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      內蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的分離鑒定

      2015-12-16 07:43:54劉紅新任艷張冬蕾楊彥榮劉文俊孫天松
      中國乳品工業(yè) 2015年10期
      關鍵詞:馬奶錫林郭勒乳酸菌

      劉紅新,任艷,張冬蕾,楊彥榮,劉文俊,孫天松

      (內蒙古農業(yè)大學乳品生物技術與工程教育部重點實驗室,呼和浩特010018)

      0 引言

      酸馬奶(koumiss)是中亞地區(qū)傳統(tǒng)的發(fā)酵馬乳飲料,又稱“馬奶酒”[1]。它以新鮮馬奶為原料,經乳酸菌和酵母菌共同發(fā)酵而成,具有獨特的風味和豐富的營養(yǎng)價值[2]。蒙醫(yī)藥典中也曾記載酸馬奶能開胃、祛濕、解毒潤膚等功效[3]。酸馬奶之所以具有與馬奶不同的功效,主要由于其微生物菌群以酵母菌群和乳酸菌群為主。乳酸菌是指發(fā)酵碳水化合物產生乳酸的一類革蘭氏陽性、不產芽孢、過氧化氫酶陰性的一類細菌的總稱[4],在人體內具有諸多益生作用[5]。

      本研究采用實驗室純培養(yǎng)的方法分離、鑒定錫林郭勒地區(qū)傳統(tǒng)酸馬奶中的乳酸菌,通過16S rDNA序列分析的方法對乳酸菌分離株進行鑒定,并分析其優(yōu)勢菌群,保護我國益生菌資源,為傳統(tǒng)酸馬奶的篩選和開發(fā)利用提供參考。

      1 實驗

      1.1 材料

      1.1.1 樣品來源

      本研究中27份酸馬奶樣品由實驗室的研究人員于2014年7月16日—2014年7月18日在內蒙古錫林郭勒的不同地區(qū)采集。樣品采集后低溫保存,帶回實驗室于-80℃超低溫保藏,進行后續(xù)實驗。

      1.1.2 培養(yǎng)基與試劑

      培養(yǎng)基:MRS固體培養(yǎng)基,MRS液體培養(yǎng)基,M17固體培養(yǎng)基,M17液體培養(yǎng)基。

      實驗所用試劑:PBS保護液,PBS緩沖液,脫脂乳保護劑,提取DNA所用試劑,PCR擴增和電泳檢測所用試劑[6]。

      1.1.3 儀器與設備

      便攜式冰箱,溫度計,便攜式PH計,采樣箱等。

      ZHJH-C1214C型超凈工作臺,TGL-168高速臺式離心機,HWS28型電熱恒溫水浴鍋,AR2202CN型電子天平,KDC-1044型低速離心機,LRH-250生化培養(yǎng)箱,BX50型光學顯微鏡,HA-300M型全自動高壓蒸汽滅菌器,SP-650型全自動高壓干熱滅菌器,WD-9405B型水平搖床,LL-6SFPY型真空冷凍干燥機,PTC-200梯度基因擴增儀;DYY-12型電泳儀,GDS-8000型凝膠成像儀,ND-1000型微量紫外分光光度計等。

      1.2 方法

      1.2.1 樣品采集

      本試驗在采集乳樣品時采用直接取樣法。先將容器中的發(fā)酵乳制品充分混勻,再用移液槍吸取1.5 mL樣品至裝有滅菌中和劑(內含0.5 g,CaCO3:淀粉=1∶50,質量比)的2.5 mL無菌螺口凍存管中,混勻后標記樣品號并作記錄,封口保存。最后將采集的乳樣置于4℃便攜式冰箱中以維持其低溫狀態(tài),盡快帶回實驗室進行乳酸菌的分離純化等實驗。

      1.2.2 樣品中乳酸菌的計數(shù)

      乳酸菌計數(shù)根據(jù)參考文獻[7]采用傾注培養(yǎng)法。計數(shù)即為每mL樣品的菌落數(shù)。

      1.2.3 樣品中乳酸菌的分離純化及保存

      分別吸取 0.2 mL稀釋度為10-5,10-6,10-7稀釋液于MRS固體培養(yǎng)基上涂布后置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中厭氧培養(yǎng)48 h,待菌落形成后,隨機挑取形態(tài)學特征各不相同的單個菌落于相應的液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24 h。將不純的菌株在MRS固體培養(yǎng)基上劃線分離,37℃培養(yǎng)48 h,如此反復2~3次,直至鏡檢結果為純的單菌后編號并接種于相應液體培養(yǎng)基進行擴培和傳代。

      選取過氧化氫陰性、革蘭氏陽性的純培養(yǎng)物,將此培養(yǎng)物暫定為乳酸菌,加入質量分數(shù)為0.1%谷氨酸鈉的脫脂乳保護劑,混勻后置于-80℃保存?zhèn)溆?。同時,另一份樣品進行DNA提取和后續(xù)鑒定實驗。

      1.3 16S rDNA序列分析

      1.3.1 總DNA的提取及純度的檢測

      采用液氮反復凍融-CTAB法提取乳酸菌基因組DNA[8]。再用ND-1000型微量紫外分光光度計測其濃度以及OD260/280值。再用質量分數(shù)為1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。

      1.3.2 16S rRNA基因的PCR擴增

      16S rRNA基因的PCR擴增引物序列為

      FA-27F:5'-GCAGAGTTCTCGGAGTCACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',

      RA-1495R:5'-AGCGGATCACTTCACACAGGACTACGGCTACCTTGTTACGA-3'[9]。

      PCR擴增體系(模板為上述DNA稀釋液):5 μL10×EasyTaq Buffer(+Mg2+);4 μL High Pure dNTPs(2.5 mmol/L);1.5 μL 引物 FA-27F(濃度 10 mmol/L);1.5 μL 引 物 RA-1495R(10 mmol/L);0.5 μL EasyTaq DNA polymerase(5 U/μL);2 μL DNA 模板(質量濃度100 ng/μL);35.5 μL ddH2O。

      PCR擴增循環(huán)參數(shù)為:94℃預變性5 min;94℃變性1 min,58 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,30個循環(huán);72℃末端延伸10 min。

      擴增完畢后,取約2 μL的PCR擴增產物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,若在1 500 bp處有清晰的擴增條帶且無拖尾、彌散現(xiàn)象,則PCR擴增成功[10]。將PCR擴增產物送往上海美吉生物公司進行純化和DNA測序。

      1.4 同源性分析

      將測序得到的DNA序列運用SeqMan(DNAStar 5.01)軟件進行序列拼接后,再利用NCBI中的BLAST將拼接好的序列與數(shù)據(jù)庫中已鑒定的乳酸菌16S rDNA序列進行同源性分析,將待鑒定菌株序列與同源性最高的模式菌株序列應用MEGA 4.0(http://www.megasoftware.net)軟件構建系統(tǒng)發(fā)育樹,進行遺傳進化研究。

      2 結果與分析

      2.1 乳酸菌分離株的菌落形態(tài)及細胞形態(tài)特征

      根據(jù)乳酸菌的形態(tài)學特征[11-12],初步從27個酸馬奶樣品中共分離出83株疑似乳酸菌的菌株。經過革蘭氏染色、過氧化氫酶反應,均為革蘭氏陽性,過氧化氫陰性菌[13]。初步將83株菌定為乳酸菌。

      2.2 乳酸菌計數(shù)結果

      錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的活菌數(shù)如表1所示。

      由表1可以看出,酸馬奶樣品中乳酸菌數(shù)在4.44~8.99 mL-1(對數(shù)值)之間。平均值為(6.09±0.13)mL-1(對數(shù)值)。其中XM3,XM4,XM14等樣品中乳酸菌活菌數(shù)低于106/mL-1,低于酸奶國家標準。大部分菌株的活菌數(shù)高于106mL-1,符合新的酸奶國家標準和國家衛(wèi)生標準,有利于進一步分離與研究。由于本次采樣,并未按照特定時間點進行,是隨機采樣,有的地點樣品發(fā)酵和貯藏時間長,有的樣品發(fā)酵和貯藏時間短,所以其中乳酸菌活菌數(shù)量存在較大差異。李道敏,劉開永等人[14]對木糖醇酸奶發(fā)酵、貯藏期間質量變化做過研究,閆志國[15]對發(fā)酵乳在貯藏期間的理化性質的變化也做過詳細報道,均闡述自然發(fā)酵乳制品中微生物隨著發(fā)酵和貯藏時間的延長,乳酸菌種屬和數(shù)量有較大的變化。

      表1 內蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌計數(shù)結果 mL-1

      2.3 乳酸菌分離鑒定結果

      2.3.1 DNA提取和PCR擴增結果

      DNA濃度和OD260/280值的測定:提取83株乳酸菌的DNA并測其濃度以及OD260/280值,OD260/280值在1.8~2.0之間即為純DNA樣品。將DNA原液稀釋至濃度為100 ng/μL后進行16S rRNA基因的PCR擴增。擴增結果經1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,可以觀察到在大約1 500 bp的位置處有一條清晰明亮的條帶,并且無拖尾、彌散現(xiàn)象,未發(fā)現(xiàn)明顯非特異擴增現(xiàn)象,說明分析菌株的16S rRNA基因擴增成功。將PCR擴增產物送于上海美吉生物科技有限公司進行測序。

      圖1 部分分離菌DNA瓊脂糖凝膠電泳

      2.3.2 16S rRNA基因同源性比對及系統(tǒng)發(fā)育樹構建

      將測序獲得的16S rRNA基因序列通過NCBI數(shù)據(jù)庫中BLAST進行同源序列比對分析,若同源性高于99%則可直接將其歸為此種模式株菌種,選取部分具有代表性的菌株用 MEGA 4.0(http://www.megasoftware.net)軟件構建系統(tǒng)發(fā)育樹。分離株與模式株系統(tǒng)發(fā)育樹見圖2(選取部分作圖):

      圖2 內蒙古錫林郭勒地區(qū)代表性分離株的16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      由圖2可以看出,所有分離株聚為2個大的類群,一個類群為桿菌,一個類群為球菌,IMAU11650(KR858843)與模式菌Enterococcus durans ATCC19432(AJ276354)聚為一類,同源性分別為100%,將其鑒定為 Enterococcus durans。IMAU11655(KR858848)與模式菌Enterococcus faecium ATCC19434(AJ301830)聚為一類,同源性為100%,因此將歸其為Enterococcus faecium。IMAU11642(KR858836)與模式菌Enterococcus devriesei CCM7299(AJ891167)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為Enterococcus devriesei。IMAU11152(KR858806)與模式菌Enterococcus faecalis JCM5803(AB012212)聚為一類,同源性為100%,故鑒定為Enterococcus faecalis。IMAU11668(KR858860)與模式菌Enterococcus italicus DSM 15952(AJ582753)聚為一類,同源性為 100%,故將其鑒定為Enterococcusitalicus。IMAU11124(KR858778)與模式菌Lactococcus lactis subsp.lactis ATCC19435(AB100803)聚為一類,同源性為100%,故鑒定為Lactococcus lactis subsp.Lactis。IMAU11138(KR858792)與模式菌Streptococcus parauberis DSM6631(AY584477)聚為一類,同源性為99%,故將其歸為為Streptococcus parauberis。IMAU11641(KR858835)與模式菌Lactobacillus plantarum ATCC14917(AJ965482)聚為一類,同源性為100%,故將其鑒定為Lactobacillus plantarum。IMAU11674(KR858866)與模式菌Lactobacillus diolivorans DSM14421(AF264701)聚為一類,同源性為100%,故將其鑒定為Lactobacillusdiolivorans。IMAU11656(KR858849)與Lactobacillus casei ATCC393(AF469172)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為Lactobacillus casei。 IMAU11657(KR858850)與模式菌Lactobacillus paracasei ATCC25302(D79212)聚為一類,同源性為100%,因此將其鑒定為Lactobacillus paracasei。IMAU11644(KR858838)與模式菌Lactobacillus helveticus ATCC15009(AM113779)聚為一類,同源性分別為99%,故鑒定為 Lactobacillus helveticus。IMAU11126(KR858780)與模式菌 Lactobacillus kefiranofaciensDSM 5016(AM113781)聚為一類,同源性為99%故,將其鑒定為Lactobacillus kefiranofaciens。IMAU11158(KR858812)與模式菌 Leuconostoc pseudomesenteroides ATCC12291(AB023237)聚為一類,同源性分別為99%,故鑒定為Leuconostoc pseudomesenteroides。IMAU 11125(KR858779)與模式菌Leuconostoc mesenteroides NCFB529(AB023244)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為Leuconostoc mesenteroides。根據(jù)16S rDNA序列分析,分離的83株菌中,49株菌與模式菌株的同源性達到99%,34株菌與模式菌株的同源性達到100%。

      2.4 錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的優(yōu)勢菌種分析

      乳酸菌的分布結果如表2所示。

      表2 內蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的分離結果

      由表2可以看出,27份酸馬奶樣品中分離出的83株乳酸菌疑似菌株,經16S rDNA序列測定和同源性分析鑒定,分屬于5個屬15個種或亞種。其中錫林郭勒地區(qū)的優(yōu)勢菌群為Lactococcus lactis subsp.lactis,占總分離株的34%。近幾年,孫天松[16]等人對新疆地區(qū)酸馬奶進行分離鑒定,其優(yōu)勢菌種為Lactobacillus helveticus。劉芳、都立輝[17]等人對內蒙古酸馬奶多樣性進行研究,發(fā)現(xiàn)Lactococcus lactis為優(yōu)勢菌群。魏艷、曾小群[18]等人對新疆酸馬奶中乳酸菌分離鑒定,結果表明優(yōu)勢菌群為發(fā)酵乳桿菌和干酪乳桿菌。由此可見不同地區(qū)酸馬奶優(yōu)勢菌種不同,即使同一地區(qū)采樣時間、貯藏時間不同,結果也會有差異。

      3 結論

      本研究對27份錫林郭勒地區(qū)酸馬奶樣品進行乳酸菌的分離鑒定,共分離出83株乳酸菌。通過16S rDNA序列同源性分析,將83株乳酸菌鑒定為5個屬,15個種或亞種,分別屬于乳桿菌屬、乳球菌屬、明串珠菌屬、腸球菌屬、鏈球菌屬。其中Lactococcus lactis subsp.Lactis為錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中的優(yōu)勢菌種,占總分離株的34%。

      [1]孟和畢力格,烏日娜,王立平,楊續(xù)金,徐杰,董瑩,孫志宏,張和平.不同地區(qū)酸馬奶中乳桿菌的分離及其生物學特性的研究[J].中國乳品工業(yè),2004,11:6-11.

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