zhang等從真菌Aspergillus carbonarius(廣西潿洲島海底沉積物)分離到 Carbonarones A和 B(100~101),這兩個化合物對K-562細胞株顯示出中等的細胞毒活性,IC50值分別為 56.0、27.8 μgmL-1[35]。二硫化合物 Acetylaranotin、Acetylapoaranotin、Deoxyapoaranotin(102~104)分離自真菌Aspergillus sp.(韓國東海沉積物),研究顯示這三個化合物在濃度分別為20、10和50 μM時能誘導(dǎo)HCT116細胞株凋亡速度加快1.93、3.85和3.50倍[36]。化合物105~106分離自真菌 Aspergillus caronarius(廣西潿洲島),這兩個化合物都表現(xiàn)出中等的細胞毒活性,對K-562細胞株的EC50值分別為244.54和121.39 μM[21,35]。Cui等從真菌 Aspergillus fumigatus(深海沉積物)分離到系列二酮哌嗪化合物107~119,這些化合物都具有細胞周期抑制活性,其中Tryprostatin A(107)能破壞微導(dǎo)管紡錘體抑制微導(dǎo)管的組裝,在濃度分別為50和12.5 μgmL-1時Tryprostatins A、B(107~108)都能使小鼠tsFT210細胞在G2/M時期完全被阻斷,化合物109~113抑制該細胞在M期的 MIC 值分別0.45、4.1、60.8、26.1 和12.2 μM,另外化合物Spirotryprostatins A-B(114~115)和Cyclotryprostatins A-D(116~119)抑制該細胞在G2/M時期的 IC50值分別為 197.5、14.0、5.6、19.5、23.4、25.3 μM[37-39]。
1.3.2 聚酮類
2009年,Lu等從真菌Aspergillus ustus(海南文昌紅樹林木欖植物根系土壤)中分離到6個苯并呋喃衍生物120~125,其中化合物124對HL-60細胞株有較強的抑制作用,IC50值達 0.13 μM[40]?;衔顰spergiolide A(126)能選擇性地抑制A-549、HL-60、BEL-7402和P-388腫瘤細胞株,其IC50值分別為0.13、0.28、7.5、35.0 μM,在體內(nèi)試驗顯示該化合物能有效抑制大鼠腫瘤細胞生長[21]。系列聚酮化合物127~134分離自真菌Aspergillus glaucus(海洋沉積物),化合物127對A-549和HL-60細胞株表現(xiàn)出很強的細胞毒活性,其IC50值分別為0.24和0.51 mM,從結(jié)構(gòu)分析化合物127是因為8位羥基的甲基化導(dǎo)致細胞毒活性增強。另外,化合物133和順式異構(gòu)體134對A-549和HL-60細胞株都表現(xiàn)出中等的細胞毒活性,說明10位的立體異構(gòu)對細胞毒活性基本沒有影響[41]。
1.3.3 肽類
2009年,F(xiàn)remlin等從真菌 Aspergillus versicolor(澳大利亞科特斯魯海灘)中分離到兩個環(huán)五肽類化合物 Cotteslosins A 和 B(135和136)[34]。
1.4.1 生物堿類
2007年,孫等從連云港海域真菌 Trichoderma reesei分離到兩個生物堿化合物:3、6-二芐基哌嗪-2、5-二酮(137)和 3-芐基-8-羥基吡咯并哌嗪-2、5-二酮(138)[42]?;衔?39分離自南海紅樹林角果木植物根系土壤真菌 Trichoderma atroviride[43]。
1.4.2 聚酮類
Trichodermatides A-D(140~143)是Sun等從連云港潮間帶海泥真菌Trichoderma reesei中分離到的聚酮類化合物,對人黑色素瘤細胞A375-S2的IC50值分別為 102.2、187.3、38.8 和 222.0 μgmL-1[44]。環(huán)狀戊烯酮類化合物Trichoderone(144)具有選擇性的細胞毒活性,對 A-549、NCI-H460、MCF-7、MDAMB-435s、HeLa、DU-145六種腫瘤細胞株都有細胞毒活性作用,但在濃度低于7.02 mM時對正常人肺成纖維細胞(HLF)沒有影響,另外該化合物對HIV蛋白酶和Taq DNA聚合酶有抑制作用[45]?;衔?45和146分離自真菌Trichoderma sp.(福建沉積物),這兩個化合物對HL-60細胞株都有中等程度的細胞毒活性[46]。
1.4.3 肽類
化合物Trichoderide A(147)是由丙氨酸、脯氨酸、纈氨酸和鳥氨酸縮合而成的環(huán)四肽,分離自連云港海域潮間帶海泥真菌 Trichoderma reesei[47]。Asperelines A-F(148~153)是從真菌 Trichodermaasperellum(南極企鵝島沉積物)中分離到的系列肽類化合物,這6個化合物的氮端被乙?;?,碳端連接了罕見的脯氨醇殘基[48]。環(huán)二肽化合物(154~157)分離自真菌Trichoderma atroviride(南海紅樹林角果木屬植物根系土壤)[49]。
1.4.4 甾體類和萜類
甾體化合物158分離自真菌Trichoderma sp.(南海深海沉積物)[45]?;衔?59和160分別屬倍半萜和降二倍半萜類,分離自真菌Trichoderma reesei(連云港海域潮間帶海泥)[42,47]。
1.4.5 其他類
化合物161與化合物159、160來源于同一株真菌[42,47]。化合物162分離自南海紅樹林植物根系沉積物真菌[49]。
1.5.1 萜類
二倍半萜化合物163~171屬蛇孢菌素類,分離自真菌Emericella variecolor(日本Gokasyo海灣沉積物),其中Ophiobolin K(170)對多種癌細胞表現(xiàn)出較強的細胞毒活性,對P-388細胞株的IC50值為0.27-0.65 μM[50]。
1.6.1 生物堿類
2009年,Wang等從真菌 Alternaria raphani(青島海鹽場沉積物)中分離到化合物Alternarosin A(172)和Bisdethiobis(methylthio)acetylaranotin(173),Alternarosin A對三種細菌 Escherichia coli、Bacillus subtilis、Candida albicans的 MIC 值分別為203、203、和 406 μM[51]。
1.6.2 肽類和腦苷脂類
肽類化合物Alternaramide(174)從真菌Alternaria sp.(韓國馬山灣沉積物)中分離得到[52]。2009年,Wang等從真菌Alternaria raphani(青島海鹽場沉積物)分離到腦苷脂類化合物Alternarosides A-C(175~177)和 Cerebroside C(178),其中 Alternarosides A-C 對細菌 Escherichia coli、Bacillus subtilis、Candida albicans的 MIC 值為70 ~270 μM[51]。
1.7.1 甾體類
目前被報道來源于Geotrichum屬真菌的只有四個甾體化合物179~182,其中化合物180來屬雙氧橋麥角甾醇,該類化合物不僅能抑制癌細胞生長,而且具有很強的抗氧化活性,能有效抑制脂質(zhì)過氧化[53]。
1.8.1 生物堿類
2006年,Gallardo等從真菌Acremonium furcatum(阿根廷米拉馬爾潮間帶沉積物)中分離到四個生物堿化合物183~186,這四個化合物都表現(xiàn)出抗細菌和植物病原真菌的活性,其中化合物183對曲霉菌和鐮刀霉菌的抑菌圈均為 15 mm(50 μg/spot)[54,55]。
1.9.1 生物堿類
生物堿類化合物Plectosphaeroic acids A-C(187~189)分離自真菌Plectosphaerella cucumerina(加拿大西岸巴克利灣),這三個化合物都對人吲哚胺2、3-雙加氧酶有抑制作用,IC50值都在 2 μM 左右[56]。黃等從真菌Gliocladium sp.(乳山海泥)中分離到一對幾何異構(gòu)體化合物190~191,是罕見的二酮哌嗪側(cè)鏈上連接牻牛兒取代基的化合物,這兩個化合物對腫瘤細胞都表現(xiàn)出良好的細胞毒活性,但后者的活性強于前者,說明幾何異構(gòu)體對其細胞毒活性具有一定的影響[57]。
1.9.2 聚酮類
2009年,Chen等從Xylaria屬真菌(南海紅樹林沉積物)分離到兩個聚醚類化合物Xyloketal A和Xyloketal B(192~193),Xyloketal A能抑制乙酰膽堿酯酶,Xyloketal B能抑制NADPH氧化酶,增加NO的釋放,從而保護人臍靜脈內(nèi)皮細胞免于被氧化的低密度脂蛋白誘導(dǎo)損傷[58]。Fusaquinon A(194)屬蒽醌類,從珠海紅樹林沉積物真菌Fusarium sp.中分離到[59]?;衔?Aquastatin A(195)分離自真菌Cosmospora sp.(韓國Gejae島),能抑制蛋白酪氨酸磷酸酶,EC50值達 0.19 μM[60]?;衔颯piromassaritone和 Massariphenone(196、197)分離自Palau 島嶼海泥真菌 Massarine sp.[61]。
1.9.3 其他類
Zhang等也是從南海潮間帶海泥真菌Nigrospora sphaerica 分離到化合物 198 ~199[62]?;衔?00分離自真菌Keissleriella sp.(黃海射陽港沉積物),對紅色毛霉菌、白色念球菌和黑曲霉菌的MIC值分別為 20、40、80 μg/mL-1[63]。
海洋真菌具有易培養(yǎng)、代謝產(chǎn)物量大等優(yōu)點,但國內(nèi)外對海洋真菌的系統(tǒng)研究起步較晚,其代謝產(chǎn)物化學(xué)以及生物活性的研究遠滯后于海洋細菌和放線菌。直到90年代后,對于海洋真菌代謝產(chǎn)物的研究才逐漸進入快速發(fā)展階段[2,64,65]。海洋沉積環(huán)境資源豐富,孕育著特殊的微生物多樣性,為真菌研究提供了良好的資源基礎(chǔ)。
本綜述收集了65篇關(guān)于海洋沉積環(huán)境來源真菌次生代謝產(chǎn)物的文獻,從化合物發(fā)表的時間來看海洋沉積環(huán)境來源真菌的次生代謝產(chǎn)物發(fā)表數(shù)量逐年增加,增長趨勢明顯。從真菌屬來源分析,共有16個屬(圖1),但主要分布在前四大屬:Penicillium(青霉屬)、Aspergillus(曲霉屬)、Spicaria(穗霉屬)、Trichoderma(木霉屬),占有比例分別為30%、19%、18%和13%。從結(jié)構(gòu)分類中發(fā)現(xiàn)(圖2),生物堿類代謝產(chǎn)物的比例最高,占有43%,其次是萜類(21%)、聚酮類(21%)、肽類(7%)等,活性研究主要集中在細胞毒活性和抗菌方面。
目前,可人工培養(yǎng)的海洋沉積環(huán)境來源真菌只占真菌總量的一小部分,沉積物樣品采集后真菌脫離原生長環(huán)境存活率降低,而且只能在適合的培養(yǎng)基上生長,所以需要解決從采樣到分離純化過程中提高菌株可培養(yǎng)率的問題。此外,發(fā)酵條件的創(chuàng)新也可以提高新化合物的產(chǎn)出率,比如改變培養(yǎng)基鹽度、延長培養(yǎng)時間或在培養(yǎng)基中加入特定成分,同樣的菌株在不同的培養(yǎng)條件下,代謝系統(tǒng)會發(fā)生改變,將有利于提高代謝產(chǎn)物的出新率,擴充海洋天然產(chǎn)物庫,為開發(fā)海洋先導(dǎo)藥物奠定基礎(chǔ)。
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