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      鉤齒溲疏的SRAP遺傳多樣性分析

      2014-12-23 11:00:07呂俊杰任瑩徐秀榮梁婷婷臧德奎
      山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年11期
      關(guān)鍵詞:遺傳多樣性

      呂俊杰+任瑩+徐秀榮+梁婷婷+臧德奎

      摘 要:運(yùn)用SRAP分子標(biāo)記研究了山東省3個(gè)鉤齒溲疏居群的遺傳多樣性,結(jié)果顯示,用15對(duì)引物共檢測(cè)到244個(gè)位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)167個(gè),物種水平多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL) 68.44%,Neis基因多樣性指數(shù)(H) 0.2158,Shannons信息指數(shù)(I)0.3282,數(shù)據(jù)表明鉤齒溲疏有較高的遺傳多樣性水平;居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,表明居群間遺傳變異只占36.85%,遠(yuǎn)低于居群內(nèi)遺傳分化;在居群水平上,以嶗山鉤齒溲疏居群的遺傳多樣性最高,徂徠山最低;居群間遺傳一致度(GI)和遺傳距離(GD)變化范圍分別為0.8350~0.8884和0.1184~0.1803,居群間的遺傳距離與地理位置間沒有直接相關(guān)性。

      關(guān)鍵詞:鉤齒溲疏;SRAP;遺傳多樣性

      中圖分類號(hào):S685.990.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2014)11-0018-05

      鉤齒溲疏(Deutzia baroniana)屬于虎耳草科(Saxifragaceae)溲疏屬(Deutzia),落葉灌木,分布于遼寧、河北、山西、陜西、山東、江蘇和河南[1]。鉤齒溲疏花朵潔白,繁密而素凈,花期長(zhǎng),且盛開于初夏,正值少花時(shí)節(jié),宜叢植于山坡、草坪、路旁或林緣,也是巖石園、花籬的常用材料,花枝可作插花觀賞。鉤齒溲疏適應(yīng)性非常強(qiáng),常生于溝谷、林緣或巖石縫中,耐旱、耐瘠薄、抗寒,對(duì)于干旱、少雨的北方城市綠化極為適宜,是北方十分難得的園林綠化、美化材料。此外,鉤齒溲疏根、葉、果還可藥用。因此,鉤齒溲疏具有很高的觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值,是一種值得開發(fā)的野生植物資源,值得大力引種并繁育推廣。

      一個(gè)物種之所以能繁殖存活,并且適應(yīng)環(huán)境改變,根本原因在于其遺傳多樣性[2]。居群對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力在一定程度上由居群的遺傳多樣性水平制約著,因此通過研究其遺傳多樣性水平可預(yù)測(cè)這個(gè)居群未來的發(fā)展趨勢(shì)[3]。而目前尚未見從DNA水平上對(duì)鉤齒溲疏的遺傳多樣性進(jìn)行分析的研究和報(bào)道。

      相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)是通過設(shè)計(jì)獨(dú)特的引物對(duì)基因ORFs(Open reading frames)的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增并分析的標(biāo)記手段[4]。目前已成功應(yīng)用于作物遺傳多樣性評(píng)價(jià)、指紋圖譜構(gòu)建、重要性狀的標(biāo)記以及相關(guān)基因的克隆等方面[5~8]。本研究對(duì)山東省內(nèi)21份鉤齒溲疏進(jìn)行SRAP遺傳多樣性分析,旨在研究其遺傳多樣性水平,為開發(fā)利用鉤齒溲疏野生資源、在景觀應(yīng)用中選育優(yōu)良品種提供分子水平的依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      試驗(yàn)樣品于2012~2013年采自山東嶗山、泰山和徂徠山,共21份樣品(表1)。同一居群相鄰植株采樣間距30 m以上,采取新鮮幼嫩葉片放入密封袋中,用變色硅膠干燥。記錄所采樣品的小地名、海拔、經(jīng)緯度并編號(hào)。

      1.2 DNA提取

      選用改良的CTAB法[9]提取樣品總DNA,用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量,用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度后用ddH2O稀釋至50 ng/μL,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.3 SRAP-PCR反應(yīng)體系和程序

      SRAP引物設(shè)計(jì)參照Li等[4],13個(gè)正向引物和19個(gè)反向引物共組成247對(duì)引物組合,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。從中篩選出15對(duì)擴(kuò)增條帶數(shù)量多、清晰、穩(wěn)定的引物組合(表2)用于正式擴(kuò)增。

      反應(yīng)體系為25 μL:10×PCR Buffer 2.5 μL,模板DNA 75 ng,Mg2+ 3 mmol/L,dNTP 0.4 mmol/L,上下游引物各0.22 μmol,Taq DNA聚合酶1.5 U,用ddH2O調(diào)整使終體積為25 μL。

      PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,35℃退火1 min,72℃延伸1 min,5個(gè)循環(huán);94℃變性1 min,50℃退火1 min,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸7 min。

      PCR擴(kuò)增產(chǎn)物采用2%瓊脂糖凝膠電泳分離,溴化乙錠(EB)染色后在北京六一WD-9403CS型紫外儀上采集圖像。

      1.4 數(shù)據(jù)分析

      根據(jù)擴(kuò)增條帶結(jié)果,選取易于識(shí)別的條帶,在相同遷移率位置上,有記為1,反之為0,得到原始數(shù)據(jù)矩陣。用POPGENE 1.32統(tǒng)計(jì)各項(xiàng)遺傳參數(shù):多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)NPL、多態(tài)位點(diǎn)百分率PPL、等位基因數(shù)Na、有效等位基因數(shù)Ne;Neis基因多樣性指數(shù)H、Shannons信息指數(shù)I;居群間Neis遺傳一致度GI和遺傳距離GD;總遺傳多樣性Ht、群體內(nèi)的遺傳多樣性Hs、群體間遺傳分化系數(shù)Gst=Dst/Ht, Dst為群體間遺傳多樣性;體現(xiàn)基因流強(qiáng)度的群體每代遷移數(shù)(Nm)。應(yīng)用NTSYS pc version 2.10e 軟件根據(jù)Neis遺傳相似系數(shù)利用UPGMA方法進(jìn)行聚類,繪出聚類分析樹狀圖[10]。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 SRAP引物擴(kuò)增多態(tài)性分析

      鉤齒溲疏21份樣品用篩選出的15對(duì)引物擴(kuò)增(表3),共擴(kuò)增出244個(gè)位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)167個(gè),多態(tài)性位點(diǎn)百分率為68.44%,說明山東省鉤齒溲疏遺傳多樣性較高。每對(duì)引物產(chǎn)生的位點(diǎn)數(shù)為12~24個(gè),多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)為7~17個(gè),平均每對(duì)引物產(chǎn)生16.27個(gè)位點(diǎn)和11.13個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)。以ME7-EM15的多態(tài)性位點(diǎn)比率最高,為100%,H值和I值也均最高;ME10-EM15產(chǎn)生的多態(tài)位點(diǎn)比率最低,為38.89%,H值和I值也最低。

      2.2 居群遺傳多樣性分析

      在物種水平上,多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL)為68.44%。在居群水平上,多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL)介于32.79%~45.08%,平均為37.57%(表4);以嶗山遺傳多樣性最高,泰山次之,徂徠山最低。由Shannons信息指數(shù)計(jì)算的鉤齒溲疏物種水平的遺傳多樣性為0.3282,各居群的遺傳多樣性變化范圍為0.1776~0.2525,平均為0.2046。由Neis指數(shù)計(jì)算的物種水平的遺傳多樣性為0.2158,各居群基因多樣性介于0.1200~0.1719,平均為0.1383。該指數(shù)計(jì)算的值較Shannons信息指數(shù)低,但兩種方法計(jì)算的三個(gè)居群的遺傳多樣性大小同多態(tài)位點(diǎn)百分率大小順序是一致的,均是嶗山最高,徂徠山最低。數(shù)據(jù)表明山東省鉤齒溲疏物種水平的遺傳多樣性較高,居群水平的遺傳多樣性較低。

      2.3 居群遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳一致度分析

      對(duì)鉤齒溲疏3個(gè)自然居群的遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,總遺傳多樣性(Ht)為0.2190,其中居群內(nèi)(Hs)為0.1383,居群間(Dst)為0.0807,居群內(nèi)遺傳多樣度明顯高于居群間。居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,即居群間遺傳變異僅占36.85%,因此居群內(nèi)遺傳分化遠(yuǎn)高于居群間。在居群遺傳學(xué)研究中,基因流被劃分為高、中、低三水平[11],而鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,介于0.25~0.99,屬于中等水平,表明居群間基因流相對(duì)有限。

      統(tǒng)計(jì)鉤齒溲疏各居群間的Neis遺傳距離GD和遺傳一致度GI以進(jìn)一步分析鉤齒溲疏居群的遺傳結(jié)構(gòu)。3個(gè)居群間遺傳距離GD變動(dòng)在0.1184~0.1803,平均為0.1514(表5),以嶗山與泰山的遺傳距離最近,嶗山與徂徠山的最遠(yuǎn)。3個(gè)居群間遺傳一致度GI變化范圍為0.8350~0.8884,平均為0.8598。泰山與嶗山居群的遺傳距離是3個(gè)居群間的最小值,遺傳一致度最高,但在地理位置上距離較遠(yuǎn);同樣,泰山與徂徠山地理距離最近,但遺傳一致度反比泰山與嶗山的低。這表明,鉤齒溲疏居群間的遺傳距離和地理位置并非直接相關(guān)。

      2.4 聚類分析

      UPGMA聚類結(jié)果(圖1)顯示,泰山居群14號(hào)和15號(hào)樣品遺傳相似度最高,為0.91。在相似系數(shù)為0.74時(shí)所有樣品可以分為3大類:第Ⅰ大類包含7個(gè)樣品,全部來自徂徠山;第Ⅱ大類包括來自嶗山的4個(gè)樣品和來自泰山的8個(gè)樣品;第Ⅲ大類只有2個(gè)樣品,均來自嶗山。第Ⅱ大類在相似系數(shù)為0.81處又可分為3個(gè)亞類,第1亞類含1個(gè)樣品,第2亞類含3個(gè)樣品,均來自嶗山;第3亞類含8個(gè)樣品,全部來自泰山。

      由聚類圖可看出,徂徠山的樣品單獨(dú)聚為一個(gè)大類,泰山的樣品聚在一個(gè)亞類里,只有嶗山的樣品分布在2個(gè)大類中,這反映出嶗山居群豐富的遺傳多樣性。同時(shí),徂徠山樣品單獨(dú)聚為第Ⅰ大類,泰山和嶗山的部分樣品聚為第Ⅱ大類,表明了嶗山與泰山的遺傳相似度較高。

      聚類結(jié)果顯示,多數(shù)情況下樣品來源決定樣品間的親緣關(guān)系,地理來源相同的樣品傾向于聚在一起,但供試樣品的聚類結(jié)果又并非嚴(yán)格按照地理來源來劃分。說明山東鉤齒溲疏的遺傳分化并非受地理來源單一因素的影響,是多個(gè)因素綜合作用的結(jié)果。

      3 討論

      在體現(xiàn)居群內(nèi)變異水平方面,多態(tài)位點(diǎn)百分率是重要指標(biāo)之一。在物種水平上鉤齒溲疏的多態(tài)位點(diǎn)百分率為68.44%,表明山東省內(nèi)鉤齒溲疏有較豐富的遺傳多樣性。

      Loveless等[12]曾統(tǒng)計(jì)過不同類型植物的遺傳變異水平和居群分化程度,得出了大范圍連續(xù)分布的異交植物的遺傳變異大部分存在于居群內(nèi)的結(jié)論;而鉤齒溲疏居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,表明遺傳分化主要存在于居群內(nèi),同這一結(jié)論類似。鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,表明居群間基因流相對(duì)有限,是3個(gè)居群間存在一定程度的遺傳分化的原因之一。

      在居群水平上,徂徠山的遺傳多樣性最低,應(yīng)與徂徠山鉤齒溲疏生境類型變化相對(duì)有限有關(guān)。而嶗山居群的遺傳多樣性最為豐富,可能與嶗山的地理、氣候條件更為優(yōu)越和復(fù)雜有關(guān)。嶗山地處山東半島,東、南、北三面環(huán)海,西面與陸地相接。由于受海洋影響,氣候溫暖濕潤(rùn),南坡和北坡氣候迥異。嶗山植被類型豐富,群落組成上南坡?lián)碛休^多的亞熱帶區(qū)系成分,而北坡則以長(zhǎng)白區(qū)系成分為主[13]。嶗山復(fù)雜多樣的生境類型,高度的空間異質(zhì)性使得鉤齒溲疏不同基因型的植株都可以生長(zhǎng),所以遺傳多樣性處于較高水平。生態(tài)因子可作為控制居群中基因型頻率的一種選擇壓力,在相當(dāng)程度上對(duì)居群的遺傳分化起作用[14]。反過來,遺傳多樣性也是物種適應(yīng)環(huán)境變化的基礎(chǔ)。因此可以推測(cè),嶗山鉤齒溲疏居群較高的遺傳多樣性是對(duì)嶗山優(yōu)越、復(fù)雜的生態(tài)環(huán)境長(zhǎng)期適應(yīng)的結(jié)果。

      在調(diào)查中發(fā)現(xiàn),鉤齒溲疏嶗山居群豐富的遺傳多樣性不僅體現(xiàn)在分子水平上,也反映在形態(tài)上,尤其是花朵的大小,葉片的大小、形狀等。形態(tài)上豐富的變異為開發(fā)利用鉤齒溲疏野生資源、選育優(yōu)良類型提供了基礎(chǔ)。

      參 考 文 獻(xiàn):

      [1] 中國(guó)植物志編委會(huì). 中國(guó)植物志[M]. 北京: 科學(xué)出版社, 1982: 103-104.

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      2.3 居群遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳一致度分析

      對(duì)鉤齒溲疏3個(gè)自然居群的遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,總遺傳多樣性(Ht)為0.2190,其中居群內(nèi)(Hs)為0.1383,居群間(Dst)為0.0807,居群內(nèi)遺傳多樣度明顯高于居群間。居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,即居群間遺傳變異僅占36.85%,因此居群內(nèi)遺傳分化遠(yuǎn)高于居群間。在居群遺傳學(xué)研究中,基因流被劃分為高、中、低三水平[11],而鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,介于0.25~0.99,屬于中等水平,表明居群間基因流相對(duì)有限。

      統(tǒng)計(jì)鉤齒溲疏各居群間的Neis遺傳距離GD和遺傳一致度GI以進(jìn)一步分析鉤齒溲疏居群的遺傳結(jié)構(gòu)。3個(gè)居群間遺傳距離GD變動(dòng)在0.1184~0.1803,平均為0.1514(表5),以嶗山與泰山的遺傳距離最近,嶗山與徂徠山的最遠(yuǎn)。3個(gè)居群間遺傳一致度GI變化范圍為0.8350~0.8884,平均為0.8598。泰山與嶗山居群的遺傳距離是3個(gè)居群間的最小值,遺傳一致度最高,但在地理位置上距離較遠(yuǎn);同樣,泰山與徂徠山地理距離最近,但遺傳一致度反比泰山與嶗山的低。這表明,鉤齒溲疏居群間的遺傳距離和地理位置并非直接相關(guān)。

      2.4 聚類分析

      UPGMA聚類結(jié)果(圖1)顯示,泰山居群14號(hào)和15號(hào)樣品遺傳相似度最高,為0.91。在相似系數(shù)為0.74時(shí)所有樣品可以分為3大類:第Ⅰ大類包含7個(gè)樣品,全部來自徂徠山;第Ⅱ大類包括來自嶗山的4個(gè)樣品和來自泰山的8個(gè)樣品;第Ⅲ大類只有2個(gè)樣品,均來自嶗山。第Ⅱ大類在相似系數(shù)為0.81處又可分為3個(gè)亞類,第1亞類含1個(gè)樣品,第2亞類含3個(gè)樣品,均來自嶗山;第3亞類含8個(gè)樣品,全部來自泰山。

      由聚類圖可看出,徂徠山的樣品單獨(dú)聚為一個(gè)大類,泰山的樣品聚在一個(gè)亞類里,只有嶗山的樣品分布在2個(gè)大類中,這反映出嶗山居群豐富的遺傳多樣性。同時(shí),徂徠山樣品單獨(dú)聚為第Ⅰ大類,泰山和嶗山的部分樣品聚為第Ⅱ大類,表明了嶗山與泰山的遺傳相似度較高。

      聚類結(jié)果顯示,多數(shù)情況下樣品來源決定樣品間的親緣關(guān)系,地理來源相同的樣品傾向于聚在一起,但供試樣品的聚類結(jié)果又并非嚴(yán)格按照地理來源來劃分。說明山東鉤齒溲疏的遺傳分化并非受地理來源單一因素的影響,是多個(gè)因素綜合作用的結(jié)果。

      3 討論

      在體現(xiàn)居群內(nèi)變異水平方面,多態(tài)位點(diǎn)百分率是重要指標(biāo)之一。在物種水平上鉤齒溲疏的多態(tài)位點(diǎn)百分率為68.44%,表明山東省內(nèi)鉤齒溲疏有較豐富的遺傳多樣性。

      Loveless等[12]曾統(tǒng)計(jì)過不同類型植物的遺傳變異水平和居群分化程度,得出了大范圍連續(xù)分布的異交植物的遺傳變異大部分存在于居群內(nèi)的結(jié)論;而鉤齒溲疏居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,表明遺傳分化主要存在于居群內(nèi),同這一結(jié)論類似。鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,表明居群間基因流相對(duì)有限,是3個(gè)居群間存在一定程度的遺傳分化的原因之一。

      在居群水平上,徂徠山的遺傳多樣性最低,應(yīng)與徂徠山鉤齒溲疏生境類型變化相對(duì)有限有關(guān)。而嶗山居群的遺傳多樣性最為豐富,可能與嶗山的地理、氣候條件更為優(yōu)越和復(fù)雜有關(guān)。嶗山地處山東半島,東、南、北三面環(huán)海,西面與陸地相接。由于受海洋影響,氣候溫暖濕潤(rùn),南坡和北坡氣候迥異。嶗山植被類型豐富,群落組成上南坡?lián)碛休^多的亞熱帶區(qū)系成分,而北坡則以長(zhǎng)白區(qū)系成分為主[13]。嶗山復(fù)雜多樣的生境類型,高度的空間異質(zhì)性使得鉤齒溲疏不同基因型的植株都可以生長(zhǎng),所以遺傳多樣性處于較高水平。生態(tài)因子可作為控制居群中基因型頻率的一種選擇壓力,在相當(dāng)程度上對(duì)居群的遺傳分化起作用[14]。反過來,遺傳多樣性也是物種適應(yīng)環(huán)境變化的基礎(chǔ)。因此可以推測(cè),嶗山鉤齒溲疏居群較高的遺傳多樣性是對(duì)嶗山優(yōu)越、復(fù)雜的生態(tài)環(huán)境長(zhǎng)期適應(yīng)的結(jié)果。

      在調(diào)查中發(fā)現(xiàn),鉤齒溲疏嶗山居群豐富的遺傳多樣性不僅體現(xiàn)在分子水平上,也反映在形態(tài)上,尤其是花朵的大小,葉片的大小、形狀等。形態(tài)上豐富的變異為開發(fā)利用鉤齒溲疏野生資源、選育優(yōu)良類型提供了基礎(chǔ)。

      參 考 文 獻(xiàn):

      [1] 中國(guó)植物志編委會(huì). 中國(guó)植物志[M]. 北京: 科學(xué)出版社, 1982: 103-104.

      [2] Spiess E B. Genes in population[M]. 2nd ed. New York: John Wiley & Sons, 1989.

      [3] 潘瑩, 趙桂仿. 分子水平的遺傳多樣性及其測(cè)量方法[J]. 西北植物學(xué)報(bào), 1998, 18(4): 645-653.

      [4] Li G, Qurios C F. Sequence related amplified polymorphism(SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(3): 455-461.

      [5] 張安世, 刑智峰, 劉永英, 等. SRAP分子標(biāo)記及其應(yīng)用[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2007, 35(9): 2562-2563.

      [6] 李莉, 彭建營(yíng), 白瑞霞, 等. SRAP與TRAP標(biāo)記及其在園藝植物研究中的應(yīng)用[J]. 西北植物學(xué)報(bào), 2006, 26(8): 1749-1752.

      [7] 張鮮艷, 張飛, 陳發(fā)棣, 等. 12 份不同地理居群野菊的遺傳多樣性分析[J]. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 2011, 34(3): 48-54.

      [8] 林萍, 姚小華, 王開良, 等. 油茶長(zhǎng)林系列優(yōu)良無性系的SRAP分子鑒別及遺傳分析[J]. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào), 2010, 18(2): 272-279.

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      [11] Govindaraju D R. Relationship between dispersal ability and levels of gene flow in plants[J]. Oikos, 1988, 52: 31-35.

      [12] Loveless M D, Hamrick J L. Ecological determinants of genetic structure in plant populations[J]. Ann. Rev. Ecol. Syst., 1984, 15(1): 65-95.

      [13] 臧德奎. 山東嶗山森林植物區(qū)系的研究[D].南京: 南京林業(yè)大學(xué),1990.

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      2.3 居群遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳一致度分析

      對(duì)鉤齒溲疏3個(gè)自然居群的遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,總遺傳多樣性(Ht)為0.2190,其中居群內(nèi)(Hs)為0.1383,居群間(Dst)為0.0807,居群內(nèi)遺傳多樣度明顯高于居群間。居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,即居群間遺傳變異僅占36.85%,因此居群內(nèi)遺傳分化遠(yuǎn)高于居群間。在居群遺傳學(xué)研究中,基因流被劃分為高、中、低三水平[11],而鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,介于0.25~0.99,屬于中等水平,表明居群間基因流相對(duì)有限。

      統(tǒng)計(jì)鉤齒溲疏各居群間的Neis遺傳距離GD和遺傳一致度GI以進(jìn)一步分析鉤齒溲疏居群的遺傳結(jié)構(gòu)。3個(gè)居群間遺傳距離GD變動(dòng)在0.1184~0.1803,平均為0.1514(表5),以嶗山與泰山的遺傳距離最近,嶗山與徂徠山的最遠(yuǎn)。3個(gè)居群間遺傳一致度GI變化范圍為0.8350~0.8884,平均為0.8598。泰山與嶗山居群的遺傳距離是3個(gè)居群間的最小值,遺傳一致度最高,但在地理位置上距離較遠(yuǎn);同樣,泰山與徂徠山地理距離最近,但遺傳一致度反比泰山與嶗山的低。這表明,鉤齒溲疏居群間的遺傳距離和地理位置并非直接相關(guān)。

      2.4 聚類分析

      UPGMA聚類結(jié)果(圖1)顯示,泰山居群14號(hào)和15號(hào)樣品遺傳相似度最高,為0.91。在相似系數(shù)為0.74時(shí)所有樣品可以分為3大類:第Ⅰ大類包含7個(gè)樣品,全部來自徂徠山;第Ⅱ大類包括來自嶗山的4個(gè)樣品和來自泰山的8個(gè)樣品;第Ⅲ大類只有2個(gè)樣品,均來自嶗山。第Ⅱ大類在相似系數(shù)為0.81處又可分為3個(gè)亞類,第1亞類含1個(gè)樣品,第2亞類含3個(gè)樣品,均來自嶗山;第3亞類含8個(gè)樣品,全部來自泰山。

      由聚類圖可看出,徂徠山的樣品單獨(dú)聚為一個(gè)大類,泰山的樣品聚在一個(gè)亞類里,只有嶗山的樣品分布在2個(gè)大類中,這反映出嶗山居群豐富的遺傳多樣性。同時(shí),徂徠山樣品單獨(dú)聚為第Ⅰ大類,泰山和嶗山的部分樣品聚為第Ⅱ大類,表明了嶗山與泰山的遺傳相似度較高。

      聚類結(jié)果顯示,多數(shù)情況下樣品來源決定樣品間的親緣關(guān)系,地理來源相同的樣品傾向于聚在一起,但供試樣品的聚類結(jié)果又并非嚴(yán)格按照地理來源來劃分。說明山東鉤齒溲疏的遺傳分化并非受地理來源單一因素的影響,是多個(gè)因素綜合作用的結(jié)果。

      3 討論

      在體現(xiàn)居群內(nèi)變異水平方面,多態(tài)位點(diǎn)百分率是重要指標(biāo)之一。在物種水平上鉤齒溲疏的多態(tài)位點(diǎn)百分率為68.44%,表明山東省內(nèi)鉤齒溲疏有較豐富的遺傳多樣性。

      Loveless等[12]曾統(tǒng)計(jì)過不同類型植物的遺傳變異水平和居群分化程度,得出了大范圍連續(xù)分布的異交植物的遺傳變異大部分存在于居群內(nèi)的結(jié)論;而鉤齒溲疏居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,表明遺傳分化主要存在于居群內(nèi),同這一結(jié)論類似。鉤齒溲疏各居群間基因流(Nm)大小為0.8566,表明居群間基因流相對(duì)有限,是3個(gè)居群間存在一定程度的遺傳分化的原因之一。

      在居群水平上,徂徠山的遺傳多樣性最低,應(yīng)與徂徠山鉤齒溲疏生境類型變化相對(duì)有限有關(guān)。而嶗山居群的遺傳多樣性最為豐富,可能與嶗山的地理、氣候條件更為優(yōu)越和復(fù)雜有關(guān)。嶗山地處山東半島,東、南、北三面環(huán)海,西面與陸地相接。由于受海洋影響,氣候溫暖濕潤(rùn),南坡和北坡氣候迥異。嶗山植被類型豐富,群落組成上南坡?lián)碛休^多的亞熱帶區(qū)系成分,而北坡則以長(zhǎng)白區(qū)系成分為主[13]。嶗山復(fù)雜多樣的生境類型,高度的空間異質(zhì)性使得鉤齒溲疏不同基因型的植株都可以生長(zhǎng),所以遺傳多樣性處于較高水平。生態(tài)因子可作為控制居群中基因型頻率的一種選擇壓力,在相當(dāng)程度上對(duì)居群的遺傳分化起作用[14]。反過來,遺傳多樣性也是物種適應(yīng)環(huán)境變化的基礎(chǔ)。因此可以推測(cè),嶗山鉤齒溲疏居群較高的遺傳多樣性是對(duì)嶗山優(yōu)越、復(fù)雜的生態(tài)環(huán)境長(zhǎng)期適應(yīng)的結(jié)果。

      在調(diào)查中發(fā)現(xiàn),鉤齒溲疏嶗山居群豐富的遺傳多樣性不僅體現(xiàn)在分子水平上,也反映在形態(tài)上,尤其是花朵的大小,葉片的大小、形狀等。形態(tài)上豐富的變異為開發(fā)利用鉤齒溲疏野生資源、選育優(yōu)良類型提供了基礎(chǔ)。

      參 考 文 獻(xiàn):

      [1] 中國(guó)植物志編委會(huì). 中國(guó)植物志[M]. 北京: 科學(xué)出版社, 1982: 103-104.

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      [3] 潘瑩, 趙桂仿. 分子水平的遺傳多樣性及其測(cè)量方法[J]. 西北植物學(xué)報(bào), 1998, 18(4): 645-653.

      [4] Li G, Qurios C F. Sequence related amplified polymorphism(SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(3): 455-461.

      [5] 張安世, 刑智峰, 劉永英, 等. SRAP分子標(biāo)記及其應(yīng)用[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2007, 35(9): 2562-2563.

      [6] 李莉, 彭建營(yíng), 白瑞霞, 等. SRAP與TRAP標(biāo)記及其在園藝植物研究中的應(yīng)用[J]. 西北植物學(xué)報(bào), 2006, 26(8): 1749-1752.

      [7] 張鮮艷, 張飛, 陳發(fā)棣, 等. 12 份不同地理居群野菊的遺傳多樣性分析[J]. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 2011, 34(3): 48-54.

      [8] 林萍, 姚小華, 王開良, 等. 油茶長(zhǎng)林系列優(yōu)良無性系的SRAP分子鑒別及遺傳分析[J]. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào), 2010, 18(2): 272-279.

      [9] Kidwell K K, Osborn T C. Simple plant DNA isolation procedures[M]//Beckman J, Osborn T C. Plant genomes: methods for genetic and physical mapping. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1992: 1-13.

      [10] 徐克學(xué). 數(shù)量分類學(xué)[M]. 北京: 科學(xué)出版社,1994.

      [11] Govindaraju D R. Relationship between dispersal ability and levels of gene flow in plants[J]. Oikos, 1988, 52: 31-35.

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      [13] 臧德奎. 山東嶗山森林植物區(qū)系的研究[D].南京: 南京林業(yè)大學(xué),1990.

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