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(1.中國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東青島 266032;2.青島市黃島區(qū)動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所,山東青島 266400)
H10亞型禽流感病毒全球譜系分析
蔣文明1,于美芳1,王素春1,張玲妮2,陳繼明1,黃保續(xù)1
(1.中國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東青島 266032;2.青島市黃島區(qū)動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所,山東青島 266400)
本文借助于GenBank中的Inf l uenza Virus Resource和已發(fā)表的相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,對(duì)H10亞型禽流感病毒在全球和中國(guó)的流行譜系、流行情況和致病性進(jìn)行了分析。全球H10亞型主要存在北美和歐亞2個(gè)譜系。H10病毒的HA受體結(jié)合位點(diǎn)分析表明,其傾向于結(jié)合α-2,3-唾液酸受體,屬于典型的禽流感病毒特征。對(duì)H10病毒的HA裂解位點(diǎn)分析表明,大部分H10病毒具有低致病特性。綜合分析認(rèn)為,目前H10N8出現(xiàn)大規(guī)模流行的可能性不大,但仍需要提高警惕、加強(qiáng)監(jiān)測(cè)。
禽流感;H10亞型;譜系分析;致病性
2013年12月,江西省南昌市在1例女患者病例標(biāo)本中檢測(cè)出H10N8禽流感病毒。報(bào)道顯示,患者73歲,臨床診斷為重癥肺炎,并伴有高血壓、心臟病、重癥肌無力等基礎(chǔ)性疾病,免疫水平低下,病人在入院治療6天后死亡。據(jù)悉,死者生前有活禽經(jīng)營(yíng)市場(chǎng)暴露史,但所有密切接觸者均未出現(xiàn)異常。H7N9還沒有完全結(jié)束,現(xiàn)在又多了個(gè)H10N8,無疑將禽流感又推向了風(fēng)頭浪點(diǎn)。
禽流感病毒屬于A型流感病毒,跟據(jù)其病毒血凝素蛋白(HA)的不同可分為1~18個(gè)亞型,根據(jù)神經(jīng)氨酸酶(NA)的不同可分為1~11個(gè)亞型[1],HA的不同亞型和NA的不同亞型相互組合形成不同亞型的流感病毒,以HxNx方式組合,共可組合成近200種亞型。由于禽流感病毒存在抗原轉(zhuǎn)變的特點(diǎn),因此這個(gè)大家族里,會(huì)發(fā)生不斷的組合,有的組合不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)瞬即逝,有的較為穩(wěn)定。加上此次出現(xiàn)的H10N8亞型,已發(fā)現(xiàn)9種人感染禽流感的亞型。
H10亞型禽流感病毒(AIV)屬于低致病性毒株,研究表明,它主要存在于野生水禽體內(nèi)。該亞型病毒除感染野生鳥類外,還可以感染各種家禽以及哺乳動(dòng)物,如雞、火雞、家鴨、豬、水貂等,有些病毒能夠引起發(fā)病。H10亞型AIV感染后,可再次感染其他亞型AIV,在宿主體內(nèi)可能發(fā)生復(fù)雜的基因重組,產(chǎn)生新型的重組病毒。
從GenBank的Influenza Virus Resource網(wǎng)站,下載所有的H10亞型禽流感病毒的血凝素基因核苷酸序列,用MUSCLE軟件進(jìn)行對(duì)比,再用MEGA5.2軟件對(duì)其序列進(jìn)行譜系分析。譜系分析的參數(shù)設(shè)置如下:采用Neighbor-joining計(jì)算方法,核苷酸變異設(shè)為Kimura 2-parameter模式,各位點(diǎn)變異速率設(shè)為Gamma分布(Gamma參數(shù)為4.0)。Bootstrap值的計(jì)算設(shè)置為1000個(gè)重復(fù)。
對(duì)H10亞型禽流感病毒HA系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,全球H10亞型禽流感病毒主要分成2個(gè)大的譜系(圖1),北美譜系和歐亞譜系,與以前的報(bào)道相一致[2]。北美譜系又可分為2個(gè)明顯的分支,一個(gè)是2000年之前的病毒分支,另一個(gè)是2000年之后的病毒分支;歐亞譜系也可分為2個(gè)明顯的分支,一個(gè)是1985年之前的古老的病毒分支,另一個(gè)是1997年之后的新病毒分支。雖然全球的H10病毒分為2個(gè)明顯的分支,但也出現(xiàn)了一些特殊的情況,如在澳大利亞的野生水禽中分離到的H10N7病毒,其HA屬于北美譜系,NA接近于日本的水禽病毒,而6個(gè)內(nèi)部基因?qū)儆跉W亞譜系[3]。廣東活禽市場(chǎng)分離的病毒A/Duck/Guangdong/ E1/2012 (H10N8)譜系分析表明,HA屬于歐亞譜系,而NA屬于北美譜系[4]。
圖1全球H10亞型禽流感病毒HA譜系分析(▲為H10N8毒株)
對(duì)Influenza Virus Resource中的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)H10亞型的禽流感病毒NA基因包含了N1~N9的9個(gè)亞型,所占比例分別為3.40%(N1)、2.68%(N2)、6.17%(N3)、4.57%(N4)、2.21%(N5)、2.86%(N6)、72.23%(N7)、3.70%(N8)、2.19%(N9),H10N7亞型病毒占了絕大部分。H10亞型禽流感病毒的宿主主要是禽類,還包括了水貂(禽源)、豬(H10N5)和人類(2株,H10N7)。
中國(guó)的H10亞型禽流感病毒(H10N3、H10N4、H10N5、H10N7、H10N8、H10N9)屬于歐亞譜系。對(duì)洞庭湖地區(qū)H10N8亞型禽流感病毒的進(jìn)化分析表明,A/environment/DT/Hunan/3-9/07的HA基因?qū)儆跉W亞譜系的水生禽源病毒,NA基因?qū)儆跉W亞譜系的禽源病毒,PB2和PA基因與歐亞地區(qū)鴨的H5和H7亞型病毒的基因相近,PB1基因與歐洲一些國(guó)家的鴨、火雞、人的H7亞型禽流感相近,NP基因與歐亞譜系的H5N3和H10N5相近,M和NS基因也屬于歐亞譜系[5]。廣東活禽市場(chǎng)分離的病毒A/Duck/Guangdong/ E1/2012 (H10N8)譜系分析表明,HA屬于歐亞譜系,而NA屬于北美譜系[4]。
通過監(jiān)測(cè)發(fā)現(xiàn),我國(guó)的廣東(H10N7、H10N8)、洞庭湖(H10N3、H10N8)、江蘇(H10N9、H10N3、H10N?)、湖北(H10N4、H10N5)、廣西(H10N?)等一些地區(qū)存在某些H10亞型的禽流感病毒[6],大部分呈低致病性。
對(duì)H10病毒的HA受體結(jié)合位點(diǎn)分析表明,其傾向于結(jié)合α-2,3-唾液酸受體,屬于典型的禽流感病毒特征[7]。
對(duì)H10病毒的HA裂解位點(diǎn)分析表明,大部分病毒HA裂解位點(diǎn)處的氨基酸基序?yàn)镾EITQGRGLF,表明它們具有低致病特性。值得注意的是,一些H10亞型禽流感病毒,即使在HA裂解位點(diǎn)處不存在多個(gè)堿性氨基酸,仍然具備對(duì)雞或水貂的高致病性,如A/ turkey/England/384/79 (H10N4)和A/mandarin duck/ Singapore/8058F-72/7/93 (H10N5),雖然在HA裂解位點(diǎn)處只有一個(gè)堿性氨基酸(PEIMQGR↓GLF),但其靜脈接種致病指數(shù)>1.2,屬于高致病性禽流感病毒[8]。反之,將病毒A/Mallard/Germany/R2075/2007 (H10N7)的HA裂解位點(diǎn)處引入5個(gè)堿性氨基酸,重組突變病毒仍然是低致病性的[9]。這說明裂解位點(diǎn)處的堿性氨基酸數(shù)目不是評(píng)判H10亞型禽流感病毒致病的唯一因素,如一些病毒的NS基因能夠幫助病毒逃避先天免疫應(yīng)答,提高其致病力[10]。同樣是禽源的H10病毒,A/mink/Sweden/3900/84 (H10N4)和A/ chicken/Germany/N/49 (H10N7)對(duì)水貂的致病特性也不盡相同[10]。
對(duì)湖南洞庭湖分離的A/environment/DT/Hunan/3-9/07 (H10N8)進(jìn)行致病性試驗(yàn),表明其對(duì)雞是低致病性的,但能在小鼠的肺臟中高效復(fù)制,適應(yīng)后毒力快速增強(qiáng)[5]。廣東活禽市場(chǎng)分離的病毒A/ Duck/Guangdong/E1/2012 (H10N8),HA裂解位點(diǎn)為PEIVQER↓GLF,屬于低致病性特征[4]。
A/Duck/Hong Kong/562/79 (H10N9)感染野雞后,在長(zhǎng)期排毒過程中,感染后41天分離病毒與母本病毒的抗原性已經(jīng)發(fā)生了顯著的變異(抗原漂移),導(dǎo)致機(jī)體先天性免疫失敗[11]。
動(dòng)物流感病毒感染人類的現(xiàn)象此前發(fā)生過多次,此次江西監(jiān)測(cè)到H10N8是第一次在人體中檢出這個(gè)病毒。但是,目前H10N8出現(xiàn)大規(guī)模流行的可能性不大,因?yàn)榍萘鞲胁《具M(jìn)行跨物種傳播,即要在人類中大規(guī)模傳播,還需要發(fā)生較大的基因重組或變異才行。此次監(jiān)測(cè)到的H10N8禽流感的基因暫時(shí)仍然全部屬于禽鳥的基因,所以人傳人的機(jī)會(huì)較低。
目前研究發(fā)現(xiàn),H10N8病毒對(duì)氨酸酶類藥物比較敏感,如感染者發(fā)現(xiàn)早,采用氨酸酶類抗流感病毒藥物,病情可得到有效的控制。同時(shí),在避免禽流感病毒感染方面,要做到勤洗手,減少與活禽、病死禽接觸,特別是免疫功能低下的病人,要尤其減少或盡可能避免與禽類的接觸。
雖然H10N8禽流感引發(fā)流行的幾率較小,但仍需要我們提高警惕,加強(qiáng)監(jiān)測(cè)和宣傳,正確認(rèn)識(shí)、理性看待、解放思想、科學(xué)防控。
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Global phylogenetic analysis of H10 subtype avian inf l uenza virus
Jiang Wenming1, Yu Meifang1, Wang Suchun1, Zhang lingni2, Chen Jiming1, Huang Baoxu1
(1.China Animal Health and Epidemiology Center, Qingdao, Shandong 266032;2.Animal Health Inspection Institute of Huangdao district, Qingdao, Shandong 266400)
In this paper, phylogenesis, prevalence and pathogenicity of H10 subtype of avian influenza virus in the world and China were analyzed, by means of Inf l uenza Virus Resource in GenBank and published reports. Globally,H10 subtype viruses are divided into two lineages: North America and Eurasia. It is shown that H10 viruses tend to combine α2, 3-sialic acid receptor by analysis of HA receptor binding site, which belongs to the typical characteristics of avian inf l uenza virus, and that most of the H10 virus with low pathogenic characteristics by analysis of HA cleavage site. Comprehensive analysis indicates that current H10N8 is unlikely to cause a pandemic, but still needs vigilance and monitoring.
avian inf l uenza;H10 subtype;phylogenetic analysis;pathogenicity
S852.65
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:1005-944X(2014)02-0056-03