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2011 年,著名基因組學(xué)家Maynard V.Olson博士起草的美國國家智庫報(bào)告“走向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”正式發(fā)表,提出通過遺傳關(guān)聯(lián)研究和與臨床醫(yī)學(xué)緊密接軌,來實(shí)現(xiàn)人類疾病精準(zhǔn)治療和有效預(yù)警。美國總統(tǒng)奧巴馬于2015年1月宣布的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃,是通過分析盡可能多的志愿者的基因信息及其與疾病之間的聯(lián)系,更好地理解疾病形成機(jī)理,從而研發(fā)相應(yīng)藥物,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)預(yù)防疾病。這一計(jì)劃引起全世界醫(yī)學(xué)界科研工作者對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的高度關(guān)注[1-2]。在推行精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的過程中,醫(yī)療服務(wù)的思想和方法都將發(fā)生前所未有的變化,醫(yī)院查新也將面臨著新的機(jī)遇和挑戰(zhàn)。
隨著我國科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,醫(yī)學(xué)研究越來越精深,對(duì)查新的要求越來越高。因此,查新工作需要精準(zhǔn)查新的理念,并將這種理念灌輸于整個(gè)查新過程中,即查新點(diǎn)精準(zhǔn)、檢索過程精準(zhǔn)、查新結(jié)論精準(zhǔn)[3]。
查新工作的核心目標(biāo)是判定委托人提供的科學(xué)技術(shù)內(nèi)容是否具有新穎性,查新點(diǎn)是體現(xiàn)查新項(xiàng)目新穎性的技術(shù)創(chuàng)新點(diǎn)。查新點(diǎn)精準(zhǔn)取決于查新委托方對(duì)課題創(chuàng)新的理解,并能夠提煉歸納出查新點(diǎn),除了要求查新員具備較強(qiáng)的信息素養(yǎng)外,還要求其要有一定委托人課題相關(guān)的背景知識(shí)。為此,查新站應(yīng)制定一系列的人才培養(yǎng)計(jì)劃以提升查新人員的素質(zhì)和能力。
在掌握課題精要的基礎(chǔ)上,選擇合適的數(shù)據(jù)庫,制定精準(zhǔn)的檢索策略,包括檢索途徑的選擇、檢索詞的考量、檢索式的設(shè)計(jì)等,檢索結(jié)果的全部或者是一部分內(nèi)容將成為查新報(bào)告的參考文獻(xiàn),用來與委托人課題的查新點(diǎn)比較。對(duì)應(yīng)一個(gè)查新點(diǎn),參考文獻(xiàn)以10-20篇為宜,稱為理想?yún)⒖嘉墨I(xiàn)數(shù)量。如果檢索結(jié)果略多于理想狀態(tài),則須逐條比較,通過選擇典型文獻(xiàn)并去掉重復(fù)文獻(xiàn),選擇不同時(shí)期的文獻(xiàn),最終完成查新報(bào)告撰寫。
查新結(jié)論精準(zhǔn)來源于查新員委托內(nèi)容相關(guān)專業(yè)背景、分析能力、文筆等,以及審核員的經(jīng)驗(yàn)、職業(yè)素養(yǎng)等。查新結(jié)論的精準(zhǔn)直接影響整個(gè)委托項(xiàng)目是否有研究的意義。
20世紀(jì)80年代初,美國、日本、歐洲分別建立了美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)、日本DNA數(shù)據(jù)庫(DDBJ)和歐洲生物信息研究所[4]。隨著醫(yī)學(xué)的快速發(fā)展,醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)幾何級(jí)數(shù)的增長。如何精確利用這些數(shù)據(jù)來服務(wù)醫(yī)院臨床人員成為當(dāng)前擺在醫(yī)院面前的難題。而醫(yī)院查新站查新人員熟悉各數(shù)據(jù)庫的編目規(guī)則,了解這些數(shù)據(jù)庫主要收錄期刊類型以及檢索的方式和方法,通過數(shù)據(jù)精確的挖掘與分析,可以為臨床醫(yī)生提供疾病基因診斷、基因治療和預(yù)防的基因信息支持。醫(yī)院查新站可以通過基因檢索,將實(shí)驗(yàn)室中測出的基因數(shù)據(jù)與臨床癥狀之間的互相聯(lián)系系統(tǒng)地推送給臨床醫(yī)師,推進(jìn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展。
Genebank是美國國家生物技術(shù)信息中心建立的DNA序列數(shù)據(jù)庫,序列數(shù)據(jù)主要由科研人員直接提供或來源于大規(guī)模基因組測序計(jì)劃。如某位醫(yī)師需要了解發(fā)表于CELL上的一篇文章“Regulation of T Cell Receptor Signaling by DENND1B in TH2 Cells and Allergic Disease”中DENND1B基因的相關(guān)信息。查新人員首先制定精確檢索策略,在Genebank數(shù)據(jù)庫中檢索出DENND1B相關(guān)基因全稱、相關(guān)基因ID,得到對(duì)該基因的描述DENN domain containing 1B [Homo sapiens (human)]、該基因的位置Chromosome 1, NC_000001.11 (197504748..197782175, complement)、該基因的來源C1ORF18, C1orf218, FAM31B以及在PUBMED數(shù)據(jù)庫里的文獻(xiàn)ID 613292。DENND1B基因相關(guān)信息見圖1。
圖1 DENND1B基因相關(guān)信息
通過進(jìn)一步查閱該基因相關(guān)綜述文獻(xiàn)獲知目前國內(nèi)外該基因的研究進(jìn)展,撰寫精確查新結(jié)論:DENN基因編碼一段400個(gè)氨基酸大小不一的蛋白多肽,是在所有真核細(xì)胞中十分保守的一個(gè)蛋白結(jié)構(gòu)域,它和Rab家庭成員(GTP酶)相互作用,作為這些GTP酶的鳥嘌呤轉(zhuǎn)移因子,DENND1B突變和慢性空洞性肺曲菌病有關(guān)。最后解決了臨床醫(yī)師的問題,用戶很滿意。
利用PubMed Clinical Queries中Medical Genetics檢索“腦血管病(cerebrovascular disorders)”得到關(guān)于腦血管病診斷文獻(xiàn)8 663篇,綜述文獻(xiàn)7 166篇,不同主題引用該基因的文獻(xiàn)11 168篇。
通過精準(zhǔn)檢索與腦血管病有關(guān)基因之間的文獻(xiàn),幫助醫(yī)生重新將疾病準(zhǔn)確分類,并在此基礎(chǔ)上開展循證醫(yī)學(xué)研究。臨床醫(yī)師可以根據(jù)患者癥狀,通過實(shí)驗(yàn)室檢測出志愿者攜帶的可疑致病基因,在PubMed中搜索到國內(nèi)外學(xué)者引用該基因的相關(guān)文獻(xiàn),并在查新站分析數(shù)據(jù)的支持下,了解該基因相對(duì)應(yīng)的癥狀,進(jìn)而對(duì)這種基因的研究進(jìn)展進(jìn)行分析和解讀,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的疾病分類及診斷[5]。
例如,某醫(yī)師想了解新生兒糖尿病患者致病基因的測序情況。我們通過檢索發(fā)現(xiàn),近期《柳葉刀》雜志發(fā)表過一篇針對(duì)新生兒糖尿病患者14年跟蹤的研究[6]。研究表明,每種癌癥都有其對(duì)應(yīng)的遺傳基因、腫瘤特異性標(biāo)志物,各種類型腫瘤也有共同特點(diǎn)[7]。我們通過建立基因與癥狀的對(duì)應(yīng)關(guān)系,可以幫助醫(yī)師制定相應(yīng)的臨床診療方案。
查新專家在生物數(shù)據(jù)中心的大數(shù)據(jù)保障下實(shí)現(xiàn)了一定程度的精準(zhǔn)查新,通過基因檢索技術(shù)精確檢出單個(gè)基因,輔助臨床科室在動(dòng)物水平和臨床水平多維度驗(yàn)證疾病的診斷、預(yù)防和治療,實(shí)現(xiàn)了多學(xué)科、多領(lǐng)域間的協(xié)作,達(dá)到了臨床與基礎(chǔ)的雙向循環(huán)。
美國科學(xué)院為基礎(chǔ)研究和臨床醫(yī)學(xué)發(fā)展建立起一個(gè)共同的生物學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(網(wǎng)絡(luò))[8]。建立精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)所需的疾病知識(shí)數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)是一項(xiàng)非常浩大的前期工程。因此,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的實(shí)施要通過多部門甚至多學(xué)科之間的協(xié)作才能完成。但無論是建立生物數(shù)據(jù)庫,還是搭建精準(zhǔn)檢索平臺(tái),都需要復(fù)合型查新人才,尤其需要符合精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展要求的跨學(xué)科人才團(tuán)隊(duì)。因此要改進(jìn)查新人才培養(yǎng)方式,培養(yǎng)出既精通醫(yī)療又懂情報(bào)的復(fù)合型人才。醫(yī)院可以在各科精選業(yè)務(wù)能力強(qiáng)的醫(yī)師,對(duì)其進(jìn)行情報(bào)、檢索知識(shí)培訓(xùn),由各科培養(yǎng)的兼職專業(yè)查新人員提供相應(yīng)情報(bào)服務(wù)和分析研究,充當(dāng)“智庫”的作用。
精準(zhǔn)查新對(duì)查新人員要求更高,而且醫(yī)學(xué)發(fā)展很快,特別是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展,更需要查新人員專業(yè)能力的提升。如基因組序列信息中所用技術(shù)不同,不同查新人員對(duì)某一基因進(jìn)行分析識(shí)別的結(jié)果會(huì)大相徑庭 ,需要為其開展相關(guān)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)專業(yè)知識(shí)的培訓(xùn),提高其精確查新水平和能力[9-10]。
隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的深入發(fā)展,保護(hù)委托人隱私問題成為首要的職業(yè)道德問題。對(duì)查新數(shù)據(jù)使用的權(quán)限、范圍、方法應(yīng)進(jìn)行嚴(yán)格的規(guī)定,避免數(shù)據(jù)泄露給患者造成困擾,格守倫理精神,并保持良好的職業(yè)道德,保證精準(zhǔn)查新的開展[11-12]。
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展使基因檢測進(jìn)入臨床實(shí)踐,對(duì)精準(zhǔn)檢索和個(gè)體化查新是巨大的促進(jìn),也是巨大的挑戰(zhàn)。醫(yī)院查新人員要充當(dāng)好臨床工作人員的“智庫”角色,幫助臨床醫(yī)師根據(jù)檢索出的基因信息,分析相關(guān)基因可致疾病的發(fā)展,對(duì)治療進(jìn)行精準(zhǔn)預(yù)測,推動(dòng)臨床醫(yī)學(xué)的發(fā)展。