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      質(zhì)粒介導喹諾酮類藥物耐藥機制的研究現(xiàn)狀及進展*

      2015-02-21 17:38:57王垚綜述吳疆審校
      西部醫(yī)學 2015年7期
      關鍵詞:喹諾酮類藥物質(zhì)粒

      王垚 綜述 吳疆 審校

      (成都中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院, 四川 成都 611137)

      質(zhì)粒介導喹諾酮類藥物耐藥機制的研究現(xiàn)狀及進展*

      王垚 綜述 吳疆 審校

      (成都中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院, 四川 成都 611137)

      喹諾酮類抗菌藥物在臨床中應用相當廣泛,同其他抗菌藥物一樣,喹諾酮類也存在嚴重的耐藥問題。質(zhì)粒介導的喹諾酮類藥物耐藥機制(PMQR)為其耐藥的重要原因,近年的研究發(fā)現(xiàn)PMQR主要由qnr、aac(6’)-Ib-cr、qepA和oqxAB等基因介導,這些基因介導的耐藥機制及其各自的流行率存在很大差異,上述基因還能通過質(zhì)粒接合而廣泛傳播。研究還發(fā)現(xiàn)上述基因與超廣譜β內(nèi)酰胺酶(ESBLs)等多種耐藥基因存在密切聯(lián)系,介導更為廣泛的耐藥。PMQR基因的檢測技術也不斷更新,新的檢測技術有許多優(yōu)勢,可供科學研究參考。PMQR的嚴重性已不容忽視,需加強臨床監(jiān)測和合理使用抗菌藥物,能有效延緩抗菌藥物的抗菌周期。本文就質(zhì)粒介導的喹諾酮類藥物耐藥機制的研究現(xiàn)狀及進展作一綜述,為臨床用藥提供參考。

      質(zhì)粒; 喹諾酮; 耐藥基因; 耐藥機制

      喹諾酮類抗菌藥物是一類含4-喹諾酮母核的全合成抗菌藥物,第一個喹諾酮類藥物萘啶酸,由Lesher等[1]于1962年首先發(fā)現(xiàn)并用于臨床,到目前為止,喹諾酮類藥物已發(fā)展至第四代。該類藥物抗菌譜廣、抗菌作用強、機制獨特、高效而被廣泛用于臨床抗菌治療,有研究報道其在臨床抗菌治療中的用藥頻度(DDDs, Drug Daily Dosages)僅次于頭孢菌素類[2]。同其他抗菌藥物一樣,喹諾酮類藥物也存在嚴重的耐藥問題,有研究表明大腸埃希菌臨床株對環(huán)丙沙星、諾氟沙星、左氧氟沙星的耐藥率在75%以上[3],陰溝腸桿菌對環(huán)丙沙星和左氧氟沙星的耐藥率也高于40%[4]。當前已報道的喹諾酮類藥物的耐藥機制主要包括:①DNA 旋轉(zhuǎn)酶和拓撲異構(gòu)酶Ⅳ基因的突變機制;②主動外排機制;③細菌外膜通透性改變;④質(zhì)粒介導的諾酮喹類藥物耐藥。

      質(zhì)粒介導的喹諾酮類藥物耐藥機制(Plasmid-mediated quinolone resisitence ,PMQR)發(fā)現(xiàn)于20世紀末,該機制主要通過PMQR基因?qū)崿F(xiàn),第一個PMQR基因“qnr”基因(qnrA1亞型)由MartineZ等[5]于1998年首先報道,該基因來自一株膜蛋白缺失的肺炎克雷伯菌所攜帶質(zhì)粒pMG252,能使得細菌對氟喹諾酮藥物的耐藥水平提高,之后PMQR逐漸成為研究的熱點問題。與其他喹諾酮類耐藥機制相比,PMQR介導較為低水平的耐藥,但越來越多的研究表明,PMQR介導的的耐藥正在向高水平耐藥發(fā)展,已對臨床抗菌治療產(chǎn)生了一定程度的威脅,故PMQR問題的嚴重性已不容忽視,本文就當前PMQR相關研究現(xiàn)狀與進展作一綜述。

      1 耐藥機制及流行病學

      目前的研究已發(fā)現(xiàn)三種PMQR機制,分別由qnr、aac(6’)-Ib-cr、qepA和oqxAB基因編碼,介導喹諾酮類的靶位保護、藥物的修飾、以及藥物的外排等作用。當前報道的PMQR基因主要存在于腸桿菌科細菌中,如大腸埃希菌、克雷伯桿菌、變形桿菌、志賀菌、沙門菌等,當然,在其他非腸桿菌科中也存在PMQR,如已有報道在臨床分離銅綠假單胞菌中PMQR基因陽性率高達91.8%[6]。該類基因不僅存在于患病人體中,在非患病的人體、家畜家禽、野生動物、廢水以及海洋環(huán)境中均有大量分布[7~12]。PMQR基因的分布存在時間及地區(qū)差異性,不同地區(qū)基因的種類和數(shù)量分布不同,同一時間段,基因分布也存在較大差異,在對喹諾酮類藥物耐藥的菌株中的檢出率相對較高,當然也有對隨機分離菌株的直接檢測,如近年來國內(nèi)報道分離自動物、食物、及人體的大腸埃希菌PMQR檢出率為46.3%[13]。

      1.1qnr基因qnr基因家族是PMQR機制中最龐大的耐藥基因家族,已發(fā)現(xiàn)qnrA(1-7)、qnrB(1-73)、qnrC、qnrD(1-2)、qnrS(1-9)、qnrVC(1、2-6)等六個qnr型別(http://www.lahey.org/qnrStudies; last accessed Saturday, February 22, 2014)。qnr基因的遺傳環(huán)境較復雜,與多種整合子、轉(zhuǎn)位子等可移動元件存在密切的聯(lián)系。該基因編碼的Qnr蛋白是其發(fā)揮耐藥作用的主要物質(zhì)。Qnr蛋白屬于五肽重復家族(pentapeptide repeat proteins,PRP),由五個串聯(lián)的氨基酸殘基重復而成,在五肽中每個位置上的氨基酸殘基并不完全固定,相應位置的氨基酸為-[Ser, Thr, Ala, 或 Val][Asp 或 Asn][Leu 或Phe][Ser, Thr, 或 Arg][Gly][14]。不同qnr基因編碼的蛋白所含的氨基酸殘基總數(shù)存在差異,包含214-221個氨基酸殘基,每種 Qnr蛋白之間氨基酸同源性介于32%~64%之間[15]。qnr基因介導的喹諾酮類耐藥與喹諾酮作用的靶酶存在一定聯(lián)系,Qnr蛋白能與細菌DNA旋轉(zhuǎn)酶和拓撲異構(gòu)酶Ⅳ結(jié)合,而競爭性抑制酶與DNA分子的結(jié)合,使喹諾酮藥物的作用底物-拓撲異構(gòu)酶Ⅳ-DNA復合體減少,使藥物對細菌復制的抑制作用降低[16]。qnr基因還能提高細菌染色體基因的突變率,增加了細菌向高水平耐藥的選擇機會,同時qnr在一定程度上提高細菌的最低抑菌濃度(minimal inhibitory concentration,MIC),從而使細菌對藥物產(chǎn)生一定程度的抵抗。

      qnr基因地理分布較廣泛,在亞洲、非洲、歐洲、美洲均有有報道。該基因不同型別的檢出率也存在較大的地域差異,但從總體上看,qnr基因在發(fā)展中國家中檢出率相對較高,如來自泰國的研究顯示肺炎克雷伯桿菌中qnr基因的陽性率達48%[17],國內(nèi)聶大平等[18]報道大連地區(qū)肺炎克雷伯菌中qnr基因陽性率也高達53.2%。這與發(fā)展中國家存在的較為落后的經(jīng)濟條件、衛(wèi)生條件、較差的生活環(huán)境以及抗菌藥物的不合理使用等存在密切關系。六種qnr基因的在臨床分離菌株中的檢出率差異較大,qnrB基因作為qnr中最龐大的基因家族,該基因檢出率相對較高,在臨床分離肺炎克雷伯菌菌株中達30.8%[19]。在歐美發(fā)達國家,qnrB基因在腸桿菌科細菌中的陽性率1.7%~8.9%[20-21],來自墨西哥的研究顯示qnrB基因檢出率為15.4%[22]。其余的qnr基因表現(xiàn)出相對較低的檢出率。目前發(fā)現(xiàn)的一種新型qnr基因-qnrVC基因,該基因最先于2008年在巴西報道[23]qnrVC1基因,此外還存在其余五種qnrVC基因亞型,但qnrVC2為無功能基因,qnrVC4基因發(fā)現(xiàn)于點狀氣單胞菌,其與qnrVC2基因有99%的相似性,與qnrVC1、qnrVC3、qnrC、qnrS1、qnrA1、qnrB6、qnrD分別有75%、75%、68%、62%、60%、48%、34%的相似性,上述基因編碼的Qnr蛋白質(zhì)之間也存在極高的同源性。

      1.2 aac(6’)-Ib-cr基因 aac(6’)-Ib-cr基因于2006年首次報道,該基因是aac(6’)-Ib基因第223位、454位的堿基突變導致所表達蛋白發(fā)生相應位點氨基酸的改變(Trp →Arg 和 Asp →Tyr),最終蛋白產(chǎn)物較為獨特,為一類氨基糖苷類乙酰轉(zhuǎn)移酶,該類酶通過對含哌嗪胺為底物的喹諾酮類藥物如環(huán)丙沙星及諾氟沙星進行脫乙酰化作用致使細菌對藥物的敏感性降低,而對不含哌嗪胺的喹諾酮藥物不起作用。近年還有報道aac(6’)-Ib-cr的變種aac(6’)-Ib-cr4基因的發(fā)現(xiàn),該基因編碼的蛋白質(zhì)略有不同[24],但這類基因的作用也只是局限于含哌嗪環(huán)的喹諾酮類藥物。雖然報道時間較qnr基因晚,但這似乎不會對該基因擁有的較高陽性率產(chǎn)生影響。相關報道顯示大腸埃希菌中aac(6’)-Ib-cr基因分布在太平洋地區(qū)最高[3],余曉君等[25]報道致嬰兒腹瀉的鼠傷寒沙門菌中aac(6’)-Ib-cr陽性率高達37.1%;而且aac(6’)-Ib-cr在動物中同樣存在較高的陽性率,其在患敗血癥的雞體內(nèi)篩選出的大腸埃希菌中陽性率為36.0%[26]。另外一項來自智利的報道[27]顯示aac(6’)-Ib-cr在肺炎克雷伯菌中的陽性率為54%,在大腸埃希菌中高達74%。該基因在歐美國家的檢出率在不同菌種中的存在較大差異,在陰溝桿菌中的檢出率為2.6%[20],在大腸桿菌中也可高達37%[27],近年來,在全球范圍內(nèi)的報道表明,該基因具有全球化廣泛蔓延的流行趨勢。

      1.3qepA基因和oqxAB基因qepA和oqxAB基因是兩種較新型的PMQR基因,兩種基因分別編碼兩種質(zhì)粒介導的喹諾酮轉(zhuǎn)運蛋白[15]。qepA基因有兩種亞型,分別是qepA1、qepA2,qepA1于2002年被發(fā)現(xiàn),2008年發(fā)現(xiàn)的qepA2基因,其編碼的蛋白與qepA1基因編碼的蛋白只有兩個氨基酸的差異[29]。qepA基因編碼511個氨基酸的蛋白QepA,該蛋白質(zhì)屬于14-跨膜節(jié)段家族載體,能選擇性的將親水性的喹諾酮類藥物如諾氟沙星、環(huán)丙沙星和依諾沙星等排出菌體外,而降低藥物在菌體內(nèi)的蓄積量;另一方面,QepA能使暴露于喹諾酮類藥物的細菌染色體上gyrA、parC亞單位的功能區(qū)更易發(fā)生突變,而使細菌向高水平耐藥選擇。在腸桿菌科細菌的qeqA基因中,G+C的百分含量明顯高于其染色質(zhì),似乎存在某種對喹諾酮類藥物的耐藥特異性的表達。qeqA基因在世界范圍內(nèi)也存在廣泛的流行,早期的數(shù)據(jù)顯示,該基因流行率較低,但近年來對qepA基因的研究報道表明,其檢出率較高,國內(nèi)尚忠波等[30]報道qepA基因在多重耐藥大腸桿菌中的檢出率達14.0%;2012年廈門地區(qū)分離的大腸埃希菌中qepA基因檢出率為10.5%[31]。墨西哥報道的在兒科臨床分離的產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶基因(extended-spectrum beta-lactamase, ESBL)的腸桿菌科細菌中qepA1為1.7%[32],國內(nèi)研究人員對分離自動物、食物以及人體的大樣本大腸埃希菌的研究發(fā)現(xiàn),qepA基因的陽性率為3.3%[8],另外一份來自美國的報道顯示其在大腸埃希菌中檢出率為9.3%[33]。

      oqxAB基因包括oqxA、oqxB兩種基因,于2009年才被歸為PMQR基因家族,該質(zhì)?;蚓幋a的OqxA、OqxB蛋白屬RND家族的外排泵。在對pOLA52質(zhì)粒上的oqxAB基因序列的研究發(fā)現(xiàn),該基因上游存在的IS26側(cè)翼序列能夠介導該基因向染色體的整合[34]。oqxAB該基因的流行率也是參差不齊的,部分地區(qū)仍出現(xiàn)高流行的態(tài)勢,國內(nèi)報道的大腸埃希菌中該基因檢出率可達29.3%[8],尚有對國內(nèi)食品的分析,其采集樣本中oqxAB基因攜帶率達63.4%[35],在意大利分離自兔體內(nèi)的多耐藥大腸埃希菌中的oqxAB基因檢出率也達15%[36],國內(nèi)尚有在肺炎克雷伯菌中oqxAB基因陽性率為100%的報道[37]

      2 質(zhì)粒接合實驗與耐藥性轉(zhuǎn)移

      質(zhì)粒接合實驗常作為檢驗革蘭陰性菌質(zhì)粒耐藥基因耐藥水平的常用手段,通過將攜帶某種耐藥基因的質(zhì)粒接合到受體菌體內(nèi),培養(yǎng)后測定受體菌對某些藥物的MIC,從而分析該質(zhì)?;?qū)毦退幩降挠绊懗潭取1容^常用的質(zhì)粒接合受體菌有E.coli J53AZR、E.coli J53 RifrR、E.coli K12W1485Frif 、E.coli CSH26、E.coli Top10等,接合實驗表明質(zhì)?;蚰軌蛱岣呤荏w菌的MIC值,國內(nèi)廖景光等[38]相關研究表明,qnrA基因經(jīng)質(zhì)粒接合試驗可使受體菌對對喹諾酮抗菌藥的MIC值上升了5~30倍。aac(6’)-Ib-cr基因經(jīng)接合后能使受體菌對環(huán)丙沙星的MIC提高至少8倍[39]。不過對qepA基因的質(zhì)粒接合試驗報道相對較少,但該類基因可能存在同樣的現(xiàn)象。但有關于oqxAB基因接合實驗的研究表明,臨床分離攜帶oqxAB基因的大腸桿菌質(zhì)粒接合到受體菌中,能使受體菌的MIC提高2~256倍[37]。 盡管質(zhì)粒接合實驗已經(jīng)證明PMQR基因能提高喹諾酮藥物的MIC值,但許多研究認為這種MIC值提高的程度存在一定限度,只表現(xiàn)為在一定程度上降低細菌對喹諾酮類藥物的敏感性,很少能使細菌對喹諾酮類藥物達到實際意義的耐藥水平,同時有研究指出,質(zhì)粒接合實驗的受體菌表現(xiàn)的耐藥水平低于供體菌,可能說明染色體介導的耐藥機制在細菌耐藥中仍然起著主導作用[40]。

      質(zhì)粒接合實驗也驗證了質(zhì)粒耐藥基因的水平傳播能力,不過質(zhì)粒接合實驗主要以攜帶質(zhì)粒耐藥基因的革蘭陰性菌為供體菌,以大腸埃希菌作為受體菌,因而質(zhì)粒耐藥基因在腸桿菌科中的水平傳播是存在的,不過能不能更廣泛地在不同種屬細菌之間廣泛傳播還需要更多的研究來證實。另外,世界上許多地區(qū)均有報道野生動物以及家畜家禽體內(nèi)細菌中存在PMQR基因,包括從市場上銷售的鮮肉類中分離的細菌如沙門菌種同樣存在PMQR基因[34],而這些動物以及肉類制品在作為人類食物的同時,亦可能將其體內(nèi)的PMQR傳播至人體中,使人體類的常駐菌群獲得PMQR基因,當出現(xiàn)機會感染時,這可能會對臨床抗菌治療造成巨大的威脅。

      3 PMQR的特性及與PMQR相關的多種耐藥基因

      PMQR基因與多種耐藥基因如超廣譜β內(nèi)酰胺酶基因、16sRNA甲基化酶基因、耐碳青酶烯酶基因、耐氨基糖苷酶基因等存在密切聯(lián)系,常常在同一菌株的多個質(zhì)?;蛲毁|(zhì)粒中伴行多種耐藥基因,多種耐藥基因同時存在于同一可轉(zhuǎn)移質(zhì)粒上已有相對較高的檢出率,如在產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶的肺炎克雷伯菌臨床分離株中oqxA、oqxB基因的檢出率分別高達76.3%、74.6%[41],這些基因的同時存在,可能會進一步擴展細菌的抗菌譜,使細菌獲得對多種抗菌藥物的耐藥性。這些基因的同時存在可能是由于細菌對多種抗生素選擇作用的結(jié)果,同時也是質(zhì)粒在耐藥機制中的作用的綜合體現(xiàn)。但這些質(zhì)粒之間是否存在密切的相關性,如一種基因是否可以催生出另一種基因,或者一種基因誘發(fā)另一種基因的出現(xiàn),以及上述質(zhì)粒耐藥基因之間是否存在互補增強效應,都有待于進一步研究證實。

      PMQR基因可單獨分布在某一個質(zhì)粒中,但也可有多個PMQR基因同時存在一個質(zhì)粒上,而且這種存在方式對細菌耐藥水平的提高明顯高于單一的PMQR基因質(zhì)粒。PMQR基因多位于整合子或者其他可移動元件上,整合子還能將其他耐藥基因如超廣譜β內(nèi)酰胺酶基因、耐碳青酶烯酶基因、質(zhì)粒型Ampc酶基因等整合在一起,共同在不同菌株之間傳播,增強細菌的耐藥能力;而且多種抗菌藥物耐藥決定簇共存于同一可轉(zhuǎn)移的質(zhì)粒的現(xiàn)象,預示著任何一種抗菌藥物耐藥的發(fā)生都可能導致伴隨的其他抗菌藥物耐藥基因的表達,而使得藥物的抗菌作用增強,這可能會導致臨床抗感染治療的失敗。

      4 小結(jié)與展望

      質(zhì)粒作為細菌體內(nèi)廣泛存在的環(huán)狀DNA,在細菌耐藥性、致病性、代謝、共生等方面有重要作用。作為喹諾酮類耐藥機制中的重要組成部分,PMQR的多樣性和復雜性已有明顯的體現(xiàn),其在喹諾酮類藥物耐藥中會逐步占據(jù)主導地位,而且PMQR基因存在的復雜的基因環(huán)境以及其廣泛快速的水平傳播能力,使其具備足夠的能力與多種耐藥基因共同組成多耐藥菌株,這勢必給臨床治療增加難度。喹諾酮類藥物的應用確實為人類做出了許多貢獻,但其廣泛應用所帶來的嚴重耐藥現(xiàn)象已不容我們忽視,因而提醒醫(yī)務人員在臨床醫(yī)療工作中,應注重合理規(guī)范應用抗菌藥物,以最大限度地減低細菌耐藥性和延長抗菌藥物的療效周期。同時,還應加強對耐藥菌株的檢測,為合理有效應用抗菌藥物提供有利指導。

      傳統(tǒng)的基因檢測方法主要是聚合酶鏈反應 (polymerase chain reaction,PCR)、脈沖場凝膠電泳實驗(pulsed-filed gel electrophoresis,PFGE)等,近年來許多新技術運用于PMQR基因的檢測上,如實時熒光定量PCR(real-time PCR) 、高分辨率熔解曲線分析 (High-resolution melt curve analysis,HRMA)[42];與傳統(tǒng)的方法相比,新技術有許多優(yōu)勢,如操作程序簡單、快速、高通量、高敏感性等。real-time PCR技術是在PCR反應體系中加入熒光染料或者熒光探針,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR過程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析;HRMA是結(jié)合飽和熒光染料未標記探針和實時熒光定量PCR的一種新的檢測基因突變與基因分型的分子診斷技術,可以算是對real-time PCR技術的進一步改進和完善,該技術穩(wěn)定可靠,不受檢測位點和種類的局限,不損傷DNA,分析后可以直接純化測序, 可結(jié)合實時熒光定量PCR對一個樣品同時進行突變掃描基因分型和定量檢測。上述兩種技術均有用在PMQR相關基因的檢測中。利用real-time PCR技術能準確的檢測出多種復雜樣品中的qnr[43-44]、aac(6’)-Ib-cr[43]、qepA[45]的檢測,而且該技術較其他技術相比,更能快速準確檢測PMQR基因[46],HRMA技術對大樣本中PMQR的檢測具有更大的優(yōu)勢,能從大而復雜的樣本中準確檢測出PMQR基因。上述基因檢測的新技術在諸多領域都有運用,其高靈敏度、高特異性、操作簡便以及高通量低成本的優(yōu)勢,有望成為臨床基因診斷的常規(guī)方法,對PMQR基因相關檢測及新基因的發(fā)現(xiàn)起到重要作用。

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      Recent research and progress on plasmid-mediated quinolones resistance

      WANG YaoreviewingWU Jiangchecking

      (TheSecondClinicalMedicalCollege,ChengduUniversityofTCM,Chengdu611137)

      As widely used antibacterial agents, drug resistance restricted quinolones clinical application to extreme degree. Plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) is one of the most important part of the resistance mechanism. Recent researchers found that PMQR is mediated by the genes including qnr, c(6’)-Ib-cr, pA and oqxAB. The mechanism and prevalence of each gene is very different, and these genes could transmit through conjugation. Some researchers indicate that the PMQR genes are closely linked with other plasmid resistance genes mediated more extensive drug resistance. Some new detection with hasmany advantages can refer to scientific research. Seriousness of PMQR cannot be ignored. Strengthen clinical monitoring and rational use of antimicrobial agents is needed indeed, thus antibacterial cycle of antimicrobial agents can be effectively delayed.

      Plasmid; Quinolone; Resistant gene; The mechanism of drug resistance

      教育部博士點基金項目(20115132120004)

      吳疆,E-mail:13518217898@163.com

      R 969.3

      A

      10.3969/j.issn.1672-3511.2015.07.048

      2014-10-09; 編輯: 陳舟貴)

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