龔達(dá)平
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煙草重要基因篇:1. 煙草抗病相關(guān)基因
龔達(dá)平
(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所,青島 266101)
煙草是重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,也是研究植物與病害互作的主要模式生物。煙草病害種類(lèi)泛多,對(duì)煙草危害較為嚴(yán)重的病害有黑脛病、赤星病、青枯病、煙草普通花葉病、黃瓜花葉病、馬鈴薯Y病毒等?;瘜W(xué)藥劑防治會(huì)引起環(huán)境污染、農(nóng)藥殘留、煙葉安全性等問(wèn)題,而培育煙草抗病新品種是解決這些問(wèn)題的根本途徑。煙草抗病相關(guān)基因或分子標(biāo)記的獲得可高效靶向加快培育煙草抗病新品種的步伐。
煙草黑脛病由真菌()引起。張錦偉等[1]以高抗黑脛病的煙草品種K326苗期接種黑脛病菌絲3天后取葉片構(gòu)建了cDNA文庫(kù)。蘇振剛等[2]以煙草黑脛病抗性品種革新3號(hào)為材料,利用黑脛病0號(hào)生理小種誘導(dǎo)構(gòu)建抑制差減(SSH)文庫(kù),篩選出57個(gè)對(duì)煙草黑脛病抗性相關(guān)的差異表達(dá)基因。肖炳光[3]利用感黑脛病品種紅花大金元和抗黑脛病種質(zhì)RBST構(gòu)建BC1(紅花大金元/RBST//紅花大金元)群體,將抗黑脛病基因Ph精確定位在標(biāo)記TM10401和PT52634間的0.191 cM范圍內(nèi)。肖炳光等[4](2013)利用抗黑脛病雪茄品種Florida 301和感黑脛病品種Hicks的重組自交系群體,鑒定了11個(gè)QTL,其中貢獻(xiàn)最大的一個(gè)QTL解釋了16.9%的大田表型變異和18.6%的溫室表型變異。Vontimitta等[5](2012)利用Beinhart 1000和Hicks構(gòu)建的DH群體,鑒定了6個(gè)QTL,其中位于4號(hào)和8號(hào)染色體的兩個(gè)位點(diǎn)分別解釋了25.4%和20.4%的表型變異。
煙草赤星病由赤星病菌()引起。童治軍等[6](2012)以感赤星病品種長(zhǎng)脖黃和抗赤星病品種凈葉黃構(gòu)建F2群體,利用SSR標(biāo)記在3個(gè)連鎖群上檢測(cè)到3個(gè)與赤星病抗性相關(guān)的QTL,抗性等位基因均來(lái)自凈葉黃。這3個(gè)QTL解釋了雙親病情指數(shù)差值的86%左右,其中約61%為加性效應(yīng)。蔣彩虹等[7](2013)以抗煙草赤星病品種凈葉黃與感病品種NC82構(gòu)建F2代分離群體,獲得了一個(gè)抗赤星病基因的SSR標(biāo)記連鎖群M,該連鎖群包括12個(gè)標(biāo)記,全長(zhǎng)181.5 cM,平均間距15.1 cM,抗性基因被定位在標(biāo)記J4與J9之間,其中與J9的遺傳距離僅為4 cM。
煙草青枯病是一種由青枯菌()引起的細(xì)菌性病害。楊柳[8](2012)以中抗青枯病品種巖煙97和感病品種紅花大金元雜交得到的237個(gè)F2:3家系為作圖群體,利用SSR標(biāo)記檢測(cè)到2個(gè)主效QTL,分別位于第17a、17b連鎖群上,分別解釋了25.7%和13.28%的表型變異。在聯(lián)合分析時(shí),檢出2對(duì)具有上位效應(yīng)的QTL,貢獻(xiàn)率分別為4.73%和3.91%。Qian Y L等[9](2013)利用Enshu×TI448A和Yanyan97×TI448A的F2群體,鑒定了位于連鎖群3和5上的4個(gè)QTL位點(diǎn)(qBWR-3a,qBWR-3b,qBWR-5a和qBWR-5b);這4個(gè)位點(diǎn)分別解釋了9.00、19.70、17.30和17.40%的表型變異。
煙草普通花葉病毒病在我國(guó)各產(chǎn)煙區(qū)均有分布,病原為煙草花葉病毒(tobacco mosaic virus,TMV)。煙草N基因是理想的抗TMV基因,它和TMV之間的互作是植物和病毒互作領(lǐng)域的經(jīng)典系統(tǒng)。N基因起源于粘毛煙草(),是Whitham等[10](1994)和Dinesh-Kumar等[11](1995)利用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法進(jìn)行分離的,其結(jié)構(gòu)、功能及表達(dá)特點(diǎn)都得到了深入研究。N基因編碼一個(gè)131.4 kDa的蛋白質(zhì),屬于典型的TIR-NBS-LRR抗病基因。Padgett等[12](1993)報(bào)道,TMV復(fù)制酶126/183 Kda蛋白是激發(fā)N基因介導(dǎo)的過(guò)敏反應(yīng)(HR)所必須的;后來(lái)Erickson等[13](1999)用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的表達(dá)策略證明,50 kDa TMV解旋酶片段(p50)足以引發(fā)N基因介導(dǎo)的HR。Dinesh-Kumar等[14](2000)證實(shí),N基因的5個(gè)外顯子經(jīng)選擇性剪切可編碼NS和NL兩個(gè)轉(zhuǎn)錄物;在TMV侵染后3 h之內(nèi)以NS為主;4~8 h以NL為主。煙草N基因介導(dǎo)的TMV抗性是識(shí)別病原經(jīng)系列信號(hào)傳導(dǎo)產(chǎn)生防衛(wèi)反應(yīng)。N基因介導(dǎo)的HR是第一個(gè)防衛(wèi)反應(yīng),可限制TMV于枯斑及其鄰近部位;HR隨后誘導(dǎo)整個(gè)植株非特異的普遍的防衛(wèi)反應(yīng)即系統(tǒng)獲得性抗性(SAR)。
煙草黃瓜花葉病毒(cucumber mosaic virus, CMV)是世界上分布最廣的植物病毒之一,其株系繁多,每年都給煙葉生產(chǎn)造成重大的經(jīng)濟(jì)損失。文軻等[15](2013)以感CMV品種NC82和抗CMV品種臺(tái)煙8號(hào)及其F1為材料,從2317對(duì)SSR引物中篩選出127對(duì)多態(tài)性引物。進(jìn)一步挑選62對(duì)SSR引物,對(duì)經(jīng)過(guò)CMV接種鑒定的288個(gè)BC1(NC82/臺(tái)煙8號(hào)//NC82)單株進(jìn)行標(biāo)記定位分析。采用復(fù)合區(qū)間作圖法進(jìn)行QTL定位,檢測(cè)到一個(gè)QTL位于10號(hào)連鎖群上,在標(biāo)記53735與54196之間,標(biāo)記53735與抗性緊密連鎖,遺傳距離為0.1 cM,貢獻(xiàn)率為13%,暫命名為qCMV-1,其抗性等位基因來(lái)自臺(tái)煙8號(hào)。
煙草馬鈴薯Y病毒?。╬otato virus Y,PVY)是煙區(qū)的主要病毒病害。陳帥等[16-17](2010)和周佳等[18](2010)以不同PVY誘導(dǎo)時(shí)期的白肋煙品種VAM葉片mRNA作為探針,利用cDNA芯片篩選已構(gòu)建的抑制差減雜交文庫(kù),共有915個(gè)克隆為表達(dá)上調(diào)(Ratio>2);對(duì)上調(diào)表達(dá)明顯的天冬氨酸蛋白酶基因Ntasp、NtERD1和NtPsaN進(jìn)行了全長(zhǎng)克隆和表達(dá)分析,它們受到PVY的顯著誘導(dǎo)。Julio等[19](2013)利用Illumina測(cè)序技術(shù),對(duì)12個(gè)F7重組自交系進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,獲得了在感病材料中高表達(dá),而在抗病材料中不表達(dá)的真核細(xì)胞翻譯起始因子4E(eIF4E)。進(jìn)一步對(duì)100個(gè)F8重組自交系的PCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了感病性與eIF4E表達(dá)的相關(guān)性;利用F2分離群體進(jìn)行標(biāo)記定位也證實(shí)了eIF4E基因突變與PVY抗性完全連鎖;通過(guò)篩選EMS誘導(dǎo)的突變?nèi)后w,獲得了兩個(gè)eIF4E基因提前終止的抗PVY突變體。
抗TMV的N基因和抗PVY的eIF4E基因均是單基因,很容易進(jìn)入煙草的育種程序,但其他主要病害還需要進(jìn)一步進(jìn)行QTL的精細(xì)定位。隨著煙草基因組測(cè)序的完成和功能基因組的開(kāi)展,將加快對(duì)煙草抗病基因的深入研究,如據(jù)王元英[20](2011)分析,煙草基因組中包含400多個(gè)NBS-LRR類(lèi)抗病基因。分子育種必將成為今后煙草抗病育種的主要手段。
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