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      對瀘寧雞黑羽烏骨家系生長發(fā)育性狀的聚類分析

      2015-12-31 12:43:50陳兆賢敖學(xué)成熊應(yīng)龍方元麗
      四川畜牧獸醫(yī) 2015年2期
      關(guān)鍵詞:黑羽胸寬性狀

      熊 斌 ,鄭 璐 ,陳兆賢 ,敖學(xué)成 ,熊應(yīng)龍 ,方元麗

      (1.四川省冕寧縣畜牧局,四川 冕寧 615600;2.西昌學(xué)院,四川 西昌 615000;3.四川省涼山州畜牧局,四川 西昌 615000;4.四川省涼山州原生農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)有限責(zé)任公司,四川 冕寧 615602)

      1 材料與方法

      1.1 分析材料 從瀘寧雞擴(kuò)繁群后代中選擇黑羽烏骨雞組成家系繁育群,按公母1∶10比例采用人工授精配種,在相同孵化飼養(yǎng)條件下,孵化出雛后在脫溫舍飼養(yǎng)35d,35 d后轉(zhuǎn)到育成舍飼養(yǎng)到90 d,90 d后采用林間放養(yǎng),飼養(yǎng)到19周齡,然后隨機(jī)抽樣測定相關(guān)指標(biāo)作為分析材料。

      1.2 測定內(nèi)容與分析方法 按農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 823-2004家禽生產(chǎn)性能名詞術(shù)語和度量統(tǒng)計(jì)方法,測定體尺體重指標(biāo):胸深(X1)、胸寬(X2)、龍骨長(X3)、脛長(X4)、盆骨寬(X5)、脛圍(X6)、體斜長(X7)、體重(X8);利用 Excel和 SPSS軟件,分別進(jìn)行性狀描述分析、相關(guān)分析、主成分分析,獲取主成分值進(jìn)行聚類分析,分類后按樣本分類作類間性狀方差比較分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 體重體尺性狀的統(tǒng)計(jì)分析 體重體尺數(shù)據(jù)列表1。從表1可看出各性狀平均值的參數(shù)指標(biāo)與中位數(shù)均較接近,表明性狀均值有代表性。各性狀峰度值在-0.02~0.8之間,偏度值在-0.22~0.51之間,各性狀最大值與最小值經(jīng)處理相差比率在36.10%~183.40%之間,說明各性狀分布離差較大,群體中存在性狀的明顯差異,表型值遺傳差異明顯,存在明顯的可選擇性。

      表1 樣本體重體尺性狀的統(tǒng)計(jì)分析 cm、g

      2.2 主成分分析

      2.2.1 性狀相關(guān)分析。樣本相關(guān)系數(shù)列表2,從表2可看出,除胸寬與脛長的相關(guān)性較弱,龍骨長與脛長的相關(guān)性顯著(P<0.05)外,其余性狀間的相關(guān)系數(shù)均達(dá)到極顯著水平(P<0.01)。說明體重與體尺相關(guān)性狀間呈正相關(guān)關(guān)系,選擇體尺大的將會(huì)影響體重性狀和相關(guān)性狀的提高。

      表2 樣本相關(guān)系數(shù)

      2.2.2 主成分荷載與特征值貢獻(xiàn)率。從表3可知,按不低于85%累計(jì)特征值貢獻(xiàn)率算,前4個(gè)主成分的

      表3 主成分特征值及貢獻(xiàn)率

      特征值分別是4.810、0.907、0.682和0.557,方差貢獻(xiàn)率分別是60.121%、11.343%、8.529%和6.957%,累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到86.949%。主成分分析可以將多指標(biāo)問題轉(zhuǎn)化為較少的新的指標(biāo),從而獲得許多重要信息,并包含樣本的主要信息。此例提取的4個(gè)主成分已包含了樣本主要信息,可取代樣本的綜合指標(biāo)。

      2.2.3 依據(jù)主成分分析原理,可用提取的主成分荷載進(jìn)行主成分因子判斷,主成分荷載系數(shù)詳見表4。

      表4 主成分荷載系數(shù)

      第一主成分中8個(gè)性狀荷載系數(shù)在0.451~0.923之間,其中最大的荷載系數(shù)是體重(0.923),其次是體斜長(0.884)。當(dāng)體重大時(shí)相應(yīng)的體斜長等指標(biāo)會(huì)更大,體重會(huì)更重,因此第一主成分可定義為體斜長生長發(fā)育因子。

      第二主成分中突出較大的荷載系數(shù)是脛長(0.825),表明當(dāng)脛長越長時(shí),個(gè)體體重會(huì)更大,因此可定義為脛長因子。

      第三主成分中較大的荷載系數(shù)是胸寬(0.537),其次是脛圍,當(dāng)胸寬較大時(shí),胸圍相應(yīng)會(huì)更大,其個(gè)體體重也會(huì)更大,可定義為胸寬因子。

      第四主成分中較大的荷載系數(shù)是并列的胸寬(0.362)和脛長(0.310),當(dāng)胸寬和脛長同時(shí)較大時(shí),將對個(gè)體體重產(chǎn)生影響。鑒于第二主成分為脛長因子、第三主成分為胸寬因子,可將第四主成分定義為胸寬脛長互補(bǔ)因子。

      綜上分析可知,4個(gè)主成分代表的主要因子——體斜長生長發(fā)育因子、脛長因子、胸寬因子和胸寬脛長互補(bǔ)因子,是影響黑羽瀘寧雞的主要性狀因素。

      2.3 聚類分析 利用所獲得的主成分值進(jìn)行聚類分析(見聚類成員表5),可將樣本聚為4個(gè)大類,按分類性狀進(jìn)行方差分析(結(jié)果列表6)。從表6可看出,各類間性狀中,龍骨長、脛圍類間差異不顯著(P>0.05),胸深、胸寬、脛長、骨盆寬、體斜長類間差異達(dá)到極顯著(P<0.01),體重類間差異顯著(P<0.05)。分別命名為第1、2、3因子的性狀——體長、脛長、胸寬類間差異極顯著,說明與影響體重性狀的因子是吻合的。

      表5 聚類成員

      通過分類性狀排序比較(見表7)可看出,四個(gè)類中1類所有性狀為最小,排序均居4;2類、3類與4類的體重相似(平均僅差1.33g和23.63g),在2類中體斜長排序?yàn)?,表明和提取主成分的因子命名相吻合,因此按2、4類群性狀特點(diǎn)進(jìn)行選擇,個(gè)體體重會(huì)更大,而與此相關(guān)的性狀——體斜長、脛長、胸寬等指標(biāo)將會(huì)更大,可見具有選擇意義。

      表6 分類性狀比較分析

      表7 分類性狀排序比較

      3 結(jié)論

      通過對瀘寧雞黑羽烏骨家系后代進(jìn)行主成分和聚類分析,揭示出了瀘寧黑羽烏骨雞的選育依據(jù),可初步得出以下結(jié)論:

      3.1 利用提取主成分最大荷載提供的命名因子,可知影響瀘寧雞黑羽烏骨家系個(gè)體體重的主要性狀是體斜長、脛長和胸寬。

      3.2 主成分分析所提取的4個(gè)主成分,完全包含了樣本的主要信息,可取代樣本的綜合指標(biāo);以2、4類群性狀的表現(xiàn)特點(diǎn)作為選育依據(jù),可提高以群體體重為主的綜合性狀。

      [1] 楊朝武,朱慶,蔣小松.基于主成分分析的優(yōu)質(zhì)雞肉質(zhì)評(píng)價(jià)研究[J].生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào),2007,22(3):547-553.

      [2] 章文波,陳紅艷.實(shí)用數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析及SPSS 12.0應(yīng)用[M].北京:人民郵電出版社,2006.

      [3] 吳高嶺,朱德鳳.數(shù)值分類法在玉米品種資源上的應(yīng)用[J].玉米科學(xué),2000,8(1):23-27.

      [4] 白厚義.試驗(yàn)方法及統(tǒng)計(jì)分析[M].北京:中國林業(yè)出版社,2005.

      [5] 陳國順.運(yùn)用聚類分析和主成分分析篩選豬的血清指標(biāo)[J].甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2005(6):723-727.

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