蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊在小菜蛾蛋白質基因組研究方面獲得突破

蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊在小菜蛾蛋白質基因組方面取得重要突破，相關研究成果近期在線發(fā)表在蛋白組學權威期刊Molecular & Cellular Proteomics（分子與細胞蛋白組學）上。

隨著高通量測序技術的不斷發(fā)展，上萬種生物的全基因組DNA序列被測序完成。其基因組的注釋主要基于預測軟件和已知蛋白的同源搜索，不可避免地導致編碼蛋白質基因的錯誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外，由于缺少肽段等信息，大量基因被注釋為未知功能或假設的蛋白質。蛋白質基因組（Proteogenomics）是一種利用蛋白質組學的相關數(shù)據(jù)對基因組進行注釋校正的新方法，由于其結合了大量生物體蛋白質氨基酸信息，從而有力地彌補了基因組上基因尋找和注釋的不足。小菜蛾是一種世界性重要農業(yè)害蟲，每年因小菜蛾造成的損失高達40億～50億美元。小菜蛾幾乎對所有的殺蟲劑均產(chǎn)生了不同程度的抗藥性，包括微生物殺蟲劑Bt。蟲害防控創(chuàng)新團隊利用shotgun HPLC-ESI-MS/MS對小菜蛾幼蟲中腸蛋白質進行測定，結合其基因組數(shù)據(jù)，完成了首個小菜蛾中腸蛋白質基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質譜圖，鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲劑抗性相關的蛋白質，同時，還糾正了小菜蛾的基因注釋，鑒定了大量新基因以及新的基因剪切形式，相關研究結果為闡明小菜蛾對Bt殺蟲劑抗性調控網(wǎng)絡提供了重要的遺傳信息。