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      預(yù)擴(kuò)增qPCR方法檢測(cè)少量小鼠早期胚胎細(xì)胞中DNA甲基化相關(guān)基因的表達(dá)

      2016-03-19 07:55:53孫平楠謝慶東周小玲頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞P2實(shí)驗(yàn)室廣東汕頭5504頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院生殖醫(yī)學(xué)中心廣東汕頭5504東省感染病與分子免疫病理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室廣東汕頭5504
      癌變·畸變·突變 2016年1期
      關(guān)鍵詞:小鼠

      程 琳,孫平楠,3,謝慶東,2,周小玲,2,3,*(. 汕 頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞P2實(shí)驗(yàn)室,廣東 汕頭 5504;2. 汕 頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院生殖醫(yī)學(xué)中心,廣東 汕頭 5504;3. 廣 東省感染病與分子免疫病理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 汕頭 5504)

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      預(yù)擴(kuò)增qPCR方法檢測(cè)少量小鼠早期胚胎細(xì)胞中DNA甲基化相關(guān)基因的表達(dá)

      程 琳1,2,3,孫平楠1,3,謝慶東1,2,周小玲1,2,3,*
      (1. 汕 頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞P2實(shí)驗(yàn)室,廣東 汕頭 515041;2. 汕 頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院生殖醫(yī)學(xué)中心,廣東 汕頭 515041;3. 廣 東省感染病與分子免疫病理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 汕頭 515041)

      【摘要】目的: 比較3種實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)方法對(duì)少量小鼠早期胚胎細(xì)胞中甲基化相關(guān)基因表達(dá)水平的檢測(cè)效果,以期獲得適合日常檢測(cè)的方法。方法:分別應(yīng)用常規(guī)qPCR方法、基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法、基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法3種方案對(duì)少量小鼠早期胚胎細(xì)胞樣本中甲基化相關(guān)基因TET1、TET2、TET3、DNMT3A的mRNA表達(dá)進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果:3種方法的靈敏度由高到低依次為基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法、基于PCR預(yù)擴(kuò)增qPCR方法、常規(guī)qPCR方法。前兩種方法均能在合適的循環(huán)數(shù)下對(duì)少量小鼠胚胎細(xì)胞中的多個(gè)甲基化相關(guān)基因表達(dá)進(jìn)行定量。而基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法比基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法更經(jīng)濟(jì),適合日常檢測(cè)。因此,我們選擇應(yīng)用基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法,檢測(cè)了小鼠卵細(xì)胞以及卵細(xì)胞受精后22 h甲基化相關(guān)基因表達(dá)的變化,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該過(guò)程中TET1表達(dá)量很低,不易檢測(cè)到;TET2表達(dá)呈降低趨勢(shì);TET3和DNMT3A表達(dá)顯著升高(P<0.01),與文獻(xiàn)報(bào)道基本一致。結(jié)論:基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法檢測(cè)少量細(xì)胞樣品中甲基化相關(guān)基因的表達(dá)的靈敏度在3種qPCR方法中最高。而基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法操作簡(jiǎn)單、靈敏度較高、成本相對(duì)低,適合少量細(xì)胞樣本中多個(gè)相關(guān)基因表達(dá)的實(shí)時(shí)定量日常檢測(cè)。

      【關(guān)鍵詞】預(yù)擴(kuò)增;實(shí)時(shí)定量PCR;小鼠;早期胚胎細(xì)胞;甲基化相關(guān)基因

      作者信息: 程 琳,E-mail:470751814@qq.com。*通信作者,周小玲,

      Detection of expression of methylation-related genes in mouse early embryonic cells using pre-amplification-based real time quantitative PCR

      CHENG Lin1,2,3,SUN Pingnan1,3,XIE Qingdong1,2,ZHOU Xiaoling1,2,3,*
      (1. Stem Cell P2 Laboratory, Shantou University Medical College, Shantou 515041; 2. Reproductive Medicine Center, Shantou University Medical College, Shantou 515041; 3. Guangdong Provincial Key Laboratory of Infectious Diseases and Molecular Immunopathology, Shantou 515041, Guangdong, China)

      【ABSTRACT】OBJECTIVE: To identify a proper qPCR method for examining expression of methylation-related genes in mouse early embryonic cells. METHEDS:Normal qPCR,isothermal pre-amplification-based qPCR,and PCR pre-amplification-based qPCR methods were applied in quantitative assay of methylation-related genes (TET1,TET2,TET3 and DNMT3A) in mouse early embryonic cells. RESULTS:The sensitivity of these three methods decreased from isothermal pre-amplification-based qPCR method,PCR pre-amplification-based qPCR method to normal qPCR method. The former two methods detected expression of methylation-related genes in a few mouse embryonic cells within a proper PCR cycle number but the PCR pre-amplification-based qPCR method has lower cost than isothermal pre-amplification-based qPCR method. Therefore,we used PCR pre-amplification-based qPCR method to examine methylation-related genes in mouse oocytes and early embryonic cells after 22 h fertilization. The results showed that the expression level of TET1 mRNA was very low and not detectable,the expression of TET2 decreased,and the expression of TET3 and DNMT3A significantly increased (P<0.01) in this process,which was consistent with reported results.

      CONCLUSION:The sensitivity of isothermal pre-amplification-based qPCR method was the highest among the three qPCR methods. However,the PCR pre-amplification-based qPCR method is the most suitable one for examining multigene expression in a few cells in daily practice due to the simple procedure, relatively high sensitivity and lowexpenditure.

      【KEY W ORDS】pre-amplification;real t ime q uantitative P CR;mouse;early e mbryonic c ell;methylation-related g enes

      在哺乳動(dòng)物合子以及早期胚胎細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中,甲基化相關(guān)基因和其他早期發(fā)育相關(guān)的基因起到重要作用,且具有特定的時(shí)空表達(dá)譜,因此其表達(dá)變化情況成為研究中關(guān)注的重點(diǎn)[1-3]。行使甲基化功能的甲基轉(zhuǎn)移酶主要包括DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1(DNA methyltransferase 1 ,DNMT1)、DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3A(DNMT3A)、DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶3B(DNMT3B)。DNMT1可催化一條鏈甲基化的DNA雙鏈中的未甲基化鏈,使其完全甲基化;而DNMT3A、DNMT3B則催化未甲基化的DNA雙鏈從頭甲基化。DNA胞嘧啶甲基化后形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)。行使去甲基化功能的酶類有Tet家族成員,包括甲基胞嘧啶雙加氧酶-1( ten-eleven translocation methyl cytosine dioxygenase 1,TET1)、甲基胞嘧啶雙加氧酶-2(TET2)、甲基胞嘧啶雙加氧酶-3(TET3)。TET蛋白主要通過(guò)催化5-mC轉(zhuǎn)化為5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC),還能進(jìn)一步氧化5-hmC生成一系列衍生物,最終形成無(wú)甲基化修飾的胞嘧啶,是DNA去甲基化過(guò)程中的一種重要的酶,對(duì)于維持干細(xì)胞的多能性有重要作用。

      現(xiàn)階段,由于在研究中獲得的哺乳動(dòng)物胚胎細(xì)胞的數(shù)量有限,應(yīng)用常規(guī)實(shí)時(shí)定量PCR(quantitative realtime PCR,qPCR)對(duì)少量胚胎細(xì)胞中甲基化或發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)進(jìn)行定量檢測(cè)往往未能檢測(cè)到信號(hào),或者即使檢測(cè)到信號(hào),qPCR循環(huán)數(shù)也過(guò)多,從而導(dǎo)致處理組與對(duì)照組之間比較時(shí)可信度并不高。此外,由于起始細(xì)胞量少、所含的總RNA量也少,因此反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA量不能滿足下游檢測(cè)需要。這種情況下采用常規(guī)qPCR往往只能對(duì)1~2個(gè)基因同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)(每個(gè)基因包括內(nèi)參均還需要有重復(fù)組),從而無(wú)法同時(shí)對(duì)5~10個(gè)基因甚至更多的基因進(jìn)行實(shí)時(shí)定量檢測(cè)。

      近年來(lái),對(duì)于少量細(xì)胞樣本甚至是單細(xì)胞樣本的RNA深度測(cè)序技術(shù)有了很大的提高。有研究人員采用PCR預(yù)擴(kuò)增或者基于Phi-29酶的等溫預(yù)擴(kuò)增技術(shù)從少量樣本中預(yù)先擴(kuò)增獲得了足量的cDNA來(lái)完成后續(xù)測(cè)序工作[4-5]。PCR預(yù)擴(kuò)增方法主要是在對(duì)少量樣本進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA后進(jìn)行少量循環(huán)(6~12個(gè)循環(huán))的PCR預(yù)擴(kuò)增以獲得足量的相關(guān)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行后續(xù)定量檢測(cè)[5];基于Phi-29酶的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)是在對(duì)少量樣本進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA后,對(duì)獲得的cDNA加接頭連接環(huán)化后,再用Phi-29酶對(duì)其進(jìn)行等溫線型擴(kuò)增[4]。后者相對(duì)前者而言,由于能線性擴(kuò)增較長(zhǎng)片段的cDNA,故能夠更加準(zhǔn)確真實(shí)的反映少量細(xì)胞樣品中各個(gè)基因的表達(dá)量[4]。然而,現(xiàn)階段后者中用到的相關(guān)試劑價(jià)格較昂貴,這也限制了實(shí)際研究中對(duì)細(xì)胞數(shù)目有限的材料中多個(gè)目的基因的表達(dá)同時(shí)進(jìn)行實(shí)時(shí)定量日常檢測(cè)。

      因此,我們針對(duì)少量哺乳動(dòng)物早期胚胎細(xì)胞樣本中與甲基化相關(guān)的多個(gè)基因(TET1、TET2、TET3、DNMT3A等)的定量檢測(cè),比較了常規(guī)qPCR方法、基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法和基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法3種方案的檢測(cè)結(jié)果,為今后相關(guān)研究工作的開展提供重要參考。

      1 材料與方法

      1.1 主要試劑

      PMSG和HCG購(gòu)自寧波三生藥業(yè)有限公司。反轉(zhuǎn)錄試劑盒(ReverTra Ace qPCR RT Kit,F(xiàn)SQ-101)購(gòu)自Toyobo公司。qPCR試劑盒(Quantifast SYBR Green PCR Kit)和純化試劑盒(QIAquick PCR purification Kit)均購(gòu)自Qiagen公司。PCR試劑盒(Premix Taq? Hot Start Version,R028A)購(gòu)自Takara公司。

      經(jīng)回顧性分析可知,引發(fā)胎兒先天性心臟病的獨(dú)立危險(xiǎn)因素與孕早期感冒、負(fù)性生活事件和生殖系統(tǒng)感染存在相關(guān)性,同時(shí)與居住環(huán)境有著直接關(guān)系,見(jiàn)表2。

      1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

      采用汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心飼養(yǎng)培育的清潔級(jí)昆明品系小鼠,雌鼠為8~10周齡,雄鼠10~12周齡。

      1.3 體外授精

      處死雄鼠,取附睪置于含有0.3% BSA的TYH培養(yǎng)基中,將附睪剪碎,加入1 mL培養(yǎng)基,于37 ℃、CO2體積分?jǐn)?shù)為5%的培養(yǎng)箱中上游5 min。上游后600 g離心5 min,棄上清,加入1.5 mL獲能液(3.5% BSA)重懸精子后置于37 ℃、CO2體積分?jǐn)?shù)為5%的培養(yǎng)箱獲能1 h。600 g離心5 min,棄去部分培養(yǎng)基,用剩余培養(yǎng)基重懸精子制作精子液滴,按每滴50 μL,覆以甘油,置于37 ℃、CO2體積分?jǐn)?shù)為5%的培養(yǎng)箱中。雌鼠皮下注射10 IU PMSG,48 h后腹腔注射10 IU HCG誘導(dǎo)超排。HCG注射12~16 h后取出輸卵管,將輸卵管置于含有0.3% BSA的TYH培養(yǎng)基中,鏡下刺破壺腹部并擠壓,使卵丘細(xì)胞浸在培養(yǎng)基中將其轉(zhuǎn)入含有0.1%透明質(zhì)酸酶的TYH中,洗滌卵細(xì)胞2次將卵母細(xì)胞移入受精液滴,37 ℃、CO2體積分?jǐn)?shù)為5%的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)22 h以獲得早期胚胎細(xì)胞。

      1.4 卵細(xì)胞、胚胎細(xì)胞的收集

      分別收集30個(gè)卵細(xì)胞或30個(gè)早期胚胎細(xì)胞,用PBS洗滌2次,把洗滌后的細(xì)胞轉(zhuǎn)移至裝有20 μL細(xì)胞裂 解緩沖液(cells-to-cDNATMⅡ Kit,Ambion)的EP管中,75 ℃ ,5 m in,放置于冰上5 m in,加入1.5 μ L D Nase 1 ,短暫離心后,37 ℃,30 min,置于冰上10 min, 然后75 ℃加熱5 min。

      1.5 qPCR的3種方案

      1.5.1 常規(guī)qPCR方法 用反轉(zhuǎn)錄試劑盒,將裂解后的產(chǎn)物反轉(zhuǎn)錄成cDNA。反應(yīng)條件為:37 ℃、15 min;98 ℃、5 min。產(chǎn)物稀釋10倍后進(jìn)行qPCR。

      1.5.2 基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法 具體步驟見(jiàn)參考文獻(xiàn)[4]。簡(jiǎn)而言之,先將細(xì)胞裂解產(chǎn)物去除基因組DNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再將其進(jìn)行平端連接,然后用phi-29酶對(duì)其進(jìn)行擴(kuò)增。最終產(chǎn)物純化后稀釋100倍進(jìn)行qPCR。

      1.5.3 基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法 步驟見(jiàn)參考文獻(xiàn)[5]。用反轉(zhuǎn)錄試劑盒,將裂解后的產(chǎn)物反轉(zhuǎn)錄成cDNA。反應(yīng)條件為:37 ℃、15 min;98 ℃、5 min。用PCR試劑盒對(duì)反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進(jìn)行以下處理:Premix 12.5 μL,目的正、反向引物各1 μL,DNA模板10 μL,最后加水至25 μL。PCR反應(yīng)條件為:98 ℃、5 min;98 ℃、10 s,55 ℃、30 s,72 ℃、1 min,10個(gè)循環(huán);72 ℃、7 min擴(kuò)增。然后用純化試劑盒對(duì)上述RTPCR的產(chǎn)物進(jìn)行純化。獲得的純化產(chǎn)物稀釋10倍后進(jìn)行qPCR。

      將以上3種不同方案的cDNA產(chǎn)物按照qPCR試劑盒進(jìn)行反應(yīng)。反應(yīng)體系如下:SYBR(2×) 10 μL,目的正、反向引物各1 μL,cDNA模板8 μL,總量20 μL。PCR反應(yīng)條件:95 ℃、5 min,95 ℃、10 s,60 ℃、30 s,共40個(gè)循環(huán)。引物序列為:TET1正向引物5′-CCAT TCTCACAAGGACATTCACA-3′,反向引物5′-GCAGG ACGTGGAGTTGTTCA-3′,跨內(nèi)含子611 bp,擴(kuò)增產(chǎn)物116 bp;TET2正向引物5′-GCCATTCTCAGGAGTCACT GC-3′,反向引物5′-ACTTCTCGATTGTCTTCTCTATTG AGG-3′,跨內(nèi)含子1 700 bp,擴(kuò)增產(chǎn)物120 bp。TET3正向引物5′-GGTCACAGCCTGCATGGACT-3′,反向引物5′-AGCGATTGTCTTCCTTGGTCAG-3′,跨內(nèi)含子2 474 bp,擴(kuò)增產(chǎn)物104 bp;DNMT3A正向引物5′-ATGT GGTTCGGAGATGGCAAG-3′,反向引物5′-AGATGGC TTTGCGGTACATGG-3′,跨內(nèi)含子429 bp,擴(kuò)增產(chǎn)物124 bp; RSP6(正向引物5′-AGGAGAGAAGGATATTCCTGG AC-3′,反向引物5′-GCTTCCTGACAACATACTG GC-3′)作為內(nèi)參[6]。目的基因的表達(dá)水平與內(nèi)參相比后采用2-ΔΔCT方法計(jì)算。實(shí)驗(yàn)進(jìn)行3次重復(fù)。

      1.6 瓊脂糖凝膠電泳

      1%的凝膠,電壓至120 V,電泳30 min后,取出凝膠,在數(shù)碼凝膠成像系統(tǒng)下照相記錄電泳圖譜。

      1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

      小鼠卵細(xì)胞和早期胚胎細(xì)胞中甲基化相關(guān)基因的表達(dá)水平差異分析采用t檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

      2 結(jié) 果

      2.1 3種qPCR方案擴(kuò)增的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖

      采用3種qPCR方案分別對(duì)30個(gè)受精后22 h的小鼠早期胚胎細(xì)胞中甲基化和去甲基化相關(guān)的基因TET1、TET2、TET3、DNMT3A進(jìn)行擴(kuò)增獲得擴(kuò)增曲線(圖1)和循環(huán)閾值(CT值 )(表1)。從擴(kuò)增曲線以及CT值 來(lái)看,基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法的擴(kuò)增效果優(yōu)于常規(guī)qPCR方法,更接近于基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法。

      表1 3種qPCR方案擴(kuò)增小鼠早期胚胎細(xì)胞中DNA甲基化相關(guān)基因的CT值

      2.2 3種方案的擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳

      分別將3種方案擴(kuò)增的qPCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳(圖2)。各方案的電泳圖中擴(kuò)增產(chǎn)物亮度與各方案在qPCR結(jié)果中呈現(xiàn)的靈敏度相一致,常規(guī)qPCR方法中TET1基因未擴(kuò)增出來(lái),TET2、TET3、DNMT3A和RSP6有擴(kuò)增條帶,但是比基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法和基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法的條帶明顯要弱。就基因擴(kuò)增效果而言,基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法>基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法>常規(guī)qPCR方法,而就實(shí)驗(yàn)費(fèi)用而言,基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法要遠(yuǎn)低于基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法。因此,我們選擇基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。

      2.3 基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法定量檢測(cè)小鼠卵細(xì)胞受精后TET1、TET2、TET3和DNMT3A的基因表達(dá)變化

      我們采用基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法對(duì)小鼠卵細(xì)胞及受精后22 h的早期胚胎中去甲基化基因TET1、TET2和TET3和甲基化基因DNMT3A的表達(dá)變化進(jìn)行了快速定量檢測(cè)。結(jié)果顯示小鼠卵細(xì)胞中去甲基化基因TET2和TET3和甲基化基因DNMT3A相對(duì)于內(nèi)參RSP6的表達(dá)量分別是0.02±0.00、3.30±0.16、0.25±0.02;受精后22 h的早期胚胎細(xì)胞中TET2和TET3和甲基化基因DNMT3A相對(duì)于內(nèi)參RSP6的表達(dá)量分別是0.01± 0.00、4.30±0.35、1.90±0.23。TET1表達(dá)量太低未檢測(cè)出(圖3)。統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果表明,小鼠卵細(xì)胞體外受精后22 h的過(guò)程中TET2表達(dá)水平略下降、TET3和DNMT3A在該過(guò)程中表達(dá)則顯著增加(P<0.05)。獲得的結(jié)果和變化趨勢(shì)與Yan等[6]的深度測(cè)序結(jié)果、Iqbal等[3]以及Wossidlo等[7]報(bào)道的qPCR結(jié)果基本一致。

      A:TET1的擴(kuò)增曲線;B:TET2的擴(kuò)增曲線;C:TET3的擴(kuò)增曲線;D:DNMT3A的擴(kuò)增曲線;E:內(nèi)參RPS6的擴(kuò)增曲線. 藍(lán)色線代表基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法,橙色線代表基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法,綠色線代表常規(guī)qPCR方法.圖1 少量小鼠胚胎細(xì)胞樣本分別采用3種qPCR方案的基因擴(kuò)增曲線

      M1、M2、M3分別代表常規(guī)qPCR方法、基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法和基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法.圖2 3種方案的qPCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖

      圖3 小鼠卵細(xì)胞和早期胚胎細(xì)胞TET1、TET2、TET3和DNMT3A的相對(duì)表達(dá)水平變化

      3 討 論

      研究中基于少量細(xì)胞樣本的基因表達(dá)水平檢測(cè),往往難以實(shí)現(xiàn)同時(shí)對(duì)多個(gè)基因的檢測(cè)。近年發(fā)展起來(lái)的基于PCR預(yù)擴(kuò)增或者基于等溫預(yù)擴(kuò)增的對(duì)少量細(xì)胞或單細(xì)胞基因表達(dá)檢測(cè)的方法,為該問(wèn)題的解決提供了有利的工具[4-5]。雖然后者的實(shí)驗(yàn)結(jié)果更準(zhǔn)確,但因?yàn)槭軐?shí)驗(yàn)成本較高等因素影響,其在日常檢測(cè)中的應(yīng)用受到限制。我們研究發(fā)現(xiàn),基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法定量檢測(cè)少量樣本細(xì)胞中基因表達(dá)獲得的qPCR擴(kuò)增曲線與基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法更接近,而采用常規(guī)qPCR方法對(duì)于少量細(xì)胞樣本中的基因進(jìn)行檢測(cè)獲得的CT值 與其他兩種方法相比偏高,不利于少量樣本的準(zhǔn)確定量檢測(cè)。我們進(jìn)一步采用建立的基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法對(duì)小鼠卵細(xì)胞到卵細(xì)胞受精后22 h的早期胚胎過(guò)程中重編程相關(guān)基因TET1、TET2、TET3和DNMT3A的mRNA表達(dá)水平變化情況。結(jié)果顯示在該過(guò)程中TET1表達(dá)量很低,不易檢測(cè)到;TET2表達(dá)呈下降趨勢(shì);TET3和DNMT3A表達(dá)升高,這與文獻(xiàn)報(bào)道基本一致[3,6-7]。TET1是胚胎發(fā)育后期的關(guān)鍵調(diào)控因子在合子和二細(xì)胞中表達(dá)量少,而TET3僅在合子和二細(xì)胞胚胎階段高表達(dá)[8]。因此,與常規(guī)qPCR流程相比,基于PCR預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法更接近基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法,亦即更準(zhǔn)確,同樣的起始樣本量可以同時(shí)檢測(cè)更多的基因;與基于等溫預(yù)擴(kuò)增的qPCR方法相比,更易于在日常檢測(cè)中使用。

      參考文獻(xiàn)

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      基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(81570567,81571994);廣東省自然科學(xué)基金(2014A030313483,2015A030313447);教育部留學(xué)回國(guó)人員科研啟動(dòng)基金(第49批);汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院李嘉誠(chéng)基金

      收稿日期:2015-05-05;

      修訂日期:2015-12-24

      中圖分類號(hào):Q781

      文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

      文章編號(hào):1004-616X(2016)01-0051-05

      doi:1 0.3969/j.issn.1004-616x.2016.01.011

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