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      熒光原位雜交技術(shù)在基礎(chǔ)實驗教學(xué)中的應(yīng)用

      2014-03-25 08:01:56王宏剛陳成彬王春國宋文芹白艷玲張金紅
      實驗技術(shù)與管理 2014年3期
      關(guān)鍵詞:原位雜交端粒實驗課

      王宏剛,陳成彬,王春國,陳 力,宋文芹,白艷玲,張金紅, 劉 方

      (南開大學(xué) 生物實驗教學(xué)中心,天津 300071)

      熒光原位雜交技術(shù)(fluorescence in situ hybridization, FISH)是20世紀(jì)80年代末在放射性原位雜交技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種非放射性分子細胞遺傳技術(shù)[1-2]。他的基本原理是先把DNA(或RNA)探針用特殊的熒光染料標(biāo)記,然后將探針直接雜交到染色體上,通過熒光染料發(fā)出的熒光來檢測DNA序列在染色體上的定位、定性、相對定量分析。FISH具有安全、快速、靈敏度高、探針能長期保存、能同時顯示多種顏色等優(yōu)點,不但能顯示中期分裂相,還能顯示于間期核。目前,這項技術(shù)已應(yīng)用于生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)等多個領(lǐng)域的科學(xué)研究[3-7]。

      熒光原位雜交技術(shù)已成為生命科學(xué)類專業(yè)的學(xué)生在進行科研所必需的一項基本實驗技術(shù)。因此,需要在本科生的基礎(chǔ)實驗中設(shè)計相關(guān)的實驗項目,讓每一位生命科學(xué)類專業(yè)的本科生都能夠熟練掌握這項技術(shù)。我們將熒光原位雜交技術(shù)的基本原理和細胞生物學(xué)理論課中關(guān)于染色體端粒的相關(guān)知識結(jié)合在一起,設(shè)計了“端粒序列的熒光原位雜交定位”實驗。通過這個實驗,學(xué)生不但可以掌握熒光原位雜交技術(shù)的原理和實驗方法,還可以對中期染色體的形態(tài)及端粒的位置有更深的認識,鞏固了理論課學(xué)習(xí)的內(nèi)容。

      1 實驗材料和試劑

      (1) 實驗材料:動物細胞為小鼠淋巴瘤EL4細胞系、倉鼠卵巢CHO細胞系和鼠雜交瘤細胞系;植物材料為水稻、玉米和黑麥。

      (2) 實驗試劑:無水乙醇、甲醇、冰醋酸、2.5%果膠酶、2.5%纖維素酶、0.01%秋水仙堿、飽和對二氯代苯水溶液、Giemsa染色液、1640培養(yǎng)基、小牛血清、0.25%的胰蛋白酶、0.075mol的KCl低滲液、70%的去離子甲酰胺、Tween 20、20×SSC、含DAPI的防熒光淬滅劑。

      (3) 端粒探針:植物端粒探針FAM-5’TTTAGGGTTTAGGGTTTAGGG 3’ ;動物端粒探針TAMRA-5’TTAGGGTTAGGGTTAGGG 3’

      2 實驗方法

      2.1 染色體標(biāo)本的制備

      2.1.1 植物染色體標(biāo)本的制備

      植物材料按常規(guī)培養(yǎng)方法進行培養(yǎng),待種子萌發(fā)根尖長至0.5~1 cm后切下生長旺盛的種子根尖,用飽和對二氯代苯溶液室溫預(yù)處理3~5 h;吸去預(yù)處理液,用蒸餾水或0.075 mol/L的KCl低滲30 min;然后用卡諾固定液固定20 min,用蒸餾水洗3次,每次5 min;用2.5%的果膠酶和纖維素酶37 ℃解離根尖1 h;用蒸餾水洗去酶液,再次低滲15 min;倒掉蒸餾水,用3∶1卡諾固定液再次固定20 min;取根尖并置于預(yù)先在蒸餾水中預(yù)冷(4 ℃)的潔凈載玻片上,滴一滴固定液,用鑷子將根尖充分搗碎,再加1滴固定液,將細胞吹散,空氣干燥后用1∶30稀釋的Giemsa染色液染色10 min,自來水沖洗晾干;鏡檢并選擇分散良好的染色體用玻璃筆在反面標(biāo)記位置,-20 ℃冰箱中保存待用。

      2.1.2 動物細胞染色體標(biāo)本的制備

      將長成單層的貼壁細胞按1∶2進行傳代培養(yǎng)(如果是懸浮培養(yǎng)的細胞可以直接分瓶進行傳代);36 h后,用質(zhì)量濃度為0.04 mg/L的秋水仙素處理3 h或者低濃度秋水仙素處理過夜;用0.25%的胰蛋白酶處理單層細胞,待細胞收縮變圓時,棄去消化液并加入少許低滲液將細胞從瓶壁上洗脫下來(懸浮細胞可省去這一步);將細胞移入離心管,1 000 r/min離心10 min,棄上清;加入預(yù)熱的37 ℃的0.075 mol/L的KCl溶液低滲處理15 min;1 000 r/min離心10 min,棄上清;加入新鮮配制的卡諾固定液5 mL,邊加邊將細胞輕輕懸起,固定30 min;離心棄上清,再加5 mL新鮮配制的固定液,固定20 min;離心棄上清,根據(jù)沉淀細胞的多少,加固定液0.5~1 mL制成細胞懸液;吸1滴細胞懸液,距載玻片約20 cm的高度滴于預(yù)冷的干凈載玻片上,迅速對準(zhǔn)細胞吹氣,促進染色體分散;自然干燥后,用1∶20稀釋的Giemsa染色 5 min;鏡檢,選擇分散良好的染色體用玻璃筆在反面標(biāo)記位置,-20 ℃冰箱中保存待用。

      2.2 原位雜交

      將載玻片在45%的醋酸中浸泡5 min褪色,空氣干燥;在標(biāo)記處加30 μL、70%的去離子甲酰胺/2×SSC,蓋上蓋玻片,于干式恒溫器中70 ℃變性2~4 min;去掉蓋片,-20℃的冷乙醇系列(體積分數(shù)分別為70%,85%,100%)脫水,每級3 min,空氣干燥;每張標(biāo)本加10 μL用2×SSC稀釋探針至5 mg/L探針,蓋上蓋玻片;于濕盒中37 ℃雜交0.5~1.5 h;在4×SSC、0.2%Tween 20中室溫下避光洗滌10 min;蒸餾水沖洗片刻,空氣干燥(避光);滴加5 μL含有DAPI的防熒光淬滅劑,蓋上蓋玻片;熒光顯微鏡觀察,并用冷CCD拍照。

      3 實驗結(jié)果

      在熒光顯微鏡下,可以清楚地觀察到經(jīng)DAPI染色后,紫外光激發(fā)染色體發(fā)出的藍色熒光。植物細胞中,藍光激發(fā)同端粒序列結(jié)合的探針上的熒光基團發(fā)出綠色熒光(見圖1—圖3)。動物細胞中,綠光激發(fā)同端粒序列結(jié)合的探針上的熒光基團發(fā)出紅色熒光(見圖4—圖6)。

      圖1 玉米端粒熒光原位雜交(100×)

      圖2 水稻端粒熒光原位雜交(100×)

      圖3 黑麥端粒熒光原位雜交(100×)

      圖4 鼠雜交瘤細胞端粒熒光原位雜交(100×)

      圖5 倉鼠卵巢CHO細胞端粒熒光原位雜交

      圖6 小鼠淋巴瘤EL4細胞端粒熒光原位雜交(100×)

      4 注意事項

      (1) 染色體標(biāo)本制備注意事項[8-11]:

      ① 秋水仙素的濃度和處理時間的長短需把握好。處理不足,則染色體過于細長;處理過度,則染色體則會呈短粗狀,均不利于觀察。

      ② 低滲處理是染色體制備過程中的關(guān)鍵步驟,直接影響染色體形態(tài)好壞。低滲處理時細胞體積膨脹,容易破碎。因此,在低滲細胞混勻時,吹打動作要輕柔。

      ③ 固定是得到良好分散的染色體分裂相的重要步驟,考慮到基礎(chǔ)實驗課時間較短,故采用分步多次固定的辦法。

      ④ 滴片時使用的載玻片一定要非常干凈,此外,滴片的距離、滴加量多少也會影染色體分散的效果。

      (2) 原位雜交注意事項:

      ① 變性的時間和溫度是雜交是否成功的關(guān)鍵,為了保證變性期間溫度的穩(wěn)定,變性時可以使用PCR儀或干式恒溫器;

      ② 變性結(jié)束,要立即甩掉蓋玻片并放入70%的冰乙醇中脫水,以免DNA復(fù)性,探針結(jié)合效率降低;

      ③ 雜交過程應(yīng)保持染色體標(biāo)本的濕潤,可以在飯盒內(nèi)鋪一層濕潤的濾紙做成濕盒,然后在濕盒中避光進行雜交;

      ④ 在使用熒光顯微鏡進行觀察時,應(yīng)盡快找到合適的分裂相并進行圖像采集,防止在長時間強光照射下熒光的萃滅。

      5 討論

      5.1 課時安排

      基礎(chǔ)實驗課最突出的特點是每次上課的時間有限,一般情況下,每次實驗課的時間為4~5課時。因此,該實驗需要分兩次課完成。第1次課完成染色體標(biāo)本的制備,第2次課完成原位雜交。如果課時緊張,可由教師制作染色體標(biāo)本,學(xué)生只完成原位雜交的實驗內(nèi)容。

      在實驗材料的選擇上也可以根據(jù)具體情況靈活決定,如果考慮到植物染色體標(biāo)本制備的難度較大,可以只選擇動物細胞作為實驗材料。在細胞類型的選擇上,可以選擇生長較快、中期染色體形態(tài)典型的細胞系,一方面可以縮短細胞培養(yǎng)的時間,另一方面有利于學(xué)生觀察學(xué)習(xí)。

      5.2 教學(xué)組織

      同綜合性、開放性實驗相比,基礎(chǔ)實驗課有諸多自己的特點。如基礎(chǔ)性實驗學(xué)生人數(shù)較多、強調(diào)單人操作、注重對學(xué)生基本實驗技能的訓(xùn)練等。因此,需要在教學(xué)的組織上大膽創(chuàng)新。例如,本實驗中,熒光顯微鏡使用的訓(xùn)練是主要目的之一,但熒光顯微鏡價格昂貴,不可能大批量配備,在授課課程中,可以將學(xué)生分為若干小組,每個小組在0.5~1.5 h的范圍內(nèi)采用不同的雜交孵育時間,就可以將學(xué)生使用熒光顯微鏡的時間分散開,避免因儀器數(shù)量不足給教學(xué)帶來影響。

      6 結(jié)束語

      將科研過程中常用的實驗技術(shù)轉(zhuǎn)化為適合本科生基礎(chǔ)實驗課教學(xué)的實驗內(nèi)容是實驗課教學(xué)改革的一個重要方向。熒光原位雜交技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域研究的各個方面,將其轉(zhuǎn)化為合適本科生基礎(chǔ)實驗教學(xué)的內(nèi)容,對擴展學(xué)生的創(chuàng)新思維、提高學(xué)生的科研能力都有重要的意義[12-13]。

      [1] 陳成忠,于洪芹.熒光原位雜交技術(shù)及其應(yīng)用[J].生物學(xué)教學(xué),2007,32(1):2-4.

      [2] 王玲,寧順斌,宋運淳,等.熒光原位雜交技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用[J].植物學(xué)報,2000,42(11):1101-1107.

      [3] 楊國華,英加,李濱,等.熒光原位雜交技術(shù)在植物細胞遺傳學(xué)和繪制基因圖譜中的應(yīng)用現(xiàn)狀與展望[J].西北植物學(xué)報,2002,22(2):421-429.

      [4] 佘朝文,宋運淳.植物熒光原位雜交技術(shù)的發(fā)展及其在植物基因組分析中的應(yīng)用[J].武漢植物學(xué)研究,2006,24(4):365-376.

      [5] 陳琦,賈宇臣,王利,等.熒光原位雜交技術(shù)及其在醫(yī)學(xué)診斷上的應(yīng)用[J].現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展, 2012,12(5):988-991.

      [6] 徐月娟,沈蕾,趙鵬軍.多色-FISH 技術(shù)的進展及其在分子生物醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用[J].細胞生物學(xué)雜志, 2007,29(6):853-858.

      [7] 楊艷麗,楊長俊.DNA 熒光原位雜交(FISH) 技術(shù)在血液腫瘤診斷中的運用[J].中國醫(yī)學(xué)工程,2013,21(2):54,57.

      [8] 宋文芹,李秀蘭,許文勝,等.黑麥染色體的顯微分離與PCR 擴增[J].植物學(xué)報,1998,40(2):158-162.

      [9] 陳瑞陽,宋文芹,李秀蘭.植物染色體標(biāo)本制備的去壁、低滲法及其在細胞遺傳學(xué)中的意義[J].遺傳學(xué)報,1982,9(2):151-159.

      [10] 林穎,姜芬.動物細胞染色體制備實驗的改進[J].福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)報,2002,36(2):228-229.

      [11] 秦璐璐,耿建萍.雜交瘤細胞染色體制備及生物學(xué)意義初探[J].醫(yī)學(xué)理論與實踐,2008,21(4):375-376.

      [12] 解麗芳,林宏輝.利用基礎(chǔ)實驗教學(xué)平臺普及教研結(jié)合[J].實驗技術(shù)與管理,2012,29(11):250-252.

      [13] 王尚英,肖瀟.關(guān)于生物基礎(chǔ)實驗教學(xué)的探索[J].實驗技術(shù)與管理,2008,25(7):236-237.

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