孔偉林,壽奎均,陳成紅,黃 強(qiáng),黃學(xué)超
(1.浙江省諸暨市王家井鎮(zhèn)動物衛(wèi)生監(jiān)督站,浙江 諸暨 311813;2.浙江省諸暨市同山鎮(zhèn)動物衛(wèi)生監(jiān)督站,浙江 諸暨 311808);3.浙江省諸暨市畜牧獸醫(yī)局,浙江 諸暨 311800;4.浙江省諸暨市國偉禽業(yè)有限公司,浙江 諸暨 311813)
近年來,國內(nèi)外學(xué)者對豬POU1F1和GH基因做了一些基礎(chǔ)性研究,結(jié)果表明這兩個基因都是與動物生長相關(guān)的重要基因。本文對豬POU1F1和GH基因的研究概況進(jìn)行了闡述。
垂體特異性轉(zhuǎn)錄因子(PIT-1)是POU結(jié)構(gòu)域中幾種同源(異型)蛋白之一,目前已被正式命名為POU1F1[1]。該蛋白能夠調(diào)控生長激素、催乳素和促甲狀腺素的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),對動物生長發(fā)育過程起重要的調(diào)節(jié)作用。目前已在多種動物上發(fā)現(xiàn)其多態(tài)性與生長性狀相關(guān)。劉波、陳宏等在秦川牛及其雜種牛的四個群體中檢測POU1F1的酶切多態(tài)性,發(fā)現(xiàn)AB、BB基因型個體在胸圍、十字部高指標(biāo)上顯著高于群體AA型個體(P<0.05),可作為秦川牛體尺指標(biāo)(胸圍、十字部高)的候選基因之一[2]。龐瑾等在7個中國地方豬品種和3個國外豬品種中進(jìn)行了POU1F1基因的多態(tài)性分析,結(jié)果在7個地方品種中檢測到第4外顯子上有一個突變,沒有氨基酸變化;在3個國外品種中檢測到1個Rsa I限制性內(nèi)切酶的多態(tài)酶切位點[3]。由此看來,POU1F1基因標(biāo)記的多態(tài)信息含量較高,遺傳變異較大,分析POU1F1基因多態(tài)性進(jìn)而探討其對生長的調(diào)節(jié)作用,對于提高豬的產(chǎn)肉性能具有重要的意義。
1.1 POU1F1的生物學(xué)功能 POU1F1蛋白是動物垂體前葉特異性表達(dá)的一種具有重要功能的轉(zhuǎn)錄因子[4],該蛋白對垂體前葉胚胎發(fā)育以及生長激素(GH)、催乳素(PRL)和促甲狀腺素亞β單位(TSHβ)基因的表達(dá)起決定性作用。在多種垂體激素缺乏而導(dǎo)致侏儒的鼠和人類中,均可發(fā)現(xiàn)POU1F1基因活性的喪失。POU1F1在胚胎期率先表達(dá),提示POU1F1蛋白對于胚胎期垂體前葉細(xì)胞分化以及GH、PRL和TSH細(xì)胞的發(fā)育有重要作用。POU1F1基因突變可以導(dǎo)致垂體發(fā)育萎縮,使GH、PRL和TSHβ分泌完全缺乏,從而導(dǎo)致矮小現(xiàn)象出現(xiàn)。所以,POU1F1蛋白對于垂體細(xì)胞的形成和垂體細(xì)胞的增生具有重要作用。POU1F1蛋白與垂體中的 PRL、GH、TSHβ 基因及POU1F1自身的啟動子結(jié)合,調(diào)節(jié)這些基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),進(jìn)而對動物的生長發(fā)育、繁殖和免疫等起重要作用。
1.2 POU1F1基因的結(jié)構(gòu)與定位 POU1F1基因是POU結(jié)構(gòu)域基因家族的成員之一,而POU結(jié)構(gòu)域因子家族是一類轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,POU基因家族分成六大類,不同類別的成員行使不同的功能。POU1F1蛋白有3個重要的結(jié)構(gòu)域:N端轉(zhuǎn)錄激活區(qū)、POU特異區(qū)( POU-SD)和 POU 同源區(qū)( POU-HD)[5]。POU1F1蛋白對于靶基因的轉(zhuǎn)錄激活作用依靠此N端轉(zhuǎn)錄激活區(qū),而POU-SD和POU-HD的主要功能是識別靶DNA的特異順序并與之呈高親和力的結(jié)合,從而啟動靶DNA的轉(zhuǎn)錄。豬POU1F1基因被發(fā)現(xiàn)定位于13號染色體上的q46區(qū)域[6],已知其cDNA序列全長876bp,編碼292個氨基酸,包含6個外顯子,約含60個氨基酸。豬POU1F1基因序列與其他已知POU1F1序列的哺乳動物的同源性達(dá)95%,氨基酸序列上的差別僅出現(xiàn)在氨基端區(qū)域,POU-SD與POU-HD區(qū)域則高度保守。
Yu T P等[7]以豬POU1F1基因cDNA片段為探針,克隆了全長為2695bp的POU1F1基因組區(qū)域并進(jìn)行測序,隨后Tuggle CK等、Nicolas、Chung等也對POU1F1基因組區(qū)域進(jìn)行了克隆測序,但他們所得的DNA序列彼此并不一致,而且在POU-SD和POUHD區(qū)域中均有差異。但據(jù)江蘇省動物遺傳育種重點實驗室最近的研究驗證,發(fā)現(xiàn)Yu T P等的這段2695 bp的POU1F1基因組序列是最具科學(xué)性和說服力的。
1.3 豬POU1F1基因的多態(tài)性研究 美國的Tuggle等早在1993年就開始了POU1F1基因多態(tài)性與豬生長及胴體性狀的關(guān)系研究,研究結(jié)果是在中國豬種梅山豬的POU1F1基因中發(fā)現(xiàn)了一個Bam HI多態(tài)基因座,BB基因型豬有相對較大的初生重及平均背膘厚,但在美國豬種中并沒有發(fā)現(xiàn)同樣的多態(tài)基因座。為了進(jìn)一步研究POU1F1的多態(tài)性與豬生長和胴體性狀的關(guān)系,Yu T P等選用由梅山豬×杜洛克豬、梅山豬×漢普夏豬、梅山豬×長白豬、民豬×漢普夏豬和民豬×長白豬所組成的五個三代雜交資源家系,運用 PCR-RFLP 方法檢測 Bam HI、Msp I、Rsa I 3 種限制性內(nèi)切酶的多態(tài)性,分析與豬初生重、21日齡重、斷奶重、平均日增重、背最長肌面積、肉色、大理石紋、硬度、背膘厚測量值等指標(biāo)的相關(guān)性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),Msp I CC基因型的豬相對于DD基因型豬有較高的出生重(CC型比DD型高0.12kg),在幾個背膘厚測量指標(biāo)上,也均高于DD基因型豬,而CC基因型最初來自于中國豬種所具有的等位基因[8]。通過以上分析,認(rèn)為POU1F1與豬早期生長性狀存在相關(guān)性,是標(biāo)記早期生長性狀的最接近的基因。
為了具體研究豬POU1F1基因的酶切多態(tài)性與中國地方家系品種生長性能的相關(guān)性,滕勇等采用PCR-RFLPs技術(shù)檢測Msp I酶切位點多態(tài)性,分析Msp I酶切突變位點不同基因型對“長杜楓姜”豬不同日齡段體重和日增重的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn):MspI DD基因型豬在45、70、180日齡重上均與CD基因型和CC基因型豬呈顯著性差異;對于不同日齡段日增重,DD基因型豬也與CC基因型豬呈顯著性差異[9]??梢奝OU1F1基因?qū)ωi的中期發(fā)育也起一定的作用。
結(jié)合以上研究,我們認(rèn)為POU1F1基因?qū)ωi的早中期發(fā)育均起一定的作用,因此該基因可以作為數(shù)量性狀的遺傳標(biāo)記。
1.4 POU1F1基因的研究前景 POU1F1基因的一個主要發(fā)展前景就是其在發(fā)育機(jī)制的早中期均起作用。據(jù)報道,雞胚發(fā)育到2d時即已檢測到POU1F1 mRNA的表達(dá),牛POU1F1基因的轉(zhuǎn)錄激活貫穿于牛整個胚胎期的發(fā)育,而且豬和鼠POU1F1基因的表達(dá)均與它們的早期發(fā)育存在著相關(guān)性。這些就為檢測動物早期的表型性狀及飼養(yǎng)價值評估提供了依據(jù),節(jié)省了遺傳育種大批量生產(chǎn)的麻煩,更好地為企業(yè)的產(chǎn)業(yè)化經(jīng)營服務(wù)。
生長激素(GH)是一種由腦垂體前葉嗜酸性細(xì)胞分泌的單一肽鏈蛋白質(zhì)類激素。在動物生長軸中,GH是調(diào)控動物生長發(fā)育和合成代謝的核心激素,其作用機(jī)理復(fù)雜,影響動物機(jī)體蛋白質(zhì)、脂肪和糖的代謝,與生長發(fā)育、繁殖等密切相關(guān)。
2.1 GH的生物學(xué)功能 生長激素的功能分為三類:代謝效應(yīng)、增殖效應(yīng)和分化效應(yīng)[10]。它具有促進(jìn)各組織器官發(fā)育,增加體細(xì)胞大小與數(shù)量,促進(jìn)骨骼增長,促進(jìn)有絲分裂,促進(jìn)脂肪前體細(xì)胞成熟分化、骨髓T細(xì)胞前體發(fā)育以及造血細(xì)胞分化等作用。生長激素最普遍的作用是促進(jìn)物質(zhì)合成代謝。它可直接刺激葡萄糖進(jìn)入肌肉細(xì)胞,加速蛋白質(zhì)合成,增加肌肉重量和蛋白質(zhì)沉積,使能量由脂肪組織向其他組織轉(zhuǎn)移。GH能提高氨基酸合成蛋白質(zhì)的速度,降低氨基酸的氧化分解;在GH作用下,蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)代謝的總量減少,合成量大于降解量,從而提高蛋白質(zhì)的沉積量。
GH通過降低機(jī)體內(nèi)葡萄糖轉(zhuǎn)化成脂肪酸的速度,抑制脂肪酸合成酶mRNA的轉(zhuǎn)錄和乙酰CoA羧化酶(CBX)、脂肪合成酶的活性,降低脂肪酸的合成酯化,同時刺激脂肪的酶解作用,從而減少脂肪的沉積,GH還可改變脂肪組織對胰島素的效應(yīng),拮抗胰島素對脂肪合成的刺激作用。GH對糖代謝的影響比較復(fù)雜,不直接參與糖代謝的調(diào)節(jié),但它可改變組織對糖代謝的敏感性。生長激素對糖代謝的影響表現(xiàn)為胰島素樣和抗胰島素樣效應(yīng)。生長激素處理初期,血糖降低,此時葡萄糖的攝取和氧化加強(qiáng),生長激素表現(xiàn)出胰島素樣效應(yīng)。但過一段時間后,葡萄糖氧化減少,血糖濃度顯著升高,同時胰島素濃度也升高,生長激素降低了靶組織對胰島素的敏感性,表現(xiàn)出抗胰島素效應(yīng)[11]。
2.2 GH基因的結(jié)構(gòu)與定位 近二十年來,國內(nèi)外學(xué)者已經(jīng)對豬GH基因結(jié)構(gòu)做出了大量基礎(chǔ)性工作。1983年Seeburg等成功克隆豬GH基因的cDNA,但沒有完整的5′端非編碼區(qū)[12]。Vize等首先確定豬的GH基因序列[13]。賈鋒等對豬GH基因的全序列進(jìn)行了測定,得出豬GH基因cDNA長度約為896bp[14]。目前已知,豬GH基因由5個外顯子和4個內(nèi)含子構(gòu)成, 外顯子大小分別為 10bp、161bp、171bp、162bp 和198bp,其中外顯子1最小,編碼前導(dǎo)肽中的3個氨基酸,外顯子5最大。該基因4個內(nèi)含子的大小分別為242bp、210bp、197bp和278bp, 其位置、 大小與人、牛和鼠的生長激素基因類似;其核酸序列的組成、內(nèi)含子的位置和長度、啟動子、5′和3′端非轉(zhuǎn)錄區(qū)都有很高的保守性。
2.3 豬GH基因的多態(tài)性研究 Kirkpatrick等首先擴(kuò)增出豬生長激素基因+48~+889位長約842 bp的片段。在17頭無相關(guān)漢普夏和約克夏公豬中檢測到GH基因5′端和第2內(nèi)含子存在RFLP,且5′端的等位基因頻率存在品種間差異[15]。Kirkpatrick等又對24頭無相關(guān)約克夏和19頭遠(yuǎn)交個體的GH基因+206~+711位進(jìn)行了PCR-RFLP檢測,發(fā)現(xiàn)Hae II在+308位呈多態(tài)性,Msp I在+577位呈多態(tài)性[16]。Larsen等用PCR-RFLP技術(shù)分析了丹麥4個豬種GH基因的-119~+486位片段,發(fā)現(xiàn)Apa I于+299位,Cfo I于+330和+379位呈多態(tài)性[17]。方美英等采用PCR-RFLP方法檢測6個豬種(姜曲海豬、內(nèi)江豬、杜洛克豬、桃源豬、香豬、民豬)的GH基因第2外顯子區(qū)的遺傳變異[18]。他們所擴(kuò)增的GH基因座位230bp片段,經(jīng)用Hha I酶切,產(chǎn)生了遺傳多態(tài)性。在此片段上共存在2個Hha I酶切位點,依次產(chǎn)生124bp、49bp和57bp。兩個酶切位點是由507處的C/T替換以及555~556處的G/A和C/A替換形成的。劉紅林等對中國地方豬種生長激素基因Hha I酶切片段的多態(tài)性特征也進(jìn)行了研究,他們采用PCR-RFLP技術(shù)分析了8個中國地方豬種(太湖豬、姜曲海豬、金華豬、皖浙花豬、內(nèi)江豬、香豬、桃源豬、民豬)和4個國外豬品種(皮特蘭豬、長白豬、大約克豬、杜洛克豬),結(jié)果表明,在生長激素第2內(nèi)含子和第2外顯子區(qū)Hha I酶切等位片段的頻率在豬種間存在顯著差異,其結(jié)果與方美英等人的研究結(jié)果一致[19]。
宋成義等(2001)利用PCR-RFLP技術(shù)分析了姜曲海豬GH基因+206~+711位共506 bp片段中的2處突變位點[20],結(jié)果表明,Apa I酶切突變位點G4G4基因型個體的70日齡體重極顯著高于G3G3/G3G4基因型個體(P<0.01);G4G4基因型個體的0~70日齡日增重也極顯著高于G3G3/G3G4基因型個體(P<0.01)。仲飛等以PCR方法擴(kuò)增了GH基因的第1內(nèi)含子,經(jīng)測序表明,擴(kuò)增的GH基因第1內(nèi)含子的序列與Vize等在1987年發(fā)表的序列存在6個堿基的差異,有高度的同源性,同源性達(dá)97.5%,說明GH基因第1內(nèi)含子具有多態(tài)性[21]。俞沛初等采用PCR-RFLP技術(shù)對香豬、上海白豬、大約克夏豬的生長激素基因-119~+715區(qū)域共843bp片段的擴(kuò)增產(chǎn)物,分別用Apa I、Dra I、Msp I 3種限制性內(nèi)切酶檢測酶切位點的多態(tài)性,結(jié)果顯示,3個品種都產(chǎn)生了Apa I的酶切多態(tài)性,經(jīng)測序發(fā)現(xiàn),該酶切位點是由位于第1內(nèi)含子的+295位處的酶切位點缺失所造成的,導(dǎo)致切點缺失的原因是+295位上發(fā)生了G/A替換[22]。
圖1 部分GH基因中限制性多態(tài)位點
所有這些都說明豬的生長激素(GH)基因座位表現(xiàn)出了廣泛的多態(tài)性。綜合以上研究,可繪出部分GH基因中限制性多態(tài)位點圖(圖1)。
2.4 GH基因的研究前景 盡管國內(nèi)外學(xué)者對GH研究較多,但大部分研究集中在對GH的生產(chǎn)和應(yīng)用效果方面,如利用GH基因生產(chǎn)轉(zhuǎn)基因豬和利用基因工程菌株來高效表達(dá)GH基因,以及生長激素對豬生長性能、胴體性狀和組成、肉質(zhì)、營養(yǎng)代謝等的影響。而真正研究GH基因多態(tài)性與生產(chǎn)性能關(guān)系的還不太多。已有的這些研究大多數(shù)集中在對多態(tài)位點的尋找上,其生物學(xué)意義還沒有確定,與生產(chǎn)性能的相關(guān)分析也比較膚淺,尚不能在豬的育種和生產(chǎn)實踐中應(yīng)用。
在今后的研究中,應(yīng)根據(jù)GH基因的多態(tài)性來判斷其基因型,并對這些不同基因型進(jìn)行分析,找出各種基因型與數(shù)量性狀的相關(guān)性,從而將分子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用到動物育種實踐中去。
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