蘭志霞,趙聯(lián)文,劉赪
摘 要:有絲分裂,是每個個體成長發(fā)育都離不開的,是細(xì)胞從間期開始,經(jīng)過前、中、后、末等時期分裂成兩個細(xì)胞的動態(tài)過程,但在實(shí)際學(xué)習(xí)過程中,往往只能看到細(xì)胞分裂某一時期的定態(tài)特征。如何讓人們更好的理解有絲分裂,本文通過Mathematica繪圖命令,將它的分裂過程以動畫效果演示出來,生動形象、易于理解。
關(guān)鍵字:Mathematica 有絲;分裂;細(xì)胞;繪圖命令
1 有絲分裂各時期的特征和變化
細(xì)胞分裂間期的特點(diǎn)是:有絲分裂間期分為G1、S、G2 三個階段,在間期,染色質(zhì)沒有高度螺旋化形成染色體,而是以染色質(zhì)的形式進(jìn)行DNA單鏈復(fù)制[1]。有絲分裂間期是有絲分裂全部過程重要準(zhǔn)備過程,是一個重要的基礎(chǔ)工作。(2)細(xì)胞分裂的前期最明顯的變化是,細(xì)胞核中出現(xiàn)染色體,在分裂間期復(fù)制的染色體,由于螺旋纏繞在一起,逐漸縮短變粗,形態(tài)越來越清楚;核膜解體逐漸消失,核仁逐漸消失,中心粒逐漸出現(xiàn)且向細(xì)胞兩極慢慢移動;紡錘絲逐漸出現(xiàn),隨中心粒逐步向兩極移,最終形成紡錘體。(3)細(xì)胞分裂的中期,紡錘體清晰可見,每條染色體的著絲點(diǎn)兩側(cè)都由紡錘絲附著在上面,紡錘絲牽引著染色體運(yùn)動,在紡錘絲牽引下,染色體的著絲點(diǎn)排列在細(xì)胞的“赤道板”上,所以在細(xì)胞分裂中期是觀察染色體的最好時期。(4)在后期,著絲點(diǎn)分裂、分離,姐妹染色單體在紡錘絲的牽引下分裂成兩個單染色體,在細(xì)胞內(nèi)的染色體數(shù)目增加了一倍,在同一個細(xì)胞內(nèi)具有兩套相同的染色體,兩套染色體分別在紡錘絲的牽引下向細(xì)胞的兩端移動,最終兩組染色單體到兩極.(5)末期,染色體分散并消失,紡錘體核,仁及核膜重新形成。(6)在分裂末期結(jié)束后,進(jìn)行的是質(zhì)分裂,產(chǎn)生分裂溝或細(xì)胞板,最后分成兩個子細(xì)胞。
2 用Mathematica動畫效果呈現(xiàn)有絲分裂
要將Mathematica軟件[2]與有絲分裂相結(jié)合,需要解決的問題主要有:1、作圖,包括細(xì)胞、細(xì)胞核、核仁、及不同時期出現(xiàn)的染色體、紡錘絲等的作圖問題;2、圖形組合,即把一個分裂期的單個作圖組合起來,形成一個完整的細(xì)胞圖;3、加以動畫效果,也就是在不同時期有不同的動態(tài)特征,通過命令將其形象生動的表現(xiàn)出來;4、將動態(tài)圖與動態(tài)圖結(jié)合起來,即不同的動畫效果如何在一個時期同時呈現(xiàn)。
2.1 繪制間期細(xì)胞 根據(jù)第一部分對間期作的的介紹,在Mathematica中用不同半徑的圓來繪制出細(xì)胞和細(xì)胞核,用實(shí)心圓繪制出核仁,同時細(xì)胞核內(nèi)有一些蛋白質(zhì)的合成,這個可以通過隨機(jī)點(diǎn)來反映,染色體已經(jīng)過復(fù)制,可以用正弦函數(shù)在自變量取不同取值范圍獲得它的圖形。然后將以上所做的圖形進(jìn)行恰當(dāng)?shù)慕M合,為了更形象一些,通過繪圖命令PlotStyle->{RGBColor[1,0,1]}給核仁加上顏色[3]。最后將所有圖像都做成點(diǎn)態(tài)圖,就可以用同一個作圖命令將隨機(jī)點(diǎn)與圖形組合到一起,實(shí)現(xiàn)間期細(xì)胞的完整圖形,但是,間期細(xì)胞在外表上看不出有關(guān)細(xì)胞核的形態(tài)或結(jié)構(gòu)上的任何變化,所以不需要加動態(tài)。
2.2 繪制前期細(xì)胞 由于細(xì)胞分裂前期,細(xì)胞的變化特點(diǎn)比較多,為了能形象的反映這一時期的各種變化,把它分為兩個程序。
2.2.1 前期 結(jié)合文章第一部分介紹,第一個程序主要做在間期圖形的基礎(chǔ)上,隨機(jī)點(diǎn)要逐漸減少用For循環(huán)[4]來解決,每次做出的點(diǎn)隨K的值的變化越來越少代表蛋白質(zhì)的減少;對于中心粒的圖,首先做出兩個交叉直線段代表它,然后改變它的顏色使它逐漸清晰呈現(xiàn);對于核仁的逐漸變小,直接使實(shí)心圓半徑逐漸減少即可.
2.2.2 前中期 第二個程序是通過做幾段圓弧,然后將圓弧修飾成虛線的,用來表示核膜的解體;代表核仁的實(shí)心圓半徑逐漸減小直至為零,體現(xiàn)核仁的消失;中心粒分開是通過改變直線的取值范圍和與y軸截距b的變化來實(shí)現(xiàn)[5];紡錘體可以通過二次函數(shù)開口大小,與y軸交點(diǎn)的高低,以及x的取值范圍來決定,同時隨著y變化移動;染色體的形態(tài)逐漸清晰,讓兩條表示姐妹染色單體的正弦曲線隨K值逐漸拉開距離,而且X的取值范圍減小使其逐漸變短。最后,將隨機(jī)點(diǎn)的定義及各種作圖命令放到一個Table[]作圖命令[3]中,就可以實(shí)現(xiàn)需要的前期有絲分裂的動態(tài)圖,
2.3 繪制中期細(xì)胞 對于中期,由第一部分的描述,用正弦函數(shù)和余弦函數(shù)做恰當(dāng)運(yùn)算組合起來即可得到;然后改變紡錘絲的開口,使其逐漸排在赤道板上,同時相應(yīng)改變正余弦函數(shù)的位置,讓染色體隨紡錘絲移動。依據(jù)前面的經(jīng)驗(yàn)組合圖形和加動態(tài)便完成所需的有絲分裂中期的動態(tài)圖.
2.4 繪制后期細(xì)胞 同樣依據(jù)第一部分的介紹,要實(shí)現(xiàn)染色體的分裂和向兩極移動,可以通過改變中期正余弦函數(shù)的周期[6],可得單條染色體圖,其它圖形在中期已作出,后期的關(guān)鍵問題在于細(xì)胞的微凹,經(jīng)多次試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)可通過畫兩個圓心分別在x軸上方和下方的圓,在控制畫圓的取值范圍后,改變?nèi)≈捣秶顾鼈冎饾u外移,從而呈現(xiàn)一個逐漸內(nèi)凹的效果,后期圖形。
2.5 繪制末期細(xì)胞 末期情況剛好與前期相反:出現(xiàn)核膜、核仁,消失紡錘體、染色體,改變程序中圖形的取值范圍即可實(shí)現(xiàn);不同的是在末期需要做兩個圓周和兩個實(shí)心圓,圓心分別上下平移便可得呈現(xiàn)細(xì)胞的逐漸分離;然后畫染色體的三角函數(shù)圖象逐漸變細(xì)成絲,說明染色體又變成了染色質(zhì).
2.6 質(zhì)分裂 在分裂末期結(jié)束后,進(jìn)行的是質(zhì)分裂:產(chǎn)生分裂溝或細(xì)胞板,最后分成兩個子細(xì)胞。對于質(zhì)分裂,在末期作圖基礎(chǔ)上,只需要在圓內(nèi)加入一些隨機(jī)點(diǎn),表示一個新細(xì)胞內(nèi)的某些蛋白質(zhì)顆粒;改變表染色質(zhì)的函數(shù)的y軸使其逐步往圓內(nèi)移體現(xiàn)染色質(zhì)往核內(nèi)移的特點(diǎn);表細(xì)胞的兩圓隨圓心逐漸上移或下移以及繪圖區(qū)間的增大,實(shí)現(xiàn)兩圓的逐漸分離,末期的分裂圖,見圖1。
圖1
3 結(jié)論
將Mathematica軟件與細(xì)胞有絲分裂相結(jié)合,通過Mathematica繪圖命令將有絲分裂的連續(xù)分裂過程生動形象的以動態(tài)形式呈現(xiàn)出來,方便大家對有絲分裂的理解和學(xué)習(xí),同時也讓大家對Mathematica軟件有所了解和認(rèn)識。
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