內(nèi)含子
- 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)揭示內(nèi)含子miRNA作為“信號(hào)轉(zhuǎn)換器”調(diào)控植物抗逆的新機(jī)制
。該研究闡明了內(nèi)含子剪切是調(diào)控內(nèi)含子miRNA加工的關(guān)鍵步驟，內(nèi)含子miRNA可以作為“信號(hào)轉(zhuǎn)換器”在增強(qiáng)植物抗逆性中發(fā)揮重要作用。為詳細(xì)研究內(nèi)含子miRNA的加工剪切過程，課題組構(gòu)建并創(chuàng)制了能夠觀察內(nèi)含子miR400剪切的含熒光素酶報(bào)告基因的遺傳材料。通過大范圍的篩選發(fā)現(xiàn)，重金屬鎘離子處理會(huì)特異誘導(dǎo)miR400的內(nèi)含子發(fā)生保留，成熟miR400的產(chǎn)生受到抑制；過表達(dá)miR400降低了擬南芥鎘脅迫抗性，敲低miR400表達(dá)則增強(qiáng)了擬南芥鎘脅迫抗性。進(jìn)一步研
蔬菜 2023年9期2023-12-21
- 豬嵌合RNA BCL2L2-PABPN1剪接調(diào)控、表達(dá)與亞細(xì)胞定位分析
錄通讀，再通過內(nèi)含子剪接將不同基因外顯子連接成一個(gè)嵌合RNA 過程[4]。內(nèi)含子剪接是真核生物基因表達(dá)調(diào)控重要手段，cis-SAGe 和經(jīng)典內(nèi)含子剪接機(jī)制相同，均由剪接位點(diǎn)（Splice sites，SS）、小分子核糖核蛋白等共同參與完成。剪接時(shí)，在剪接增強(qiáng)子、沉默子等剪接調(diào)控元件（Splicing regulatorycis-elements，SRE）調(diào)控下，pre-mRNA 上 SSs 與小分子核糖核蛋白共同裝配成RNA 剪接復(fù)合體，形成套索結(jié)構(gòu)，切除
- 中國家驢MSTN 基因第1 內(nèi)含子多態(tài)性分析
外顯子和2 個(gè)內(nèi)含子組成，其中外顯子序列在不同物種之間屬于高保守性[9-10]，但是基因中外顯子序列約占10%，大部分為內(nèi)含子序列。雖然哺乳動(dòng)物的基因表達(dá)普遍不需要內(nèi)含子，但是內(nèi)含子中含有具備啟動(dòng)子、增強(qiáng)子和抑制子作用和功能的序列以及多種順勢作用元件，對轉(zhuǎn)錄和表達(dá)量有重要的調(diào)控作用[11-12]。內(nèi)含子中堿基發(fā)生突變可能會(huì)引起這些序列功能的改變，影響正常的轉(zhuǎn)錄和翻譯過程。本研究對中國14 個(gè)品種家驢542 個(gè)個(gè)體的MSTN基因第1 內(nèi)含子進(jìn)行多態(tài)性分析，以
中國畜牧雜志 2022年11期2022-11-17
- TGF-β1基因g.8666_8667delAC位點(diǎn)突變與大白豬繁殖性能的關(guān)系
突變位點(diǎn)[第4內(nèi)含子32核苷酸(nt)處C>T突變,第6內(nèi)含子179 nt處 G>A 突變和1 043 nt處C>T突變,3′-UTR 2 490 nt處G>A突變和2 494 nt處G>A突變],共形成2種單倍型CGCAA(記為A)和TATGG(記為K),關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)大白豬群體中KK型母豬的初產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)顯著高于AA型,兩者平均每胎相差1.02頭。為了進(jìn)一步研究TGF-β1基因多態(tài)性與母豬繁殖性能的關(guān)系,本文采用PCR和測序技術(shù)鑒定大白豬TGF-β1基因第
- 小兒支氣管哮喘與信號(hào)傳導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3等位基因相關(guān)性分析
足25 μl。內(nèi)含子11 rs2293152位點(diǎn)擴(kuò)增條件：94℃預(yù)變性5 min，94℃變性30 s連續(xù)8個(gè)循環(huán)，60℃退火45 s，73℃延伸45 s；94℃變性30 s連續(xù)25個(gè)循環(huán)，52℃退火45 s，73℃延伸45 s，73℃延伸5 min。內(nèi)含子23 rs957970位點(diǎn)擴(kuò)增條件：94℃預(yù)變性5 min，94℃變性30 s連續(xù)35個(gè)循環(huán)，50℃退火45 s，73℃延伸45 s，73℃延伸5 min。1.3.3 瓊脂糖凝膠電泳 瓊脂糖凝膠(15 g
臨床軍醫(yī)雜志 2021年12期2022-01-04
- PPR蛋白在植物細(xì)胞器組分轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中的作用機(jī)制
NA剪接是指把內(nèi)含子從前體mRNA (pre- mRNA)上移除，并將外顯子連接起來的過程。與細(xì)胞核基因不同，葉綠體和線粒體基因的外顯子并非連續(xù)分布在環(huán)狀基因組上，而是包含多個(gè)多順反子結(jié)構(gòu)，需要順式剪切和反式剪切形成多個(gè)轉(zhuǎn)錄中間產(chǎn)物，并分別去除內(nèi)含子，才能將外顯子連接起來形成成熟mRNA。發(fā)生在一條前體mRNA之間的剪接，稱為順式剪接(-splicing)，多見于真核生物細(xì)胞核基因的剪接；發(fā)生在不同前體mRNA之間的剪接，稱為反式剪接(-splicing)
遺傳 2021年11期2021-11-27
- 線粒體核糖體蛋白基因中內(nèi)含子序列間匹配特性分析
010022)內(nèi)含子是真核生物基因組的重要組成部分[1-2],在真核生物體內(nèi)普遍存在。內(nèi)含子作為一類特殊的非編碼序列,與基因表達(dá)、細(xì)胞骨架構(gòu)建和動(dòng)態(tài)變化密切相關(guān)[3-4]。例如,內(nèi)含子可以通過剪接來提高mRNA穩(wěn)定性、促進(jìn)mRNA的輸出、增強(qiáng)mRNA的翻譯,進(jìn)而提高基因的表達(dá)[5]。許多研究表明內(nèi)含子中存在基因表達(dá)的重要調(diào)控元件[6]。且內(nèi)含子不僅參與基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控、前體mRNA的加工(主要是選擇性剪接),也參與多種非編碼RNA的功能活動(dòng)[7-8]。內(nèi)含子
內(nèi)蒙古師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)漢文版) 2021年3期2021-06-01
- 探討嵌合內(nèi)含子對非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系PC-9上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的影響
7,8]。嵌合內(nèi)含子(chimeric intron)是由人β-球蛋白第一個(gè)內(nèi)含子5'端剪切序列與人免疫球蛋白IgG重鏈可變區(qū)中內(nèi)含子3'端剪切序列組合而成[9]。有研究表明，嵌合內(nèi)含子能夠提高蛋白在體外的表達(dá)[10-12]以及能顯著促進(jìn)氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶基因(chloramphenicol acetyltransferase,CAT)在小鼠體內(nèi)的表達(dá)[10]。還有研究證實(shí)，它能提高綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)在
海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào) 2021年2期2021-01-27
- 老年高血壓病人血漿蛋白Z水平變化及蛋白Z內(nèi)含子FG79A基因多態(tài)性的臨床意義
平變化及蛋白Z內(nèi)含子FG79A基因多態(tài)性的臨床意義。1 資料與方法1.1 一般資料 選取2018年1月—2019年1月在我院治療的老年高血壓病人220例作為觀察組，其中高血壓1級65例，高血壓2級110例，高血壓3級45例。納入標(biāo)準(zhǔn)：符合世界衛(wèi)生組織制定的原發(fā)性高血壓診斷標(biāo)準(zhǔn)；年齡≥60歲，漢族；病人及家屬知情同意。排除標(biāo)準(zhǔn)：合并惡性腫瘤、肝腎功能障礙、甲狀腺疾病、自身免疫性疾病等其他基礎(chǔ)性疾?。唤?個(gè)月內(nèi)有出血史或手術(shù)史。選取同期健康體檢者220名作為對
中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志 2020年24期2021-01-20
- 基因內(nèi)含子遺傳變異與鴨蛋殼品質(zhì)關(guān)聯(lián)性分析
位點(diǎn)，分別處于內(nèi)含子10的g128643840 G>A、g128643903 G>A和g128643906 G>A，以及內(nèi)含子14的g128659401 T>G，4個(gè)SNP位點(diǎn)中g(shù)128643840 G>A和g128643903 G>A 位點(diǎn)三穗鴨群體中基因型分布均顯著偏離哈代溫伯格平衡（Hardy-Weinberg平衡）（PA、g128643903 G>A及g128659401 T>G位點(diǎn)能顯著提高蛋殼強(qiáng)度（PA位點(diǎn)顯著影響蛋黃色澤（P關(guān)鍵詞：ITPR2
山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào) 2020年2期2020-11-09
- 內(nèi)含子編碼蛋白Mg2+結(jié)合位點(diǎn)功能分析及驗(yàn)證
004）II型內(nèi)含子（Group II intron）是一類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（Retrotransposon），在細(xì)菌、古細(xì)菌以及真核生物葉綠體和線粒體基因組中廣泛存在，尤其以細(xì)菌中最為普遍［1-4］。目前，通過現(xiàn)代基因組測序已鑒定了數(shù)千種細(xì)菌II型內(nèi)含子，在鑒定的細(xì)菌II型內(nèi)含子中，研究最為詳細(xì)的主要包括兩類，第一類是來源于乳酸乳球菌（Lactococcus lactis，Ll.LtrB）的嗜中溫II型內(nèi)含子［5-9］，另一類是來源于Thermosynech
生物技術(shù)通報(bào) 2020年10期2020-11-02
- mRNA序列與相應(yīng)內(nèi)含子序列匹配的普適性分析
研究都開始重視內(nèi)含子對基因表達(dá)的影響[1]。大量研究表明，內(nèi)含子是一類具有生物學(xué)功能的序列。許多基因表達(dá)調(diào)控元件，例如基因轉(zhuǎn)錄和mRNA加工(尤其是可變剪接)，都屬于內(nèi)含子序列的一部分。各種非編碼RNA，例如microRNA和snoRNA，也屬于內(nèi)含子[2]。對內(nèi)含子序列而言，它的丟失和獲得對非編碼RNA變異和基因重組有影響，這是關(guān)系到真核基因進(jìn)化的主要方面[3-7]。許多疾病的發(fā)生是由于內(nèi)含子的突變造成的[8-9]。內(nèi)含子兩端和中間序列的突變，都是因?yàn)榧?/div>
生物信息學(xué) 2020年3期2020-11-02
- 蘋果ANR基因沉默的原因分析
順式作用元件、內(nèi)含子序列、外顯子序列等的變異。結(jié)果表明，其ANR基因沉默可能是由內(nèi)含子產(chǎn)生的變異引起，上述研究結(jié)果為今后的進(jìn)一步研究打下了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞 ? ?蘋果;ANR基因;內(nèi)含子;基因沉默中圖分類號(hào) ? ?S661.1 ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 ? ?A文章編號(hào) ? 1007-5739（2020）15-0057-03 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2020年15期2020-08-16
- 環(huán)狀RNA在缺氧窒息死亡原因推斷中的意義
胞質(zhì)中，而少量內(nèi)含子衍生的circRNA位于細(xì)胞核中［2］；（5） 大多數(shù)circRNA包含外顯子序列，而其中少數(shù)是通過內(nèi)含子環(huán)化形成的［6］；（6）一些circRNA富含來自外顯子的miRNA應(yīng)答元件（MRE）；（7）circRNA在轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮調(diào)控作用。2 CircRNA的形成機(jī)制環(huán)狀RNA來源于其親本基因的轉(zhuǎn)錄，由前體mRNA通過非經(jīng)典的選擇性剪接產(chǎn)生，根據(jù)其來源分為以下三類。2.1 外顯子來源的circRNA（exonic circRNA，廣東公安科技 2020年1期2020-03-12
- 青蘿卜晚抽薹性狀回交轉(zhuǎn)育及FLC2第1內(nèi)含子PCR擴(kuò)增檢測
現(xiàn)FLC基因的內(nèi)含子區(qū)存在變異，其中在內(nèi)含子1和內(nèi)含子2中存在與植株材料抽薹特性顯著相關(guān)的插入-缺失型差異區(qū)域，與晚抽薹性狀密切相關(guān)，但沒有報(bào)道序列及序列長度。白菜中鑒定了4個(gè)FLC基因[10-11]，在蘿卜中有2個(gè)FLC[12]。越來越多的研究證實(shí)FLC2成為抽薹開花時(shí)期的關(guān)鍵基因[12-13]。FLC蛋白不僅會(huì)對擬南芥的開花產(chǎn)生抑制作用，而且在其他開花植物成花的過程中也起到關(guān)鍵的調(diào)控作用[14]。如白菜[15]、花椰菜、油菜[16]中FLC功能也已得到華北農(nóng)學(xué)報(bào) 2019年5期2019-11-05
- 綿羊GH基因的Pvu Ⅱ 位點(diǎn)的多態(tài)性與其生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。劉士力等[5]研究表明，翹嘴鲌生長激素基因全長5 966 bp，其中轉(zhuǎn)錄單元長1 648 bp，由5個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子組成。牛志剛等[6]研究表明，GH基因的AhⅠ位點(diǎn)在新疆褐牛群體中表現(xiàn)為VV、LV和LL三種基因型，而且14月齡的LV和LL基因型個(gè)體的體質(zhì)量、體長均比VV基因型的高，且差異顯著(P許鋒[8]在4個(gè)蛋用品系雞中發(fā)現(xiàn)GH基因內(nèi)含子3中存在2個(gè)AvaⅠ酶切位點(diǎn)，該酶切位點(diǎn)與蛋型指標(biāo)關(guān)聯(lián)顯著(P1 材料與方法1.1 基浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年9期2019-09-25
- N端無半胱氨酸斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子的構(gòu)建
10]。蛋白質(zhì)內(nèi)含子(intein)是具有自我催化活性的蛋白質(zhì)。翻譯成熟后，內(nèi)含子會(huì)自我切除，然后將兩側(cè)的外顯子(extein)以肽鍵的形式連接起來[11]。而斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子(split intein)的N端和C端可以相互識(shí)別，形成有活性的蛋白構(gòu)象，然后發(fā)生反式剪接反應(yīng)(trans-splicing)[12]。在某些情況下，split intein的某一端可以發(fā)生斷裂反應(yīng)(cleavage)：當(dāng)N端外顯子缺失時(shí)，會(huì)催化inetin的C端發(fā)生斷裂，在蛋白的生物學(xué)雜志 2019年4期2019-08-21
- 小麥抗逆相關(guān)基因TaSAP1的5′非翻譯區(qū)內(nèi)含子功能分析
機(jī)制尚不明確。內(nèi)含子是斷裂基因中的非編碼序列,通過選擇性剪接豐富蛋白質(zhì)的多樣性[9],還可以影響宿主基因的表達(dá)[10],這種現(xiàn)象在植物中受到廣泛關(guān)注,已報(bào)道了大量相關(guān)基因,例如玉米Hsp82、Sh1、Adh1、GapA1和Ub1[11-15],水稻OsPB-73、rubi3和OsTub6[16-18],擬南芥MHX、PUX7、PYM和PhADF1[19-21]。擬南芥UBQ10基因啟動(dòng)子與其第一內(nèi)含子融合后使大麥中熒光素酶報(bào)告基因的表達(dá)量增加3 倍[22]作物學(xué)報(bào) 2019年9期2019-08-20
- 大腸桿菌Targetron基因打靶載體構(gòu)建及應(yīng)用*
0004)Ⅱ型內(nèi)含子(group II introns)是一類具有自我剪接功能、可在染色體不同位置移動(dòng)的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子，廣泛存在于細(xì)菌、古細(xì)菌和植物的細(xì)胞器基因組中[1-2]。來源于乳酸乳球菌(lactococcuslactis)的Ll.LtrB內(nèi)含子由內(nèi)含子RNA和內(nèi)含子編碼蛋白(intron-encoded protein，IEP)兩部分組成，其中內(nèi)含子編碼蛋白IEP由反轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)域、成熟酶結(jié)構(gòu)域、DNA結(jié)合域和核酸內(nèi)切酶結(jié)構(gòu)域等多個(gè)功能結(jié)構(gòu)域組成[2-6貴州醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) 2019年7期2019-08-02
- 高效嚴(yán)謹(jǐn)型大腸桿菌Targetron基因打靶系統(tǒng)的構(gòu)建
004）II型內(nèi)含子（Group II Intron）是在細(xì)菌、古細(xì)菌及高等植物細(xì)胞器（線粒體、葉綠體）中發(fā)現(xiàn)的一類核酶，由內(nèi)含子RNA和內(nèi)含子編碼蛋白（Intron Encoded Protein，IEP）組成［1-4]。其中，內(nèi)含子RNA具有核酶活性，通過堿基互補(bǔ)配對原則識(shí)別雙鏈DNA；IEP具有反轉(zhuǎn)錄酶和DNA核酸內(nèi)切酶活性，與內(nèi)含子RNA組裝為核糖核蛋白復(fù)合體，維持內(nèi)含子RNA的空間結(jié)構(gòu)，輔助內(nèi)含子RNA識(shí)別靶位點(diǎn)，并發(fā)揮核酸內(nèi)切酶活性切割靶位點(diǎn)，生物技術(shù)通報(bào) 2019年6期2019-07-26
- 不同方向內(nèi)含子對重組CHO細(xì)胞中神經(jīng)生長因子表達(dá)的影響
王芳?不同方向內(nèi)含子對重組CHO細(xì)胞中神經(jīng)生長因子表達(dá)的影響董衛(wèi)華1,2，李翠萍1，楊赟1，王天云1,2，王芳11 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院 生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室，河南 新鄉(xiāng) 453003 2 河南省分子診斷與醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心，河南 新鄉(xiāng) 453003為了研究不同方向的嵌合體內(nèi)含子對重組神經(jīng)生長因子 (Nerve growth factor，NGF) 基因表達(dá)的影響，以人β-珠蛋白第一內(nèi)含子5?端剪接序列和人免疫球蛋白重鏈可變區(qū)內(nèi)含子3?端剪接生物工程學(xué)報(bào) 2019年6期2019-07-10
- 翹嘴鲌胰島素樣生長因子-Ⅰ的克隆及序列分析
Ⅰ基因具有4個(gè)內(nèi)含子, 其中第2內(nèi)含子較長[4, 5]?；虻?span id="j5i0abt0b" class="hl">內(nèi)含子在調(diào)節(jié)基因的表達(dá)過程中具有重要作用[6], 其中經(jīng)常包含一些微衛(wèi)星和單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Single nucleotide polymorphism, SNP), 有時(shí)與生產(chǎn)性狀密切相關(guān)。阮瑞霞等[4]在吉富羅非魚(Oreochromis niloticus)內(nèi)含子1和內(nèi)含子3中發(fā)現(xiàn)與增重有關(guān)的2個(gè)SNP; 鯉(Cyprinus carpio)內(nèi)含子1和2中也存在2個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)與體質(zhì)量有關(guān)水生生物學(xué)報(bào) 2019年2期2019-03-11
- 真核生物基因組長內(nèi)含子遞歸剪接事件的分子機(jī)制
核生物基因組長內(nèi)含子遞歸剪接事件的分子機(jī)制魏金川1，徐添翼1，吳靜1,2，宋曉峰11. 南京航空航天大學(xué)自動(dòng)化學(xué)院，南京 211106 2. 南京醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程與信息學(xué)院，南京 211166在高等真核生物基因組轉(zhuǎn)錄過程中，一次剪接可完成短內(nèi)含子的去除，而較長內(nèi)含子(>10 kb)則需通過多次剪接方可去除。多次剪接去除長內(nèi)含子的過程通常被稱為遞歸性剪接。已有研究表明，遞歸性剪接事件與諸多生物學(xué)過程及疾病的發(fā)生發(fā)展有著密切的聯(lián)系。近年來，關(guān)于遞歸性剪接的遺傳 2019年2期2019-02-28
- ATP7A基因內(nèi)含子突變致Menkes病1家系2例報(bào)告
72 號(hào)編碼區(qū)內(nèi)含子c.2172+5＿2172+6insTGAAT表型正常的攜帶者(圖3MD)，胎兒出生后發(fā)育正常。2 文獻(xiàn)復(fù)習(xí)本文2例患兒的ATP7A基因突變?yōu)?span id="j5i0abt0b" class="hl">內(nèi)含子突變(c.2172+5_2172+6 insTGAAT)，在萬方、中國知網(wǎng)、PubMed和EBSCO數(shù)據(jù)庫中檢索類似病例，檢索時(shí)間為建庫至2018年12月1日。中文數(shù)據(jù)庫以“萬方醫(yī)學(xué)網(wǎng)”為例，檢索式為((Menkes病) ANDATP7A) AND 內(nèi)含子突變。英文數(shù)據(jù)庫以PubMed為例，中國循證兒科雜志 2018年6期2019-01-25
- “垃圾DNA”不“垃圾”
現(xiàn)，這些被稱為內(nèi)含子的片段有助于酵母在艱難時(shí)期存活。這項(xiàng)研究揭示了DNA的另一種可能的功能，科學(xué)家曾認(rèn)為這種功能是無用的。未參與該研究的美國加州舊金山州立大學(xué)進(jìn)化分子生物學(xué)家Scott Roy說：“這些結(jié)果非常令人信服，也非常令人興奮?！边@項(xiàng)研究開啟了了解“內(nèi)含子作用的全新范式”。加州大學(xué)洛杉磯分校酵母微生物學(xué)家Guillaume Chanfreau說，這也回答了一個(gè)長期存在的問題：為什么酵母保留了以前被認(rèn)為是“垃圾DNA”的東西。內(nèi)含子普遍存在于植物和真醫(yī)藥前沿 2019年18期2019-01-04
- 豬Nramp1基因內(nèi)含子6的SNP多態(tài)性分析
外顯子和14個(gè)內(nèi)含子，編碼氨基酸數(shù)539[1-3]，表達(dá)于網(wǎng)狀內(nèi)皮細(xì)胞器官的巨噬細(xì)胞中，如豬的脾臟、大腦、肺臟的免疫器官，用于抵抗外來病原微生物的作用[4]。其作用機(jī)制為存在于巨噬細(xì)胞中的內(nèi)吞小體通過消耗含有病原微生物吞噬體中的Fe2+和Mn2+等二價(jià)金屬離子，使病原微生物缺乏合成的酶系從而使動(dòng)物免受細(xì)菌等病原體的侵害[5]。由于豬Nramp1基因具有良好的特異性，因此可作為研究豬免疫疾病的候選基因之一。前人已對豬Nramp1基因內(nèi)含子6做了大量研究，楊軍現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2018年10期2018-12-03
- 人SLC25A13基因內(nèi)含子突變IVS6-11A>G導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄子剪接異常
變居多，而位于內(nèi)含子以內(nèi)導(dǎo)致剪接異常的突變有多種，多位于與內(nèi)含子相鄰的5個(gè)內(nèi)含子堿基內(nèi)[13-14].位于內(nèi)含子較深內(nèi)部的突變，目前僅發(fā)現(xiàn)1例IVS6-11A>G報(bào)道，且文獻(xiàn)未能確切證實(shí)該突變會(huì)引起異常剪接及剪接異常形式[15].本研究通過pSPL3外顯子捕獲質(zhì)粒設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)，確認(rèn)SLC25A13基因IVS6-11A>G (c.615-11A>G) 會(huì)導(dǎo)致出現(xiàn)新的剪接位點(diǎn).1 材料與方法1.1 材料胎牛血清，DMEM培養(yǎng)基購自美國Gibco公司；TRIzolT暨南大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版） 2018年5期2018-10-29
- 定向進(jìn)化后Cne PRP8蛋白質(zhì)內(nèi)含子的剪接機(jī)理研究
620)蛋白質(zhì)內(nèi)含子(intein)是在前體蛋白質(zhì)中的一段多肽序列，其能夠借助自身發(fā)生的催化反應(yīng)由前體蛋白質(zhì)中成功地剪切出來，同時(shí)將兩側(cè)的蛋白質(zhì)序列(蛋白質(zhì)外顯子，extein)以天然肽鍵連接，形成成熟蛋白質(zhì)[1-2]，這一過程被稱為蛋白質(zhì)內(nèi)含子介導(dǎo)的蛋白質(zhì)剪接。蛋白質(zhì)內(nèi)含子根據(jù)其結(jié)構(gòu)特征可分為3類，即標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)內(nèi)含子(canonical intein)，微小蛋白質(zhì)內(nèi)含子(mini-intein)和斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子(split-intein)[3]。由標(biāo)準(zhǔn)生物學(xué)雜志 2018年5期2018-10-15
- HaV01 Pol內(nèi)部半胱氨酸對其剪接活性的影響
620)蛋白質(zhì)內(nèi)含子(intein)是位于蛋白質(zhì)前體中的一段多肽序列。通過蛋白質(zhì)剪接，它可以從前體蛋白中自我切除，同時(shí)將兩端的外顯子以肽鍵的形式連接起來，形成成熟的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)內(nèi)含子根據(jù)其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)可分為3種類型：標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)內(nèi)含子、微小蛋白質(zhì)內(nèi)含子和斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子[1-2]。每一類蛋白質(zhì)內(nèi)含子都有3個(gè)區(qū)域，N端剪接結(jié)構(gòu)域、中間歸巢核酸內(nèi)切酶區(qū)域或中間連接子(Linker)和C端剪接結(jié)構(gòu)域[3-4]。根據(jù)蛋白質(zhì)內(nèi)含子剪接過程的不同，將內(nèi)含子又分為3種類型，生物學(xué)雜志 2018年5期2018-10-15
- 內(nèi)含子的特異性識(shí)別與選擇性剪切*
0108）1 內(nèi)含子的分類對于大部分真核生物來說， 其基因通常是不連續(xù)的， 即在編碼序列間存在至少一個(gè)以上的間插序列，編碼序列稱為外顯子（exon），間插序列稱為內(nèi)含子（intron）。 DNA 編碼鏈轉(zhuǎn)錄形成前體RNA時(shí)，前體RNA 中包含大量內(nèi)含子，這些內(nèi)含子必須通過剪切反應(yīng)去除， 并且將外顯子部分連成一條鏈，前體mRNA（precursor mRNA）才能形成成熟的mRNA， 翻譯成相關(guān)蛋白， 這個(gè)過程稱為RNA剪接。 在RNA 剪接過程中，剪接復(fù)合生物學(xué)通報(bào) 2018年12期2018-10-10
- 環(huán)狀RNA及其生物學(xué)功能概述
質(zhì)中，但少部分內(nèi)含子來源的circRNA則存在于核內(nèi)，具有一定的組織、時(shí)序和疾病特異性；②廣泛存在于真核細(xì)胞中，部分基因的circRNA表達(dá)水平甚至比mRNA高10倍以上；③與傳統(tǒng)的線性RNA (linear RNA)不同，circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)，不具有5′末端帽子和3′末端poly(A)尾巴，比線性RNA更穩(wěn)定，不易被核酸外切酶(RNase R)降解，其半衰期可超過48h，而mRNA平均只有10h[4]。1.3 circRNA的類別 理論上，c生物學(xué)教學(xué) 2018年12期2018-08-15
- 陸地棉GhDHN1基因結(jié)構(gòu)及內(nèi)含子生物信息學(xué)分析
個(gè)90 bp的內(nèi)含子，響應(yīng)低溫脅迫，在細(xì)胞膜附近起作用[4]；其啟動(dòng)子含有多個(gè)響應(yīng)非生物逆境脅迫的順式作用元件[5]。內(nèi)含子是真核生物基因組中的獨(dú)特成分，在基因演變過程中起著重要的作用[6]?；虻?span id="j5i0abt0b" class="hl">內(nèi)含子在調(diào)控基因表達(dá)方面的研究也越來越受到科研人員的重視[7]。本研究在前期研究的基礎(chǔ)上，對陸地棉脫水素基因GhDHN1的結(jié)構(gòu)和內(nèi)含子進(jìn)行生物信息學(xué)分析，旨在揭示棉花脫水素基因響應(yīng)非生物脅迫的機(jī)制。1 材料與方法1.1 供試數(shù)據(jù)庫陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫（http:/中國棉花 2018年6期2018-07-06
- 千屈菜科中rpl2基因內(nèi)含子缺失現(xiàn)象探析
薇葉綠體基因組內(nèi)含子的研究較少，而在植物進(jìn)化過程中基因的內(nèi)含子丟失現(xiàn)象廣泛發(fā)生。對鼠耳芥Arabidopsis thaliana的研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子丟失與植物基因突變率有明顯相關(guān)性[7]，這為紫薇葉綠體基因組內(nèi)含子研究及紫薇育種在分子水平上提供了參考。真核生物細(xì)胞基因 DNA中把編碼區(qū)域間隔開來的序列為內(nèi)含子（Intron），在基因轉(zhuǎn)錄后剪接去除[8]，內(nèi)含子作為真核生物基因組的組成部分，與基因表達(dá)過程關(guān)系密切，內(nèi)含子極大的豐富了轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的數(shù)量和種類，并在mR浙江林業(yè)科技 2018年2期2018-06-20
- 環(huán)狀RNA研究進(jìn)展
cRNAs）、內(nèi)含子circRNA（IntroniccircRNAs, ciRNAs）外顯子-內(nèi)含子 circRNA（Exon-intron circRNAs，EIciRNAs）、基因間 circRNA（IntergeniccircRNA）[3]。關(guān)于circRNA的生物發(fā)生，目前已經(jīng)提出兩種假說，分別是“內(nèi)含子配對驅(qū)動(dòng)環(huán)化”（直接反向剪接）和“套索驅(qū)動(dòng)環(huán)化”（外顯子跳讀），當(dāng)前主流觀點(diǎn)認(rèn)為反向剪接機(jī)制在circRNA的生物發(fā)生過程中起重要的調(diào)控作用[4]生物化工 2018年6期2018-04-02
- 棉花GhFAD2-1基因5’UTR內(nèi)含子的克隆與序列分析
上游5'UTR內(nèi)含子序列，對研究GhFAD2-1時(shí)空表達(dá)特性及調(diào)控的分子機(jī)制具有重要的意義?！厩叭搜芯窟M(jìn)展】包括陸地棉(G.hirsutum)、海島棉(G.barbadense)、雷蒙德氏棉(G.raimondii)以及魯賓遜氏棉(G.robinsonii)等棉屬的FAD2-1基因的上游序列都含有一個(gè)位于5'非翻譯區(qū)(5'UTR)的內(nèi)含子[2]；GhFAD2-1的啟動(dòng)子序列則位于該5'UTR內(nèi)含子的上游，由于GhFAD2-1的上游區(qū)域含有內(nèi)含子，所以增加了新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年1期2018-03-13
- 環(huán)狀RNA及其在畜禽中的研究進(jìn)展
r RNA)、內(nèi)含子來源的circRNA(intronic circular RNA)及由外顯子和內(nèi)含子共同組成的circRNA(exonic -intronic circular RNA, ElciRNA)。1.1 外顯子來源circRNA和ElciRNA的形成機(jī)制關(guān)于exonic circRNA 和ElciRNA的形成機(jī)制主要有3種：直接反式剪接、外顯子跳躍和內(nèi)含子配對驅(qū)動(dòng)的環(huán)化。直接反式剪接是由同一個(gè)外顯子下游的3′端和上游的5′端相結(jié)合，使下游的供西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年3期2018-01-29
- 5種鳥類FoxP2的分子進(jìn)化分析
列進(jìn)行外顯子和內(nèi)含子分區(qū)。以家雞FoxP2的外顯子和內(nèi)含子序號(hào)為參照進(jìn)行基因區(qū)域的編號(hào)。使用BioEdit 7.1.3統(tǒng)計(jì)基因的堿基組成；堿基偏選使用的公式為：AT skew = (A-T)/(A+T), GC skew=(G-C)/(G+C)。1.2.2 基因序列的比對及堿基替代模型的分析通過MAFFT 7 在線分析平臺(tái)(mafft.cbrc.jp/alignment/software/)對核苷酸和氨基酸進(jìn)行序列比對。使用ModelGenerator V生物學(xué)雜志 2017年5期2017-10-16
- 豬IGF2基因多態(tài)性研究
IGF2）基因內(nèi)含子3的3 072位點(diǎn)在大白、長白、杜洛克3個(gè)品種中的多態(tài)性，并分析不同基因型與100 kg體重日齡和背膘厚的關(guān)系。結(jié)果表明，在3個(gè)品種中均存在A、G基因型，且A基因型為優(yōu)勢基因型。3個(gè)品種中A基因型個(gè)體背膘厚顯著低于G基因型個(gè)體（P＜0.05），而不同基因型間100 kg體重日齡無顯著差異。結(jié)果提示IGF2可作為脂肪沉積的候選基因應(yīng)用于標(biāo)記輔助選擇。豬；IGF2基因；多態(tài)性；背膘厚胰島素樣生長因子2基因（Insulinlike Growt豬業(yè)科學(xué) 2017年2期2017-03-30
- 甘藍(lán)型油菜BnFAD2-C5基因啟動(dòng)子及內(nèi)含子在表達(dá)水平的功能分析
5基因啟動(dòng)子及內(nèi)含子在表達(dá)水平的功能分析劉睿洋**劉 芳**張振乾 官春云*湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院 / 國家油料改良中心湖南分中心， 湖南長沙 410128富含油酸的菜籽油具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值， 使得高油酸育種及油酸形成機(jī)制成為熱點(diǎn)。油酸脫氫酶基因（FAD2基因）是控制油酸含量的關(guān)鍵酶基因。本文針對BnFAD2-C5基因展開研究， 根據(jù)油菜和甘藍(lán)的同源性， 克隆了1257 bp啟動(dòng)子序列， 利用 GUS和 GFP作為報(bào)告基因分別構(gòu)建含有不同片段長度的啟動(dòng)子和內(nèi)含作物學(xué)報(bào) 2016年10期2016-10-19
- 泥蚶HDAC1基因cDNA全長、內(nèi)含子克隆及時(shí)空表達(dá)特征分析
cDNA全長、內(nèi)含子克隆及時(shí)空表達(dá)特征分析任付真1，2，姚韓韓2，董迎輝2，周小龍1，林志華2*(1. 上海海洋大學(xué) 水產(chǎn)與生命學(xué)院，上海 201306；2.浙江萬里學(xué)院 生物與環(huán)境學(xué)院 浙江省水產(chǎn)種質(zhì)資源高效利用技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，浙江 寧波 315100)摘要：HDAC1作為HDACs家族中重要成員，可使組蛋白去乙?；M(jìn)而調(diào)節(jié)基因表達(dá)，在細(xì)胞分化和胚胎早期發(fā)育中起重要作用。本文利用SMART RACE技術(shù)克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的海洋學(xué)報(bào) 2016年8期2016-08-09
- CYP3A4*1G依賴的CYP3A4內(nèi)含子10啟動(dòng)的真核表達(dá)載體的構(gòu)建*
的CYP3A4內(nèi)含子10啟動(dòng)的真核表達(dá)載體的構(gòu)建*趙云龍1)，楊衛(wèi)紅1)，閆良2)，魏璐嫚2)，王沛3)， 張衛(wèi)4)，曾昭書1)#，張莉蓉2)#1)鄭州大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)教研室 鄭州 4500012)鄭州大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院藥理學(xué)教研室 鄭州 4500013)鄭州大學(xué)藥學(xué)院藥理學(xué)系 鄭州 4500014)鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院麻醉科 鄭州 450052關(guān)鍵詞CYP3A4；真核表達(dá)載體；啟動(dòng)子；內(nèi)含子摘要目的：構(gòu)建CYP3A4*1G依賴的CYP3A4內(nèi)含子10啟動(dòng)- 真菌線粒體基因組大小變化
守的，但基因內(nèi)內(nèi)含子的數(shù)目和分布是多樣的，且各基因間的順序也是可變的[5]。下面筆者將對真菌線粒體基因組的大小變化作相應(yīng)描述，并且對其影響因素進(jìn)行分析。1真菌線粒體基因組大小變化真菌線粒體基因組大小變化是線粒體進(jìn)化研究的一個(gè)重要方面。Bullerwell等[2]365對已測序、公布的真菌類群的線粒體基因組進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)真菌類群線粒體基因組尺寸變化很大。其中，以物種間和物種內(nèi)線粒體基因組變化較典型。1.1物種間線粒體基因組大小變化日益增加的真菌線粒體基因組測安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年1期2016-03-19
- 莊河大骨雞生長激素受體基因內(nèi)含子2多態(tài)性的研究
長激素受體基因內(nèi)含子2多態(tài)性的研究謝明欣，許 紅，畢 雪，朱弘焱，蘇玉虹，田玉民?（遼寧醫(yī)學(xué)院畜牧獸醫(yī)學(xué)院，遼寧 錦州 121001）為研究莊河大骨雞生長激素受體（GHR）基因內(nèi)含子2特點(diǎn)，本試驗(yàn)從200只大骨雞血液中提取DNA，PCR擴(kuò)增GHR內(nèi)含子2后進(jìn)行HindⅢ酶切和瓊脂糖凝膠電泳。研究結(jié)果表明，所選取的200只莊河大骨雞GHR基因內(nèi)含子2片段均能得到PCR擴(kuò)增，產(chǎn)物大小為914 bp；擴(kuò)增產(chǎn)物中具有2個(gè)HindⅢ酶切位點(diǎn)，均能獲得3個(gè)酶切片段（5現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2015年5期2015-01-04
- 昆蟲JHE 基因結(jié)構(gòu)及與甲基化相關(guān)的CpG O/E 值分析
基因的外顯子或內(nèi)含子區(qū)域中(Huang et al.，2006)。目前已經(jīng)克隆出多種昆蟲的JHE 基因，但多數(shù)報(bào)道的是保幼激素酯酶蛋白質(zhì)編碼序列，對該基因的外顯子和內(nèi)含子等序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行進(jìn)一步分析的則很少。本研究在NCBI數(shù)據(jù)庫中下載了已公布的4種昆蟲的全基因組序列和完整的JHE 基因序列，通過序列比對分析確定各JHE 基因的外顯子和內(nèi)含子等結(jié)構(gòu)區(qū)域，然后對各個(gè)區(qū)域的CpG 位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)并計(jì)算出CpG O/E 值，分析這些區(qū)域可能的甲基化情況，為進(jìn)一步明確J環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào) 2014年5期2014-12-16
- 吉林松原地區(qū)CD36基因單體型與2型糖尿病的相關(guān)性研究
)患者CD36內(nèi)含子3(intron 3)［TG］重復(fù)序列基因多態(tài)性分布情況進(jìn)行研究, 探討該基因多態(tài)性與2型糖尿病的相關(guān)性。方法 應(yīng)用 PCR和直接測序法對40例正常組和193例2型糖尿病患者CD36內(nèi)含子3 ［TG］重復(fù)序列基因多態(tài)性進(jìn)行分析。結(jié)果 ①CD36內(nèi)含子3 ［TG］重復(fù)序列有5種單體型, 即［TG］重復(fù)次數(shù)為11、12、13、15、16次。②正常組與2型糖尿病患者之間CD36內(nèi)含子3 ［TG］重復(fù)序列各種單體型及基因型分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(中國實(shí)用醫(yī)藥 2014年11期2014-09-04
- 鳡肌肉生長抑制素基因內(nèi)含子和部分啟動(dòng)子序列的克隆與分析
了該基因的兩個(gè)內(nèi)含子和啟動(dòng)子區(qū)，為其結(jié)構(gòu)和表達(dá)特點(diǎn)的研究打下基礎(chǔ).1 材料與方法1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及總DNA提取鳡由江蘇省蘇州市長江特色水產(chǎn)工程中心提供，取其肌肉，采用酚、氯仿法提取基因組DNA，保存于-80℃冰箱.1.2 鳡MSTN內(nèi)含子的擴(kuò)增通過鳡MSTN的cDNA序列和鯉魚（Cyprinus carpio）MSTN的基因序列（GU014395.1）的比對，分別在鳡MSTN 兩個(gè)內(nèi)含子上 下游的外顯子上 設(shè)計(jì)引 物 gynhza5：5′-AACATGCC常熟理工學(xué)院學(xué)報(bào) 2014年2期2014-06-17
- 甘蔗SoNIN1基因結(jié)構(gòu)及其內(nèi)含子信息分析
1基因結(jié)構(gòu)及其內(nèi)含子信息分析?？∑?吳朝興1楊麗濤1，2李楊瑞1，2（1. 廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院 亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，南寧 530005；2. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究中心 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所 農(nóng)業(yè)部廣西甘蔗生物技術(shù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 廣西甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室，南寧 530007）根據(jù)前期克隆得到的SoNIN1基因的全長cDNA和部分啟動(dòng)子序列設(shè)計(jì)引物，應(yīng)用PCR技術(shù)從甘蔗葉片gDNA中克隆S生物技術(shù)通報(bào) 2014年12期2014-03-22
- 人多巴胺D2受體基因內(nèi)含子區(qū)51103 T/C多態(tài)性對基因轉(zhuǎn)錄活性的影響
RD2基因第3內(nèi)含子區(qū)51 103 bp位點(diǎn)的rs2075652多態(tài)性可能與PTSD的易患性相關(guān)，然而截至目前該位點(diǎn)的具體生物學(xué)機(jī)制還不十分清楚。鑒于此，本研究擬構(gòu)建含單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs2075652位點(diǎn)的DRD2基因熒光素酶表達(dá)載體，為今后探索其生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。1 材料與方法1.1 材料 pmirGlo質(zhì)粒、海腎熒光素酶表達(dá)質(zhì)粒pRL-SV40、DNA純化試劑盒和雙熒光素酶報(bào)道基因試劑盒均為Promega公司產(chǎn)品;質(zhì)粒提取試劑盒、基因組DN解放軍醫(yī)藥雜志 2014年11期2014-03-06
- 決明查爾酮合成酶全長基因序列的克隆與分析
們被一個(gè)或多個(gè)內(nèi)含子所間隔，這些內(nèi)含子在轉(zhuǎn)錄后被除去以形成具有完整讀碼框的mRNA。盡管真核生物基因翻譯后獲得的蛋白質(zhì)序列中不含有內(nèi)含子的信息，但是內(nèi)含子的存在對基因表達(dá)有著積極的作用，能夠促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄、促進(jìn)mRNA的翻譯、參與基因的差異表達(dá)，是真核生物基因表達(dá)調(diào)控的重要元件之一。黃酮類化合物是一類重要的植物次級代謝產(chǎn)物，在植物花色形成、植物育種、低抗紫外線輻射、防止病原微生物侵染中都發(fā)揮了重要作用。并且，黃酮類化合物還具有預(yù)防心血管疾病、抗癌、調(diào)節(jié)免疫、生物技術(shù)通報(bào) 2013年5期2013-12-23
- 應(yīng)用基因測序方法檢測哮喘兒童的PTEN基因突變
TEN基因第8內(nèi)含子的第32個(gè)堿基發(fā)生突變，T→G，突變率為83.3%（25／30）。對照組物基因突變。突變位點(diǎn)見圖1所示。2.2 外周血EOS計(jì)數(shù)結(jié)果2.2.1 哮喘組兒童外周血EOS計(jì)數(shù)明顯高于對照組兒童，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＜0.05），見表2所示。2.2.2 哮喘患兒中，根據(jù)有無發(fā)生PTEN基因第8內(nèi)含子突變，分為基因突變組和基因正常組，組間性別、年齡差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。PTEN基因發(fā)生突變的哮喘患兒外周血EOS計(jì)數(shù)高于無突變的哮喘兒童，差異顯著（中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué) 2013年5期2013-11-24
- 含內(nèi)含子的核糖體蛋白基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)情況分析
55011）含內(nèi)含子的核糖體蛋白基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)情況分析丁雪梅（曲靖師范學(xué)院 數(shù)學(xué)與信息科學(xué)學(xué)院，云南 曲靖 655011）選取69個(gè)含內(nèi)含子的核糖體蛋白基因，抽取其中每個(gè)基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近長度為100個(gè)堿基的序列，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)為堿基A的占92.8%，給出由位點(diǎn)狀態(tài)轉(zhuǎn)移到位點(diǎn)后與位點(diǎn)相鄰狀態(tài)的一步轉(zhuǎn)移概率矩陣P以及由位點(diǎn)前與位點(diǎn)相鄰狀態(tài)轉(zhuǎn)移到位點(diǎn)狀態(tài)的一步轉(zhuǎn)移概率矩陣 .含內(nèi)含子的核糖體蛋白基因中富含堿基A，T的序列可能有利于基因的轉(zhuǎn)錄.內(nèi)含子；核糖赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)·自然科學(xué)版 2013年4期2013-07-31
- 利用β-纖維蛋白原第7內(nèi)含子分析三種鶴的親緣關(guān)系
。細(xì)胞核基因的內(nèi)含子是普遍存在的，并且相鄰的外顯子的核苷酸序列是保守的，能獨(dú)立快速發(fā)展的DNA，內(nèi)含子序列的研究成為動(dòng)物分子系統(tǒng)學(xué)的基礎(chǔ)[5]。β-纖維蛋白原第7內(nèi)含子是一個(gè)富含AT的內(nèi)含子，其堿基組成的變化代表著鳥類的進(jìn)化[6]。β-纖維蛋白原核苷酸的多態(tài)性檢測曾被用于貓科[7]等哺乳動(dòng)物[8]及某些鳥類[6，9]的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析。本文以三種鶴類為研究對象，以火烈鳥為對照，通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)以及測序?qū)嶒?yàn)，分析β-纖維蛋白原第七內(nèi)含子的核苷酸多態(tài)性，從DN黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào) 2013年3期2013-07-04
- 杜仲M(fèi)EP途徑系列基因的基因結(jié)構(gòu)預(yù)測
10-13]。內(nèi)含子（intron）為真核細(xì)胞基因DNA中的間插序列，這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA，但隨即被剪輯除去而不翻譯。大約80%～85%的高等植物含有內(nèi)含子，不同基因的內(nèi)含子數(shù)目各異。長期以來，人們普遍認(rèn)為內(nèi)含子沒有功能作用，隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展，人們發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子在基因表達(dá)調(diào)控中有很重要的作用，內(nèi)含子會(huì)影響基因表達(dá)模式，可以增強(qiáng)基因表達(dá)水平，還能驅(qū)動(dòng)基因表達(dá)[14]。隨著對內(nèi)含子功能認(rèn)識(shí)的逐步深入，內(nèi)含子將會(huì)成為精確地調(diào)控目的基因表達(dá)的有力工具，在基因工經(jīng)濟(jì)林研究 2013年4期2013-04-03
- 應(yīng)用EST－ILPs分子標(biāo)記技術(shù)快速鑒定菟絲子屬種子
來源于編碼區(qū)，內(nèi)含子位置通常較為保守；而不同種或地理亞種間的內(nèi)含子長度又存在差異，故用它建立的ILPs分子標(biāo)記在種間鑒定上具有優(yōu)越性。采用ILPs（intron length polymorphisms）分子標(biāo)記在菟絲子屬的分類鑒定上國內(nèi)外均未見報(bào)道。因此本研究利用旋花科（Convolvulaceae）番薯屬（Ipomoea）的EST（expressed sequence tags，Tags，表達(dá)序列標(biāo)簽）序列，通過網(wǎng)站（http：∥ibi.zju.edu植物保護(hù) 2012年6期2012-09-28
- 蛋白質(zhì)剪接在蛋白質(zhì)研究和蛋白質(zhì)工程中的應(yīng)用
g）是由蛋白質(zhì)內(nèi)含子介導(dǎo)的在蛋白質(zhì)水平上翻譯后的加工過程。蛋白質(zhì)內(nèi)含子（intein）是指前體蛋白中的一段插入序列，它在蛋白質(zhì)翻譯后的成熟過程中能自我催化，使自身從前體蛋白中切除，并將其兩側(cè)的多肽片段以肽鍵連接，形成成熟的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)內(nèi)含子的發(fā)現(xiàn)豐富了基因表達(dá)和蛋白質(zhì)翻譯成熟過程的理論，而且在蛋白質(zhì)研究和蛋白質(zhì)工程中有廣泛的應(yīng)用。本文試圖綜述蛋白質(zhì)剪接在蛋白質(zhì)特異位點(diǎn)標(biāo)記、蛋白質(zhì)片段化標(biāo)記同位素、蛋白質(zhì)環(huán)化、蛋白質(zhì)芯片、基因治療等研究中的應(yīng)用。蛋白質(zhì)內(nèi)含自然雜志 2012年1期2012-01-24
- 松江鱸Myostatin基因內(nèi)含子和線粒體D-loop DNA序列分析
個(gè)外顯子和兩個(gè)內(nèi)含子組成[3-5]，我們對松江鱸MSTN基因的全長cDNA和組織表達(dá)特異性作了研究[6]，但目前對松江鱸MSTN基因的內(nèi)含子序列尚未有報(bào)道.mtDNA是獨(dú)立于細(xì)胞核基因組外的環(huán)狀雙鏈DNA分子，在mtDNA上存在一個(gè)獨(dú)特的D-loop結(jié)構(gòu)，是整個(gè)線粒體基因組序列和長度變異最大的區(qū)域，其進(jìn)化速度最快.線粒體DNA的D-loop區(qū)可用于研究物種起源和進(jìn)化以及種內(nèi)種群的系統(tǒng)進(jìn)化分析，探討物種在進(jìn)化過程中可能發(fā)生的變異情況.魚類mtDNA是一個(gè)相對常熟理工學(xué)院學(xué)報(bào) 2011年2期2011-02-08
- 新疆鎖陽線粒體nad 1基因第2內(nèi)含子序列居群間變異分析△
d 1基因第2內(nèi)含子序列居群間變異分析△王果平1，王川易2，賈新岳1，郭寶林2*（1.新疆中藥民族藥研究所，新疆 烏魯木齊 830002；2.中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)藥用植物研究所，北京 100193）目的：對分布于新疆的鎖陽Cynomorium songaricum4個(gè)居群22個(gè)個(gè)體進(jìn)行了線粒體nad1基因第2內(nèi)含子序列的比較研究，分析序列居群差異。方法：提取鎖陽DNA，用通用引物擴(kuò)增線粒體nad1基因第2內(nèi)含子序列，ClustalW軟件比較分析序中國現(xiàn)代中藥 2010年10期2010-10-16
- Htra2基因內(nèi)含子5-59A/G位點(diǎn)多態(tài)性與帕金森病的相關(guān)性研究
1977年發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子以來,內(nèi)含子功能的研究一直受到人們的關(guān)注。在許多基因的內(nèi)含子中均發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)的調(diào)控元件,其中大多為增強(qiáng)元件,可以調(diào)控轉(zhuǎn)錄的起始來增強(qiáng)基因的表達(dá);此外,一些內(nèi)含子在基因的表達(dá)中起抑制作用;一些基因的內(nèi)含子突變會(huì)引起基因表達(dá)效應(yīng)的變化。單核苷酸多態(tài)性是一種重要的遺傳標(biāo)記。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)Htra2基因多個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)與帕金森病相關(guān)[4-5]。Htra2基因內(nèi)含子5-59A/G(rs2241027)位點(diǎn)的多態(tài)性(等位基因?yàn)锳和G)與帕金森病關(guān)系中國康復(fù)理論與實(shí)踐 2010年7期2010-08-09
- 血友病A的基因診斷研究
I-PCR檢測內(nèi)含子22倒位 引物設(shè)計(jì)和反應(yīng)條件參照文獻(xiàn)[3,4],根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物的片段長度進(jìn)行判斷。正常人的I-PCR產(chǎn)物片段為487 bp,內(nèi)含子22倒位者產(chǎn)物片段為559 bp,倒位攜帶者產(chǎn)物片段為487 bp和559 bp 2條帶。1.3.2 PCR檢測內(nèi)含子1倒位 對內(nèi)含子22倒位陰性者,進(jìn)一步檢測內(nèi)含子1倒位。按文獻(xiàn)[5]方法操作,分別擴(kuò)增F8基因內(nèi)含子1中的Int1h-1片段及F8基因外的Int1h-2片段,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后觀察電泳條帶。中國產(chǎn)前診斷雜志(電子版) 2010年2期2010-08-04
- 蘋果ANR基因沉默的原因分析