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      我國近海中度嗜鹽菌的分離篩選及其產(chǎn)酶多樣性分析

      2014-01-10 03:45:34產(chǎn)竹華劉洋王昭凱鐘添華曾潤穎
      海洋學(xué)報 2014年2期
      關(guān)鍵詞:株菌產(chǎn)酶酯酶

      產(chǎn)竹華,劉洋,王昭凱,鐘添華,曾潤穎*

      (1.國家海洋局第三海洋研究所海洋生物遺傳資源重點實驗室,福建廈門361005)

      1 引言

      中度嗜鹽菌(Moderately halophilic bacteria)指一類能夠在NaCl的質(zhì)量分?jǐn)?shù)為3%~15%之間最適生長能力的極端微生物類群[1-2],廣泛生活于近海、鹽湖、鹽場、高鹽土壤和鹽漬食物等環(huán)境[3]。由于中度嗜鹽菌獨特的生理生化特性,易于在高鹽環(huán)境下生長及可以利用多種有機物作為碳源和氮源,決定了其在酶制劑生產(chǎn)、食品工業(yè)、污水處理等方面的具有可能的應(yīng)用價值[4-5]。

      嗜鹽菌由于其獨特遺傳背景和代謝途徑,使其產(chǎn)生的生物酶在食品、化工、環(huán)保等領(lǐng)域有重大的應(yīng)用潛力,因此其逐漸成為研究的熱點。Sanchez等[6]從幾百株中度嗜鹽菌得到多種胞外水解酶并對酶活性進行了詳細(xì)的研究,同時,他們也分離得到高產(chǎn)蛋白酶的中度嗜鹽菌[7]。Mohammad等[8]從中度嗜鹽菌Salinivibriosp.AF-2004中得到分泌性的堿性金屬蛋白酶,并進行了分離純化,它具有較寬的pH生長范圍和鹽耐受性,為它的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)[9]。Hiroko Tokunaga等[10]研究了由中度嗜鹽菌中的134個氨基酸組成的二聚體-核酸二磷酸激酶,并對它的結(jié)構(gòu)進行了分析。Moozegar等[11]人對Halobacillus sp.MA-2在高溫及高鹽條件下分泌的淀粉酶做了詳細(xì)的研究。這些工作極大地豐富了我們對中度嗜鹽菌產(chǎn)酶的認(rèn)識。

      本文從天津濱海、山東東營、江蘇連云港、福建廈門、海南三亞等地近海采集樣品,富集、分離篩選中度嗜鹽菌。利用底物特異性實驗分析了嗜鹽菌株的產(chǎn)酶多樣性。通過16SrRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析產(chǎn)酶嗜鹽菌株的分類地位,從而可以了解各菌株的系統(tǒng)進化和產(chǎn)酶多樣性,為進一步研究嗜鹽微生物資源提供了參考。

      2 材料與方法

      2.1 試驗樣品

      從天津濱海(39°06′N,117°43′E)、山東東營(37°32′N,118°55′E)、江蘇連云港(34°49′N,119°14′E)、福建廈門(24°32′N,118°22′E)、海南三亞(18°12′N,109°28′E)等地近海采集樣品。樣品放置4℃冰箱保存,然后進行菌株的篩選。

      2.2 基礎(chǔ)培養(yǎng)基

      中度嗜鹽菌富集,篩選培養(yǎng)基(g/L):NaCl 100,葡萄糖10,酵母粉10,蛋白胨5,KCl 2.0,MgSO4· 7H2O 1.0,CaCl20.36,NaHCO30.06,F(xiàn)eCl30.001,pH 7.4~7.6。固體培養(yǎng)基加入瓊脂15~20。

      基本培養(yǎng)基(g/L):NaCl 100,KCl 2.0,MgSO4· 7H2O 1.0,CaCl20.36,F(xiàn)eCl30.001,pH 7.4~7.6。固體培養(yǎng)基加入瓊脂15~20。

      發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):NaCl 100,葡萄糖10,蛋白胨10,酵母粉5。

      2.3 實驗方法

      2.3.1 菌株的富集和分離純化

      稱取樣品(土樣或水樣)1g或1mL置于250mL裝液量50mL篩選培養(yǎng)基的三角瓶中,37℃、200r/min搖床培養(yǎng)3~5d,富集菌體;然后取富集的菌液逐級稀釋從10-2到10-8,取2~3個梯度涂平板;37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)2~3d長出單菌落,挑取單菌落劃線、培養(yǎng),直到得到純培養(yǎng)菌株。用斜面劃線試管和-70℃甘油管兩種方法保存。

      2.3.2 菌落特征

      劃線接種于嗜鹽培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)2~3d,觀察單菌落的形狀、大小、透明度、顏色、邊緣和表面特征。

      2.3.3 菌體特征

      采用革蘭氏染色法和芽孢染色法[12-13],通過光學(xué)顯微鏡和透射電子顯微鏡對菌體形態(tài)進行觀察。

      2.3.4 部分生理生化特征

      依據(jù)《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》[14]和《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(第9版)》[15]進行常規(guī)生化鑒定。

      2.3.5 16SrRNA基因擴增和系統(tǒng)進化分析

      使用BioTeke試劑盒提取細(xì)菌總DNA。以細(xì)菌總DNA為模板,用16SrRNA通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′),1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)進行PCR擴增菌株16SrRNA[16]。PCR產(chǎn)物送交到Invitrogen公司測定。測序得到的16SrRNA基因序列通過BLASTN(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)進行比對。

      2.3.6 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹

      提交各嗜鹽菌株的16SrRNA基因序列在EMBL數(shù)據(jù)庫中進行比對,選取與之相似性較高的模式種的16SrRNA基因序列,采用MEGA4.0軟件進行系統(tǒng)發(fā)育分析,采用Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,Bootstrap1000次進行穩(wěn)定性驗證。

      2.4 產(chǎn)酶中度嗜鹽菌的篩選

      2.4.1 產(chǎn)蛋白酶中度嗜鹽菌的篩選

      基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入1%脫脂奶粉,制成平板。在平板上劃線中度嗜鹽菌株,37℃培養(yǎng)1周后觀察有無透明圈出現(xiàn)[17]。

      2.4.2 產(chǎn)淀粉酶中度嗜鹽菌的篩選

      基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入1%可溶性淀粉,制成平板。在平板上點種嗜鹽菌株,37℃培養(yǎng)1周后用路戈氏碘液檢驗,觀察有無透明圈出現(xiàn)[18]。

      2.4.3 產(chǎn)酯酶中度嗜鹽菌的篩選

      基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入1%Tween80,制成平板。在平板上劃線中度嗜鹽菌株,37℃培養(yǎng)1周后觀察有無白色暈圈[19]。

      2.4.4 產(chǎn)纖維素酶中度嗜鹽菌的篩選

      基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入1%羧甲基纖維素鈉和0.2%剛果紅,制成平板。在平板上點種嗜鹽菌株,37℃培養(yǎng)觀察有無透明圈出現(xiàn)[20]。

      2.5 酶活力測定方法

      (1)蛋白酶活力測定方法:參照中華人民共和國專業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《蛋白酶活力測定方法》SB/T10317-1999進行測定[21]。

      (2)淀粉酶活力的測定:采用YoungJ.Y00改良法[22]。

      (3)酯酶活力測定法:采用改進過的α-乙酸萘酯比色法[23-25]測定酶活。

      (4)纖維素酶活力測定參照文獻[26-27],酶活力按照國際單位規(guī)定定義為:每分鐘催化纖維素水解生成1μmol葡萄糖的酶量為1個酶活力單位U。

      3 結(jié)果與分析

      3.1 部分生理生化特征

      通過對天津、三亞、連云港、廈門、東營等地近海和鹽田的樣品進行富集、分離純化。得到26株中度嗜鹽菌,生長3~4d后,菌落均為干燥或濕潤,大多菌株的菌落為白色,其次為黃色。菌株形態(tài)和菌落顏色具有多樣性。革蘭氏染色顯示革蘭氏陽性菌占絕對優(yōu)勢,各株菌的部分生理生化特征見表1。

      表1 中度嗜鹽菌的部分生理生化性質(zhì)

      3.2 中度嗜鹽菌產(chǎn)酶多樣性

      經(jīng)過篩選得到26株產(chǎn)酶嗜鹽菌株,分別對26株菌株進行底物特異性試驗,驗證了菌株的產(chǎn)酶情況。發(fā)現(xiàn)13株菌產(chǎn)蛋白酶,其中LYG1-4、WJ5-1、WJ5-3、TJ5-2、TJ7-4和BZ2-2產(chǎn)蛋白酶能力較強;19株菌產(chǎn)淀粉酶,其中TJ6-1、TJ8-1產(chǎn)酶能力較強;13株菌產(chǎn)酯酶,其中TJ3-2、TJ9-5、TJ12-3、LYG1-1、LYG2-5、LYG3-5產(chǎn)酶能力較強;4株菌產(chǎn)纖維素酶,分別屬于Virgibacillus、Halobacillus、 Halomonas等屬。從表2中可以看出,沒有一株菌可以同時產(chǎn)4種酶,有6株菌同時產(chǎn)3種酶,有11株菌能產(chǎn)2種酶,表明了中度嗜鹽菌產(chǎn)酶的多樣性。

      表2 中度嗜鹽菌產(chǎn)酶多樣性

      3.3 嗜鹽菌產(chǎn)酶分析

      3.3.1 中度嗜鹽菌株產(chǎn)蛋白酶

      雖然蛋白酶的種類很多,而且有些已在工業(yè)生產(chǎn)中應(yīng)用。但應(yīng)用環(huán)境往往會影響到酶的活力,特別是高鹽環(huán)境下的活力。因而需要適應(yīng)于廣譜pH、溫度、鹽度的酶。中度嗜鹽菌特殊的生理生化條件決定了其所產(chǎn)蛋白酶的特殊性,耐鹽、較寬的pH和溫度范圍菌保持較高活性。本工作中篩選到產(chǎn)蛋白酶的中度嗜鹽菌有13株,占產(chǎn)酶菌株總量的50%。如圖1顯示,在脫脂奶粉平板上生長的中度嗜鹽菌生長1周后,菌落周圍出現(xiàn)透明圈,說明這些菌株能產(chǎn)生蛋白酶。通過搖瓶實驗,測定產(chǎn)酶菌株的酶活(3組重復(fù)取平均),結(jié)果表明LYG1-4、WJ5-1、WJ5-3、TJ5-2、TJ7-4和BZ2-2產(chǎn)蛋白酶能力較強,其中BZ2-2菌株酶活力最高,達到765U/g。

      3.3.2 中度嗜鹽菌株產(chǎn)淀粉酶

      圖2顯示,在淀粉平板上生長的中度嗜鹽菌生長1周后,將碘液滴在菌苔上,如果周圍無藍色,而對照仍然為藍色,說明該菌株能產(chǎn)生淀粉酶(圖2)。淀粉酶都需要特定的溫度、pH值和鹽度范圍,故對淀粉酶活較高的中度嗜鹽菌進行分離和鑒定,有助于發(fā)現(xiàn)新的淀粉酶來適應(yīng)新的工業(yè)需要。通過搖瓶實驗,測定產(chǎn)酶菌株的酶活(3組重復(fù)取平均),結(jié)果表明TJ6-1、TJ8-1產(chǎn)酶能力較強,其中菌株TJ6-1酶活力達到387U/g。

      圖1 菌株產(chǎn)蛋白酶的照片

      圖2 菌株產(chǎn)淀粉酶(左:對照,右:產(chǎn)淀粉酶菌株)

      3.3.3 中度嗜鹽菌株產(chǎn)酯酶

      在酯酶篩選平板上點種嗜鹽菌株,培養(yǎng)一定時間后發(fā)現(xiàn)有些生長的菌株周圍產(chǎn)生白色暈圈,說明該菌株產(chǎn)生酯酶(圖3)。酯酶菌株的獲得說明中度嗜鹽菌的產(chǎn)酶具有多樣性,也為更好的利用中度嗜鹽菌提供了參考。從圖中可以看出,菌株在固體平板上產(chǎn)酯酶的情況較好,明顯出現(xiàn)白色暈圈。通過搖瓶實驗,測定胞外和胞內(nèi)酶活(3組重復(fù)取平均),該酶大部分屬于胞外酶。結(jié)果表明TJ3-2、TJ9-5、TJ12-3、LYG1-1、LYG2-5、LYG3-5產(chǎn)酶能力較強,其中菌株LYG3-5的酶活力達到582U/g。

      3.3.4 中度嗜鹽菌株產(chǎn)纖維素酶

      在纖維素的平板上點種嗜鹽菌株,結(jié)果發(fā)現(xiàn)只有4株菌能夠生長。進一步通過搖瓶實驗,測定纖維素酶活力(3組重復(fù)取平均),分別為248U/g、476U/g、207U/g、356U/g,說明這4株菌產(chǎn)纖維素酶,分別屬于Virgibacillus,Halobacillus,Halomonas屬,產(chǎn)纖維素酶的嗜鹽菌株占總菌數(shù)不到20%。

      圖3 菌株產(chǎn)酯酶的情況

      3.4 系統(tǒng)進化分析

      經(jīng)過篩選,得到了至少產(chǎn)一種胞外酶的26株嗜鹽菌,其中有11株與鹽單胞菌屬的細(xì)菌相近,占分離細(xì)菌總數(shù)的42.31%,其次有6株與Idiomarina屬的細(xì)菌相近,是占優(yōu)勢的類群。16SrRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析表明大部分菌株的進化地位相當(dāng)明確(見圖4),26株菌分別屬于7個屬(Halomonas,Oceanobacillus,Idiomarina,Virgibacillus,Pontibacillus,Halobacillus和Marinilactibacillus)的13個不同的種,系統(tǒng)進化地位不等,表明中度嗜鹽菌分布的多樣性和廣泛性,以及資源的豐富性,為嗜鹽微生物以及嗜鹽酶的研究提供了參考。

      4 討論

      4.1 中度嗜鹽菌系統(tǒng)發(fā)育多樣性

      通過對天津、三亞、連云港、廈門、東營等地近海或鹽田的樣品進行分離篩選和鑒定,得到26株產(chǎn)酶菌株,分別屬于13個種,7個屬。其中WJ5-1,TJ3-2分別屬于Halomonas,Idiomarina屬,與各屬中的模式菌株Halomonas variabilis DSM 3051T,Idiomarina zobellii KMM 231T的16SrRNA基因同源性分別為97.62%、97.83%,可能代表該屬內(nèi)的新種,要確定該菌是否為新種需通過GC含量、DNA分子雜交等實驗進一步分析和鑒定[28]。表明我國近海中度嗜鹽菌分布多樣性以及系統(tǒng)進化多樣性。

      4.2 中度嗜鹽菌產(chǎn)酶多樣性

      對嗜鹽菌株進行底物特異性試驗表明,篩選到的菌株沒有一株可以同時產(chǎn)4種酶,有6株菌同時產(chǎn)3種酶,有11株菌能產(chǎn)2種酶。通過嗜鹽產(chǎn)酶情況分析,表明我國近海中度嗜鹽菌產(chǎn)酶的多樣性。經(jīng)過性質(zhì)研究發(fā)現(xiàn),大多數(shù)嗜鹽酶活力最適鹽度為10%,且在NaCl濃度為20%、pH 10和溫度20~55℃條件下均有活性,且活性都保持在50%以上。嗜鹽酶獨特的生理特性將為嗜鹽菌在工業(yè)應(yīng)用方面提供重要參考。

      圖4 中度嗜鹽菌菌株基于16SrRNA基因序列相似性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

      4.3 中度嗜鹽菌酶的應(yīng)用分析

      隨著工業(yè)的發(fā)展,工業(yè)廢水的污染越來越嚴(yán)重,電子廢水、造紙廢水、高鹽廢水的治理需要更高的成本。中度嗜鹽菌酶具有能在高鹽、較高pH以及較寬溫度均有活性,為工業(yè)廢水的治理提供了一個新的思路。因此,開發(fā)出高酶活的嗜鹽菌酶和能較好治理工業(yè)廢水的嗜鹽菌酶是下一步的研究重點。

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