王 靜，王 丹

（河南師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院，河南 新鄉(xiāng) 453007）

網(wǎng)絡(luò)資源在生物學(xué)習(xí)中的應(yīng)用

王 靜，王 丹

（河南師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院，河南 新鄉(xiāng) 453007）

隨著信息技術(shù)的發(fā)展，網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)已經(jīng)成為大學(xué)生學(xué)習(xí)的主要方式之一，而網(wǎng)絡(luò)資源的使用是直接影響網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)效果的重要因素。本文從5個(gè)方面探討了網(wǎng)絡(luò)資源在生物專(zhuān)業(yè)學(xué)習(xí)中的應(yīng)用，從而使生物專(zhuān)業(yè)大學(xué)生在主動(dòng)學(xué)習(xí)過(guò)程中提高自己的科研素養(yǎng)以及實(shí)踐能力。

生物；網(wǎng)絡(luò)資源；學(xué)習(xí)

生命科學(xué)是21世紀(jì)發(fā)展最為迅速的學(xué)科之一[1]，該專(zhuān)業(yè)具有實(shí)驗(yàn)性、實(shí)踐性以及前沿性等特征。對(duì)于生物專(zhuān)業(yè)的大學(xué)生來(lái)說(shuō)，除了課堂學(xué)習(xí)之外，進(jìn)入試驗(yàn)室進(jìn)行一定的科學(xué)研究工作，對(duì)于培養(yǎng)自己的獨(dú)立創(chuàng)新能力以及適應(yīng)未來(lái)工作的能力有很大的益處。大學(xué)生在著手試驗(yàn)室工作之前，必須閱讀大量的文獻(xiàn)資料，迅速地了解本領(lǐng)域國(guó)內(nèi)外的最新研究進(jìn)展，一方面可以借鑒前人的研究成果，并以此為基礎(chǔ)開(kāi)展自己的工作，另一方面可以避免不必要的重復(fù)，節(jié)約人力、物力和財(cái)力。試驗(yàn)室工作完成后，會(huì)有大量試驗(yàn)數(shù)據(jù)，處理這些數(shù)據(jù)不可避免會(huì)用到一些生物軟件。查閱文獻(xiàn)資料和下載使用相關(guān)軟件，網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)很好的平臺(tái)。那么，如何有效的利用網(wǎng)絡(luò)資源，是大學(xué)生必須面對(duì)的問(wèn)題。本文將從以下幾方面來(lái)探討生物科學(xué)專(zhuān)業(yè)大學(xué)生如何充分利用網(wǎng)絡(luò)資源來(lái)提高自己的學(xué)習(xí)和科研水平：

一、充分利用學(xué)校的電子圖書(shū)館

目前，計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)飛速發(fā)展，幾乎所有的大學(xué)都建立了自己的電子圖書(shū)館，購(gòu)買(mǎi)了科技論文數(shù)據(jù)庫(kù)，提供大量的電子資源。除此以外，我們還可以通過(guò)館際互借等方法來(lái)獲取自己所需的文獻(xiàn)資料。這些方法使大學(xué)生在查閱資料的效率大大提高，并且，在使用時(shí)不需要額外付費(fèi)。因此，大學(xué)生可以充分利用學(xué)校的這一資源，方便快捷的查詢(xún)、下載自己所需的文獻(xiàn)資料。生物專(zhuān)業(yè)常用的中文數(shù)據(jù)庫(kù)有：中國(guó)學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)、中國(guó)學(xué)位全文數(shù)據(jù)庫(kù)、中國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議全文數(shù)據(jù)庫(kù)、萬(wàn)方數(shù)據(jù)、重慶維普《中文科技期刊》。英文電子期刊數(shù)據(jù)庫(kù)有：SCI數(shù)據(jù)庫(kù)、EI數(shù)據(jù)庫(kù)、Elsevier Science Direct全文期刊數(shù)據(jù)庫(kù)、Springer全文電子期刊數(shù)據(jù)庫(kù)、NSTL網(wǎng)絡(luò)版科技期刊數(shù)據(jù)庫(kù)。

二、通過(guò)網(wǎng)絡(luò)搜索引擎查找相關(guān)信息

網(wǎng)絡(luò)的普及可以使我們便捷得獲取豐富的資源，但是，網(wǎng)絡(luò)的高度開(kāi)放性讓我們每個(gè)人都有可能在網(wǎng)上發(fā)布信息。因此，獲取準(zhǔn)確可信的信息變得非常重要。如何在浩如煙海的信息中，快速有效地找到我們需要的信息？這就需要掌握一些搜索引擎。Google（http：//www.google.com）是一個(gè)搜索功能非常強(qiáng)大的搜索引擎，很值得一提的還有Google學(xué)術(shù)搜索（http：//scholar.google.com）和百度（http：//www.baidu. com）。其中，中文信息檢索大多使用百度。如果搜索英文信息，Google是個(gè)很好的選擇。

三、登陸生物網(wǎng)站并下載相關(guān)生物軟件

網(wǎng)絡(luò)上很多共享的資源，或者這些資源可以免費(fèi)獲取。不能小看這些共享的資源，它們可能會(huì)在試驗(yàn)前期或者分析數(shù)據(jù)時(shí)起到舉足輕重的作用。大學(xué)生可以利用網(wǎng)絡(luò)上的搜索引擎找到相關(guān)的生物網(wǎng)站。進(jìn)入到幾乎任何一個(gè)生物網(wǎng)站后，如果有足夠的耐心，我們可以找到絕大多數(shù)免費(fèi)公用的生物軟件，并且可能附帶使用說(shuō)明、工作原理等信息[2]。有的網(wǎng)站會(huì)提供免費(fèi)的在線服務(wù)，我們?cè)跒g覽網(wǎng)站的時(shí)候，一方面了解它的相關(guān)功能，另一方面也要學(xué)習(xí)使用流程。一旦自己試驗(yàn)需要，那么使用起來(lái)就會(huì)輕車(chē)熟路，節(jié)約不少時(shí)間。生物科學(xué)專(zhuān)業(yè)常用的生物網(wǎng)站有：①Online analysis tools（http：//molbiol-tools.ca/）：這是Guelph大學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)及分子生物學(xué)教授Andrew Kropinski整理的在線生物學(xué)分析工具網(wǎng)站，主要包括DNA序列、RNA序列、基因組、蛋白的在線分析等。②Basic Local Alignment Search Tool（BLAST）（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2231712）：這是生物專(zhuān)業(yè)功能最為完整的網(wǎng)上服務(wù)器。其中核苷酸分析包括酶切位點(diǎn)的查找，motif、開(kāi)讀框的搜索等，PCR引物設(shè)計(jì)，二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，多重序列比較以及分子進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建等；蛋白分析則包括酶切圖譜，功能區(qū)搜索，分子進(jìn)化分析，蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)等；此外還提供序列管理等功能。③GenBank（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/）：GenBank是美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）所維護(hù)的供公眾自由讀取的、帶注釋的DNA序列的總數(shù)據(jù)庫(kù)，包含70，000多種生物的核苷酸序列。每條紀(jì)錄都有編碼區(qū)（CDS）特征的注釋?zhuān)€包括氨基酸的翻譯。④The European Molecular Biology Laboratory（EMBL）（http：//www.embl.org/）：歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（EMBL）成立于1974年，由16個(gè)國(guó)家支持。在該網(wǎng)站可以進(jìn)行序列查找和檢索以及序列的配對(duì)、通過(guò)登陸號(hào)檢索EMBL核酸數(shù)據(jù)庫(kù)、通過(guò)FTP傳輸EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)文件；還可以分析蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)等，此外該網(wǎng)站還提供一些軟件。⑤DNA Data Bank of Japan（DDBJ）（http：//www.ddbj. nig.ac.jp/）：DDBJ數(shù)據(jù)庫(kù)創(chuàng)建于1984年。DDBJ數(shù)據(jù)庫(kù)主頁(yè)包括數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、數(shù)據(jù)提交、數(shù)據(jù)分析等功能。GenBank、EMBL和DDBJ這三大數(shù)據(jù)庫(kù)雖然具有各自不同的數(shù)據(jù)記錄格式，但是由于國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展，用戶(hù)可以任意地向其中任何一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)提交序列，所提交的序列也將從公布之日起同時(shí)在該三大數(shù)據(jù)庫(kù)中出現(xiàn)[3]。一般情況下，大學(xué)生需要了解和使用的生物軟件有：Bioedit：具有序列簡(jiǎn)單分析和序列對(duì)比功能的軟件；Clustal W：用來(lái)對(duì)核苷酸與蛋白質(zhì)序列進(jìn)行多序列比較的軟件；Clustal X：ClustalW Windows界面程序；）Cn3D：觀看蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的軟件；DNAStar5.03：序列分析軟件；DNAMAN：限制酶分析，引物設(shè)計(jì)，序列比對(duì)的軟件；FASTA：數(shù)據(jù)庫(kù)中查找同源序列軟件；GeneDoc：對(duì)序列進(jìn)行相關(guān)分析等操作的軟件；Primer Premier 5.0：核酸序列引物分析設(shè)計(jì)軟件；Peptool：蛋白分析軟件；Phylip：進(jìn)化樹(shù)分析軟件；Puzzle：核苷酸序列、蛋白質(zhì)序列相似性分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建工具；Paup：系統(tǒng)進(jìn)化分析軟件；TreeView：進(jìn)化樹(shù)處理軟件；SeqPup 0.9：生物分子序列編輯與分析軟件；SPSS：統(tǒng)計(jì)軟件。

四、關(guān)注一些生物論壇

論壇是網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下一種學(xué)習(xí)與交流的平臺(tái)，它可以突破常規(guī)交流在時(shí)間和地域上的局限性，和相關(guān)領(lǐng)域的科研人員進(jìn)行溝通。比如：試驗(yàn)過(guò)程中遇到了技術(shù)上的問(wèn)題，自己一時(shí)又難以解決，可以在論壇上和大家一起討論。往往這些問(wèn)題已有人碰到過(guò)，并且已經(jīng)找到了解決的辦法，討論的時(shí)候就可以得到他們的指點(diǎn)，不少難題迎刃而解。常見(jiàn)的生物論壇有：小木蟲(chóng)（http：//emuch.net/）、丁香園（http：//www. dxy.cn/）、生物谷（http：//www.bioon.com/）、中國(guó)生命科學(xué)論壇（http：//bbs.bioon.net/bbs/forum.php）、生物信息學(xué)論壇（http：//www.bioxxx.cn/）等。

五、通過(guò)電子郵件和作者溝通

大學(xué)生在閱讀文獻(xiàn)資料時(shí)，難免會(huì)遇到反復(fù)思考仍不得其解的問(wèn)題，有的學(xué)生可能會(huì)因?yàn)榍笾鸁o(wú)門(mén)而不了了之。其實(shí)，我們有一個(gè)非常好的求助對(duì)象，那就是作者。一般在期刊論文首頁(yè)的下方會(huì)留有作者的電子郵件信箱。我們?cè)谧屑?xì)閱讀論文之后，如果發(fā)現(xiàn)有疑惑的地方，可以通過(guò)電子郵件和作者進(jìn)行請(qǐng)教和討論，一般作者都會(huì)很好的給予答復(fù)。

綜上所述，大學(xué)生平時(shí)在完成學(xué)校設(shè)定的課程之余，可以以網(wǎng)絡(luò)為媒介，結(jié)合自身興趣，主動(dòng)探索，充分挖掘網(wǎng)絡(luò)資源的優(yōu)勢(shì)，從專(zhuān)業(yè)學(xué)習(xí)中選擇和確定相關(guān)課題，在指導(dǎo)教師的幫助下，以個(gè)人或小組的方式進(jìn)行科學(xué)研究，培養(yǎng)自己的創(chuàng)新精神和實(shí)踐能力。

[1]吉愛(ài)國(guó)，王偉莉，梁浩.在生物科學(xué)專(zhuān)業(yè)人才培養(yǎng)過(guò)程中強(qiáng)化海洋生物特色的探討[J].高等理科教育，2007，（5）：65-67.

[2]許忠能.生物信息學(xué)[M].第一版.北京：清華大學(xué)出版社，2008.

[3]邢美園，蘇開(kāi)顏.生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)——日本DDBJ數(shù)據(jù)庫(kù)及其檢索應(yīng)用[J].情報(bào)雜志，2003，（5）：59-61.

G40-056

A

1674-9324（2014）29-0244-02

王靜（1978-），女，博士，河南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，講師，主要研究方向進(jìn)化遺傳學(xué)。