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      表觀遺傳學(xué)與糖尿病腎病的研究進(jìn)展①

      2014-08-15 00:51:10呂俊高家林王李卓
      關(guān)鍵詞:賴氨酸基轉(zhuǎn)移酶乙?;?/a>

      呂俊,高家林,王李卓

      (皖南醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)教研室,皖南醫(yī)學(xué)院附屬弋磯山醫(yī)院內(nèi)分泌科,安徽 蕪湖 241002 E-mail:2802654657@qq.com)

      遺傳學(xué)是指基于基因序列改變所致基因表達(dá)水平變化,如基因突變、基因雜合丟失和微衛(wèi)星不穩(wěn)定等;而表觀遺傳學(xué)則是指基于非基因序列改變所致基因表達(dá)水平變化,如DNA甲基化和染色質(zhì)構(gòu)象變化等。表觀遺傳學(xué)(epigenetics)這一概念最早在1942年由康拉德·哈爾·沃丁頓提出,認(rèn)為基因型通過一些偶然的、不確定的機(jī)制決定了不同的表型,并指出表觀遺傳與遺傳是相對(duì)的。主要研究基因型和表型的關(guān)系。幾十年后,霍利迪對(duì)這個(gè)內(nèi)容作了補(bǔ)充和完善。即表觀遺傳學(xué)是基因的DNA序列不發(fā)生改變的前提下,基因的表達(dá)水平和功能發(fā)生改變,并產(chǎn)生可以遺傳的表型。主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾、微小RNA干擾等。其與腫瘤、糖尿病、心血管、代謝綜合征等多種疾病的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。

      糖尿病是世界第三大慢性疾病,嚴(yán)重危害著人類健康。隨著經(jīng)濟(jì)的發(fā)展和人均壽命的延長,我國糖尿病的患病率正在急劇增高,預(yù)計(jì)到2025年,我國糖尿病患者總數(shù)可能達(dá)到1億人左右。糖尿病腎病是糖尿病的嚴(yán)重并發(fā)癥。其發(fā)生率可達(dá)20%~50%之多。糖尿病腎病是糖尿病患者高死亡率的重要原因之一[1]。值得注意的是糖毒作用后即使血糖控制在正常范圍,糖尿病腎臟的病變依然持續(xù)進(jìn)展,而早期強(qiáng)化血糖控制則可產(chǎn)生持久的效益,這一現(xiàn)象被稱為“代謝記憶”[2]或者“遺留效應(yīng)”[3]。

      正常情況下,腎小球細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)的合成及降解與腎小球毛細(xì)血管叢的再生及修復(fù)保持一種高度協(xié)調(diào),它受各種細(xì)胞因子、蛋白酶及抑制因子的調(diào)控,是一個(gè)復(fù)雜的過程。任何一個(gè)環(huán)節(jié)的細(xì)微變化均可導(dǎo)致腎小球中ECM的合成與降解失衡從而出現(xiàn)腎小球基質(zhì)膜的破壞和ECM的堆積,導(dǎo)致腎小球的硬化。腎小球硬化是腎小球損傷的結(jié)局,而高血糖無疑是上述病變形成的始動(dòng)因素之一。糖尿病腎病相關(guān)基因的發(fā)現(xiàn)及其功能的闡明將為糖尿病腎病的早期診斷、基因治療提供有效的手段。即使血糖控制在理想狀態(tài)下,其炎癥仍能持續(xù)發(fā)生,間質(zhì)化繼續(xù)加重。提示存在“代謝記憶”,有研究指出可從表觀遺傳學(xué)水平闡明其發(fā)病機(jī)制。

      1 DNA甲基化、去甲基化

      1.1 DNA甲基化 是目前研究最為深入的表觀遺傳學(xué)機(jī)制之一[4],它是指S-腺苷甲硫氨酸(SAM)脫去1個(gè)甲基轉(zhuǎn)變?yōu)镾-腺苷同型半胱氨酸(SAH),同時(shí)將該甲基轉(zhuǎn)運(yùn)至胞嘧啶-鳥嘧啶(CpG)二核苷酸中的胞嘧啶第5位碳原子(c)上,修飾為5-甲基胞嘧啶(5-mC)。CpG二核苷酸在基因組中出現(xiàn)的頻率較低,但在特定區(qū)域,如基因啟動(dòng)子區(qū),CpG二核苷酸密集存在,可高達(dá)60%~70%,發(fā)揮調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄作用。DNA甲基化需在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下進(jìn)行。

      DNA發(fā)生甲基化后,可以通過以下三個(gè)方面直接或者間接影響該基因的表達(dá)[5]:①通過阻斷轉(zhuǎn)錄起始因子與啟動(dòng)子的結(jié)合直接抑制基因轉(zhuǎn)錄;②可招募甲基化CpG結(jié)合蛋白(methyl-CpG-binding proteins,MBPs),其與5-甲基胞嘧啶結(jié)合后,將進(jìn)一步阻礙轉(zhuǎn)錄起始因子與啟動(dòng)子結(jié)合;③還可招募組蛋白去乙?;感纬蓮?fù)合物,使組蛋白去乙?;?,導(dǎo)致染色質(zhì)聚縮成非活性致密結(jié)構(gòu),間接抑制基因轉(zhuǎn)錄,參與x染色體沉默、基因印跡、組織特異性基因表達(dá)等生理過程。

      1.2 DNA去甲基化 是5-甲基胞嘧啶經(jīng)過一系列反應(yīng)被胞嘧啶所取代的過程。長期以來,一直認(rèn)為去甲基化主要發(fā)生在DNA復(fù)制過程中,是一個(gè)被動(dòng)的過程,然而目前,有關(guān)DNA主動(dòng)去甲基化的機(jī)制被提出[6]。

      2 組蛋白修飾

      組蛋白修飾是表觀遺傳學(xué)中的另外一項(xiàng)重要的內(nèi)容。組蛋白是真核生物染色體的基本結(jié)構(gòu)蛋白,是一類小分子堿性蛋白質(zhì)[7]。在真核生物體內(nèi),DNA以環(huán)狀超螺旋形式圍繞在4種核心組蛋白(H2A、H2B、H3、H4)周圍組成核小體,是染色質(zhì)的基本單位。組蛋白H1結(jié)合于核小體間的連接DNA(1inker DNA)上,使核小體成串排列,形成串珠樣結(jié)構(gòu)。組蛋白有兩個(gè)活性末端:即羧基端和氨基端。

      核心組蛋白的N末端在物種之間十分保守且易發(fā)生各種類型轉(zhuǎn)錄后修飾,這種常見的組蛋白外在修飾作用包括乙?;?、甲基化、磷酸化、泛素化、糖基化、ADP核糖基化、羰基化等,它們都是組蛋白密碼的基本元素。該結(jié)構(gòu)不僅利于壓縮和保護(hù)DNA,而且可以保存遺傳信息和控制基因表達(dá)[8]。修飾后的殘基通過兩種途徑影響基因的功能,一是通過改變構(gòu)像或者改變組蛋白電荷而影響核小體-核小體或DNA-核小體相互作用。從而改變?nèi)旧|(zhì)的疏松或者凝集狀態(tài);二是形成靶點(diǎn),招募特定蛋白質(zhì)影響轉(zhuǎn)錄過程。

      2.1 組蛋白甲基化 主要發(fā)生在賴氨酸和精氨酸側(cè)鏈的氮原子上,其中賴氨酸的甲基化被認(rèn)為是具有穩(wěn)定性和遺傳性。由甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基酶催化完成。甲基轉(zhuǎn)移酶主要有三個(gè)蛋白家族:蛋白質(zhì)精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族、SET家族和非SET家族[9]。組蛋白賴氨酸甲基化主要發(fā)生在H3和H4上。組蛋白精氨酸的甲基化和基因的激活密切相關(guān)[10-11]。而 H3、H4精氨酸的去甲基化則可能導(dǎo)致基因沉默。甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基轉(zhuǎn)移酶可以逆轉(zhuǎn)調(diào)節(jié)組蛋白的甲基化過程,對(duì)基因的表達(dá)起著決定性的作用[12]。譬如:轉(zhuǎn)甲基酶set7/9可能與RNA聚合酶II相互作用共同調(diào)節(jié)胰島β細(xì)胞的基因表達(dá);賴氨酸4和賴氨酸36發(fā)生的組蛋白H3甲基化,常使常染色質(zhì)結(jié)構(gòu)疏松伴隨轉(zhuǎn)錄能力的增強(qiáng),但是賴氨酸9和27發(fā)生的組蛋白H3的甲基化則使染色體的結(jié)構(gòu)致密,并伴隨有基因的沉默[13]。

      2.2 組蛋白的乙?;?組蛋白的乙酰化主要發(fā)生在H3和H4的N端的賴氨酸位點(diǎn)上,主要由乙酰轉(zhuǎn)移酶和去乙酰轉(zhuǎn)移酶協(xié)調(diào)進(jìn)行。乙酰轉(zhuǎn)移酶可以使組蛋白賴氨酸的相關(guān)位點(diǎn)乙酰化減弱組蛋白和DNA結(jié)合的能力,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。去乙?;缚梢允菇M蛋白去乙?;鰪?qiáng)組蛋白與DNA結(jié)合能力,抑制轉(zhuǎn)錄。譬如賴氨酸殘基的乙?;彩悄壳傲私獾谋容^清楚的一個(gè)過程[14],乙?;蟮腄NA結(jié)構(gòu)變得松散使轉(zhuǎn)錄因子易于結(jié)合上去,這一過程往往伴隨DNA的轉(zhuǎn)錄活化[15],這一修飾過程同時(shí)又可以被組蛋白去乙?;杆孓D(zhuǎn)。這些修飾作用由修飾位點(diǎn)和修飾程度所決定,或互相協(xié)同或互相拮抗,動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)基因表達(dá)。

      3 糖尿病腎病與表觀遺傳修飾

      無論1型還是2型糖尿病都可顯著加速微血管的病變從而引發(fā)并發(fā)癥如糖尿病腎病。涉及其中的主要事件包括免疫調(diào)控炎癥因子的表達(dá),糖基化終產(chǎn)物(advanced glycation end products,AGEs)的生成,多元醇和氨基己糖代謝途徑及PKC信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的激活等[16-17]。Wren等[18]通過 Data-Mining分析羅列了引起糖尿病及其并發(fā)癥的諸多因素,結(jié)果發(fā)現(xiàn)“甲基化”和“染色質(zhì)”的統(tǒng)計(jì)得分最高,表明機(jī)體的表觀遺傳修飾是糖尿病發(fā)生發(fā)展的重要原因。

      3.1 DNA甲基化與糖尿病腎病 表觀遺傳因素在基因和環(huán)境之間起到調(diào)節(jié)作用,并影響糖尿病及其并發(fā)癥。Bell等[19]測(cè)定了兩組高加索人外周血甲基化水平(分別為糖尿病組和正常組),發(fā)現(xiàn)兩組的DNA甲基化水平有著明顯的差異。也有研究表明DNA甲基化修飾可能是糖尿病的早期事件。最新研究對(duì)唾液中提取的DNA基因進(jìn)行甲基化水平測(cè)定,發(fā)現(xiàn)糖尿病腎?。╠iabetic nephropathy,DN)不同的發(fā)展階段 DNA 的甲基化差異顯著,根據(jù)DN的發(fā)展階段分成兩組,一組是糖尿病終末期腎病與另外一組是無腎臟并發(fā)癥的糖尿病患者組。發(fā)現(xiàn)此兩組至少有兩個(gè)CpG位點(diǎn)的甲基化存在著明顯的差異[20]。有學(xué)者進(jìn)一步指出糖尿病大鼠腎組織內(nèi)CpG二核苷酸C堿基處的DNA甲基化模式發(fā)生改變,并伴隨DNA甲基化酶、RNA聚合酶的活性下降。并且通過高通量分析DNA甲基化確定了至少19個(gè)CpG位點(diǎn)與DN的發(fā)生密切相關(guān),但在1型糖尿病患者中,糖尿病相關(guān)基因UNC13B則出現(xiàn)了DNA的高甲基化。這說明DNA的甲基化在DN中的作用機(jī)制以及作用模式比較復(fù)雜。在新近的一項(xiàng)臨床試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)糖尿病患者血清白細(xì)胞介素17(interleukin-17,IL-17)、白細(xì)胞介素6(interleukin-6,IL-6)、超敏CRP(hypersensitive C-ractive protein,hsCRP)等炎癥因子明顯高于健康組(P<0.05),且糖尿病腎病組顯著高于單純糖尿病組(P<0.05)[21]。從表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域探索機(jī)制,采用甲基化特異性PCR技術(shù)(Methyl-specific PCR,MSP)檢測(cè)大鼠主動(dòng)脈各炎癥因子基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化水平,結(jié)果顯示糖尿病組IL-17、IL-6、腫瘤壞死因子α(TNF-α)等基因啟動(dòng)子區(qū)的DNA甲基化水平顯著低于正常組,并與mRNA和蛋白的表達(dá)水平成負(fù)相關(guān)。上述研究提示高糖誘導(dǎo)基因組DNA甲基化水平改變致炎性基因高表達(dá)可能是糖尿病腎病病變一個(gè)潛在原因[18]。

      3.2 組蛋白修飾與糖尿病腎病 組蛋白修飾是表觀遺傳學(xué)中的另一項(xiàng)重要的內(nèi)容。其在糖尿病腎病的發(fā)病過程中也扮演著重要的角色。目前對(duì)于糖尿病腎病的發(fā)病機(jī)制存在一個(gè)共識(shí),即DN患者的腎臟血管發(fā)生了炎癥改變。與單純的糖尿病人相比,炎癥因子均有不同程度的升高。NF-ΚB是DN炎癥通路的重要因子之一。當(dāng)機(jī)體處于高糖狀態(tài)或者血糖控制不佳時(shí),NF-ΚB的含量明顯升高[17]。繼而可以募集炎癥細(xì)胞在腎臟血管壁聚集并活化下游的炎癥因子,從而造成腎臟的血管炎性損傷,繼而出現(xiàn)臨床癥狀。Sayyed等[22]將暴露于高糖環(huán)境的牛主動(dòng)脈內(nèi)皮細(xì)胞的染色質(zhì)免疫提純,發(fā)現(xiàn)組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶Set7富集于NF-KB p65基因的啟動(dòng)子區(qū)激活轉(zhuǎn)錄,當(dāng)小干擾RNA(small interferingRNA,siRNA)使Set7沉默或敲除時(shí),高糖無法誘導(dǎo)NF-KB p65基因的高表達(dá)[23]。Set7為特異性的單甲基化酶靶向作用于組蛋白賴氨酸4(H3K4)[24],表明高糖致NF-KB表達(dá)增加可能是通過Set7催化H3K4ml實(shí)現(xiàn)的。

      腎臟細(xì)胞外基質(zhì)過度蓄積和腎小管上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)型將導(dǎo)致腎臟纖維化,而腎臟纖維化和DN發(fā)病密切相關(guān)。組蛋白去乙酰酶決定了組蛋白乙?;癄顟B(tài),從而調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。實(shí)驗(yàn)證明,組蛋白去乙酰酶-2的活性在糖尿病模型大鼠中明顯增強(qiáng)。并且還發(fā)現(xiàn),組蛋白去乙酰酶抑制劑能明顯減少細(xì)胞外基質(zhì)的mRNA和蛋白的表達(dá),并能防止腎小管上皮細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)型。同時(shí)在正常大鼠的腎小管上皮細(xì)胞中用RNA干擾的方法是組蛋白去乙酰酶-2基因沉默后纖維連接蛋白的mRNA的表達(dá)水平有所減少[25]。

      4 結(jié)語

      近年來,表觀遺傳學(xué)對(duì)糖尿病腎病的具體作用機(jī)制還有待于進(jìn)一步研究,但是已日益受到中外學(xué)者的重視,而且有可能成為未來治療策略的理論基礎(chǔ)。從理論上講表觀遺傳學(xué)不僅可以揭示糖尿病腎病的發(fā)病機(jī)制,而且表觀遺傳藥物具有比傳統(tǒng)藥物更高的治療潛力和較低的不良反應(yīng)?,F(xiàn)在各種表觀遺傳藥物,如DNA甲基化抑制劑等正在不同程度的研究中。我們相信在征服糖尿病腎病的道路上,表觀遺傳學(xué)將成為最有利最可靠的工具之一。

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